XLOC_008514 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008514
Unique NameXLOC_008514
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000205:236759..245291-

Legend: gene
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>XLOC_008514 ID=XLOC_008514|Name=XLOC_008514|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8533bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000205:236759..245291- (Clytia hemisphaerica)
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GGAAAAATGAAAAAATACTCCTTTATACGTCCTGGAAATTCTTCTCCCAT TATCCCATGGAAAATATTCTTCCAATAGTATGGCCTAATGTTATGTTATG GATCTTATTTTCTGTGCATTGCTGCATGTTAAAGAATAACTTAGTGGCTA ATTTTTTAAATTGATATTTCGCTAATCAAAGGTCAAGATTTAAGTAGATA GCATTTCAGGAATTAGCCTCTTTTTCACTTTAACAAAAATCCTGATCCTA AATCTTTGGCAAGGACTGAATTATGGAAAATGACCAAAAGTTACAAAACT TAATCCACTGAAGGTATTTACAATTACTATGAAATATATTTCCCATGGAT TCCAAAATGTTTAGCTGAACTTCTTATGAATAGCAAATAAAAACATGATT AAAATTTGGCTTCCATAGCAACCTTATGGTCTTGATAACACATGTATTTT TTATTAAACCATTAGTCTGCATTGATCAACCTTGAACAATATTTGATTTT ATTTTCTTTTCTCCTGTCAGGACTGAGAGACCAAGAAACAAAGGAGGCCT AGGTAAAATGAATATCCCACTTGTATCTGACTTAACAAAACAAATTTCCA AAGACTACGGAATCCTTCTTGAAGATGCAGGCATCTCTCTCAGGTAAGAT TGGTTTCGATACGTTTTTGGATTACTTAAAAGCTAAAAGTTGTAATTTTC AACTAATTTTCATCCATTTCAAGATTCAAAAAGCATGCTTGCCATAAAAG TGCGATGTACTTTCTAACCCTTATTTTGATGATTTCAGATCAAACCCATG TTTTAAGATTTTTAAGGCGTTTCCTAGGAATCCATAAGTCTGGAAATGGT TTTTTAGCCCCAAATGGGCTAGAGATTAATCTTTAATCTTTCTTAAGTAA GAAAAAGTGAAGTTNTTAGCCCCAAATGGGCTAGAGATGAATCGTTAATC TTTCTTAAGTAAGAAAAAGTCTTAAGATCTGCGCCGCATTAAGAATGACG GGTTCATGTAAAAACCAGGCGAGTCATGCGTTTTTGGAGTTTGAAGTCTA GCCCCTTCATGGCTTTGAATAAAATGATTTTAATTGAATTTTTTCAATTG GTTGGTAGTACGAAAATGAGATTTTTTTCATGGATGAACCTTCTCTAATC TATGTCTAAGGATTGATCAATCTTTCCTATATTTGGCGATTTAAACCATG TTTGTTTTCTTTAGAGGATTATTTATTATTGACGACAAAGGAACACTGCG ACAAATCACCGTCAACGATTTACCGGTTGGACGATCTGTCGACGAAACTT TGCGATTAGTACAAGCTTTCAAATTCACTGACGAACACGGAGAAGTTTGC CCTGCTGGATGGAAACCAGGATCTGACACCGTAAGTTCTTTTTTTGTTTT GCTGTCTAGCTCTTGAGTTTCCAGGTCTCCAGTTCAGAAGATAGCATTTG CTGTTCATGTGCTGCAACTTAATTCATCAAAACTGCTTTAAAAATGTCAG CGAGGTTCTCAGGAGTGTAAACTGACCTTGACCTTGTCTAACCCATAAGC TGGAAAGCTGATAGGTTTTTTGGTGTTCAGGGGCTTAAGTGTTTCTGCAA AGTGTTTTGCCATCCGATGAGTTTAGATTTACAGGCTGCTACGCTGAGGC TTAATTAATCTCATCTCCCCGTTGAAGGAATTAAATTATAAAGTTTAGAA AATTTTTGTGGTAATATTTAAACGTTTTTGATTAAAAACATTTAAGTTTT ATCTTACTTTTTGAGTTGAGTTGAGTTATATACATAACCTTACCCGTCTT AATCCCGATATGAAGAAGTGTAGAGACTTTGTTTCACATGCATTATCAAG AAAAAATCTTTTATGTTTGACGTCATCATCTCAACAATATATATTGGTGA ATCTTACTAGATTTTCCTGAACTTTTTGAATTACCGATTTCTTTTACTTT ACACCTTGGAAACGAAAGATGATTTTTTTTCTCATATCTATATCTTTGTA AAATATTAAGTTTCCAATTTTAAATGTTTTTCGAAAACGATATTTTGAAG TTTGTCACAAATCACGTCGCGAATTCTCTTTTTCTCTCGCTTGTTTTATT GAACTGAAGATACTAGACAAAACACTTTCAAAAGATGAAAAGATAAAGAA TTTTAGAGTCCACGTTTAATTTTCTTTTTTCAGATCAAGCCATCAGTTGA CGAGTCGAAAGAATATTTTGGAAAACAATAGATTGTCTTCAATCGAAAAA TGAGAAAGACCAATATCATTAGGGACCGTTACCCCTTTGATCGAAGAACG ACTTGATGGATTTTAAATATTAGTACTAATATATTAGACATGTTGTTATT TTTAATTTTTCTTTCTACCCAACGTATTGTCGGGAAAGTTTAGGAGGCTG TAAGATCATGTCTTTTTTTAAACCATTAAAAGAACGTGGTAAGAGCATTT GCGGTTTGTTCGTGAACACAAACTTGATCCAAACTGCCTAAAGGGGGGAC ATAACCACTATTTTATGTTTTGTTAATGTTTTTATACTTTTTGTTACATA TTTTTTTTTTGCTCTGTACTTACTTAGGACAAATTCTATTTTCTTTAATA TTATTATTGGTAGTAGAGTAAAGAACTGTATTTCGAGGAAAACCGCTGTA TTAAATTTTTACCCAAAATTGTCCCACTAAAGTCTGCCTCAATAAAATTT GCAGCGGTAGACCAGCGGCCGAGGTAATGAATTGTGTCACTTGGTAGGGC ACCCCTTAGATCAGGGCAAAATTTTGATATTATGCAGCTAATAGGGTGTA GAATTGACAAAAAAATTGCCCTTCAAATCTCCT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015229TCONS_00015229Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015228TCONS_00015228Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015229-proteinTCONS_00015229-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000205supercontigsc0000205:236759..245291 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
PRDX1peroxiredoxin-1 Homo Sapiens
PRDX2peroxiredoxin-2 Homo Sapiens
PRDX4peroxiredoxin-4 precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
814.17 820.99 956.73 965.23 199.19 161.77 364.92 389.54 606.49 496.38 645.85 573.08 258.8 266.13 263.84 234.99 450.26 429.21 227.66 305.1 333.54 318.1 491.67 471.24 427.7 454.21 471.65 466.42 468.46 404.61