|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000063:319491..329800+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_003498 ID=XLOC_003498|Name=XLOC_003498|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10310bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000063:319491..329800+ (Clytia hemisphaerica) TTTAGATTCTAgcaaatcaaaaaacaacacCTATTTGTTgtaaaaatgac
aaataaacCATCTAATGGGCAAATAGCTGCCATTGGAATAGAATTGGTTG
TTTTTGCTGTACTCTCATACTTTGGAGTGAAATGGATCGCAAAAGTGTTG
GATCCCACCAGCAAACAAAAAGAGGCAGCTCAAAAACAGGTatttaaaag
gttttgtttttaaataagagtgatatcatttgcttactcatcaagcttgt
tcacattggattgatacAAATGTGGAGCAAAGTTGgacagaaaaaggaaa
agaaaaatattttttttgcttataatcagcataatataacaatagcataa
cactgtcctgatatgaaatatgtgtctgatatgaaacggaaacactaatg
taataaaacctttaaagcttggtactcactttttgaaaaaggtaGTGTTT
AACACTAAACGCCGGCGTATAACTTTATACGCGCGCGTCTGAAACCATAA
GATCTCTAGTGAGTACACTCAATAAACGCCGGCGTTTAATTTATACGCCC
GCGTTTAATTTATACGCCCGCGTTTAATGTTAAACGCCGGCGTttatcaa
actttgaaaaaaatatttaaacgcgcatatcaaaaaattttgatatgtgc
GTTTAAAGTTCAAAGGCACCGCAATGTAAACAAGATTAAatctttttaat
tcttttgtaatttttggtttttactttcgatttcgtttCACTTTTCCCCT
CTTTTACTATCTTTTACTATATTTCTCTTTGCTAAAGAGCTCCTAGTGAG
TACATAGATGATCTGAAAAGTTAAACGCCTGCGTTTATCATTAGACGCGT
GCGACTAAAGTGTTAAACGCCACTTTTTCAACAAGTGAGTACTAAGCTTA
AGTGTTTCCAGAAAAGAATGTATACATCTATCTTGAGTTGAAGCTCACTA
TGTTTAACCTTGTTTGGAACTAGTTTTATTGGTGCAGATTTGGTCTCTTT
ACCGCTTTATGAATACCCCTCCTGTTTTTACTATTCTCCTTACTCCGTTT
TACCCCCTTTATAACACTTTGTTCTTGCCCTTTTTAATGACATTTGGGAG
CGCTCTGTAGAGAGGGGAGGGGGTCGAACTATGACCCTACTATAGAAtga
ataaagctttttaatcaattttttttatgattttggtCCCTTAATAAATC
AATTACACATTtcctaaaaacaaatattttgtctCTTTTCCTGGGCACAT
TGTATGATCTTAATATGATAATTTTCAACTTTGTGTGCATGCATTCATAA
TTATAATAATAGACGGTNCATTTGGGAGCGCTCAGTAGAGAGGGGAGGGG
GTCGAACTATGACCCTACTATAGAATGAATAAAgctttttagtcaatttt
tttgatgattttagtCCCTTAATAAATCAATTACACATTtcctaaaaaca
aatatttttgtctcTTTTCCTGGGCACATTGTATGATCTTATATGATAAT
TTTCAACTTTGTGTGCATGCAtttataattataataataatcGGCTGTAG
AGGGACAAATAGAAGGCTTACTAAACTAAATAAGATAACTGAGAAATCCA
TTTTCCactctttattttcattttaggcggAAAAGATAACCAAATCACTT
GGTATTGAGACAGAGGTATTAGATAAATCATAGTTTAACTGGgttgattt
tcaaaagatttaaaACTCACAAAATCACTCAACATTGCTGACTCATGACA
TTAAATGACCGTGAAAATTCCATTTTTTGTCGTAAATTGCAAATCTTACC
GGGTATTTCAAGCCGAATTTCTGATCTTTTTAAGTAGATTCAATATATTA
AGAATGAGCAATTCCACGCGATTTTGTGAGTTTAAAAAATCATAATACAG
TAAAAGCGATGCTACTTTTACAAAATATCTTGAACTGGAGGCCAAGGACA
CTCAAAATTTGCATAAAAGTTAGTATTATTATGTTGAAAGGACAAAATAC
ACTgaattttgtaaacatagaCTTTTCACTGTTTTATTCATAAATATTTA
CGGTTTCTTATAATGCCAATGAGGTTCCTTCCTTGCCTGTAAAATAAATA
GAACTACAGCAATATTGCATTATTACTTAAAACAGGGAAAAAGATCTTTG
AGACCGCtttgtttttggtgtttttcaggtAAATCCtcgtaagtaagtct
gcgaccgcattcggaggcgacccgaaggctcctctttcgatagctatcta
cccaaaggtaggggagggcgctactctttctccctggatttctccactta
cccttgatccttctcttaattgctgagaatcaagcagagaggcatcaagt
ttGAGAATCTTTGGAATGATCcggctggggattgaacccacaatcttgcg
caccgtagccggatggtctaccactgcactacggtcgctattGTTCCATG
TTGATCTTGTattaaaagcaattttttttccCATAGCTAACAGAGTATGA
AACAACGATAGCTGCACTTTTGATTGACCCATTAAATTTACCAAATACGT
GGCATGACATTGGTGGTTTGGATTCTGTCATCTCTGAAATGAGGGTACAC
ACTGTTTTATCGTAATagaccttatcagagtttttgttttttctaaaaaa
gcgatgcattgtgggattgtttcgagtgtatattacaatagaaatctctt
aggaattcctcgagggaattctattgtaatacactctaaacaatcccaca
atgcatcgctttttaaaaaaaatcaaaaactccgataaggtctttaacct
tattacacgaataacgcaagtattcaacggccttgaaatttgcacaatct
caaatttttctgctttttcatgGAACAGTGGCCAGCagtggctggtttta
attaaggggggtttttcaattcgtgttaataaaatgactaataatattcg
tgtaataagatGCTACCAATATTTTTGGACCAACCAtcgatttttttatc
attttcctgGTTGTTATAGGCTCTATTAttaaatcgtttgttttattttg
cttttttagCTTTCGaccaaaattgaaacttttgtgTTATAATTGTATAT
TCCAATCCAGGAACCTCCCCATGGCTTTTAGAATCTGGCTGATTACTAGC
TATTTGTCTAAATTTGCATAATAATTGAGTAAGAATTTTGAGTATTTTGG
GAAAACCCTCAgcgttttcaaaatatggacCCCTCTCAATGTGTGTTTTA
CAAGCTATCTGTGGAattaccactgacctttatatactcTGAAAAAAAGC
TATATACCCGCAATCTTTGATCGTAATTTTTAGAAAGGTACTCTAAGGAT
AGCACTACTCGATATGGCCCAATTtgtaaatcaaagaaattttccgTTTA
AAAATTAGTGCTACAATTAGGGTACCCACGATAAAAAATATTGCTCGGCT
TGGATTGAGGACTGTGTCCTGGGTATATAAAGCTCAGTGGGAATTTTACG
GaaagttttctctttttttttcaggaaacgGTCATCCTTCCTTTACAAAG
AAGAGCATTGTTCCAAACATCAAATCTCCTTTCAGCTCCTAAAGGTTTCT
TGATTTTCATATCGAATCATTATAGCAATCGTCTTGCCAGAGTTGAATAA
ACCATCATCAGAGTAGGGCTGTCGACCATGtattagctctagtttagaca
gcccacttttcgccctgcctattataactgtgaattaaagtgggcataaa
gtgggctatctaaagtcattgcattgccctcttttgacgtcaatgcactg
acttctttcaatctttcctAAGCAAAGATTTTAGCTGCTAACTTTTTGCC
TCtactaacaattagaataggtagggaagaaagtcggccgtctaaactag
agctaagctGCTTTTTTACCGTTAACTACTGTAAGAGTTTTCCTATTTAA
GCCGGTAAGTAATGACTTAACTCTAGTTTAAACGGTCacctttctgccct
gcctattctaattgttagagtaggcagaaagagggcacaaagttggcagt
taaaatctttgcttttagaaaagattgaaaaaagtcattgcattgagaGG
GAAATgtattgactttagacagcaaACTATCTGCCGACTTTAattaacaa
ttagaataggcagggcgaaaagtgagccgtctaaactagagcttactttg
gatatttgaaaaaaaaagttgtattTATTATTGTAGAGCTTTTACCGTGC
TATCTTTCTTAAGGCGTTTTATTATTCGGACCACCTGGCTGTGGAAAGAC
AATGATTGCACGGGCAACCGCAAAAGAGGCTGGTAAGTTGACCGGAATTG
AACTCACTGAATATTaaagtagagtctctttaacttcTCTAACTCAAATG
TAGGTGTTGTAGTTGTGAATGTACTCCTAGGAGAGTAGGTGTTCCGCTCC
ACCTGAGACCCGGCTACCCGCTAAAAAAACTCTCACTCCTACCTCCGCTG
ATATCTACTTACCTACTACAATAGCAAATTGTCACTTTTCATTCCACTTC
ATCGTTTCAGGTTGTCATTTTATTAATTTGGATGTGTCAAGTTTGACAGA
TAAATGGTATGGTGAATCGCAAAAACTCGCCAATGCTGTCTTTTCTCTGG
TATGTTTCGCTACTGCGTTGTGTTATACTCTAATTATCCAACATTTTATT
TCCATCTTGTTCAAATACACGCTACatgaaattatgtttttttttcaact
accgtcaagacattttttaaattcaaaatctgACATCACAGCAAATAAAG
AATGAACTTCTTCTTGGGCTTAAATTGTTCTCAGTTATTGTGCTCTTAGT
GTAAAAGCTGGATAGCAGCAGTTGATCTTTGTATACACGCGTTTAATTGA
GCATTTTATATATAAGAATACTTTGTCAGGCAAAATATCAAGagtaaatt
aaaaataacattATTACCATTAAAAGGCTTTGGAAAGTATGTATAGAAAG
ACTTGCtcaatagtgaaaataagaaaattatgaaaacatttttaggctta
actctgaaagttaagaacatccaaaggcttgaAAGATTtaggacattctt
ataaaaaaaggtgtatctCGAGAGAACTGATCAGCACTAAATTAGAAACG
TTGAATGTCGATGGTTTTTGTCAAATTAGTATTGCAGATAACAGAAAttc
attgttttgttttacCTCGTAGGCATTGAAAATTCAACCTTGCATCATTT
TCATCGACGAAATAGGTATGGATCTTCTTGTTATTTCTATGAGTTTCCCC
CTCAATCTTCCTAGAACTTTTTCTGAATCCTTTTCactcatcattattca
tgatatgcactattgtaatgtcttccaaggacccaacagctgattggctg
aaagtggcgtattgactgattttttgtcaataacaaccaatcagctgttg
ggtccgtgatgtaatgtcagaagacattgcagtagTGCATAACATGAATT
CAACCCTATTTTGCAATTGCTATATATAAATCAACAAAGCTTATGTCTGA
ATTATCCCGAAATTTATTGCAAAAGGAACTCGTTTAAAAAGTCCTACTCA
AAGCTTATGTATAGCTTTCGAAATGTATATGATGTTATTGCCTGAaaata
agtttgaatttttgaaaatctcttaCCCCTTAGGACCTTTTCGGGGAAAg
ggaattttcccaaaaatgagATTCCACGAGTTTCCTCTTGAAAAGGTCTA
ATTAAAGCTTcggtattattttttttctactaACGCATCCGACGTTGTAA
AGTTTTATTAAAGACTTGTAAATAGACATAttgccttatccgttgggcca
caggaccagCCTTTTCAACATCTAGCTCTCTTATAACATATCTTGGTTAC
TTATCCAATACTTGTTTTATTGAATCTCTGTGATTGTATTTCTTCCTTAC
CTGCCTTTCAGATTCATTTTTGCGATCACGCGAATCGAATGACCACGAAG
TCACTGCAATGATGAAAGCTCAGTTCATGAGCCAATGGGATGGTATGTAG
TTACTCTCTCTATGAatcgttgaaaagattttttcaagaaaaacattaac
cttatatattgtccggggggtagcgaaaaatcatcaaaatttgccttgtt
cggggggtaaatttgctctgtccgggggtaatttggatTGTCCGGGgagc
caaaagtcactttgtcactgaaaattgttatatccttcaccccccatatt
aaatttttttctggaaaagcccattcggAGAATTCACGAACCGCGTTCAA
cgaaagaacaaactatataagtaTATACTGTGTAGACACCAACAATTTAA
AACATCATTTAAACGAAGACTTTGCAAAACAAAACTGATCGAAACGCTTT
ACTATTTTCGTCAAACGGAACAACTCCGTTTATTTCGTTGCTCTTAAACG
TTCCAAAACCAACACGAACACTTGTTATCCTTAACTAGAACCGATGCTAA
ACTTTAATGTCTACACATGGTCttagaaaattaagaatttataGCTCGTT
TAAATGAAcatgaaacttaaaaaaactaGGCTTAAGATTTCTCTGAGAAT
ATGAAGAATTGGGGTCTAAAAgtgatattttctttcttttataataattc
atatattattcaaaaaatttgaatatggggggtggatataacaattttca
gtgatttaccccctggacaaagtgacttttgccccccggacaagcatcag
ttgaccccccggacaacccaaattacccctggacagagcaaatttacccc
tcGGACAAGgcaagttttgaggattttttgctgcccctggacaatatatc
ctccacccccatgtacggacattttctggaagagcccattacacTTCCTT
GTAAAAGATTTAACCAAAATGACTGACACTCGATCTTTCATTTGCTACGG
GGTGTTTTTATTTCAGGGTTACTCTCACAGACAAgttgtgacgtcatcat
aatGGGCGCCACCAACCGCCCTCACGATATAGATCGCGCCATCTTAAGGA
GATTACCCTGTCGTTTTCATATTGGTTTACCGGTAAgatgaatgttttga
aaaagaattgtttccaaacaaatttaataaaagactgttaatctaacgtt
tccagaccatcgaaaaagaacgacaaataactgttaaaaagtgacaaaaa
gaACTGACAAAacctaaccctaactatcaaagaacgacatatttcgccat
ccacaaccccgaatAAAATTAACTGTACCACACCCacagattcattcctc
tttgtttatcacgggaattaactacatgtggtttaaaagaatgcaaaatt
acgcatgcgtataagtctctatttgggtgagctggaatcattagatgaac
taactcATAATATTGCATGACTcattgacctttatataccttGGATATAG
ATCTGGccaaacaaaatctttgatcgaagttttttttaaagtggtaccag
ccggcacacaacgttgtttcaacgtttatctaacgttcacaacgtccata
taacgtNcgccatccacaaccccgaatAAAATTAACTGTACCACACCCac
agattcattcctctttgtttatcacgggaattaactacatgtggtttaaa
agaatgcaaaattacgcatgcgtataagtctctatttgggtgagctggaa
tcattagatgaactaactcATAATATTGCATGACTcattgacctttatat
accttGGATATAGATCTGGccaaacaaaatctttgatcgaagtttttttt
aaagtggtaccagccggcacacaacgttgtttcaacgtttatctaacgtt
cacaacgtccatataacgttagattaacgtttaaacaacgtagtgtgcca
gctggggtaccttcatggtagcactactcaatatcggtgaacaaattttt
aaatgaaagaTGTTATCGAATTACAAATTGACTCACATCGAGAAGTGCTA
CCATTCGGGTaccatttttccaaaaattccgATCATAGATGGCGGATAGA
TATAGCTTGGTTCAGGGTATATCAAAGTCAGTGAGTTTGGCGGCTGAAGT
TTTTTCGTATCGCAAACTCTTGTTGAAAAGGCAAGCATGtggctcaaatt
ttaatttGCTGTTTGAAAGTAAATTCCTATCTTTTTTTACCCTAAATATC
CTGcaactgccaaattaaattcccgccaaatttatttttttctccgccat
ccgccaaattaaattccgtctgaaaaaactttttcggccatctgcCAAac
taaattcctgccaaaatttctttctataTTTCATTTGAACTATTATCCTT
CAATTTTTCCAGGAGCTTGTTCAACGGAAAGCCATACTGAAGATCATACT
AGCTGAAGAAGATGTAAGAAAAATTTCATTGCGCCAATATTGTCAACCTT
TTTTATTGAGGGCTCTGacctagcctagaaatctaagccagattgattca
gtcacttagtAAAATCtaatggtaagttgtgactgaatatcagtttttca
aggcaaacttaaaattccgtacatcataaaaatcatcAAAGCACCGATAA
CGCTATATTGCCTTCAGCCGTACCTTGGCcttgtaaaaactggcttggtt
aaccaggctaGCTCTGACCATAGTTATTTCTTACATTTGGCAAGTACAAA
ATTTAACATACAGctgttgactctcgctaattggAACTCCAAACTCTTat
ctgttcgaattacagagagattcgaattatagtaTATTAAGAGGGTTTTC
CTCTGGCAGTGACTGGAAatgatttcgagttatagaaattcgaataaaag
aagttcgaattagcgaaagtCCACTGTATTGcgatcttaaaattttaaat
cctcTACGCTTCGCATTTTTAAAATTAGCTGAAACGAAAATTATTTTCGT
TGTACCGTAAGTGTCGTTCATTTTTTGTCATGATTTTGTTTACAGTATTA
CAATCCCAATAACGACCCATCAACATAATAATTGTTTCATTTTCTAGTTA
TCTGAGGATGTTGATTTCGATAACCTAGCTTCCCAAACCAAAGGTTATGC
AGGATCAGATCTGAAAGAGTTTTGCCGATATGCTGCCCTGCATTGCTTGC
GAAGACAGGTCATTGATATTGATTGTGCTACAATGGATGGGtatgtgtta
aaaattcatgatatgcaccactggagagtcttccgagcttttaaaatttt
ccacccaatagaaaaagtgacgtattgggtggaacaaaaacagaaaaatt
gcataatttcgtgaagtcattgtagtggtgcatatcatgaattatttcCG
ACGTAAGTCAGAAGATGATTATGAATTCCAATTTTCCAAATTGTGCTTTC
TGATTTGGCAAATACTTCTCTGAGCGGGGCAAAAAAGTGGACAATTCAAG
ATGGTTGCCAAAAATGTGACAAAAttggaaagtttttttaaaaataacaa
gcaaatttgtaaataaatttttcacatcaaaaatGTATTTCATTTTTCTA
CAGAGTATCGCATAACAATATGTTTTTATCGCTGGAACAAAACGATTTCA
ACTCCGCTGTGGAGAGAATGAAGAAAAATCGTATCCTGTTTGAACCGTCT
CATCCGTTGGAACAGGCAGCCAATCACGATGTTGATTGAACAAAGGAGAG
AGGGAGGGAACCAATCAGATCTCGCGTTGGTCCGGCAGgaaccaatcaga
attcacgaTAGTTTGGAAGAAACCAACCAGAATGCACGATGACAGTTGAA
AGGAACAATGTACAGCTCATGTCGATTGAATGTTATACGATTTAGGGTTT
ATAGTTCACGTTTTGTTTTTTATGTTGAAACGGCCTCTCATGGAAAATTG
TATCAATGGTCTCAATGGTATCTGCAAATCATATATTGTTGAGATGGAAT
GAACGTATTGTGAGCTCTGGTTTATTTGAGAAGTGAAATCAAAGTTCGTT
CGAGATAAAACATTGCTTTGTTTTGAATGTTGTAATCAAATTTGATCATT
ACAAAAGACCACTACTGAAATCGTCTTGTTACTTTAATgagataaatttt
cgcggggattagatttcgcggttgagcttatccgtgaaattttgagattt
ggcatggacttaattttgcggatgacaTTATCAGAAGACAATATTTCATG
GTTTTGTGCCTTTTACTGCCAAATtgtgcatgttggttgttgaaaaaCGC
ATTATTAGCGcatctttgatgccagtaaacattttaaaagtagttatttg
gctttttttt
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000063 | supercontig | sc0000063:319491..329800 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog Name | Description | Organism |
ATAD1 | PREDICTED: ATPase family AAA domain-containing protein 1 isoform X1 | Homo Sapiens |
|