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gene from alignment at sc0000127:284465..306716+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_006364 ID=XLOC_006364|Name=XLOC_006364|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=22252bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000127:284465..306716+ (Clytia hemisphaerica) ATAAGTAAGACACGGCTTGATTTCACTGACACTTTCGATAACCAAAATGC
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AGTACACTCCCTCGAAAAAAATAAGCCTTTATCAGAAACAAATTGAAGGt
acagttgaactcatgtaattcgaactccTATAATTCGAAAACTCACTTAA
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gaaatatgaagcTTTCCGTGACTTGGAGGATGGTATATCAATAAAGACGC
ATCCATCAAGtacaaatacaaaaaattgttcaaaaagtAAACCTGGGAAA
GACTTTTTTTATCGAATTAGGTCAAAAATACGAAAACTCATCTAGTTcga
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TGCAACCTGTTACCTGTCAACCTGTTACCTGTCAACCTGTAACCCTGTAA
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CGATCATTGCAGACAATAGTTTAGAAAGATATCTTTTATTATAACCCATG
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TTCTACCCagcttagcctggatatccagactgtaaactatttcaccgtct
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ctgcagggatatttgtCACTGCATATAATACGAGTGcatctaattggtca
gtacccGCCCAGTCACTGATCTGCATTTTTGCGggcttttttctattttt
ctatgtGCGCGCATGAAAAAGGCTGACTTggcagaaaaaggaaaaaaaat
caaaataaaaacacaggttcatttctaaacaaaatggctgatggaaagga
gcctttataaatAGTTTTGATGAAGATGAAGTTGGCTGATGTTTTTTCCT
GTAGTGTATAAactagttttgaaatatttatagtTTGTAAAAAAGGTTTT
ATATGTTGaggttttttctgaaattttgagtctggatacccaggctatac
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taataaataattatttatacAGAAGGgatgaaagataaaaaaaattagct
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GTTTGTCATTCTCTATATCATAATGCTTTTTGGACCTAGGCCTATTACTC
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aaaaaaaaagttgaactcatttcaacttttttcaacctttacgtcagatc
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GCTGTCccccaaaatatttgaaaatattcagctcttactttcttttgttt
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ttattttagtgatttagactttcattcgatgccctaatttttttaaactg
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AAGATTCTTGTACCATAATCTATTGTAGGGTTAAATTTTAATAAGTTTGG
TTAAATGTTTGGGCGAAATTGAAGCAatatttgaagtcaaaattctTTGT
AAACTTACTGCCAGAATTAATCAAACTCTAAAACTAGTACTCTTATTAAG
CTAGtgcaaaaacattattattttaATTATGAATTTTCGATGGATGTGCA
AAATCTCATGAAAAAGTCAAATTGTTTGGCTCATTTTGTGCTCTTATTTT
GGTTCCCGCACTTCCCAAAATTTCAATCCATAAATAATAAAAGGTCCATT
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ATTCTTTAGATCGATGCTGATGAATGTAAAATCACCAATTGTTTTCTGCC
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ATACAACCCATTGTTATTGGCCgtcattcttttcatttttgcttAATAAA
TGCCTCTTCTCTATCTATCTCCCCAGATCTTATTAGGATCCccttgtttt
taaattttcggcTTTCAAAGTAAAAGTCCCTTTTGTTACTCAAAATATCT
TAATTTTATTACTTCTTTTAACTTAATTTAGGGAATTTAAAAGTACACTT
TCCAACCCCCGGGTAATTAGGTCACCCCTCTTTATATTAGAATCTGAAAC
TATTGAATATTGTCGCGGGTGGGCCGCCACGGCTCAATAAGTAACTCCCG
ACAATAGTCCTCAACAGCAATATTTATATATTTGTCCCCGGATTAGTTCA
GGATCCCAAGCTATTATTGGAAGAGAACCGATTAGGTATTATAGGATTCA
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AATGAATAACCGTAAAATCCACGTGATAAAGTCTCAGTAATCAATTCAGT
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ACATTCGATTGATCGACTTCGACTACAGCAGTTATAATTACAGGTGATGT
ATATTAATTCAATATTGAAATAAACATGGCTTCTATGCCCCCTTCACTTA
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GGCCTTTAAATAAAGATCTTTAAGTTGTTCTTTTCCAACCGCTAAGAATG
TTATGGTGCTTGTTAGTTAGCAACATTGCTCTTTTAAATATTCCTGCTTC
ATCCAATAACTTTTAAGAATTTTCACCTCAGCTCTATAGTTTTAAGACCA
GGAGTCAGCTTGAAGACTTTTCAATTTTGTCTCTCCTATCAAGTTTCATA
TAAGAATAATTAGACTCTGTTGAGGAGCAAGCTCTGCTTCTCCGTTCACC
ACAAGCGATTGTGCGAAGCTAGCTTAGTGtttgagcactctggtgacaac
agcagtctatgcttgcttacccgagccgcactgataagtcctgggaagga
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CTCAGTATCTGGAATgttaatttctaattattttagAGGATTTGATATTG
GCAACCATTTCTCAGAGCATCTACATGAATACAGCGAAGATTTTCCTGAC
GGTGTTATTTGCACACAAGAGAATTATCCTACCCGAGAAGAACAGGTTTT
ACATTATAATAATTCTTTTGAATTCCCAACTTTTTTTAACTCTCATATTA
AATTCTTTCAACAAGTGACTGGCAACCACGAATGCTGAcgaatttcattt
ctttaacAAATAGATTTTGATATCGTGacttgcttttttataagaacagg
taGTAGGCTATGTCAAATACTTAACAAAACAAAGTGTGTACTAGGAAAGA
AGGACTGCAGGTATTACAACTGATAAGGGTATTTTTAGACTTTGATAACC
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gactgaaattcggTACTCTTGTtctttgggtgaatatctggtggAGTTTT
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TTATTTTTGGGCCCGATGGACTGTTAATATTATATCAAGAATATTTACAA
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CTTTATGACCTTATTactcaatttattttcaaaaatttatttcacaaAAA
TCTCTCGAGATAATATCTCAATAGTTACCTACTGTACTGTTTGCTTAGAT
TGATAGAtttgatattttacgtggatagcccagtaaccTAGGACTTtcag
acagtctttcgattgtctTCACGAGGTCCACGGCCTGCTGGCTCTGGTAT
CTTTCAACTGaatggaacattggaaggagcggggattcgaaccgtaAACC
CCTTGGTTGAGACGCTGACTCCCTAGACCACTTGGTCCTTCCTTGCTTAG
CTGATCAGGCCTGGACTGAGTGTAGTTTTCCAGGAAAATCTGTCCTTTGT
AATATTGGAGATGATTCAACATAGATTGAGTGTCGACTCGGATTTGatct
ttcaacctttttcaGAGATATTACTCAGGCAATGTTGaaaaactatttta
aaattaaatagaAGATCTAacaaatgtaacaaaaaattactttttcagGA
GAACTTTGCACGATCATATCTTGATACTATTCAACGTATGAGAGTGAAGG
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GGAAGTGTTGACGAATTACTCAACGAAGCTAACAGGTAAAATCAACAACG
TGGTTTGGGTTCTAGTATGTGAGGTCGGATGAGGTCAAGTCATTTCAATG
ACTTTAATTTGAATGTAAACTATATCTTCAGATTTTCACACAAGGGCTGG
TAATAGATGGTAAATATTATCGCCCTTAAAGGTGGCGTCCTGGGATTTTT
TAGGACGACGAGACGGATTTTTACAAACAGATTCAGAAATTAGATATTAG
ACTTCGATATCAAATCATTATTTTGACATTTATAATGATCAATAGCTTCT
TTTTTGATCCGGGAGGCTTTATTAACAAAACGCACCCATGAAACACTGAT
TTCATACATCTTATATTACACATTAGATAATATATCGTTTTAAAGACCTT
TTTAACCAGTGTGTTAAAAAAATCGCATCGTCGTTCAAGAGATAAGACGT
CAGGCTTAAACGCTTAATCACGACATTTTAAGGATTAACATTGCACTGAC
AAGAAGTCAGAAAAAATTGTCTAACTTGTTATGTTCATCTTTTCTAAAAT
TCCTTTTGTGAGTTAATACGAAATTATTGACTACTTAAGCAGGGGGAGAT
TTTATCGACGATCAAGTGTTGCTTCAAGTATATTTCAAATTCGTACTGTC
AATCATCACACGTGACTGCATGTCAAATTCGGACAAAAATGACAAtctaa
actttttaatttttcaaactctGTCGAATTTCATTTACTGGACCagataa
tttctaaaaaaagtaCTTTTGGTGTGGTTCCAATGTCCAAATAAAACCTC
TTACTCTTAATATTTATAATACATTGTCAAAtgtattgagattttttttg
ttgtttcgctatatttcaaaatttaaagttcagGCGAGAATGGAGATTTC
CACCTTATTTCATCGAGTTTttcgattttgtaaaatttacaCATAAATCA
CATAAGTCTTTACTCATTGTTTCATTTCTTTAGTCAGGTCCTTNTTTGTA
AAATTTATACATAAATCACATAAGTctttactcattttttcatttcttta
gtcAGGTCCTCTTTACTCTGTGTCGGACTTAAAGTTGTATAAGTTTGATA
AATTCTCCGCTCATTTTTTCAAACCACACCCtacttttttacgttttttt
gtccCATCATGAATCCTGTTTTCGGTCATATGGTAGATGcaagaaaagga
aaattttagtaTCAATATCCTTTGAGTTGGACGGAAAGAATAAGATATAT
AAGTCAACCAGAAGGGTTTTACAGTTTAATCTCTAAAAACTCGACCAATT
TTAATTCCCTGTAATGCCGATCCATGAAAATATGGTaatagatttcgatt
ttcattgattttgttatttttctgtatcaatatttttgttatttttccct
ttttggacctaccccagtGGGTGGATTCCGTCCGTCTGAtgcaagctttt
ctcgggattggctcattcgatttttaatgaaattttggacatgcaaaatg
gcaatacctaaaatgtgacagagcccgattttcaataaacatacttttcc
tgtcgaaaatgccggatatatgccggaaaaaccgtttgtGTGGCATTTTC
TCGGgatttcattagtttttttctgattttctgcacaaagatgcgtatta
gtaATGTCCataacatggccgagtccgattttttagaaacatttatttCC
GGCCgcaaatgccggaaatatgtcgTTTCTTATTTTACTTCCTTTTCCAT
TTCCATTCTATATTTTTCATTAGATATGTCCAATATGCATTGTGCTTGTT
TTTGATAAACTAAATTTACTTCCACGGAAAATCtttttaggaaataattt
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AAAATCCGTATTGAaaacccaatggggatagaaatcctattgttccaagg
ttaaaataTCCACTGGGGATGGTTTCGGAGTGAAATTTTTAAGCACTAAA
TTAGGAATGGAGATGAAACCAAAATCAATCTCTGAgaatgaaatttcagg
gtattttccaacCGGGGACAAAATCTTTGCCAAATTTGCCTGTGGGGCTA
GggcccagcgggtctgtgacacagaagTATCTTTTTCGTTTGCAAATGAT
AGACTATGATATGTTTGTTGAATAAACTAATGCAAGCTCTCTCTTACGCT
TTCCGGTACATCCAGTCTACCCTCTGCATATCTTACGCTTTCCGGTACAT
CCAGTTTTCCCTCTGCATACCTATAATTAATGCCCCCCTTAATATGTCCA
AATACACCCCTAGCTCCTGAAATATtgccaatacacgtttttttttttat
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNtcagcctgagcagttccttaacaattccttattt
tttgaaccattttcagcctcgagttccttataaacgtgttccttataaaa
aaacaacgtgtaattGATTTTCCAGCTAGCAGGTAGCGTGAAGCTAACTT
CCATATAGCACTATTATACAACGTGAGCTCatagaaattgatttaaataA
CTTTGTGTACCGGTTGAAAGGTTTCAAATCCATTTATTTAACACAGTATT
TATCAAGCTTACGAATTTTAGCCATTAAGGAAAAAGGCTCAACTATGTTT
CAATCTTAGACAAGAGCTAGCATTAGTTAATATAGGAAATGTCATACATA
TCTTCATACTTTTTCCGGAACGACCCTTCATATAAGCTATAGATGATTTA
TACTTCTAAATCCATTTGTATCTTTATACCTTAAGCTTCTTCTCTTAAAA
CTTTTAGAACTTTGTAAACAtatctcattttttttttttctgtagcAAGT
GTTTGATTTTAAACTTTGATGACTGATAATCAGGGTCTTTAATTCTACCT
TTTTTCTGTCACTTATAGTTTTAGAATCTTTTAAATCTCTTTCATGATGT
ATGTACTTTTTTGTGCGATTTTCATTGCTTGACAGtcaaactacacgttt
tttataaggaacacgtttacaaggaacttgaggctgaaaatggtccaaaa
ttGACACAGTTTCGCGATCCCGAAGAAAAAGCTTTGATCAAGATTTTTGA
TCATgcggtagcactactcaattTTGAACggaaaatttaattgaaacact
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ATTTTTCTAAATACTCAGATTAAAGATGGGCTTAACTCATTCCGCATGTG
AGGGAAATCGGGTACCGCCACTAGATCTAGGActcaaaaaaaatacaatg
tttCTTCTGTATAGTTCGATTACTGTTATTTTACACTTCCCCACAATGCA
CCGCGAGCAAAAAGCAAAAGAGACTTTCGTGTGTTATCATTTTCCTTTCT
TTAGGGGAGGGCGTGAGAGATTATCGATGAATCGGCACTGGCGTTATTTT
AGATCGGTTAATCGGTACTGAGGGTAAATTGATCGGTAATCTGTATTTCA
AGAGCCTATCAGTATCGGTACAAAAAAACCATGTTCTTTTCATGATAGAT
ATTTTCAATAAAGATTTAATCTGAAAAATATCCGCTCGTTCGCTGCTCCC
ATATCATCTTTATCCCCTTTTCAGAAGTTCTAAACTCCcgcttgaaattc
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TT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000127 | supercontig | sc0000127:284465..306716 + |
|