XLOC_006364 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006364
Unique NameXLOC_006364
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000127:284465..306716+

Legend: gene
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ACACAAACCCTTTTTTAGAAGATGATGCATATTCTATTTGTTACTATTGA CTGTGTATTCGAAAAACGCTTCTATTTCAGTTATGCAATTTTCTTAACAA CCTTTTGTGGTGGAATTTTTTCCACCAAAGTAAAATAAGAAAGCAAGTGT ATGGCCTTGTGACAATAATATTCTTCCTCAATTCTCGAATCAAAAGATTT CCTTAGCAAAggattcaagatttttaaagcCGACTCGCATCCCTTATAAC AAAAAGCATAAGAGGAATGTTGTCAGCCTAATTTATTACAGCTCCACTTC ATAATGACTAATCACACTCCATGTACTAGACCCGTTGGGACCTCCACCCC CTCCCCTGGCTTCGACCAAAAAATCGTAGTCGGTAAAAATGGTAttcttg taaaatttttagtttaacCTTTTGATTTAACTAAAGCAGATATAACACTT TAATGTAAGATTGGTAGTATTCATCTAATTTGTAGGATAATAATCTTGCC ATTCCTTCTGTTCTGAGTCCAGTTCTAAATTGCTGCAATATTTTATTCAC GTGATCGTTTTCAAATAAAGATTCATCAAATGTTATCCGAATAGAGGACA ACCCGAAAAAACCATTTCATGATCGCAATGACTCACTGGAGATCGGGACT CATTGCACTTTTCCTcttcttcttcaaaattttagacCAATAGGAAGAGT CCATTGATCTCAATTACCCCTGATTCATTTCGACCATGCATTTGCCTATG GTCCCTATGCGAATACATAACAATCAAAAGCTAGAATAGTTTATCACCCC TGAAATTTATTCATATTAGCATCGACCCTTTAtttcaaggcaaattttga GCAATATAAGAAAATATAGTTCAAGGTTTGACTCTGTCGAATCGGATCAA GGGGTTTGAACTAACAGCATACCACGTAAGCAAATGCTTCTCTAACTACT AAAATAACACGTAGTAAAACACTGTCGGACAAGGTGACACAAGGCTTTTA TACTTAACAAGAAATTCACACAGATTAACCTCAACTGATCAACGACTAAT TAACATCAGCCAAAAGAAAAGCcaggtaaaatataaaatgtaaaatttat cCTAGATATCACTCCTATGGACCTGCAAACAGGgcctttattttatttaa ggCTACGATCTACTCTTCCTCTTAATTCGAATCGACCAAGATGAGGCTGT ATTAAGGGGATTTCAAattaaagaagtttattatttccTCCTATTTCATT CAGTGTCATAGGAGAGACTTCTTGCGCTAAATTTCACATTCTTACTGACC CGTTCAAAGATAACTCGGAAAGCCCAACTCCAAGACCTTGGCGACAACTT GAAACAGCGATTATAATTAGAAACATTTGAAGACAGTATTCGAATATTCA AGATGAGAAATTCACCAGTACCTGAAACTGTTGAACTGTTGTTAATCTCG TCGTTGAAGTTTACTTTTAACTCAGAGAGAATTATATAGACACTTTACTG GATACGCATGGAAGAAGCAAAACATGACatattgtttttttatatacGGA TAATTTTTTTACGGATAGGACTTATTACAAGGTGGAAAGAGTCTTTTATG ATAAATATATATAGTAGTTTTATTATTTCTTCAATATGAAGAAGATTTCG TTAATGTCaagacaaaaaaaacttttcatttccaTTCTAGAGGCTTTTTT GGGTTGAATCTTTGCagaaatacacccctgtgttacAGACCCGCTGGGTC CCCGgccctactggaaaatttggcaaaaatttctttttggtgggaaaaat accctataatTTCAGCCCTAcggagaaattgactttgatttcatccccat ttgaaattcattgtttagaaattgcactccaaaaacTGGATtatttaacc ttggaacaataaaatttttatccccattgagatttcaatcgaaattttta tatctgctgtaggaaaaagtttaatgagacaggggtgtaaaaattATATG GGAACTGGAACTAGAAGTGAAGGGCGATGTAGTCATCTTCAATACTAAAA TTATGGGTcttattatcatttttttctgaaactaTATACAATTATTATGA CAAAAGTATAACATGgaaattataataattataatttgTAAAATCATAAT GTTACATTTGAAGATTTAtgataaacaaaattttgtaaatacaaAATGCT TTATAATTCTAACCTCGAAATAATGTTGATTCTTTAAATGGAAATTAAAT GTCGTTTTAGAGATGTAGATAACCTTTTTAATAACAAGAGCAAAACACTC TATAAGTATGAAGAAATCACGTTCGATTTTGATAATCATTTGTAATACCC CCAAAATTGAATCTTAATTTGAAGCTGGTATGTAGTCTCAGTAAATATAA GAACTAGGAAATTTGCCTGAGACTTATTCATATTTTCGAGATATCAAATT TCAAACAactaaaaaactataaaaaatttaagaagaaaGCATCtacccaa aatttcaaaatatggtaATACTCTTAGGACATTCGTACCTTTTTATTCAA TCAAGCATGAGTATTCTTATAGAGTatgttcttatagataaaaagtaaat ttcttaaaaaaattcattgatCGTCTTTCTCTTGCTTACTACTGGTTAGC GGcgaattttgttgtttttgacagTCTAATTCATTGTTATTCGCTTCTTT ACGAAATGTTTCTGCTAAGATTTTAACAGCTTCTAGTAAGAAAGCGCTTG TACGACAATTAGCTTCTTTCTCTTCCCGCATTCGACCTTCTTCAATCTCA AGTCGTTTCTTTTCAATTTCGATCAaagttttcatttgtttatactGCAG TTGCAATAGATCCTGATTGAACATAAGGTGTGTTTGGGCGTTCTTAGCGT AATTATCAGCCGTTGGGGCGACACCGCCTCTATACAGTTGTATGTAATTA TGTCTGTAATGGTGTGGGGGTGGAGGTTGTGGTGGACCCTGTGGCGGAGT GTAATAATTACACGCGTGATTTCTAGACTCTCCCCCTTTGGTGGAAGGCT CACTTTGAAGGTTGATCATTTGTGCAGATGGGGGTGGCGGCGCCATGTTG TACTGTTCCAAAGGTGGTATGGGAAGGGCGGAAGGCGGCTCCATTTGTTC TTTATTGAAATCCTTCTCTTTAGTAGATTTACCACTTCTTGACGTGTATG GGGCGGGTTTAGTGCAACAACTTCCCGAGCAGGGTTCTCCGCGATGATGC ATCCGACTAAAGTTAGATGGAATGGAGGAAGCTGCATGATATGGGTTGCT TCCTCCATACTCGCTTTTCATTGCATAAGCAGGTATCTTGCGAGGTGGTG GGTGGCAGTTAGCCGAAGATGTAGTTGTTGGGGGATAGTACAGTTTGCCA TGATCTAGATCAGGGTGCTCGTTAAATTCTTCAGTCGAACGAACagatga ttttcttttatttgttgtGTTGATTTTTCGTTCTTCTTCCATTTCTTCAA CCCTCTCTTTCTCTTCCTCGTACGCTTTCTCGTTGTGCAGCTTGGGTGGG CTCATCGACTGTGAACCTGGACTATAGCTCTTAGAATCGCTCAAATTTGA CGTCACCATACCACCAGTCGAAGTCTCTTTGCGTGTCATGATCTTGTCAA CGATGTCAAAATACTCTGGTAAATCTTCCCATGATTTCTCGGATCGACGA CTATCGATAGTTTGTCTGTAAAACTGTAACAAGTTTTTCATACGGATTTG ACACTGCGCAGGCGTGCGAAATACTTCTCGTTCAGCCAATAAGTGAGCTA TTTCTTCCCACATTTCTTTGTTAACGCGAACACCCTTACTCTGCTTCCAC CATCGTGTTTGACAAATCTTGTCACGCCATATTTCAACAAGAGCTTCTGT TTCATCTTCACGCCATCTTGAACCAGCATTCTTTGTCACCGGTTCTCCGC CATTGCTatggctaccattttgattttcattactATCAGAAGGCATGACG TACACTAGATTCTCGTGCCCATTCCTCGGGTATTGATACGTTCCATTGTA ACACGTGTATGGTGATTTTGAATTCATGTTGGAGTCATCAATTGGGGATG ATTCATAGGACGGGTGCTGACGCAGCATAGATctgtaaaaaagtaaaaat gttcATAAGTTATGTATCAAGCCTTAGTGACCAGCATTCTTAATCCCTGT TT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011351TCONS_00011351Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011352TCONS_00011352Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011353TCONS_00011353Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000127supercontigsc0000127:284465..306716 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
9.61 8.76 3.55 3.22 3.54 2.89 6.8 6.91 6.64 6.79 4.55 4.57 5.07 5 4.55 4.93 10.31 9.68 3.87 4.45 19.49 19.04 18.35 18.53 10.1 10.28 6.26 4.96 11.45 10.89