XLOC_000131 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000131
Unique NameXLOC_000131
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000001:2131680..2143981-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000131 ID=XLOC_000131|Name=XLOC_000131|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12302bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001:2131680..2143981- (Clytia hemisphaerica)
GCTAACCAAAACTCAGTTTAATAAACAAACAGAATTTCTTCATGTTTTTA ATTTGATTTGGTGATTCTGGATGGTGACGGTGCTGTATTTGCCTTGTCTT TCTGGCTATTTGACAAGGACGTTGTTTTTTTATTGAGATTCGAATGCTAT ATGTTTTGTTGATAATAATAAAGGAATTGTTAATTTTTTGAATTTTCTAC TGGAGAGTTCTGTTATTTGAATAATTCCTGACATCGATAAGCTGCGTAAG GAAATTCCTTGTAACTCAGCAGTTAAACGGTGAAAAGCTGGGATAATTGT AAAAGATCCAAAGACTGCGCAATGTACATGTAGTCTTAACGTACACACAA AACACAACAACAACAANCGCGTAAAGAAATTCCTGGGAACACAGCAGTCA AACGGTGAAAGACTGGGATAATTGCAAAAGATCCAAAGACTTCGTTATGT AAATGTAGCCTTAACGTGCACACAAAACAACAACAGCATTCGAACAATGT ATATTAACAGGTTTATAAAAACTACATGTGTATACCTTATATTACTTGTA ACTCTGGTATATTCTAAAAGGACTAAAACAACTACATGGCAGAATCATGA TTTTTTAACGAATTTCCAATTGAAACGACTGATCGAAGAAAATGTATTAC GTAAAGCTGATATTGCTAAATTACCGGTAAGAGGCTCAAGAAGCCCTATC CCATGTTATTTTAACGTTCATCTAACGTCATACTGACGGCCAGGATGTTA TATCCACGTTGAAACAATGTCCTGTCACAGTTTGGAAAGGTAGAGCAGTA GCGTAGACATCGGTAAAGGGACATTTGCTTAGGAGAGCAGATTTAAGGAC ACCTTAATTATTTTTATGCCACAAATAGGTAAGTTCTTTGTCGTTTCAAT CTGCTATCCTACGCAGATCGTTTTTCGCCCCTGTCTACGCTACTGGTAGA 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GCGTTCTGAATGAGAAATAAGTGGTTTCATTTCCCATCCAGGAGTCTCGC ATCTAGCCCTTCGGGCTTGAAACTCAATCACCTATTCGATAAACTCCCTC ATTCGATTAAATTAATTCGATGAAAATTCAATTCCCCTTGAACTGTATTT ACACGATATAGGAGAGTATCGTTTTTGAAACTTTCTTGTCGACGATGACT TTTAATTCAATCGAATAATGGAGCGGAGCGAGGAGTGGAACACCGAATTA GAGAGCGTTAGTGTCCAAACCGTAGGATTAAAAAGGGGAAATGGATTTTG GAGCGAAGGTCAGGGATAATGGCATTTCTCTGGGTTTAGTGGGGGGGGGG AGCAATCTGATGGCAACAAGTCGATCTGAAGACGGGATAATTTTCTATCC AGGGTTGGGAAAACTGAAGGAGGATTTTTTCAAATTTCGCATGGAGGCAG ACCCTGAAAGTCATACTTAAATGTCATAAAGTAGTAATTAAGTTCGATTG TATATCAGGGTCGAATACATAATTATCTCGTACCGTAGCCACTTGAACCA ATTTTTTGTAGTCTACTATTACTGATGGACGTTGGTACTTGGGCCCCGTC AACAAAATAAAAGGCCCCCTCACTCAAAATGGCTCGCCGGGACCCATTTG GTATGATCGTGAGCGCTAACATCATAATCATAAAAAAGTGAACTAAGCTT GGCGTTCTAAATCTACAGGCCTAGCAAGCGTGCAGCGACTTCGATTTTGT GGAGCTCAGTTTTCAGAAGTTGTTGCATTGATACTTGTATGAAATGTACC ACGGAGCAAGAATTTCAGTTTTGTTTCGGTGCATTTTTAAGAACGGCGGA GCGAGCCCAAAAGTGAAGTCGCTGCACACTTACTAGGCTAGGCCTGTAGA TTCAGAACGCCATGGAATAAGTGCCTGGGTTCGAGTTTGGATCGAATATT 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GCAAATGGTCAATATTATGCCGCAACCATCGGGAGGAGGATACATGGTTA TGCAACCATCAGTACCGTCATCCATTACACCAACTGGCAAAGCTAAGAAG CAGAAGAATAAGTCAACTAAAAAGCCAGCGATGAATAGTGGTAAAGCTAC TAAGGTAAAAAACAATATTAATAAGATTATTTAGATTGAGGACTCATACT TTTTTAAAATCCTTTGTAATTTGATAGATCCTTGTAATGCTGGGAATAAG GAACAATCGACTGTAAATACTTATCAACAAAGAATAACTCTTAACACTTT AAGACTGCATCATTAATAGAGCAATAAACAGTAAACAGTAGTAGCAAAAT TTAATAAGATATAGTCCGACCCTTCCCGCTTCCCGCTACTTGAATATAAA AAGGGAAAGATTTACTCTTTACTCCTTCAGTCTTCAAAAACAACTTCCTA CCATGTAATATTTCAAAAACAACATCTTGTATTTCCAGATAACCAAAATA CAGAAGAAGAAAGTGATGCCAGAACACAACACGGCCAAGAAGAAACATAC AACAGCTACTTCACAGCAACCAATCCCTCATCCTTCTGTAATAACAACTG AAAAACTGAAACCAGCAGTAACAAAAAGTAGTAAAACAGATAAAAAACCT ACTTTTACAACAGAGACAAAAAAAGTTGACATCAAGGCTAGCGAGTTAAA GAAGCAACAAAAGTTGTCACCCGTTGCTGATAAAAAGATTGAAAACAAAG CAATCGAGACAAAAACAAAGTCAAATGACTCGTCGAGCAGCAAAAAAATC AAAAATAAGGCAATTGAGAGAAAGAAAGAGCAAAATGTATCGCCAACGGT TGACAAAAAAATCAAAAGCAAAGCAATCGAGGCAAATAAGTTCAATACAA AGCAGAAGGTGAAGACCGACTCACCGGCCAAAAAACAGGACCAACATTTG 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ATAACCTAGGTGTCCGAAAAAAGTATTTTTTGTTGATTTATTTTTTCTTC ACAAAACTTTGAAATTTAAATTGCATTTCATTGTTAAAGCTTCAGGGCTA GTATAATAGACTATTTTAAAGATATTCTCAATTTTAAGAAAAAAAATTTT TCATTAGAAACTGAAAGATAGTACCAAAATCTACCAGTGTGCAAAATTTC AGCTTAATCGGATCAGAATTGGCCTAGTTATTAAAGTTTTAAATTCTGGT CAGTAAATTAATGGTCTGTAAATTACATTTTCGTAAATTGGGCATAACTT ACCAACCGCTGTTGCTATTAACAAAATTTTAAAAAAGTACTCCAATGAAT TCCAGTTTTTTTAGACACATTGTATAAAGCTGATACGCCTTATTATTACA CAGGAAGCAAGTAATATTACTGATTACGTCAACAATTTGGAAGACATCAA ACGACGATTACTGGATACGGGTGCAACAGTAGGATTTGTACTCTCAACAC CGGTCACTTATGATAAACGAAAAGACGATATGATAAGGAGATATAATCAT GCAGCCAAAAAGTAAATATTTTTTAATTTTGTGATTTTTATGATCTTAAA TTCGAAAGTGTGTTAAACTGCCGACAAAAAGAAATAAAGATTCTTTAAAC ATTTGTGATATTTAAGTCAATTTTTAACAGAAAAGCCAAAATTTCTGTTA CAACCCCAGTTGAATTTGGCTGATGAAATATTCGTCATCCCAGGGAAACC CCTGTCCCCCAAGTATGCATTCACTACCTTCCGATTTCGGAATGCAGATT GATTTAGAAAGACCAGGCTGTATAACAGAAGCATTAAAATAATGAAATAT CCTTATTAACTGTAAACTCTTATTATCAACCATAATAGTTTAAAATCTTG GCGAAACTGATCAGAATTGTATGCGGAGAGTGTACATAGGAAGTTCTTTA TTTCATTCTAGGGTGATGGAAACAGGTGAGGACAAAATAATGACCATCAA CCTTCACAAAATCGTGACCAGAGAGTGTGGCCCAGTCCCTTTTGAAAATT GTTATATGATGAAGAAACCGCATGACGTGGTGAGTTTTTCTTGTGTAGTT TTTGTATTTTGCAGTTTTCCTGTACTGCTCGAGAAAAAGTCCGGAGAAAG TATTGTCAGTATTAATTGTTCAGCGTTTGTTGTTCGTCTAGTTTGTTTAT CATTAAGAATAATATCTTCAAGGGTTGAAATTCAATTTTGCACGCGCAGA TTTTTGAATAAATGTTTAAACCTTTAACTGTTTAAGCTTACGATGTTGTT TTTCTTTTTGTAAAATGGCGAAGGAAAAGTTTCCTGGGATTCCAGAAATT TGGGGTTAAGTTTTCGACTATAATTTAGCAGCTTTAACATTGATATGCTA TTTGAAATGTTTAATATTTCTTCTACAGCACTATGGTGTGACAGGATCCA TAATGCTTGGCAAACGGGTTGCATCAGCAATCTCTTATCTTCTCAAGAAA AGAAAATTCAAACGAAGCTGGACAGGTTTGGTTTTTATACACCCAACAGT CATTAGGTTTAAGTTTACCAGCATCAAACGTTGTTAAATGGGTATACCTT AGCTAAGCGCACCAATGCAGCAACTTTTGGCTTTGATTATTTGATATAAT TCGGTCTTTATCAAACTCGACTCAACTCTCCTTTTAGCATTTCAGTTGCA TTCCAACCAGCCTCAAGACCTGGAAAAGGCCACATTTTTGATAAACTTTT GCTTCGCCGTAATTTTACTCTAACTTAAACCTGTATGGAATGATGTCCTA ACTCGCATAAGACCATCATAAACCGCCCAAAGCGACCTTTTCCCGTGGGT AGCAGGTCGGCCGCTAAGAGGGATTGACATTCCCTACTCTCGGGTACCTA ATAGCCGGGGGGGTTGGAAAATATCTCAAAACTTAATAAGCGGCGGGGGG TTGGAATAAAAATGTACTGGGTGGAAAACTTTTGAAAAGGAGGCTAATAC AGCAGAATAAGGATTAATTGGGGAACGGCTATATAGGTACACGACAGTAA TAGGAGCACACATTCAAAACTATGTTTGAACTTTTTACATATCTTTTTCA TTTGTAGCTTTAACACCATCCAGTGTCGAGTTAGCGTCCAACAAAACATT ATGTGCCGTGCCTGGTACAGCCTGTCCGGTAAATAGTGTTTGTATGAACA ATATGGTTTCACGTTCCGGACATGGTTGTTGTCAGCTGTCCGGTGGTGTC GATTGCGGTGACTCATGGCATTGTTGTCCGGCAGGTAGTTTTTGTCATCC AAAATGCTCGGACACAAAGTGTTCTTGTATGTCCGGCAATGCTTACCAAT CAATGATGAGTAATGGTGGTTATTCACCACAAGCTCAAACAATGTTACCT GGTTCTGCCGACACTGCTTATCCTTATGGTTATGCTAAACGTAAATTTTG ATAGGTAACATACTGTAGAGGAGATTATTGGTCATTTACGCATGAAGGTT CTTAATAGAGTTTATGTAAAATAACCATTTGTGTTATGCCTCCGGATACA GTTTGGTTGTTTTAATTTAAGCTCCCAAAAGCTTATAAACATAGTCGCAA TGATATCGGCCATCAAAGAAGTTAGAAGTGAAACAAGAACTTTCAAAAAT GGGAAAAAAACTGAGGATTGTGATGAAAATCCATTTTACATACGATGTTA TTTCAACATCCATGGAGAAATGTTCACAACGCAATAATGATGTCAAGAAG GATTTTAAGATATTTTATATGTTCATATTATAGCAAATTTATATCATAAG CA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000243TCONS_00000243Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00000242TCONS_00000242Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000243-proteinTCONS_00000243-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001supercontigsc0000001:2131680..2143981 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.5 0.41 0.24 0.15 0.57 0.29 6.05 6.91 4.36 2.87 3.85 3.29 8.9 6.98 4.82 13.44 7.74 7.43 0.69 0.56 3.9 4.1 2.62 2.68 4.91 6.61 0.47 0.33 0.21 0.1