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protein sequence of transcript:BL97350_cuf3 >transcript:BL97350_cuf3-protein ID=transcript:BL97350_cuf3-protein|Name=transcript:BL97350_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=867bp
DGTWTGIQPVCYSLKCQTLTIPAHGTVHMVGGSLFGGTATYSCDAGYEVV GTPVRMCQASRTWSGNEPTCEKISCVSLAAPLNGGISGFNQYGDTVTYDC STGFQLVGDQTRTCQSDQQWSGTQPHCQRLQCPQLGTIANGGYTGGLYYG DHASFTCNTGYDIQGNTSAVCMDNGQWSSTAPSCIAQECPPLTAPADGAM SGTFFVGDRVTFSCKTGFDLVGSNVIVCQATQTWSGTEPKCQSVTCSSLL APVYGSVRAPGNTYGDTATISCEPGYELIGDSVRTCEASGLWSGSTPLCQ RKCCSALSVPFGDYVGTICYNDTITFNCDPGYEMFGATGATCNETGHWDT AVPQCQKVCCNSSPVIPNGQLTTARGNCFNDVGLVDCSVGYVNYGNDILY CNASGQWEGKMPQCQLMCCGDPGSIRDGAVSYTGLCYGDVATYSCDNGFT LVGNATYTCSASGDWGPSPYCQPYSLCDRNTLSAPHGGTKICFDSPQGTD LIEYCQMHCNAGKDYSNHNEALYECSAATSWKWMVRRFVPGGFSSFIDVN VGICSAAAYFNPFAAVVANGLTITFSGAVDMAAVEAEMKNYLLTNNLCTL PCQVSNIELQIDPTARVGPRAKAARSNSRATMSVQLYAYADESRITATNT VQMEWVRLAGELSEVMTTLQQPGGITLTVQGVEVVLHAENMQISPPSLGC QLGEVQEGVRCRKCGQGTYYDIYENDCRPCPYATYQDESGQTECKPCKEG TTTAMMSARNSTQCQAFAECNCGIHPCKLTDSAGYVCDCLDGYEQADIAG ELLCKDIDECMQPDVCPNAACHNRPGTYSCECLPGFEEPNCIDIDECRYV GFCPDNSECTNTPGSYN Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000091:603008..612979- Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL97350_cuf3 ID=transcript:BL97350_cuf3|Name=transcript:BL97350_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=9972bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000091:603008..612979- (Branchiostoma lanceolatum) CTGATGGAACCTGGACAGGAATCCAGCCAGTTTGTTACTGTAAGTTACTG
AACTATATCTGTCTAATACTAGTATTTGGCTCAGGACTTAGCATCTCAGT
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AATCAAAGTAAAAATTAAATGTCTTTCTACCATTTATGATGGAGGTATAA
TGGGCGGCCTTATACTGATGCCACACGCATGTTTTTGATACATGTCATCA
CTGAGAAGTACAATTATTTTAGCACAGACGAATGAATTACTGAACCATGA
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TCATTAGAGAGAGAGAATCCCCTCACATGTTCTTGGTGCTGATTGGTTGA
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TTGCAAGGTTTCCAAGTCCCCATTGTATTTATTGGCTTCCTCCTCCATTA
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TGTTTGCTTTCAGAGATAGTAGTTCCACAATGTTTTCATTTCAGGATTTT
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TTGCAGTAGATTGTATTAAGCACAATCATTTATGTTCTCATATTTTAATA
CCAGTGATGGGAAGATTGTGTCATAATGTAATTTGTGTATGAAGTTAACA
TGAAGAATACTGACTGAACTGCAGTGAAACAAGCACTACCTGTAGTGATA
GTATTAAACATCAGTCTTGTTCTACCATTAGGACTGCAGTGTCCACAGCT
TGGTACGATCGCAAACGGTGGCTACACAGGTGGGCTGTACTATGGTGACC
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AGTTTTACTTTCTAAGTTTTAAGATTGACGTGCTAAAACCTTCTGCATGA
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TCTCCTGCAAGACTGGGTTTGACTTGGTGGGCAGCAATGTCATTGTGTGC
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ACAGATAATAATAGTCTGACTCTTTTTATGCAACAAAGTGATTCATTCAA
CCAATGTTTTGGTGACAATCTGTCACCTTCATCAAGGCAATTCTGACTGG
TTCACATTGCACTGCAGCACAGATGTCGCTTCTTATGGATGCGTTCCCAA
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CTCTCTCCTCGCCCCTGTGTATGGGAGTGTAAGAGCCCCAGGGAACACTT
ATGGTGACACAGCAACAATTTCATGTGAACCTGGATACGAGCTGATCGGT
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TTTTCTAAATCATATATTTTCATAGATTATTATTGATGAAAGAAAAATGA
CTACTCCTTCAGGTTATTAGTCATACATTATTTGTGATTATGATGATAAT
GATAGAATGAATTATATTCTGCTCAATAAAAATGAAAACATTTGACAATT
TCACTTTCAGTTCACCCAATGCACTATACAAGACATGCAATTGTGCAGAA
ATATGATACTTACCATCGGTTCAAGATGCATTGTCCGAATGTATATCAGG
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ACTATCTGCTACAACGACACTATCACCTTCAACTGTGACCCCGGCTACGA
GATGTTTGGAGCGACGGGGGCAACATGTAACGAGACTGGTCATTGGGACA
CGGCAGTTCCCCAGTGTCAAAGTAAGTAAGCAGCAGTGTGTAAAGAAGTT
GACATTGTGTATCATACTTACTACAGCATCTTGTCAATTGGTGTCATGGA
AAATCGTAATTACAGAGAAATTGTAACACTATGATACTTCAAAAGTACAC
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TGCCCACATACTCTACGTCGCCAATATGTTTTTTTAACACCAATCTTGTT
TCAAACTTTTGCCCAGAGGTGTGCTGTAACAGTTCCCCAGTGATCCCCAA
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AACGCAAGTGGACAATGGGAGGGAAAGATGCCCCAATGTCAATGTAAGAA
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TTGTATAGTCATGGCTTCTTTGAAATGAGACTGATTCAGAACTTGTCTAC
TGTGTACTGTATGTTGTAGGTGCATCAAAATATAAGCCTGCATGATGGCA
AAGAGACTTTCAAATTGTCAAAAATGATAAGTAGATTTTTTTTATATTTA
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TTGTAATGCACTCAAGTCACCTCCTTGAACACGGGAGCCCCATTTTTCGT
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GATCCGGGGTCTCCCAGATCCAACTAATTAGAAACAGGAGGCTCAACTGC
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TCTAAATTGTTCATCATGATTTCAATAGCTACTACTGTTTCTTTACTGCA
GTATAACTGTTTGCTTGGTTCTCTCCACCTGACAGTAATGTGCTGTGGAG
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TGCAACATACACCTGTTCTGCAAGTGGCGACTGGGGACCATCACCTTACT
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GTTCTTTCTTGAAGTTGGAAGTTCACCTAATATGTGAATTCTAGACAGAT
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GTGAATCGGTCATTAATTCAAGGTTATCAAATTCTGGAATAAATCTAACT
TCTTATGGATTTTCTGTCTGTCTTAACAAAAAGCTATCTTAAACTATATA
TGCTTAAGCCAATATTACTATATTAATTTATTAACTTAATGATTTATTGC
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TTAGATTCGATCTCTAACTTATTATACTTCACATAGGATTAGAGTGGTCC
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GGATCCTCATTACACTGCATCCCCTGCTAGTAATTAAATCATTTCAATCA
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GATGTTCTGGCAAACATTTTGTTCACTTCACTTCTTTCCAGCTTTTGCTG
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AAGTAAGATGTGGAGCAGGATCTGGTTTGGAATCATTTAAAGTACGAGAA
AATTTTAGATTTAGAAATATACTAGAGTTGAATGGAAGGGTAAGGTCTCG
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ATTCCTAGAATATAAACTTAACATTGAATTTATAGAGAGCAATCCAAATA
TTCTTTGGGATTTTTACAGGTCTTTCCATTGAATTGGCTTTTACTGGTCA
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ATCGATGAGTGTCGGTATGTGGGTTTCTGCCCAGATAACTCCGAATGTAC
CAACACACCCGGCAGTTACAAC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000091:603008..612979- >transcript:BL97350_cuf3 ID=transcript:BL97350_cuf3|Name=transcript:BL97350_cuf3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=44217bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000091:603008..612979- (Branchiostoma lanceolatum) GATGGAACCTGGACAGGAATCCAGCCAGTTTGTTACTCCTTGAAGTGTCA GACTCTGACTATACCTGCCCACGGAACTGTACACATGGTCGGAGGGTCGT TGTTTGGTGGCACCGCCACGTACTCCTGTGATGCTGGGTACGAGGTGGTC GGGACCCCCGTCAGGATGTGCCAAGCTAGCAGGACATGGAGTGGAAATGA ACCAACTTGTGAAAAAATATCCTGTGTTAGCCTGGCCGCTCCCCTCAATG GTGGGATCAGCGGGTTCAACCAGTACGGAGACACGGTGACATATGACTGC AGCACTGGGTTTCAGTTAGTGGGTGACCAGACAAGGACCTGTCAGAGTGA CCAGCAGTGGAGTGGAACACAGCCTCACTGTCAAAGACTGCAGTGTCCAC AGCTTGGTACGATCGCAAACGGTGGCTACACAGGTGGGCTGTACTATGGT GACCATGCCTCCTTCACGTGCAATACTGGGTATGACATTCAGGGGAATAC CAGTGCAGTTTGCATGGACAACGGACAATGGAGCAGTACAGCACCTTCAT GCATAGCACAAGAATGTCCTCCCCTGACAGCCCCAGCTGATGGTGCCATG AGTGGAACCTTTTTTGTGGGTGACAGGGTGACATTCTCCTGCAAGACTGG GTTTGACTTGGTGGGCAGCAATGTCATTGTGTGCCAGGCCACTCAAACAT GGAGTGGAACTGAACCAAAATGTCAAAGTGTTACTTGCAGCTCTCTCCTC GCCCCTGTGTATGGGAGTGTAAGAGCCCCAGGGAACACTTATGGTGACAC AGCAACAATTTCATGTGAACCTGGATACGAGCTGATCGGTGACAGCGTCA GGACGTGTGAAGCCAGCGGACTGTGGAGTGGTTCCACGCCTCTTTGTCAA AGGAAATGCTGTAGTGCTCTGTCCGTTCCGTTTGGTGATTATGTGGGAAC TATCTGCTACAACGACACTATCACCTTCAACTGTGACCCCGGCTACGAGA TGTTTGGAGCGACGGGGGCAACATGTAACGAGACTGGTCATTGGGACACG GCAGTTCCCCAGTGTCAAAAGGTGTGCTGTAACAGTTCCCCAGTGATCCC CAACGGCCAGCTGACTACTGCACGTGGCAACTGTTTCAATGATGTGGGCC TGGTAGACTGCTCGGTAGGCTACGTAAACTATGGAAACGATATCCTTTAC TGCAACGCAAGTGGACAATGGGAGGGAAAGATGCCCCAATGTCAATTAAT GTGCTGTGGAGACCCAGGGTCCATCCGGGATGGTGCAGTAAGCTATACGG GACTGTGCTACGGTGATGTTGCAACCTACTCGTGTGACAACGGATTCACT CTTGTGGGCAATGCAACATACACCTGTTCTGCAAGTGGCGACTGGGGACC ATCACCTTACTGTCAACCTTACAGCTTGTGTGACAGAAACACCCTGTCAG CTCCACACGGAGGCACCAAGATCTGTTTTGACAGCCCCCAGGGAACGGAC CTCATAGAGTACTGCCAGATGCACTGCAACGCCGGGAAGGACTACTCCAA CCATAATGAGGCTCTGTATGAATGTAGCGCTGCAACCAGCTGGAAGTGGA 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AAGGAAATGCTGTAGTGCTCTGTCCGTTCCGTTTGGTGATTATGTGGGAA CTATCTGCTACAACGACACTATCACCTTCAACTGTGACCCCGGCTACGAG ATGTTTGGAGCGACGGGGGCAACATGTAACGAGACTGGTCATTGGGACAC GGCAGTTCCCCAGTGTCAAAAGGTGTGCTGTAACAGTTCCCCAGTGATCC CCAACGGCCAGCTGACTACTGCACGTGGCAACTGTTTCAATGATGTGGGC CTGGTAGACTGCTCGGTAGGCTACGTAAACTATGGAAACGATATCCTTTA CTGCAACGCAAGTGGACAATGGGAGGGAAAGATGCCCCAATGTCAATTAA TGTGCTGTGGAGACCCAGGGTCCATCCGGGATGGTGCAGTAAGCTATACG GGACTGTGCTACGGTGATGTTGCAACCTACTCGTGTGACAACGGATTCAC TCTTGTGGGCAATGCAACATACACCTGTTCTGCAAGTGGCGACTGGGGAC CATCACCTTACTGTCAACCTTACAGCTTGTGTGACAGAAACACCCTGTCA GCTCCACACGGAGGCACCAAGATCTGTTTTGACAGCCCCCAGGGAACGGA CCTCATAGAGTACTGCCAGATGCACTGCAACGCCGGGAAGGACTACTCCA ACCATAATGAGGCTCTGTATGAATGTAGCGCTGCAACCAGCTGGAAGTGG ATGGTTCGTCGCTTTGTGCCAGGCGGCTTCAGCAGTTTCATTGATGTCAA TGTTGGGATTTGTTCTGCCGCAGCCTATTTCAACCCGTTTGCTGCCGTGG TTGCCAACGGTCTGACCATCACCTTCTCCGGAGCCGTTGACATGGCAGCT GTTGAGGCAGAGATGAAGAACTACCTCCTCACCAATAACCTCTGCACTTT GCCATGTCAGGTTAGCAACATTGAGCTGCAAATTGATCCTACGGCCAGAG 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GAAGGACTACTCCAACCATAATGAGGCTCTGTATGAATGTAGCGCTGCAA CCAGCTGGAAGTGGATGGTTCGTCGCTTTGTGCCAGGCGGCTTCAGCAGT TTCATTGATGTCAATGTTGGGATTTGTTCTGCCGCAGCCTATTTCAACCC GTTTGCTGCCGTGGTTGCCAACGGTCTGACCATCACCTTCTCCGGAGCCG TTGACATGGCAGCTGTTGAGGCAGAGATGAAGAACTACCTCCTCACCAAT AACCTCTGCACTTTGCCATGTCAGGTTAGCAACATTGAGCTGCAAATTGA TCCTACGGCCAGAGTGGGACCACGAGCAAAGGCTGCCAGATCTAACAGCC GTGCCACCATGTCAGTCCAACTCTACGCCTACGCAGACGAGAGCCGCATT ACCGCAACGAACACAGTTCAGATGGAGTGGGTTCGTCTGGCTGGAGAACT TAGTGAAGTGATGACAACCCTCCAACAGCCAGGAGGGATCACTCTGACAG TCCAGGGAGTGGAAGTTGTGCTTCATGCTGAAAATATGCAGATCTCCCCA CCAAGTCTGGGATGCCAGCTGGGAGAAGTACAGGAGGGGGTTCGGTGTAG AAAGTGTGGCCAAGGCACATACTATGACATATACGAGAACGACTGTCGCC CGTGTCCGTACGCCACTTACCAAGACGAGTCGGGACAGACCGAGTGCAAA CCATGCAAGGAGGGAACCACAACTGCCATGATGAGTGCCCGTAACTCCAC CCAGTGTCAAGCTTTTGCTGAGTGCAACTGTGGCATCCATCCGTGCAAGC TGACCGACTCAGCAGGATACGTGTGTGATTGTCTGGATGGGTACGAACAG GCAGACATCGCAGGGGAATTACTGTGCAAAGACATCGATGAGTGTATGCA GCCAGACGTTTGTCCAAACGCTGCATGCCACAACCGCCCGGGGACCTACT 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ATCGGTGACAGCGTCAGGACGTGTGAAGCCAGCGGACTGTGGAGTGGTTC CACGCCTCTTTGTCAAAGGAAATGCTGTAGTGCTCTGTCCGTTCCGTTTG GTGATTATGTGGGAACTATCTGCTACAACGACACTATCACCTTCAACTGT GACCCCGGCTACGAGATGTTTGGAGCGACGGGGGCAACATGTAACGAGAC TGGTCATTGGGACACGGCAGTTCCCCAGTGTCAAAAGGTGTGCTGTAACA GTTCCCCAGTGATCCCCAACGGCCAGCTGACTACTGCACGTGGCAACTGT TTCAATGATGTGGGCCTGGTAGACTGCTCGGTAGGCTACGTAAACTATGG AAACGATATCCTTTACTGCAACGCAAGTGGACAATGGGAGGGAAAGATGC CCCAATGTCAATTAATGTGCTGTGGAGACCCAGGGTCCATCCGGGATGGT GCAGTAAGCTATACGGGACTGTGCTACGGTGATGTTGCAACCTACTCGTG TGACAACGGATTCACTCTTGTGGGCAATGCAACATACACCTGTTCTGCAA GTGGCGACTGGGGACCATCACCTTACTGTCAACCTTACAGCTTGTGTGAC AGAAACACCCTGTCAGCTCCACACGGAGGCACCAAGATCTGTTTTGACAG CCCCCAGGGAACGGACCTCATAGAGTACTGCCAGATGCACTGCAACGCCG GGAAGGACTACTCCAACCATAATGAGGCTCTGTATGAATGTAGCGCTGCA ACCAGCTGGAAGTGGATGGTTCGTCGCTTTGTGCCAGGCGGCTTCAGCAG TTTCATTGATGTCAATGTTGGGATTTGTTCTGCCGCAGCCTATTTCAACC CGTTTGCTGCCGTGGTTGCCAACGGTCTGACCATCACCTTCTCCGGAGCC GTTGACATGGCAGCTGTTGAGGCAGAGATGAAGAACTACCTCCTCACCAA 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000091 | genome | Sc0000091:603008..612979 - |
Properties
Property Name | Value |
Transcript id | BL97350_cuf3 |
Biotype | protein_coding |
|