XLOC_005912 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_005912
Unique NameXLOC_005912
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000107:138740..166400-

Legend: gene
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>XLOC_005912 ID=XLOC_005912|Name=XLOC_005912|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=27661bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107:138740..166400- (Clytia hemisphaerica)
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TACAGATTCTTGAACATAGAAATTGTGCATTGGGGCATGCACTTTAGACA AAGTATCGAAGCTTTTTAAAGTAAATCGACAATAGTCACAATAGTGTGTG CTAAAAAGTTGTTTTACATGCGGCTCTTCGGAAAAGGGATTTTTTAATTT GAGGTCAAACTTCTTGAATATGAGAACTCATTCGTGTTCTTATAACAAAA ACTATAAAAAGAACAACAGAGGGAGAAACCCTATTGGTAACTTTTAAGGT TACCATAGCAATACCATTTCATTGACGATTGAGTTAAGCTTTCCTTCAAT CTTAACTTGCATAAATTACATTGTTGAATAGCTTTTTTCAAATTATGGAA GTTGGTTATGATTATCTCTCTCTACTTTATTTCTCATATTTAGTTTCTTG TATTCTTTGCTCGAAGACACATTTAAAGAGCTTCATTCTTAACTCTGAAT ACGTGTCGAATGTGTCTGGAGACAGGCTTGTTAAATTTTACGGATTTCCT ATTAGAAACATTTTGAGAGTCGTAGCTTATCGAAGTTTTGCGTTTAGTAC TTTAGCTCTAGTTACTGTTAGTATAATAGCATTCTATCAGTAATAACAGC AAGTTAGTTTTACTTTAGGTGTACAAACTTTCGCGAGCAGAAACTTTCGC GATTTTCGCGAATTCCGGCTCTTTTCGCGAACAGTAAATGTCTTTAAAAA TTCTAGGAAGGGTCATTCGCGAAAGTTTATGTCCGCGAAAAATTCTTGAC AAAATAGAAAATCTGTTAAACTTCAAACTTTGATTAAAATGTAGCTTTTA TGGCTTTTTTTAGCCTGCTAAAAGACTAACTAGCTGGGCCAATATGTAAG TCAAAGGATAAATGTTTCAAGCCAAACCTAGAACTATTTGTCCTTCTAAG CTATTTTTTCATGTGAAAATTCTCAATTTTACGTCTTGATTCGCGAAAGT TTATGCTCGCGAAAAATATCTTTCCGTTAAATTCGCAAAAGTAAATGTCG TGAATTTCGCGATTTTTCTTCCTCGTGAAAGTTTCTGTTCGCGAAAGTTT GTACGCCTGAAGTAATTGAAGATTTCTGGCATTTTTTATTAAGAACTCTA GTAGGTTTGTGTAAATAAAACTCTGGGGGGGGGCAGCTGGGCAAAAGGAC CGACGGGTATGTGCGGGTCCTAAGGGTACCTTTTCCAATATGTTTAAAAA AATGTCGGAAAAACTAAAGATGCACTGTAAGGGTAGAAATCTCAGAAAAT TCTTGAAAAATCGAGATATTTTGCCCAAAAATGCTAGAATTTTGACCATT TTTTGCACGAAAGGGATCGAAAATTTGGGGGAAAATGCACTCTAAGGGTA TGATTTTCACTGATTTTTTGCTGCACTGTAAGGGTGCAATTTTAAAAGCC AATTTTTGGCCCGCACATACCGTCAGTCTGCAAACCCAGTGCCCCCCGGG ATAAAACTGAACTTTTTTATATTTGTCACAAATATTTATTTTAAAATAGA ATATTGAAATATTAAACTACAGTTATTAAAACAAAGAAACTTTGATTTTC TCCATAATGTATCCATAACTTCATATAAACTTTTTTTTTTCAGGAGGAAT ATGTACGCCGCCAAAACATCCAGATGGCGGCCAGGATTGTCCAGGAGNCT TTTTTTCTTCAGGAGGAATATGTACGCCGCCAAAACATCCAGATGGCGGC CAGGATTGTCCAGGAGATGGTCAGGGGTGTAAGCACGCCACCGAGGAGCC CGTCTCCACCACCCCTATTAACGGTAATGTTCAAAATCATTGTAATTTTA ATCAGTTTTTGGAAATCCATGGCGAAAAACCTCTGTTATATTCACTTTTT GAACCAAATGCAACCGTACAGTGTTGAATATGGTAGAAGATCGACTGAAA TCGTCAGCTCAAATCGTTGATTATTAAAAAATTCGTTGTATTGATGTCAA ATCAAGCATTGTACATTCTCGTACTCAGTATAGTATCGGCTTTTCACTGA AAGAAGGAATTTCAGCAAAAGATTTGGGAATAACCCCGACCCTAGCGTTA GAAAATGATAGCTTTTGATGTTAAGCCCTCTATTCTCGAAATGCAAAATA GAAAAACTATTGTCTAGACTAGAATTTCACCAATTTTTACTCCTTAGGAA GAAGAAGAATTCAATGAGAGAAATCTGAACGTAAGATATTTAAACTTTTG TAAAATTTTTACAATTGCATTTATTCATACTTGATTTTTGACTCAAATAT TCCACGTCATGGCTTTCTATTTTGTCCCATATGAGACCACCCATAAAAAA GCACTCGAGATATTTTCACTGTTGATTGCCCTAAGATCTCTTCGAATTGT TGTGAATGTCAGTGCAATGTGCAAAACAACAACATAGAGTTGTGGTGACT CGACAACATCCTCTCCTTCCATTGTTGTGGTCTTGTACCTTTTTCACACA ATCAACGAAACATGTGCAAAGATTAACTGATTGTTTTCCTAACAAAAGCA CCTTCAATGAACACGCTTACTAGTCTCGAATTTTTCCATATTTTTGAGGT TTTTTCTTCCGGTGCAGTGATTCCTGACTTTAGGTTAGAGCCTATTTTCA CTAGTGAAGGGTCTTATCTTGTCTGTTCTTCTAACCAATGATATATGCTA CAAAGCTAACACGAGCCTTTATTTCTAGAATACTTATACCCCTGCTTCTT ACCCCTGTTTCCCATTTTAGTTACATTACAACAAGTCGGCTGCTGAAGAC ATGAAGAAGTTCTTCGTTGAACTCAATCCCCGTGAGAATTGGGATCTTTC CATCATGACCATGCTCAAAGTATGTTTTTGTTTTTGACGTACCTTCCTCC CTACCCTCCTCATCTCTATTCTTTGACTGTGTTTTGCGTCTCACTTTGAC GAAAGCTTAATAAGCCTCTATATGGTTTGAGGCCGGGTAACTCGGTAGAG CGTACACCTTTCAACCCAAAAAGTTGTGGGTTTGATTCCCGGTCACCGTC AACTCGGCGAATGAGTAGTTTGGATTGGGTAATCTGATATCTAGGTGGTG AGTTACTGGGATCTGAGAGTAGGTGTAGCGCTCCACCTCAGCATTTGATC TCCCAGGGCTAGCGCAAACAGAAAAAGGAGATAGACTGCCTCACTTCCAG CTCTTCCGACAACCAATATTTCCTTACTTATATGGTTTGATTAGATCTTG TTTCTCCCGGCGACTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATACATTCA TTCTAAGAATATCGAGAACCTTGAGGAAGCGGATGTTATAAATGACGGCG AAGAAGAGAAGGATGTAGAAGAGACAAAAGAAGAAGCACTAAACCGTTTA AACAAAGAGCTGGTTTCATTTAACCATCCTGTACGCAAACCTGCTCATCG AAATACCTATGATAAGTGGTAAGCTCAACTATGAAGTTTAAACAATTCTG AAAGGGCTAGATAGGAATCTTCAATCTTTCACAGACGTAAGAAAATTGTG AAGCTCTAAGATTAGCACCATAAAGCTTTTTTTAAGCTCGATGAGATCTA CTCTACGAAGCGAGGGGATGTGCCGATAAGGCAAGTTTCGAAATAATGAC TCGTGAGAGTAGAAAATAAATTTATCGTTATCGTATTCTGTTACCCTCAA AAAGCACAAATTTGGCGTAAAAGCTATCAATTGCAAGAAACACTATTAGA TCTATCAGGGTGCTAGCCTTCTGCGATGACTCTCTTTTTCTCTTTCTTTG TATGCTCTTTAATTCTTCCAACATTCACATTAAATTATATACTGCGTGAA GCATTTTGGAGTATTCTAGACTTTGTTATGGTCGAGAAGGAAAAGGAATG GGATTTATTCATTGTTCAATTTGACATTTTTATCTTACTAGCTATAAGGT GATCTGTGAAGCAGTCGACAGATTCGTGTTACAGACCATGACCTCAAGAC ACCAACTTGGAATGCCTGAAAAAGAAATATACGTCAAACAAGAAAGTATG CTTTTAACCGAGTCACTTCTTGAAGCAAACCAAAATGGATTCTTTTTTTT TTGAAGTTTTGGTCTGGAAGTCTTCGAGTTAGTAGGGGAAGGAATTTGTA ATAGTAATGATATGACATTGAAATTGTGGGCAAATAATAAGGATCTCTCC TTGAAAGAGGTAAAAAAGAAGGACATCTTAGCTTAATTTCGTGAAATTAG GGATTAATACCCCGACTTCAAACTCTCAAGACTTGTTTTCATTTTTTCAG TACCCGTGCACAGAGGGAAAAGCAGAAAAGTAGTGGATACACAGAAGAAT ACACGTAACGATGCCAAGAGTCCAAACAAAAAGAAAGAGGACGCTGGAAA AGCCAGAACACCCAATGCTAAAGAGAAAAAACAAGGTAAAGTGGGAGCAA TTCTCCAGTGTATGATCTCATTTGATATCGGAAAATATTCTCTCTGTGGT TTGTTAAATTTTAAAAGTTTCTATAAAGGTCGATTTTCGAACTATGATCT AGACATAATTCTCATCTCGCAAACTTAATTCCCTCCTTCTCGATACTACA CTTCTAAGCCTTGGAGAATTTCTTTTACACATTATTTATGAATGATTGTC TCATTTCAGCTGAGCCACTTCTAATTGCCAAAGAAGAATCAGCAGTGATA CAAGAAACTAAAGACAATACGGTGAAGATTGATATTTTCTTCTTAACTTT CTACATTGCCAGAGAAGCTTCATTAACATGATATGTAAAATTGTTAGTAG GATAATGTTACTATCAAACAGCGGACTTTCGCTAATTCGATTTTCTATTA TTCGAACTATTTCTCGGTTCCTGTCAAGGGGAAACCCTCGTAAAATACTT TCTATAATTTGAACAAATTAGACTCCCCGCTCGAGTCCGAATTAATTAAA ACTGTAATTTGCCCATTTTTAAGAATGCTTGTTTAAATTGTGTGAAGTAG ATATCTGTTCTTTCAAAAATAAATTCAACCTCTGGATATTGTAGTATTGT CCTTTTCAGACGCTCTGTTGAATTGTTATCAACCCGACAATTATTTCCTT TTGCTTCTCATCGGCTTTTTCAATTACCATTTACACATGAAACAAGAATC TTTCAATTTTTGGTTTCTCTCTCTCTCTTTATTATAGAACACAGCGGCAT TTGTTGTTAATGAGACTCAACATGCTAATTATAATAAATATATGGACAAA ATGTACAGCCAGGTAAGATCATTATATGTGAATGTGTCTGTTGACAAAAC TGATAATGGGAGGACGTCCAAATAAGAGGTTACTTCTCTGAACTGTTGTT CTCGTTCTCAATGAGGATAAGATTTTAGATCCCAAGAAAATTTATTATTT TATATTTGGCCTTCATCTTGTGAAGTTATGTAACAGAGAGACCACTATTA ATTTCTGAGCATTAAAATAATGGCTTTTTTTGTTTACGTTCCACTTTATG CCTTCTTCTCTTTACCTTGTTTTGTTTGTGAGAGATTTCTAAATATAAGC AACAGTTTAATAAAGTGTTTACTCTCTGTTGCTATACTGTATTTATTAAG CCCAAACTACATTAGCAGCTAGTTAGTGTTTTGTATGTTTTATTTGTTTG ATGTTTGTTATCCAAGCTAGTAGATCAATGTGAAACATTGTAGAACTGTC ATGGTTTACAAAATGACTATTCTTGTATGTTCTGAATGTTATCAATACTT ATTGAATAAGGTTGCTGGTTTGTTTTTTTTCAATTGTTAGGTGTACAGTT GTCTGCAGGACTTGGCAGATGACATTGAAGCAATATTTGCGTTGCAAGAA TGACTCCAAAGTTACATTCTGCTGACTCATTCACCTTCAAAGATAAGGGT TTGTACATACAAAGAGGAATTTTGCTAATTATTTTTATTTCTGTTCCCAT AAGATTGTCTTTAATTTATTTTTAACTATAGCTTATTTTTGTATATGGTT TGATTAATATATATTGGGTGTGTTATACTGTATAAAATGCTTAGATAATT TATTATAGTATTAAGAAAAAAAGTAATGACAGAAGTTAGAGAATTAAAAT ACTCCTTTACAGCCTAGTTTGTTTTACAATTTGCAGCGGTCGAAATTAAG TCCAAGTAAGCTGGGATCCTATATTTACTATCAACACTCATTTGTTTCGA GCTATCAAGTTTCGAAACTTTTGATTTTATAGAAAGCATCTTTAAATAAC TTGATTATATAGTTTGACAGCGCGATAATCTATGATATAGGCGAAGCTGT TTACTTGCTGGATGTAAATGCAATTTATATAAGGTTTGAATGATGTTTTT GTTATCTTTCTTTTATTAGATTAAATTAATAACTATACCGTTTCTTGTTT GACCTTGCTTTCTATGATGTAAGACAGCAGAAAAAAGGATTGAAAGGTCA ACAGCCAATCGAACGTGTTTTGATGATTGACTCGGTTTGGTTATTATAAA TTGTGTGGAGAACATACTACAGACTTTTGAAGGTACACATCTAAACTTCG TATAAATTGAAAACAGGATTCAGTCAATTTTAAAACAAGATTAAAGCTTT GGCCAACTTTGGAGAATCAAAGTATTTAACCATGTTCAAGAGCAAATCAA CATTGGTCCATTTTGTAATTATTTTGATATGTTTGGTGTTATACTATCTA AATAAACCTTTACCGAATTTATCGCCACAAGTGAGAGATTGGTTTAACAA GGGACAAATCTTCAAATATAATGATACTTTTGATATCTTTTATTATGATA GTGGAGTTAATACTGAAAATAAGGATGGTCCTATTTTATTGGTTATTCAT GGATTCCCAGCTAATTCATTCATCTGGCGTGACTTAGTTCCTGAGTTCAA AACTAAATTCTCTCGAGTTGTTATCCCCGATTTAATGGGATTGGGTTTCA GTGATAAACCGATCGGATATCGGTACACAATGATGGAACAATCACGGATG CTGGTGCAATTGTTGACACAGTTGAATTTGACCGATATCCATGTTGTTGC ACATGATTATGGAGTCAGTATAGGTCAAGAATTGATACACCAAGTGAACC AGGGTTCACCAGAAATCATGGTCAAAAGTATTTGTTTTTTGAACGGTGGT TTAGTACCATCTCGTCATAACATTCTTTTCATACAGAAACTTTTCTCCTC GCCAACCTTCAAAAAGATTATGCCTTACCTGTTAACATACCCTATCTACA AGAACCGCTTGTCAAGTATATTTGGACCACACACACGTCCGTCCGACACC CAACTCGAAGATATTTGGGCCATTATGCTACACAAAAACGGACATATTGC TATACCTGATATTTTCACATATCTCTTTGAGCGAAAAGCAAACGAGATGA GATGGTTAAGTGCTTTACAAGAAACCAAAGTCCCAGTGCATTTAGTGTAC GGGCCTGAAGACCCAGTTAATACACCTGATGGTTTTCTGAAAACATACAA AGAGTTGATACCGAATTCTTCGGTCACCGTTTTAGATAATGTCGGACATT ATCCTCAAGTGGAGGACCCTGACGGTTTTATTGCATCCTATATGCGATTT TTAAAGAAAGTAAGGATGTAAGAATTTAGGTGTTGTTTTTTTTATATTTT ATATTATTTTAGCACCAGACAGTTTTAAGCCGATGCTAATGGGCAGATAA TCAATCTTTTTTTTGTAAAATGAATCGAAATGTTTCGATTATCTGCTTTG TACATAATTTTAGATGGACGCATGAGTGGCGTAAGTAGGGTTTTTGTTTG AAATGTTTTTGAATCGAAGTCCAAATGAAGGCATTCCTACCTTTATCATA GTTCGTATGAAAAAATATGATCTGGAAGTCTATCTGTCAAGAATATGTTC AAATAAGCCGATCATCGGTTCTTTAGATGATATTATTTTGGATACTAGAC CTTTTCATAAATTACTTTACGAACATCACTTGCTTCGTTTTGAAATTATT GATTAAATCCCAGCGGATTTTATTAAAACAACTTCCTATTCATAAAAAAA ATCAGTCTCTAGAGACATAATAACCATGGTAATTGTTTGAATACGAGGCT AGTGATGTTTGTGACGTAATTTATGAAAAGGTCTATTTAGTGTGGAATGT GTGTGCCGAACTTGACTCTGGCTTCTGAGATTTCCAAGATTCATTAAAGC GCATGTGTAAGAGCAGAGATTTTCACCACAGCCTGTATAACAGACTGTCG GCTCTTTAGACGATTTCAAACCAAACATTATCCCGATTCTTCATATCTTT TTCTTCGAAGTTGAAATTAACGAAATCTTGTCGGAAAATGCTCTTTTGAC TTAAGGAAATTAAATTCAAGAAGAAAAAACGTTTGTTTTCCTTTAATCGC ATTTTCTTGTTTTAATATAGGCTTAGGATCCCATAAATTATCTATTCAAA AACCGATGGTCGCATAATTTGAACAACATCGTAGACTGTCCTGACCCGTT CTTCCTTATTAAGATTTCATTATAAATATAGATCATTATAGATCGATCAG AGCTCTCCCTATACTTTCGTCGAATTCTTCAATAGATTTTTTTTACGTTT TTACGAATCATGTTGTATAATTTGAGAAAAGAAAAACTTTTGACACATTT TTTACTCGCTTTGAAATTCTCTGTCTAACACCCCCCTGACTAAAAGTAAA ATGCTCCCCAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00010546TCONS_00010546Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010545TCONS_00010545Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010544TCONS_00010544Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010543TCONS_00010543Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00010543-proteinTCONS_00010543-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107supercontigsc0000107:138740..166400 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
21.32 18.76 34.57 36.3 115.53 87.83 52.95 55.06 41.66 39.04 23.22 29.43 7.36 6.69 4.81 5.84 12.78 12.47 6.92 9.62 10.1 10.24 14.56 14.53 57.4 44.37 10.58 8.85 10.07 10.88