XLOC_001823 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_001823
Unique NameXLOC_001823
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000026:454689..492519+

Legend: gene
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aaatagccaaaaaattaagaatatcaccatcatggaattttgctactcaa gctaataatgccatttttagagcattttcgattataaattgtcaattacc ccttaagtaaggctcactcctttcacaaaaatgtcattctatgcttgaga cgtatgtactaaatgttaaatctagtctgaatcaggatcctaacctagga atgtgctgtaagaatattttaggatgattttcccaaaaaagttaagaata tccataatgaaatggatttacaccattctttgattcttataaaaaaaagc gtgtagtagaGGGTGGCGGTATCGTAGTACGGGGGATTcaagccccgggg gggggggggggNCGAAAAGCAGCATGTTTCTGTCTCGTCTCTGTGCACAA CGTGGCTGGACCTGACCTCGTGCAACCTTATTTCCAGAATCTTGCTGGTT CCAAGGTATTAATTCTACCATTTGTTTTCAAGTCGTTCATTTGTGCTTCC CCTTCGCGGATATCTTTTAACTGATGAcattattttcagaatttccaAGA ATGTTTATAGAAACTAAACAAGTTTCGAGTTTTCACTCTGATTATATTTT AGATCTAAGATGGTTTTCTCTCGTGTTTTGGAAATATCCAAGACAATTCA GGGTGTTCTTAAGAATAAAGGGTTTTCCTAGGGCACCACGTTTTGATGTG ATTCAGTGTATTTTAAAGCGTGGTTATGTGATTTACAATATTTTGTCAGT GTGCCAATTATGAGGAATATCATCGGTTTTAGTTGTCTTttatttaattt agtttttctaattCTCTTTTCTCTTCCTATTTAGATCAAACTCTTGAACT TGTACATCCGTCGGTCGCAAACGAGCAACGTGTGAATGGTGCCCTAAGTG AGGAGAAAATGTGGATGGTACCTTAAAGAATGGGAAGAGGTCGTGACGTC ATAGGGGTTCATAAAATCTCCCTAAAAAATAGATCGACCTTGAGGTCTTT CAGATGCACTCGAAAATGGCCATGGTTCGTTGGTTGGTCTTTGATTCCCA ATTATGATAAAGTTTTATCGTTTAAAACGTATTTTGAATACAAATATAAA CGAGTCATCCCGTGATGCAACAGTAAACAAAGAGACTACGTTTCGACTAA TTGCATTATGGGTATTGAGTGTACAAAACTCAAAACAATGAACTCCAATA AGAATTTTTGACCGACATTATGGTCACTTAATTCATCAAGAATAAATGAA ACTAGAAAAGTGAAAGTTAAGAAGATGatatatattttctaaaatttttc ctttctttattATAGATATTTTaccttcaaaataattgttttctttttcc tctttattCCCTCTAAGATTACTTTAACAATGTATAGATACTCactttta aattatttattgatagtgaaaatttttttctcttgattttattaaattgt tttgctttttttgtcATATAGTACGGAActaactttgtttattttttaac cCTGTTGTTGATATTTTGGCTCCTTTTTTCATCTTAGTTCTGATCTACTT GCTAGAGAACTCCTCTCTGTATATTCCTAATCTAATGTCTAAACCCTTTT AAAATATGGGATGATCGGGGTAAAATTGTGTACACACCCTTTTTTCAATA GGTCTTACCATGTTTGCGTCCTTTGTTTTTGACCTGAAGTGGTGATGAAA TATGAATGCGAGTTTTAGACCATCTTCCACT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003272TCONS_00003272Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003273TCONS_00003273Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003274TCONS_00003274Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00003276TCONS_00003276Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003277TCONS_00003277Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003278TCONS_00003278Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003279TCONS_00003279Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003280TCONS_00003280Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003281TCONS_00003281Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003282TCONS_00003282Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003283TCONS_00003283Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003273-proteinTCONS_00003273-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000026supercontigsc0000026:454689..492519 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CLASP1PREDICTED: CLIP-associating protein 1 isoform X1 Homo Sapiens
CLASP2PREDICTED: CLIP-associating protein 2 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
11.78 10.85 6.84 5.75 209.1 150.3 90.16 96.92 54.9 73.41 44.45 47.84 48.68 47.11 19.74 26.81 48.59 51.75 68.98 85.69 37.54 40.78 29.72 37.22 41.91 43.55 37.64 37.7 26.98 28.16