XLOC_007345 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007345
Unique NameXLOC_007345
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000162:243412..258285-

Legend: gene
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>XLOC_007345 ID=XLOC_007345|Name=XLOC_007345|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=14874bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000162:243412..258285- (Clytia hemisphaerica)
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TTAGTGGTTTTACAGGGACAAATAAAAGTTATACTGTATACTAGTGTCTC ACATAACTGACTATCAAAATATCTGATAACAATTTCTTTTGTTTAACCTT TCCCTATTGTCCTTTTCATCCAATCAAGATAAGTTTCTCATGAAAATCCA ATCAGTTCAATGACATCATTTCTCTTCGAATTCAAGTTTTGGAAAGTCTC TCGGAACTCCTCTTTTTTCCTGGAAGATTGAGATATCTTTTTTTCATAAG AAGCCGTAAAATTTGGCTGAGATTTGGCTAATCCTATTATGATTGGGGTT TTTGGGAACGAGTGTTACTAACATTATATGTTCTCACTTTACTCACTTAT TTAGTCAAATGAGTTTAATATCTTGTAGAGAATCTTCTTTCTCTAGAGTT TTAAATACATAGTAGAGCTGTCAAATGGGCTTTTTCTTGGTCGCATCTGA AATCTGACGTGAAAAACGGTCTTATCTGTCCTTAGTTTTTTTTCCTTATA AAATTGTTCTTAAAAACGTGTCTTTCAAAATTTTCTTTCCTTGTTTATTA GCTGTACAATGTGAACGCAAGCCATTGGTATTGACGCAACTCTCGGTACC GAGTATTGACGACAAAGTGAACCGAAACAAAACCATTGGTCTCGATTATC GAACGAGTTCCGACGAGAGCGATGACGACAAACGATCAGATCCGTTAACA AACAAAACATCTTCCACATCCAGTGAAAAAGATAACGCCCTTCTAAATGT TGTCATAGACAGGGTGGATGAAGAGGGTGGAAGGGCGCTTTTGAATTTAG CTCAAAGTTGCCAACGGAAACCGATTTCGATAGATAGTGATGAGAACTTG ATGCAGTATTCAGAAATAGGAACCATCAAATCGGAATGTTCAGACGAAAC ACCCCCGTCATCTCACACCTCTTACCCGGCCTATACGGAAAAACCACCAG 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AGTCGATTTTAATGGCTCCCAGAGAGAACGATAATGATTTTTTACCTCTA TTACTCGAACTAGTAATTCGAGTTACTTAGGGGGCATTTTCTACAGTTTG AATTTCAAAAAGACATGGAAAATAGATGTTCGTATCGTAACCGCCTTTCG TTTTGGAAAGTCAGGGAATCCCTTTTTCGTTTCTTATTTTTCCATCATGA CATATTCACGACAGACTTAATTAATTGACCGTTTACATTGTGAAAAGAAA ACGTCATTTTAAGCTGTAAGCTCATAAGTGCACGCAAGTCACAAACAATA CAACAGAAACAGTAGGAAACGAGCTCACGAAACACTTCATGTGCTTATAT ATACCGAGTTCAACGGATTTAATGATGAAAAGAATACAAGAATAAAATGA AGTAACGAAATTCGTGAGTTCAACATGGGCTTGAAATTTCACGAAATCGA CCTAAGTCTTTTTCTTGACTTCCTTTTGAACAGTGAGAAATCCCCATTCA TTTCCACTAGGTGTGCGGGCTTCACTTTCAAGCATTTTATTCTCCATGCT CACTCNATCTTTTTCTTGACTTCCTTTTGATCAGTGAGAAATCCCCATTC ATTTCCACTAGGTGTGCGGGCTTCACTTTCAAGCATTTTATTCTCCATGC TCATTCTCTCGATCTCTTAAAGAGCGAGATTGAAGTTTTACTTGCTAATC TACTCATATCCAAGAGGGGAAAAGTAAAATTTCTCAAAAAAAAAAGAAAC CGCGAATCTCTAATAACTGATAAACTTTCAATCTTTTCAGGGATAATTTT ACTTCAATAATTATATACACCAGTCTGAAAGTTTGCTTGACTCCCACTCC ATAATATATCTCCCTTTATTTATTTTCAGAAATCCCTGGCCTTGGGGACC GAGAATTCACCCATCGCACATGCGCACACTCGCGACAATTATTGGAAGAT CTCTTCGAAAATAATCAGAATCCAAAAGACTCGATGGATAATGATAAGAC GAACTTGAATCAACAACGTATGTTTAAAGTTTTAGAATGTGTGAACACGA TACGTAAAGTTGAAGTGACTGATACTTTCTTTGTACCCATATTGAGACAG ACCTCTATTGAGTACGTCATACAAAAGGTTTTGAATGCAGAGAAAGATTG AGCGGAGAATATTAATCCACGCGTTTTGGATGGCAACTGCAATAGCATAT AAGAAAAAAACTAAACTACGAATAAAATAAATCTAACTCTGATTCTCAGA CCTCTACGGACATACTTGAGGATTAGTATAAATGGTGGGGGTGAGGATGA GTATTGATCGAGAAGTTTTCCTGTGCTTGGCACTAAATGGGAGAAAAGAT TGAGTTTTTCATTTTTAGAAAAACTTGATAGGTAGTTGGAAACCCACAGA GAGCGAATTAGCTGTTGAAAATTTTTTTTCTGTTTTACTATGTTAAAAAC GAAATTTTCAAAACATAATTTTGGGATATTATTATTATTGTAAAAATTTA GTGTGTTATTTGTATATTATATGATTATATATTATCAAATCAAATCTATC AAAACTTTTAAAACATATACCATC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013157TCONS_00013157Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013156TCONS_00013156Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013155TCONS_00013155Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013154TCONS_00013154Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013153TCONS_00013153Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013152TCONS_00013152Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013151TCONS_00013151Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013150TCONS_00013150Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013149TCONS_00013149Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013152-proteinTCONS_00013152-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000162supercontigsc0000162:243412..258285 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.65 1.29 0.71 0.38 10.76 9.61 5.59 5.7 3.62 2.17 3.17 3.1 2.35 2.23 1.8 5.25 50.44 81.26 0.44 0.36 13.12 13.27 6.56 9.52 14.91 20.54 5.14 2.61 1.73 2.06