XLOC_007759 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007759
Unique NameXLOC_007759
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
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gene from alignment at sc0000174:616220..637712-

Legend: gene
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CATATTTCTGAAGTAAACAACTGTTAAGGACCGGCTGAAATTAAAGTAGA AAGTTTCCAAGCCAAATCACTGGTCATAATGCTATTCTTTAATGGGATTA ATTTTCGGGGGGATAAAATTCTGCGTTTGAGTTGCACCTGCGAAGTTTTA GATTTTGTGAGGATTTAATTTCGCGGACTACTGTATGAGGTGACAATATT TTCATGATTTTTTGCCTTTTACTGTCAAATCAATCATGTTGGTTGTTGAT GACAGTAAACATTCAAAAAGTGATTCTTTGACACTTTTTGAGTTTTGTTT AGAAATGTTTCGCGGATAAGGCCTTTCCTAATTCTGAGAATTCTTTACAA CAAAGGCTCAATTGGAGGAGTTTTAATAAAAATGGTTGTTGTGTAAGCTG AACAATGAAGGTTGTGATATATTCAAGCATTAATCACTACATCCCTTTTC CTATAGCGTCTTCGTCGGACGAAGAAGACATCACAAAATCCAGCAACAAC AAGAAAGCACAGAAACACAAGCAACCAAAAGAAGTGGAGATTTCTGAAGA TGAAGAGAGTGATGAGGATAATTGTGATGAGAAAGAACGAATCAAGAAAT ATCGGGTTTGTCAAAACATTTCTTTGCTTCTACACCACGCTCATATTTTA ATAAAACAAGACAGAGTAGACAGGAATGAGAGGCGGTTTATTAAAATTGC TTTATTCTTCGCCAAGATGGAGCGGTTTTAAATTTACAATTGAACGACTT CTTTGAAATGGTTTAATTGATTTTAAAAAATGAGTTTGGGATTAGTATTT GTTTTGATAAAATTTCATCTATAAGTCATCACTCATTTGTAAACTCGTCC AGGGTTTTTTGTCATAAAACACATTCAGAGGGTCATATCATAAAACACAT AAAATGTTTTAATTCCTCATTAGCGAATGAACATTGAAAACCTTTCTGTA ATCCGAAATCCATCTGAAACGAAAATCCTTGCTTTGACCACTGACGTTTA AAGAAAATAGCTGCATTTACGAACTATTTTGGCAAGGTGCCAGAAACTGA ATTTTCGTTGTCATGCAAAAGATGTTTAATAAGGCATCTAAGACATTTTT CTGTTTTGTTGTATGTCTATCATTTTCAAACACATTTTACATCCTGTTAA CTCTCTCCTTAGCAATTAATGGACGAGATCAACGCCAAAGAACGTCAAAA TGAAAACGACGACGATGGGGACGGGAATATGGAGGTCACGTGGTCTATGG AGGACCAATCAAGTTTCAAGAAAGCAAAAGATAATGACGAAGACGTTTCT GAAGGTGAAAACTCCACAAGTGGTGAAGAAGAGGCGGAAAGTGACGATGA AGAGGCGTTACGGGCGGATGGTGACGACGACGATGGTTTTGATGATCCGT TCTTTTCACAACCTTCAGAAATGAACGAGAAGATTTCTGCCTCGGTAGAC GATGAAAATGAGAATATAATAAACGGAGTTAAGAATAAAAATCAAAAGAA GAAGAAGAAAAAAGCGAAAAAAGATTCTCAAATGACCGAAGAAGAACTCA AACAGAAGGTATAAACATATGATAAATGCGTGTACATAACTAACAAGTAG TTCGCTTTCGATCTAGTTTCTTCTTGAGCATGGGCATGGACATGGGCTCT TATTAAGGTCCAGCCAGACCTACCAGTAAAAGACTAAAAAGTTCCGTTTT AGTTTTCTAATTTCCTTGATTATTTTCGATAAGCTAATTTAATTTAATTC AACATTGATCAGACCCCATCAAGAAAGGTTTGTTTCAGGCTCTATTTACC GAGTGGGAAATAAATTCACTTTTTGTTTTAAACATCATTAGAACGAACTT GAACTGTTACTACTGGGTGACGAAACGACAGAAGAACAGAAGAAACATTT CAGTTTGAAAGGCATCATGGAACAAGAAAAAAATACAAAGAAAAATAACA AAAGAAAGAAACGAAAGCTCAAAGAAGAACAACCGGAAGATGATTTCGTT TTCAATACTAAAGACGAACGATTCAATGCGCTTTACGATTCTCATCTTTT CTCACTGGATCCTTCAGAACCAAATTTTAAGTAAGTTTGACACTTATTAG ATCCCTAGTTCCTTCGTTTCTAACTTTCATTTTTCGCACTGTACTTGGCT TCTGTCTACTGTTGTCTTTCAATATGGCGGTAAACTAAGATGATTTGCTG TTAACTTTTTATTGGGTCTATTTCAGTAGGGGTAAACCCTTAGGGCCCGG AACATCTTCTGATGCGACGCAACCAAATCTGGTCCATTTCAAAGAATGAA GTCTGTTTTTGAGTGTTAAAAAAGTTTCCTAGGCCTTAGTAGAAAACCCC CTCGTGAAAAACTATAAATATTTCATTCTTTGAAATGGACCAGGTTTGGT TGCTTCGCATGAAACATGTCCTAAGGCTTCGCCCGGGGGTTCGCCCTACT ATTTTCATATTTTAAGCACTTTTCATTTGCTTTTAGAAAAACGAAAGCGA CAGAAGCAATCATTGGTGAAGCACAAAAGAGGAGAGAAAATCGCGCTCAA GAACGAACTGAAAAAGGTATCACATAATATTATATCATAATACTTTTGGT ACTGGGGCTCTATATTAAAGGTTGTGATCTCGACATAAGTTATGTAGCGT CTGAAGATGAGAAAGTAATTTATTAAGAGGCACTTGATTCCCAAACTCTT GGCGCTGATTTCACTGTGCAGAATCTTTCGTTTTTTCTATTCATGCATTA TGTATTTTTCATCGTTTGTGTTGCAAACCGATGTTTGGTGGAAGTGTTTT TTAAAATAGTTATAATTCTTTGGCTTTAGTGAAATACAATACAAACAGTA AAAACGATGTTGAATCAAAATCTAGTTCAACAAAAGATATGAGCAAAGCC AGGTAAGAATTAAATTTACGCGAATTCGAAAAAAAATATTTTTCGCAAGC ATAAACACTCGCGAATCAAGACATAAATATGAAAATTTCCATGCTAAAAT TGGCTCACAGGGACAGATACTTTTGAATTGGTTTAAAACTTTTGTCTTTT GACTAAGCTATAAACCTTTTATTTTAAGATGGAAGTTTTATAGCTTTTCT ATTTTGTCAAGAATTTCGCGAGCATTAACTTTTGCGAATGGCCCTTTCCA GAATTTGCTAAAATTCGCGAAAATCGGAAAAGTTTCTGCTCGCGAAAATT TGTACGTCTAAGTAATGCCAATGTTCGAAAGACTCGACATCCTTCGTAAA GTCAAACGGGGAAATGACCATTGAAGTGTGAGGGATAGTTACCGAACCTC TTGTAACAGATGATAGATCAATTTCTTGTTTATTTCTTTCAGCTTATCTG CTCTGGTGAAATCAGTCAAATCGAAAACGCAAAACCATCAGGCTCAAAAA CAAAAACGAAAACTAAGGTAGCAGGAGAACGGTTTGACTGTNN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013904TCONS_00013904Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013904-proteinTCONS_00013904-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000174supercontigsc0000174:616220..637712 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
ESF1ESF1 homolog Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
42.14 41.74 38.75 35.23 27.27 21.75 28.47 31.47 21.04 21.42 22.44 24.79 25.36 26.13 27.23 33.21 29.01 35.05 15.93 18.21 30.09 30.55 27.59 29.1 19.78 25.3 14.64 12.09 22.74 24.4