XLOC_009795 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009795
Unique NameXLOC_009795
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000269:221595..259188+

Legend: gene
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ACTGCACCTGTCTACATTGCTGTTGGCTCATCAATCGAAGCATCACCATC TGAAAGTTTCGTCCAAGAAAGTTCTGCTACTTCTTTACTATTGAATGTCT CTTTGAGTGGTTTCCAAGAACAACATGTTGTAGCCTATGTCATCATTGGT CAAGAATATCCTTCCAATGTCGACGTTAGTGTCCAGACCTCCCAAGAACC CGTGACCTATCATTTGGCATTCAACAGTACACAGACTACCACTTACAGAT ACAGATTGTACAATGTTGCCCGAATCCCAATTGCCACAGTTACATCCACC AGAACAAGAAGATCGGTACGTGATGTTGAATTATTTTTGGGATGATTAGA CTCTCCCCATAATAGAATTCTTAGGTGGTATTTAAAGTATAAAATAATAG TGTGCTGGACTCGAATTTGTGAAAGTACAGTTTTTGGTCGGGCTTATTAA TTTCTCTATAATAAAGCAAACGATACCACActcaaaccaaaccaaatcaA ATTCACAGACATTTAATAATATAGTCTATTATTTCACTTGCAGTTGGAAA AAGCCGAAGCAACCAGCTTGTTATACAGAGTGGGCGCTCAGACACCATGT CCATCCACTGAGAAATATTGCAATGGACCTTTGACAACTGGCAACAGATA CAGGTGAGGATGGTTGAACCCAATGAAACTTCGTGTTGTAGGCTGCGATT TATTCGATCGTGTCGAGGTTTTTCTTTGGTCTATGAGAATTAAATTTTAC AATGAAAGAGGATTTCTTTTTAAAGCCATTAACCCAATCTTCTTCGTCGG TATCTGAaactctttttattcttttttgttaTAGATTCTTTGTAGCAGCC ATCTACAACACTCCAGGAGTAACAAACGGAGTACAAGTCAATAGCCCCGC CACACCTGCCGCCCTCACAAGTAAGATTCATTAGAAAAACGTTGTGTTAA TTATTAaaacattttcgtcactttttcaTGATTTGTCATCCATCGCGGAT TTCGTTCAAGAATACTTCCCCTTTTCGGATAAGATTCTCAATAATTTCTT GGAAATCAGCAAAACATAGCGAATTTTATTTATTCATCTACTTTTTCCTT CTTTTCGTTATAGTCGGTCCAAATATTGGCGCCCTTGGTGGTCAGCAATC TGTACACGTCAACGCCCTCGTCATTTGGATTGTCGCCCTTGTAGTCATGG GAACACTCTTCTGGTTGGCTATCCTGGCACTCGCCATTGTCTTGTGTTAC AAACGAAGATACTTACACGACAAAGCATACGATTTAGGTTACAACGGACC TCCAATCCCAAATAGCGGAAACGCCTATGCTTTTGATAACAAGGGGGCAA AAATTAACGAAGGTTCACCTATTCATTACTCCGAAGTTGCAACAATCGCA GATCGACGTGCTTCCGTCCCTGACCAACAAACCAAGATTAACATCACACA CGCACCGGTCGTCCTTGATTCACCGGAACACTCCCCACAATTGAAAACTA ATTTAAAGACTTACGAAGACACTGTCACCACCAGTACATTCTCACAAGAA TTTGAAACTCGGTctgcaaatttgaaatttggagaTGAGAATCCTGAATG GGAAAGTATGGATATTCAACTGAGGATCGATCCGACCGGAGAACGAGATC CTGTTATCACTCGCAAAGAAACTAAAAAAGGTACATTGGTTTTAGATAAT CAAACGATATTTATAGTTTGAAGATttataatttaagttttgaattcttt ttgcgTAACTATCACAGTGGATTTCATGAATTTCTGTCACaggaaaatat gaaaatatcttttttcataTTNTTCTTTTGCGTAACTATCACAATGGATT TCATGAATTTCTGTCAcagtaaaatatgaaaatatctttttcatATTTAA TACAAGTCAAGAATGATCCCCTTTCCCTGTTTCGCAATGCCTCTGACAAT AACTTCTTAATGAATTCATTCTGTATCGATTCTTCCTCTATAGAAGAAGA ACATCCAGGGATTCAGGTGCCAGAACCACCAGTCGCACCGGTCGTCAATA CCCAAACGTCCGTGACCGAAATCACCACGACAACCACAACAATACAACAA GTTGTCAATGAAAATGGTGACGTTATCGAAGAAAAAGTCGTCGATCAAAC GACAACCGACGAATTGAGTCGCGTTTAAACGACAAATTAATCGGACGAAT ACGGGAAAACGGCCTTAGGACAATTCTATTTTATAAATAATACCTATCAC TAGTtatatttctttataatttctatttttgttttaatgtatctaaaaag ttttgaagtatatataaataaaaaattgtaatttCTAATCTTAGTCTTTG GTTACTTTTATGatattttctgttttattttttcgaaaccAATTCGTTAT GTTTAATGAAATACGAATTGCTAAATAtgattttaaacaaaatt
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00017502TCONS_00017502Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00017503TCONS_00017503Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00017510TCONS_00017510Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00017511TCONS_00017511Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00017513TCONS_00017513Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00017514TCONS_00017514Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00017515TCONS_00017515Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00017516TCONS_00017516Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00017517TCONS_00017517Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00017504-proteinTCONS_00017504-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000269supercontigsc0000269:221595..259188 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
169.11 133.69 303.13 300.53 40.4 33.58 49.89 66.19 34.74 47.54 38.65 35.73 3.78 3.89 1.12 2.33 67.83 45.42 3.5 8.28 337.36 237.62 69.19 87.41 132.28 100.38 37.44 38.23 63.54 54.99