XLOC_007272 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007272
Unique NameXLOC_007272
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000161:37647..64119+

Legend: gene
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>XLOC_007272 ID=XLOC_007272|Name=XLOC_007272|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=26473bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000161:37647..64119+ (Clytia hemisphaerica)
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ATTTTCATAataatattattatatatttttttctttttcaaatatttttt cttatgtttttggcattctttttttttttgctgacgaCAACAAAAAATAG ATAATTTATCACAAAATACTTCCTACGTAActttgttttatgaaaataat ttttttgtaaaatatcatACATTAATGCAGTAATTTTTTGACGCATCAAT ATAAGAAGTAAATTTCAAGGATTTCCAGACCCTCATATTCCAAGATTTGC CTTGCATCGCGTAGAATTGAACAGTCTGTTGCGTTATGTATTAGCGTTAT AGATATATACCTTTTTCAACCAAATCTCAGTTTGATTAATATCATAACTT TcataattttgaagatttttgcgtctagctaACTGATGTCGTTACTTGAG CGCAACCAGTCCTGGTTACCCATGaatcatttcgactgtgaaattGCCTG TGTGTGACGCAATTCGATTGGCACAAAATAGAACGCGCGCGAAAAGCAAT GCAAAAACTTGTTTCTTGAGATGAAAAAAAGCGCGACATTCATTCTGCGC GATGGGTACCTTGATATCTTGAAACAaagctaaaaaagggtttttgacTT TTGATGGTTTTATACACccaaatttgtcaaaatatatCTTAATTACACTA GAATCTTTCAATTCAAGTATTCCTCTGAAATAATGCTATAATAGTAAAAG GCTCCTTCCATTTAGACTTATtagtatgattttttttaaatgaatgattg aaaattgaaaattaataggaaatttttttttaagatataaaatatttttg ccattaGTGAATTATTTTGTTGGTAAGCAGTTATGTTTTGGTTTGATTGG AATAATTTaagattatatattttttgttgtttttttcggtTGTTTAGATT TGGGAAGGTTAAATTTAGAGATAATTGTCAAGATAATTAACTTTTCTTCT GAAAGGGACATTTGACAGTTGAAAACAAGCTGTATGCAGGCTATGCAGCg tgatacaaaatcaaaacaaattttacaaaataaaaattcagaatattccg tttttattgttttaaaaagtttcGGTTGTGACTTTTATTGTTCTACTCTA TGTATGACACGTTGTTCAAGAAGTGTTTACATTTTTCACTTCCCGCGCTA AGACTCCATTGACTCTTCCGGAATTTTGTGTTTACTTACGAAACTGAAAT ATCTCCGAAactcatttttcaactacccggagccttggtctttttccgct agaaaagttGCATTGCAGTGAAATCTTAGTGCGGGACTGGAATCTTATGG AAAACGACGGTACTACTGTTATCCCTGTTATTTAATCCTACCGTCTAATC AATAAAATATAACCTCTTCTAAACTTACCCACAAAAACAACAATAGATTT GTGATATAATTTATGCAGTAGTTTATATTTTACTACATTGTTTTAggtat tttttgtcattttctcaGTTTGTCACGTGATGAAAATCGTTACATGTGAA TCTAGGTCCCAGGctctttctttaaaatttgtaaacaaaagaaaagaccA CTCCCTAACCCCCCAGGGCACAATTTGAGAAATCCTTTtgttaatacacc ttttcgaccgtattCACGCGGTCGGGCGTGTGCCACTTCATTaattaatt atccccctaaactcgatccaatcctttttttacaactttttctaTTGCAA AAAAACTGGAACGGTTTTAAGGGGGTAaattggacaaaaaaatgcccgtg cggcaattggtggctacagTCGAAACGGTgtattctgctttgtcagcaaa aaagaaatattgatAGAAAAGGTGAAAGGAACTGAAAGTATACATACATA CAGTATTAcggtaaaattgtttcatatctttgttgaaaaattcacATACG CGATGCCTATCCAAATTAAATTAGATTTTATTGCTCGTTTGTGGTATTTA AAGATTGATTAATTACTCCGACGTCAAGCAATGATGAGTTTGCTTAATAT CACTCGTCAAAACCTAATTAACTGGCATTGGCTAACACAAACTGCTGGGA TATCGTAGTTTCTTTATTGAATTTCTCTATAATTCTTGATCGAAAGGTTT TCTTATGTGTCAAGGATTATTAGTGCTTACTAGAAATTATTAACGAAGCA ATTTCGTCTACCCAGAAACTCTGTTCTACCTTTGCAACAAAACATAATAT GATCTctcaacatttcaaaataaccaAGCCTTCTGAAAGTGTTTTGACAT GATTAGAAAAATGACTGCAAAGAAGCTTTATGATTTTCCCATAGAGATTC CATCAATGATAATATTtgatgactcaccacgtttagACACAACGTTCTTC AAACGTTCATAGCATCTATTATAATGACATTTTGTGAAGCTTGAAATGTC CTGGCGTCTACGGCTGAGGACATGTCGTTTAGCCATAAGTAcatattaaa aactttttagcTTTGAGTATATAattgtttctaaaattttacgGACAGAA AAATGTATTCAAACTGATTTTCTGGCTTTTTATGCCTAAGCTGAAAAAAG TTAAATGTGTACTTTTGGGATTTAGGCTTTAGTTTTAAGGGTTTTTCTTT TAtaggaagaaatattttttgtcaagaaatttatttgaaaaagaaagaaa agatttaaaagatttttttgttgtgtaaataaaagtaagaaaaataaaaa atacaaatttgtttataaaaaga
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012943TCONS_00012943Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012944TCONS_00012944Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012945TCONS_00012945Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012946TCONS_00012946Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012944-proteinTCONS_00012944-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000161supercontigsc0000161:37647..64119 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7.74 7.68 8.26 7.27 51.16 38.73 48.03 53.14 25.96 37.35 31.41 20.09 32.64 28.89 25.55 33.11 37.9 36.94 29.13 31.43 27.03 30.61 17.84 23.79 29.37 32.02 35.52 28.68 35.86 41.6