XLOC_000116 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000116
Unique NameXLOC_000116
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000001:1490373..1500297-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000116 ID=XLOC_000116|Name=XLOC_000116|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9925bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001:1490373..1500297- (Clytia hemisphaerica)
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ATCAAACGCATAACCAATAAGTTTATAACAGAAGATGCTATTGTTAATCC AATGTATATCAAAATCATTGTCAAAGCAACGTATAAGTTTTGATTATAAT ATCCGTTATTATCTGGATGTTTTTTCTTGATTTCCTGTAACGCTACCAAG TCTCCAAACCCGATGGTTGTCAAGGTAACAAAGAAATAATATAAGGACCT GAAAAAGGACCAAGTCTCGTAGTAACTGAATACAGCTGCACCCAAACATT GAAAAACAAACCATATCATGACTCCAAATGCCACTAGATGAACCAAGTTG ACTTCTGTACTCTTCATACCTAGACAACGTTTCGTGCGACGTAATATGTA CGACATAAAGACGCCCATACGCTCCCCGATAGCTTGAAACATGGTTAAGT TCAATGGGATTCCGATACACGCGTATAACATACAAAAGATCTGTCCGCTG ATGGTTTGTGGAACTGAATGACCGTAACCTGAAATGAAATTGAAGAGATT TGTTTGTTTTTTTGGTGATGATTTATGTTACATATTTGCCTTCGGATGTT CTTAGCTTTTTGAGTTATAAGCCTTAAAATGTTCTTAATATTTTAGCCAT CGAAGCCATATGTTCTTATATAATTTGTTCTAATAAGAAAAAAACGTGTA GGAAAAAATGAAGAAATTTCTCTGTGACGTTTAAGCAAAATTTAAGGTTA CTACAAAACTGCATTTTATCGAAAGTTTTAAGCTTTTTCATCGTGAATTC TCCCAAAATGTCATATGAAATCTGTTCTATGAGAATTGACAGTCCGCAAA TTTTGATAGATTGCTCTTGAAGGAGAAATGATTAAAAGTAGTTCCTCGTT GAAAAGATAGTATGAAGTGGATGATTTCAACGTTTCAGAATCTAAAGATT TTGAAAATGAAGATGAAAAAAAAGATTTTTTCTATCAGAAACTCTTCTGA 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TTTTGTCCTGCATTTAGAAGCCTAGGAAGAAATTTTGTCGGCGGCAAGGG GGCTAAAAGGTTAATGTTAATCAGCAATCTCTCACCAACTTTTGCTTGTT CTCTTACACAGCTCCTATTCTAGCAATCGCCCGCCGCCTTTTTGTTCCCA CCCTCTCTGAAATTATTATTTAACAGACTAGTTTGCTAGTCTACTGCAAT GCTAATCTACCCTACTCTTTTTCTCTACTCTCTACTCACTTCAGCTCAAG ATCTATTGTATGAGTAATATTTCTCTCTTTCAGTAACATGGAACTGTAAA CAGAAGGCTGCGCGATGAGACCATTGACGTCAGACAGAGGTATGATCTTT TATCTGATTGCTAATCGGCTTTTAGTTCCCCTTGCTATCAAGTTAAAAGC TTTTCGTTCATACGTCACATCACAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000213TCONS_00000213Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00000212TCONS_00000212Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000213-proteinTCONS_00000213-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001supercontigsc0000001:1490373..1500297 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.83 0.89 1.56 1.75 2.77 2.29 2.44 3.36 1.42 1.25 1.86 1.18 1.07 0.94 1.63 1.84 1.45 1.59 0.67 1.2 2 1.36 0.96 1.26 1.87 2.26 1.31 1.28 1.51 1.27