XLOC_000976 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000976
Unique NameXLOC_000976
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000012:922168..933218+

Legend: gene
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>XLOC_000976 ID=XLOC_000976|Name=XLOC_000976|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11051bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:922168..933218+ (Clytia hemisphaerica)
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CCGTTTCTGGAAGTTGTTAATTAGGATACTATACTTAATAAGCCATAATT AGCATCTCTTTTACTCTTTTGTTTTCAGTATCCATCGAAAGTAGGACCGT TCAAAGTTCTTGGCGTGCGAGATCTGACGGGCGAAGGTTATGATAGCAGC ACTCCTGACAAAAAACCCGTAAGTTCATTCTATACAATACTATACAATTT CTTTCTCGAtagatttttacaattttgttagtctttttctttgtcatttg acgaaaattttgaaacccCTTTAAAAAGGTTTGAGGGACAGTTCAACATG AAGTTCGCTTCTTTTCAAGGCGAACAACTGTTTTTGCGAAGTAGTATTAA TAAGAGAGGTGCTACCAAAATTACACCCTATACCATGTTTCTGTCAATAA TTTTCTCCGATGGATAACTTTCTTTTCAGACGTTACCAACGAGTAGCTCG AACATGATTACTTTCAAATTCGATGAAGGATGTGTGGCCACCATTCGAAC AAGTGGCACTGAACCTAAAATCAAATATTATTCTGAAATCTCAAGGCAAC CGGGTGACAGGTATGTTTTTGGTATCATTTTTAAACCGGAAAAACAAGTC TtaagctttttttattttgctactTAGAAACGCGACTGaacgcaattaaa atttttgaattataCTGTCTGGTTGTTTTCTAGTCTCTtttttttgttgg aatatttattttacacggccaattttcggGTTGTTTTGCCGATGGCACAA ACTTCGGCTAATTTCCTTTCTCCTAAGCGTGACTAAAAAAGAACTTGACT TGTTTGAATGTTTGTGGCGTGTAAAGGGATAATAGATTGTGGTCCCCTAA TAAGGTGAGGTGGATTAGGGAGTCTTTGTTGTTCATTTTTTCGATGAAGA TAATAGACACTTCATCTTCTTTTTAGTATGTGGGGAGAGGGTAGATTATA TCCTTACTTAAGAGATTTGAAATGATGGTTTCAGGTGGCAGACAAAAAGT CTCGGTCAAGTGGGCTTTCAGTTTTCTTCCTATTGagattttctcttctt ttcttcctttgaaatttcttgaaaGTAAGAAGTTGACTTTAACAGagaca aacttcaaaataatttactttaCTTTTGAAAGACAAACATTCTCCCAACA ACTTTTGAATCAGAAGaggaaataaaattgaattaacCCAAGTCTCCTCC TTTCTTACCAGTGGGCTTTTCTTCATCCGAGATATGTGACAGCAAAAAAT TATTGGATCAAAAAGTCACTTATTTCATAATCATGTTTTTCTTATATTCT GCCTGAACAAATCCCCATCTTTTTGGCACAATTGCTTTTCCAATGTTAAG ATATTTAGTTTTGAATGTACACTGTTACacgagtttttttcaaaaaaatc ttcctGTTAGTTTTAGGAAGATTAacgttttggaaaaatttcgaGGTTTC CCTCAGGTCTAATGAATAATGGTCCGCTATTTTCAGTATGTCATGGGAAG ATGCCGGTAAGAAGATCGACGAATTAATTGAACATTTAGTGCAAGAATTA TTGGAGCCTGAAAAAAATCAACTACAAAGACGTCCAGTAagttaactttt taaaatttgataattgaacatatatttttaatatcaaaaaggttaaattt tatAACTAATTTATACAATGCCGTTCTGACAATCCGTACTTAGAACTAAT TTTTAACATGACCGTAGTGGCTTTCGCACCCTGTTTCAGTTGTTTATTTC CCTCAGTGCAGTCGTCAtctttttaagaaatatttaaacTCTTTTTAATG TAGtgtttgggaaaatcatctaaaatattcttacggtattcatTCTTAGG TTAGCATCAAAGTTCAACCTAAATTTAATATGCAATAAATAACTGAAaaa 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001847TCONS_00001847Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001848TCONS_00001848Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001848-proteinTCONS_00001848-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000012supercontigsc0000012:922168..933218 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
PGM2L1PREDICTED: glucose 1,6-bisphosphate synthase isoform X1 Homo Sapiens
PGM2phosphoglucomutase-2 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
42.05 39.39 9.23 6.26 6.46 4.03 8.19 10.01 13.11 15.66 19.57 11.48 30.87 29.92 47.23 50.88 46.41 44.7 28.12 25.84 27.52 29.85 38.47 39.51 26.45 26.84 55.85 48.23 70.45 57.18