XLOC_003885 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003885
Unique NameXLOC_003885
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000072:486625..495673-

Legend: gene
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>XLOC_003885 ID=XLOC_003885|Name=XLOC_003885|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9049bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072:486625..495673- (Clytia hemisphaerica)
CTTTCTTGGGCTGTCTGCTGTTGGGTCAAGATCAATCCTTCTTTGTGCCC ATCATTGTCTGACACGTTGATTGGAGTAGTAAGAAATTTTTAATCTTTTA TTTTAGTAAGAACTTTGTTTTATGATTGCTGAATGATTCTAAATTTAACT TTCAAAGAACGGTTGGTAAAGTTTGCTTTTTTGATGATGCATGGACTGAT CATTTTTTTGACTACGAAGCTTTCAAAAACGTTTCNGCTCAAAAAACCAA CTTTCCCTAAGGGAACGCAGGCAAAAACGGGTTTGTTTACCTCCAGAGAC CAAACGGTGGAGAGCATCGAAATAATGCGCGCGCATTAGTTTTACGAATT ACGGGAAAGGTGTATTTCTACCGAAATAAACGATTTTAAGTGTCTGGAAC AAAATGTCCGATCAGATTGCTTTAGCTTAAAATTATGATTTTTTGGGTCG GACATGAAGCTATTTGGGTCAGACAATACCCCATGTTCAGCCGTTATTTC AAGCCCTGTGAAAATTTTGAGCCTTTAAATTTTTGATACTGTAATGAGTC ACAATTTACTTTTGAAATACTGGATTCCGTAATATTTTGAAATAAAAAGC CAAGATTCACAGAATTATTTGCTTTTTGGGATATTTCGAAGAATAAAGTA CCTTTTAAGGGTGTCACATCCAATGCTTCTGGTTCCCCAATTGATATCTT CCGTTGGCTTACTTACTTGCAGGTTACTTGAAATTGATTTTTTCAATATG GAGACCAGTGTTGTTGTAAGGGATCCATGACTGCCATCTGTTTGATTCAG CTTGCCTCAAGCCAGTGTTTCTATTTCTATCCATTTATTTGCATAAGCCT AAAAAAGCTAACATCGCAAATAACCTGAAACGAGGGGTTCATCAGGGACA GTACACAGGAATTTATTAAGTTGACGTTTTAAGGCATCCTTGGTGCAGTC 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CCTCTCTGTTTGCTTGAAATGGGTTTTTGATATGTACTTGAAATTATATT CCATAGTGCGCTAAAAAGGTTGTATGTGATGGTTTTTACTGTCAGCCTTT TTGACAAATTTGTTGATTTTGTAATAGATAAACGTTTGTTTTTTTATAAG AACATCCAAAATTTTTGAAGCCTTCAAATTTTCTTAACGTTCGAGTTTTA AGCCTAAAAATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTCGCAATTTTTTGATTAT TTTGTCCATTTTCCTAAAAAATAAGGTGAATTAGCGTCCACCAAGCCTTA AAATGTTTTTACTTAACTTGTTCATAATATTTTGGCCATCAAAGCCTTAT GTTCTTATATATAGTTTGTTCTTATAAAAAACGTGTATGTATAAATGTCA CTTATAAATCTCAGTTGTACTAAATGCAACGAATAGAACTGTTTTAAATG ACGATATAATTTTCTTGTTTTATCAATGACAACAAATAAATCAGGTAATT TTGATAGGATTACAAACCCTTAGCAACAATGTGTGGTTTGCCTTAATGTT GTTTTGATAAACTTAACTCTCTTCTCTCTCTCTCCTTTCATGTCATTGAT CATTGCATTTTATGATACACGTCATGTCATGTGTGTGTGTTGTCATTCCT TTTGCATTTTGTTTTTCTAACTTCTGGATTTACTTTAGTCCTACTAGGAT TGTTAACTTATCAAAATGTATTTTATCTATACTTCATCCTGTAGTGTGTG GTTTGCTGAAGTTGTTACCGTATGCTCTCAAAAAATCTCATCTACGTCTT AAAAACATGCCTATCCGGACGTGTTTTTTTTACATAAACGTTTGATGACG TTTGAATGAGCCCATAATAAATGCAGTCAAGGATCAAAGATTTTGTTTGC GTTACTAGAAATTGATTATTCTCTTTTCAGACTTAATATCATAAAGTACC TTATAAAAAAATAATATTAACAATACAAAATGGTTGAATCTGGTGTCAAA CTGAACCTCGATTGCGTCGAAGCTTTCACCAATGTGAGTAACTTTTTTTC TGCATTTTAATTATCCATATTTTTATTACCTTCATGGTTTATTTAAGTCA TTTTGAATACACGTTTTCGACCGTAGTCGCACGGGCATTTTTTGGCATTT CACTGAAACTGTCCCAATCCTTTTTTGACGCATCTTTCTATTGTCTATAG GTGCGAAAAAAGGGCTGGGACGATTTTAGTGGGAAAAAAATGCCCGCGGG ACTACGGTCGAAACGGTGTATTGTATGAACGTAAATAACGGTGAAACAAA ACGAGGCAGAATTTGCCTTTAAATTAAAGTAACTTTTTGAAATAACCAAC TTGACAATTCGCTAAATTTGAGGCAGACCTTTGATGGTTACATTACCAAC CTCATCTTTAAAACTTTATTTCATTCCAAAGGTCCACAAAGCACAAACAA GCCGATTCTGCGTGTTTGGATTTAACGATAAACGAACCAAAGTCGAGTTG AAGTACGCTGCAGGAAAAGAAGAAAATTTTGAACAGCTATTGGCACAGCT CCCAAAAGATCATGTTCGCTTTATCTTCTACGACTGCCAATACAAAACGA AGGAAGGACAGGATCGGAATAAGGTAAAAATAGAGTTTCGGATTCAACTT ATGACACAGTCTCTCAACTTTGACATACTATATTTTTCAAGCCATAAAAA GGAGTGACAAAAGTGATTCAAAAGTATACACGCAGTTGAAATTTTGCATT TCAGCGTTGAAAAATGTTGATAAAATATATTGCAAACTTGTGAAAAATCT TCGAGAATAATTCTTTTGTGAATTACAAGTATGTTCAAGCTCTAATAAAA TACATAAAAAGTACATAAAAATACTTTTAAATGACCAAACTTTTCTTTTT GAATTGATAAATTTTTCAAACAAATCAATTTTATACTCTAGTCAAGTGGA AAAAAAGCGAAGGCTCTCAGGCCGGTTAGGTCGAAGTTTTTTATCACTCC TGGAAATGGGTTGTAAATATTTATCGGTGTCTACAGGGAGTGGTTCTTTT ATGAGTCCAAACTGATGTTTTGTGTCCGATTCGGATAAAAATTGCAAATT TTAGAAAGTGTAAAATCAATATCATTGAAATAAGTTTCAGCCTAGGGTAA AGAATCTAAAATCACAGTCCATGGTGAATATTTGTGTTTTGCAATGACTC AACCTTTTTCTATTGTCTTTTATACAGGTACTTTATGCTGTTTGGTCTAG TGACGACGATGCACCAGGAAAAGAAAAAATGTTGCTCTCTTCAACCTCCA AAGAGGTGGAGAAAAAATGCAACGGATTCGCCAAGAAGGCTTCATACCAC GAATGGGCAGAACTTACCGAAGCCGCCTTCGTTGATGTCGTTTCCGAGGG TGGACAAAAATAAACACGCCTCGACGCCCTTCCTTCTCTCCATTGGTTTA CGTCGCGAAAATAATTAAATTTGCTGTCCGTTCATTATATCTTAAAGATG GAGGTCCACTTTTTTTGTTTTAGGTTTTTTGTATAAGTCAGATAATTAAT TGGAAACGAACTTATGTTGTCGGTTGGTGGACAAACCTTTGAATATAATA TAATGGATTGTTAAATGTTTTTTTATAACGAGGCCTTTTGATTTAAAACC AAGGTTTCCCGAATAAGGGTTGATCTTTGCCATCAATCGTTATCAAACAA ATCTAGTAAAAATCGATATGTTACATAACTGTTTTTTTTCTAAAAATTTC CCCACTGTGATTCATCGTGGTTTGATTTTGCAATGATACTCTTTATAAGG CAACTTTGGATTGAAACGACAGATCATTTCAAACTTTTCCTCTATTATGT TCAAATTGATAACAATGATATAATTTATTTTATCTATACGAAATATTAAA AATCTTTTGAAAACAATAAATATACCAAAATTTGTTCCATTTTTAAATCC AGTCGGTACCTCTGATTGTTTGTCGAAAATCGTGGCTTTCCCCTTAACAA CACGCTCATTGCGTGAATCCTTTTAAAAATGGAAAATATTACTTGGAATT TCAAAATATTGAAGGTTTCACATTCAATCTAGAAACGCAGCATTTTATGT AGATTTCAAATATACACAATGAAAGCAAATTTTTCTGTTATATTTGATCC CTCTAATACGTATTTGTTTGGTGATCCGCAGTGAACGTGATGACCAAGAC TTCGTGAATTTCTTTTATGAGCTCTCATGGGTTTTAGAGAAGATGTGAAC ATAGAGTGGTGAGATGTTAAGAACATCTCAAGGGCTTCAAAAAATTGGGG TTCCGAAAGCTAATTCTTGGTCATTTTTTCATACTCGGCCCGAGCTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00006953TCONS_00006953Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006952TCONS_00006952Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006951TCONS_00006951Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00006952-proteinTCONS_00006952-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000072supercontigsc0000072:486625..495673 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1007.31 1047.23 1110.63 1214.1 740.27 551.59 936.68 957.51 1295.73 1041.95 1098.05 1383.46 1642.1 1777.32 1352.51 1217.36 1240.89 1371.58 1650.64 1453.23 1651.61 1587.46 1102.12 1185.27 878.14 928.58 1462.98 1788.7 1505.99 1558.34