XLOC_006487 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006487
Unique NameXLOC_006487
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000130:313029..325409-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_006487 ID=XLOC_006487|Name=XLOC_006487|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12381bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130:313029..325409- (Clytia hemisphaerica)
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ATCACGGTAATCACGCCCTTACGCCACAATATATCGCCCTTATAGCGCCA CACCATAATACAAAGGACCAAAAGCATATTCAATGATGTATCTATTTAAT GATCCAAGTGTTAAAGAAATTTAAAGCCTGGAGGCTGTTTTAATAATTGT GTGATGAATTATTGAAAGTCTGCGACGCTCCCTCCGCCCTCTGGATTATT TATATTCACGAATTGTGCCATGGCTAGATGTCCAAGTGGATTCTTGTATC ACTTCAGATCCACTTATATCTGACAAATGCAGTGAGGAAAATATACTAGG ATGATCTATTACATTGAAAATATGGTTTTTGTTGTGAATACAGTTAAAAC ACAAATTTAATTTAAATTGACTAAATCAAAGTTGACGTGGACTTTGGCGC AAAATTTATAGATTGGTGCATCACGTGAAAGTGATAATTTGGAATTTCTG GACTATTTTGCTCCAGATGGCAATCCAATACCATGTTTGAAGAAATGCAG GAACGATAATTTGTTATGAAGCTTCCAAGAAAAAAAAAGCTCTGTAAATT AAAGGACTCTAACTGCAGAAATGGCTTTTGGGGGCGCTATAAGGGCGATA TGTTGTGGCGTAAGAAGGGTGTGATTACCGTGATTACCAAAATTACTGCA ATTACCATTGCCTGAGGGGTACATTGTATACTTTCTCTTATTGTGGCGTT ATAAAGGGCGATATATTGTGGCGTAAGGGTGTGATTACAGTGATTACCAA AATTACTGTAATTACCATTGCCTGAGGGGTACATTGTATACATTGTCTTA TTATGGTGTGGCGCTATAAAGGGAGATATATTGTGGCGTAAGGGTGTGTG GCGCTATAAGAGCGATATGTTGTGGCGTAAGGGCGTGATTACCGTGATTA CCAAAATTACTGTAATTACCATTGCCTGAGGGGTACATTGTATATTTTAT 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GAGGACGTGGATCACTTCATTTTAATTAACTTTTTGCTACCTTTTCAAAG TCTATCTAATTGACTGGTGTCTGGCCTCCAGGTCGACTTTGACGTCGGAT GGTCAAAAATGCAACAAATTTCACAACATATCTTCTTTCTTTATTTCGTC TTGAAATTTTCTCTCATCTTTTTCTTTATTTTTCCAGCCACAAGTTTGTT TGCGAGATCTCGCAGAACGTGATGTACCAATATATTCTGTTGGTTGTCTG GTATTTCCTGACAGCAGGGATTATTATTTCCATCACATCATTCGTGCACT TGTTCTCTACGTACGTCCGCGCGGTCTTCTGGATGCATAACCCATCTAAT TGTCGTGAGACCATGCATGGAAAAATTCAATCCTTGCTCACACTTAGAGA AATCGAGTATTTGGACATCATCAAAACAACAAATATGGCGCTTTATGGGG ATGTGCTGAGAGAGCTGACCAAGGCACGACCTGATTTGTTCGCGCTCACT AAATACTTCGACAACGAATCTTCTTACATGGCAAGGAGGGTGTGAATAAG GAGACGTTTTGGATCTATCGACAACAATACACATTTTCTTATAAGGAGCC TTAATATGGCTCTAAGCCTGAAGTTCCTTATTTTTCCAGAGAATTTCAGC CTTAAAGTTCTTTATCTAGCTCCTTATTTACTTGGCTGCTAATATTGGAT TTACTAAGTATGTGACCTATGTTTACATAAAGATAAAAGAATCGGTGTAT TTCTTCTCAATACTTTACTTGCTTACGCATTCATCAGTTGATTAGAAATA ACAATGTATAACAATGGACTAAAAGACGTTTATTGAATGTTGTTCGTCAA TATTTTGTCATCTTTTTGTTTAGGCTTTGGTAAATGTGATCAGTTCACGG TTTTTTTCTNCGGATCTGTTTCCCCATTTTTCAAAAAAAGCTCTCTCCTG GAAAAGGGAAACAGAAATTTCAGGAAAATGGGCTCGTTGGCTGCCTCTGG AAGTAGATAGGGAAAGCCACATGTCATCATTCGTGACAAATGTAACATTA CTTGAATACGTGTATTAGTGAAGTATTTTTTGAAGTGTTTTTCAGTCCAC CATAGATTGTAAAATTGCCCCACAACGCCACTGTTCATAACGTCATTTTT TTAATTTAATTGCTAATTGCTCTTGATAGAATAAATTCAGAAACAACTTA TAAAGACAGTTTTTTGTTAAAAGTGTCAAGGAACGCAAAACAAATGTTTT ATCTCCAAATCTGCGTAACCGATCTTTTGACTATGGTCAGGACCGAACAT AACACTGATTGATTAGGATGTTCGGATGTTCAAACTCTCTCATTCGGGTA CATAGCTAGGGAGTCCTCGACAGTGATTTCAAAACTTATTCACAAATATC TCCACACGGCTTAGGGTAGAAAACATATAACTTTTCAAATTTTCGCGCAT CTGAAAATATCTTCTCCTCTTTAACGAGGGCATATACGGCGTATAGTTAC TATCAAAAAATTCAGGTACATATCGGATGGGTGAATTGACTTTTTAAGCA GCAATTTCAGCCGTTCTAGGGAGTAGATGAATGATTCTTGAGCAACGTTA GAACTAAAAACAAATGTAAAGTTTATTTTGATCAATACTTAAAATATGAG CTTGGCCATCCGACATTGAGCAAACACTCTAAACTTTACGAAAAATGTTT GTTTCAGGCTCGCCGGTTCAAAAATTTTACGATTTTATAAGAACAATGAG GCTCAAAATCTCAAAAAAATAAGAAAATTAAAGAACAATGTTGTGCCTGA AATCGCTCAATTTCAAGCAATTTAGGGGTAAAAGTAATAAAAATTGGGTA TAACGCCTAAAATACCTCAATTGCATCATGTAAATAAGAACAGGATAAGA 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TTACATGGCAAGGAGGGTGTGAATAAGGAGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011579TCONS_00011579Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011578TCONS_00011578Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011578-proteinTCONS_00011578-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000130supercontigsc0000130:313029..325409 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.99 0.59 0.34 0.3 0.92 0.61 8.77 8.41 4.4 2.89 2.41 3.77 1.02 0.9 1.06 1.19 2.17 3.47 0.64 0.44 3.75 3.6 4.36 5.73 11.11 8.35 1.57 2.41 0.67 0.46