XLOC_004797 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004797
Unique NameXLOC_004797
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000086:768726..798618+

Legend: gene
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>XLOC_004797 ID=XLOC_004797|Name=XLOC_004797|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=29893bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086:768726..798618+ (Clytia hemisphaerica)
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TGACGTAGCCTACACAAGACGCCAGATCCAGGTTTTCGGGTTccaaacat tcaattttttgacgtcactttcgAAGTCCTTGCTGTATGGACGTCGAAAA AACCTTGTATGCCATCTGGTCTTAGATCAGCGGGTGATGTAATGAACTGG TTTGAATCTTCAAATGGACCAAGGCCGTTATTGGTCTTCTAGGCTGATGA CAAgcgtttatttttttttaatttcaacattCATTTGAAATTCTTCTTTT ATGTGTGGCTTTGATGGTTTTTAAATCAGTCAACTTAATTTTCCCGCTCG AGGTGTCTGTCTGTCGGACcgcaagaattttttttatctataaagATTAA GCAATTAAAATTGGGAAATATTTCGTTTCTTGGAGGTCTTGTAATTTTTC TTGACGTAAAAGCTTAATCTCTAGGAACTCTCTGCACGTTTTAATAAAAA GCAACCTTGTCTTTGCCATCCAAAACAGTTGAACTCGCGCTGCTGCTTAC ATATGTGGAACATGGTAACTATAGTTTCAAGACATGAGTTTAGGAAAAGA TGTTGCAATTTTATTCTTTCATGTTTTAGTACCCACGAAGACTTCACCAA GCAAGGCTGCCATAACGTATGCAGAATCACGTAAAGTGGAATTCGACTCG TTCGAAAGTGGTTTCCAATACAAACCTAAAAGAGATGTCGGTAAGTGTTC GACGCAGCTACTTATTTGAATCAGTGTTAAAGGTTCTTCCCTTTAAGATA GATTTCCGACTCAGTGAAGTATATAGAGAGGCTTCCCCGTCTCCAACttc tgcataattcaccagAATTTCATGAATATCTGCTAATCTagtataaaatc aattttccatcTTAGATAGTGGTTTAGGCGATCATGAAGATCTATTGAAA AACTACTGCATATCTCTTTttaatgatgacatcatcatgCCTTTTACAAG ACATCGGACAAAATAATTTATCGCGGAATGAGAATGATGGTTCTTGGAAT TCTTGTTAGAATCCAACTTCGTCAAAGTCCAGAATAAAGAACATTTCCAA GGGCTCTTATCCAGGATGAACTAAATGATCATCAGCAGATATGTATAAAA CAGTTTCCAATCTGTTATTTATTTAGCGGCGGAAATAGCGGCCGAGCTTG CACGCTTAAAAGAAGAGGAAGATGAAGCACAGCGTCAATTCGATCGCACT CAAGCGGAGAAGAGAGGAGGAGCACAACAATACGAAGGTGGAGTGCAGGA TGAAGAGGGAGAGAGACATGTGGAGGAGTGCATTCcatctgaagaagaag aagaggtgGAAGAAGGACACGtggtaagaacaatttcatcAGAACATTAT GCtgacatttttgtcaaaaacctaagaacatattaagaacaatttcatcA GAATGTAAAGTTTATTTGTCGAAATGTAAGAAGAATTTCATCACAATATG AGGTTAATTTTTCGAAACccaaaaacaaattcaaagaaCAATCTTTAGTC TCAAATTCCATAAAGTAAAAAATCTAAAGCTTATTTTAAGAACTTTAACA TCTTTAATCAATACACTCTCCTCATGATAcatgaaattttgatgatttat aAACTTTTATTTGACCAGTCTATGTCTTTCTGCTTACAGCCCGTCGATGA CTATTTCTAcgaattggaaaattttgtgagtattttaaATTAGATGGTAT TTATCATAATGTATTTAAAAGCAAAGTGTTTGTTTCAATAAATGACCCTC TGCATTGACATCCCCCGTAAACGAAACCCTATTTCTATTTAAAATTTGAT GTAATAGTCCCAATAGTTAAAGACCCTTTTTCTGAGATTGAAATTCACAA TTTGTGCTAGTGTTCTTCCGTCCCTGCGAAGTACCGAAAGCGTCGTTTCC 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ATAAAGATTTGAATTACATAGTAATTTAAATCGCTTTTCAGCTGAGGGCC CTCAATCTCttagtttgaattacagaaagtttCGAATGATTGAAGTTCGG ATTATAGAGAATTGACTGAGAATCTACGACCTAAGAATCGAACCAGGAAT CTCTTGCACCTTTTGACTTCGCATATGGCTatcgtgacgtcataatttct tATTCTCATTTTCCAGTGTTCACGACGAAGAGCATGTGCAAACAGTGCTC CAACAACAAACATCTTTCAATCAGAAGAACACCACTGTTGGTAATGTTGT TGGATGGGTCAAAGGATTCAAATCTAAGGTTAGTATTTCCCGGTTGTACT TTTTATCCTCTGACATTTTGCTGTAAAGAGTGATCTCTATTTGTTCCTTC CCTGTATGTGTAGAACAAAAATCATCAATCATTCTCGAAAGTCCTTTTAA GTGAGTAAGTCTTTCAATCGCAGTCGGGGGCGTCCCGAAGGCTCTtcttc tttcgatagctatctaccggAAGGTAGGGGATGGCGCCACTTTTCCTCCC TGAATCGCTCCACTAACCCTTCTTATTTATTGCTGAGCATtgagcagaga ggcatcaagtaccattttggaaatcctTGGTATGACCCGGCAGGGCCATA AAACGGCCGCTAAAGTCCTTCTTTTACTTCACTCCTCTTATCTTCCGTAG TCGTAGACCTTTTATAGCTAATCCACAGGAGACTTTCTAAAGTCACCTTA AAATAAGCCCTTTTAAGGGATTGAAATTTCACAAACAGAGCCAGAAAGTA ACCTGCGAAGATCGATGAAAACTATATTACAATCAAACGAATCTTATTTT GTGAACTTCTCAACGGGCAAGCTATAatagaaatgaaataaaattaataa aatggTGAGCGCAGAACTGAGCGCTATCATCTCATATATATGTAATCCTG AAGAAATGTATATTAAGTCGAAATTGTTGAATAATTTGAAGTTTGGGACC AAGATGTTCATGGTAAATAAAATTGGGAACcgaaaagaaaagtgaaaatg gAAAATTAAGTAGACCTCCTTTTTTGTACCTTTAAAAAAAGTATGTAATA TGTTTTTGATTTATTCTGTTTgagtttcgatttttttcctcttcattttt tctattgttttgttttttcacgTTTAGTTTTGGTGATTTGTTGATTATGG TTTAATAAATGGACCGAAAGTGTTGGATGAGTTTTTCGTTGGAGAAGAAA TCCTCAATCTTGGTGATTGGAGGAAAATGGTGTTCCCTGAATATAATGGA GGTCATTCTTTTATCAACGGGTGACCGATTGAAAAACATGACTAGAGTTT TTGAAATAGGCTTTCTTCTTATTTGCAAGCTATTGTTATGACCTTGGTTT TTTATTGGCTCGTGGTCCTAAGCTTGATTAAGCTGGTcttaaatttacta attttcaagatgtttaTCTGgcagggtcgacttttggtaaTTGTTGACAa atttcagggtggaaattagaaacttttcaattttttgtctaTTGTTAGTC ATTTtggccacttttcagggtgaaaatgggaaaatgtttcattttttttg acagggtcccaaatttatgAGATATTCATATCTGACATGGTCTATTTTTT CAAACTCAAGCGGCACGTCCCTGTCGGCCggcaaggtcagtgccccctcC CCCTCCGGGTCTCTCCCTAATCAATATTTTAAGTGGGAGAATGGATGACC TCTCAGTGAATGCATGTTGAGTGGTTGTCATATTGCTAAGCTTTGTGTAA TAGATGTGTTTCATTTTGGATGTGGGTGCAATACACCATCATTGAAGATC aagtttatttttggaaaatacgaagtttaatttcgcgaactggtaaagaa cattttagacTTATTTATGGCCTTTTCACGATAGAAGAAGGCCGATAAAG ATTGGTTGTTTTGGATAAAATGtagttttctttatttcttaagATATCTA AATACCtagataatgtttttttattttcttttctttctttaaaggttttg tttttaaataagagtgatatcgtttgcttactcatcaattttaatttaca agttttttatacTGAATTGACACGGacgtggagcaagattgattagaaag agggaaagaaaaacatttttttgcttatatccgCACAATNgcaatgtcca gggggtaaattgcaatgtccaggggtaattttttgtgtccacggggttga tttgatgtttgtccaggggtataacccgtgtccagggggttaaaaatgaa aatgtccaggggtaattcatgaaaaaaataatatatcctccac
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00008571TCONS_00008571Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00008574TCONS_00008574Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00008576TCONS_00008576Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008570-proteinTCONS_00008570-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086supercontigsc0000086:768726..798618 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
EHBP1PREDICTED: EH domain-binding protein 1 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
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4.78 4.75 2.5 1.98 27.18 19.75 23.07 23.83 13.95 21.98 14.42 12.84 16.76 19.09 15.08 16.19 50.47 62.61 22.46 25.81 27.2 27.78 21.67 27.5 39.19 19.31 25.75 19.23 16.65 18.11