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XLOC_000768 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000768
Unique NameXLOC_000768
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000010:923849..933588-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000768 ID=XLOC_000768|Name=XLOC_000768|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9740bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010:923849..933588- (Clytia hemisphaerica)
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CTCCTTTCTTTGAAAGGTGATGTAACAACGAAAACCTTTCGAATAACTCG AAAAAAAGGCTCGAAAATAAATCATATGTTAAATTCGAAATAAACAAGCT ACATGCTGAATGGACCTACCTGAAGAATGATGTAATATGACAATTGAAAA ATGAGAAGAATAGTATGAAAATGCAGAATAATAACGAGAACAACTCGAGA AATTCATGGAATCCGGCGATTCTCGGCTGTTTTGGCGATTTTTAGAAAGT TCCTGTACCAAAATCAGTTTCATTAAAAATTGAACCATGCTTAATCGTGG ACATTCTTATAAATCATGTTTTTGTTTGAAAAAAACAAAGACATGAAACG AAAAAATCCAATGAAAATCTGCAAAAACTGAAATTTCCGGCTTTTTTGGC CGGAAAAAACATTTTCTCAAAAATCGAACTCGGTCATGTTTTGAGCATTG CGAATACGCATCATTCTGCAGAATGCATTCTGCATTCAGAGAAAAATAAG GATGAAAATTCGAGAAAATGTCAAAAAAGACCGGTTTTTCCGGCATATTT CTGGCATTTTCGGCCGGAAAAAAATGTTTTAAGGAAATTATAAGGAAAAA GTCCAATGAAAATCCAGAAAAACGGCGATTTTCGGCATATTTTCTCAAAA ATTTTCTCAAAAATCGGACTCGGCCATGTTTTGGACATTGTTAATACGCA TCTTTGTGCAAAAAATCAGAAAATACTAATGATAAAATCTCGAGAAAATG CCAAAAAAACAGTTTTTCCGAAATATTTCCGGCATTTTCGGCCGGAAAAA AATGTTTTTCGAAAATCTAGCTCCGTCACATTTTAGGTATTGTCATTTTG CATCAGTGTGCAAAATTTCATAAAAAAATATGAAGTACAGCTCGAGAAAT TCAAGAAATACTGTCTTTCCAGCAAAAATAGGTTGTTCCGGCAATTTTTG 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TATTTCTTTCAACACAAAAACTTTAATAAGAAATAACAATATGTAAAGGT TTTAGTTTTTAAAAATGTAAGTGAAGTACCGTGAAAAGCACAGGTCGAAA TCATATATCGACGCTGTGCCGACCAATCCAGATTCTATTTTTTGTCTCCT GTATTTCCATATGACTCAAATTGAAAAATATTTTTCTATAAAGCCTGAGA TTTAGAGCTTTTTTCTCATTTTAGCAGATATCATTCTTGCTTGCTTTATT CCTGACCCATCAAGATTTCAAAATTTCTTAATAAACTCACCTACTCAATG AAATAATTTTTCAATTTTCAGATTTAATTTCTTCACATACCCTGGTGTAT GGGACATGGCGACAACAACTCTAATAGCAGATAACATTCATACAAAACTT TATTTCATCAAATATATCGGTGGTCGGCCTATCGGGGCCGTAGACCCAAT CGACATTGCTCGTCTCTTATCCACAGAAATCTTACGAAAAACATTGTTAC AGCGATACGGTGTTACCATAAAAACAGACATCATAGATATAAACTACAAA CGTATTATAGACGCTGAGATCAACAAAGACTTAACTATAATAGACGATAA GAATCTTGAAACCGGGGAAGATGATGAAAAAACAAATGAGAAGGATAATA GCTTTTCATCAGAAAGTTCATTAAAAGCAAGGATTATGATTTTGATTTTA TTTGGCGTCCTCCTTGTCACAGTCTTCATCAGTATCGTATTGTTCAGAGC GAAGCCAAGGTATGAAGTTTATCAGAAGAATTTTTTTGCTTTATGCCAAA TCCGCGAAACACGAATATTCTTAAGATTTAAAAAATCACCACTAAAATTG GTAAAATAGAGTATAAATGAGGTCATATTGAAAACAAAAATTCTCTCAAC AGCGACATTAAATTCCACGAAACTCCCGAATTTTCAGCTGTGAATTAAAT TCCGGGAAAATTTCTTTCCTTAAAGGTAAATCAGCATTCTTTAATAAGCG AATACTATCGCATCGAGAAGACCCGTTGCCTGGAAACAGACCTGATATCT ACGGAAATGTCCAAATTCATTGCTGTAGATTGAAACTCCGGTAGAGAGCA GAAGTGAAATTGTGTCAATTTTTTGTCTTTAGGCGAGGCCAATTTGATTT ATTGTTTTATGGGCCATGCTACTCAATAAAAGGTCGGTCGGCCGGTGAAA AAATAAAAATAAAAGTAGAATTTCACCTATAAAATCTCCTTAAAAGGTAG ACAAAAATGCAAAAGAATCACATAAAAAGCTGGAATTGATGGATAAAATG AAAAATAAGACCTTGGAAAAACTACCAAAATTTTGTAAATTTGGGAGTCT GTAAAGCAATGAAAATAAATTTTATTTTTATTTCGATTTTTGGAATTTAA GGGTCGGTCGTGCTTGTAAAACAACTAATCAAATTGGTTTCGCCTTACAC TCGGACGATATCTTACACCTGGGATGTACAAAAAGTCTTCCAAAACAACG TAATTTTTGGCAATATTGGTCAGATTAATTACAATTGTAACTTTTTCGGT CTTTCTTCAGACAACAGGAAAAGTGTCTTTAGTGTAAAGAGAAATACCGA TGGCAGACTATTAAATAAATTGCCGAAATTATTTGTCTGTCTATCAAACG TAATCATCTTTTGGCTTTCTTCTGTAGATCGTAAGATCGATACATGTTAC CTCACGGATTTTGGATTTAACACAGGTTAAATCGCGGTTTAACTTTTATT TGATAAGCGTCACATACAGTATTCGAATGGCTGGGTGGCCGCCCTCCGCC AACTGAGTCTACTTTGCTAATAGTTACGTGACGTCATGTTCATAATGGCC ATCGCATCTCCCTGTTCAAGTCGACGCTCTAACTGAAAGCTGACAGGATG AAATATTTTTACCTCGCTCCCTCCCTGCAGTTATGGTTTTAGGCGATCCT CACTTATTTATACTAATATTGTATTTATCGGGAAAAATTTTCCCCAAAAC TTAATATTCGAGGATTAGCCATAAATTTATGCCAAACTCATATCTACCGA CTCACACTTACTTCTCAGCCGTCCGAATACTTGATTGGTTTCTACCCCTA ATCTAGGCCATAGGCAAATGGAAAGTTAAATTACACGTTAAGAACATCCG TAAGCTTCAAAATCTTTGGACATTCGTACAAAAAAAGTGTAGTAGAATGA CCAACATGTCTTTGTCGGCAAAGTAAAAGAGTCAGAGGTCTAAAAGTCTA AATAGATAATTCTTATAAGGAAAATACTACAGGAAAATACTCGACTCACC ATAATACTAGTTCTTTCATGGTATTTCCCATCGATGGTATTTCCACATCA CAACTTGGTCCCTATCCAAAATACATGAATGGTAAAGAAAGGGTATAGAC CATACTTCTTGCCGAGCCACGTCCTTAAAAATCATGGGGTGAGAGTTTCT TTTAAATCCCCCATGAAAAAGATGAAATTAGTTAATTTTCATTTAATTAC CTACAGGTGTTTACGCCACTTTCATACATTACAACGTACGTCAAGTACAC AAGACGTTATTCAAGACACGGCAAACAACGATTTAGATAACCAACCCTCT TCATCAACTAATCAAAATGGAGTCGATGGCTTCCTGGAACCACCGCCTTA TTCAGAAGATGATAGATACAGAAAAGATAATCCTCCGCCCAAATACGATG AACTTTTTATGGAGGAAAACCGACATACTACAACTGCAGAGCTATAATGG ATTTATTCTGACTTTTATAATACTGCAGTATCATTTGTGGTTCTTGCATT TTTGGGGCCTTATAGAAAGATAATACGTTTTTCATTGGAAAAAATGTGAG AACTTGATCGGACATAGAATGCATTTCTAGTTGAATTTTTATCAAGCTGG GGAGTTCCCAGAAGATCAAAAATATTAGTTCCTCTTGGACCCAACACCCC TATTTTGGTACACAGGTAGTAAAAATCAAAATCGATTTTGGACCCAACAC CCCAATTATAGTACACAGGCAGTACATGACAAATTTTTTTCTCAAACACC CACCCACTCCAGGATACATGCCACCTTCTGGTACACTGCC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001509TCONS_00001509Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001508TCONS_00001508Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001508-proteinTCONS_00001508-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000010supercontigsc0000010:923849..933588 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.31 0.42 0.96 1.01 1.3 1.26 3.67 3.59 1.56 0.9 0.62 0.94 4.42 5.33 8.55 5.73 1.17 0.74 3.93 3.66 0.36 0.7 0.11 0.17 1.25 1.29 0.36 0.31 0.34 0.4