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The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL96821_cuf1 >transcript:BL96821_cuf1-protein ID=transcript:BL96821_cuf1-protein|Name=transcript:BL96821_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=364bp
SIWSGDVPTCTRVECSELQSPTHGDSMGDNYYQDVMSFFCDSGYELDGLA TITCQADGAWSGSVPSCTRVQCPPLTAPDNGGKTGINYYQDVVKFTCDHG YELVGVPSLICQSDRTWTGDVPTCTRIQCPVLPPPANGVSSGSNFYLDVV TFTCDSGYDLEGDSSSTCQADRTWSSNVPSCNDIDECSAANGGCDHACTN TAGSFQCSCVVGFNLNVDSHSCDEIDECIFGNAGCQENCNNIIGSYRCSC GTGYRLNGDGHTCDDLDECSAANGGCGQTCTNIHSSFYCSCGTGYSLNAN GFLCDDVNECSNGNGGCDQTCINLIGSFQCSCQDGYGLNSDSFTCGGIFV FYSVISWLQSYSFQ Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000691:2636..6694+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL96821_cuf1 ID=transcript:BL96821_cuf1|Name=transcript:BL96821_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=4059bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000691:2636..6694+ (Branchiostoma lanceolatum) ACTCCATATGGAGTGGGGACGTCCCAACCTGTACACGTAGGAGATAAAGT
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TGTCTTTTATTCTGTGATATCTTGGTTGCAATCATATTCTTTTCAATAAG
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AAGCAAAAA Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000691:2636..6694+ >transcript:BL96821_cuf1 ID=transcript:BL96821_cuf1|Name=transcript:BL96821_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=8760bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000691:2636..6694+ (Branchiostoma lanceolatum) TCCATATGGAGTGGGGACGTCCCAACCTGTACACGTGTGGAGTGCTCAGA GTTACAATCTCCTACGCATGGTGATTCAATGGGCGACAACTACTACCAGG ACGTGATGAGCTTTTTCTGTGACTCGGGTTACGAACTTGACGGTTTGGCA ACCATAACGTGTCAGGCCGACGGCGCGTGGAGTGGCAGCGTTCCCAGTTG TACACGCGTACAGTGTCCACCGCTGACAGCTCCTGACAACGGTGGAAAGA CTGGCATCAATTACTACCAGGACGTGGTAAAGTTCACGTGCGATCATGGA TACGAGCTTGTTGGAGTTCCCAGCTTGATCTGCCAATCGGACAGAACATG GACCGGGGACGTCCCAACCTGCACACGTATTCAGTGTCCTGTGCTGCCAC CTCCTGCAAATGGTGTATCGAGCGGCTCCAACTTCTACCTGGACGTGGTG ACGTTCACGTGTGACTCAGGATATGATCTGGAAGGAGACTCCAGTTCTAC CTGTCAGGCAGACCGCACCTGGAGCAGTAACGTCCCGTCATGCAACGATA TTGACGAATGTTCAGCTGCAAATGGTGGCTGTGACCATGCATGTACCAAC ACAGCGGGCAGCTTCCAGTGCTCCTGTGTGGTTGGATTCAACTTGAACGT 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AGGCAGACCGCACCTGGAGCAGTAACGTCCCGTCATGCAACGATATTGAC GAATGTTCAGCTGCAAATGGTGGCTGTGACCATGCATGTACCAACACAGC GGGCAGCTTCCAGTGCTCCTGTGTGGTTGGATTCAACTTGAACGTAGACA GCCACTCCTGTGACGAAATCGATGAATGTATATTTGGAAATGCCGGCTGC CAGGAAAACTGCAACAACATCATCGGCAGCTACCGGTGTTCATGTGGAAC TGGCTACAGATTGAACGGCGATGGTCATACTTGTGATGATTTGGACGAAT GTTCGGCTGCCAATGGTGGTTGTGGTCAGACTTGTACCAACATTCACAGT AGCTTCTATTGTTCCTGTGGGACTGGCTATAGCTTGAATGCCAACGGTTT TCTTTGTGACGACGTCAACGAATGCTCCAATGGAAATGGTGGTTGCGACC AAACGTGCATCAATCTTATCGGAAGTTTCCAGTGCTCGTGCCAGGATGGC TATGGTCTAAATAGCGACAGCTTTACTTGTGGCGGTATTTTTGTCTTTTA TTCTGTGATATCTTGGTTGCAATCATATTCTTTTCAATAATCCATATGGA GTGGGGACGTCCCAACCTGTACACGTGTGGAGTGCTCAGAGTTACAATCT CCTACGCATGGTGATTCAATGGGCGACAACTACTACCAGGACGTGATGAG CTTTTTCTGTGACTCGGGTTACGAACTTGACGGTTTGGCAACCATAACGT GTCAGGCCGACGGCGCGTGGAGTGGCAGCGTTCCCAGTTGTACACGCGTA CAGTGTCCACCGCTGACAGCTCCTGACAACGGTGGAAAGACTGGCATCAA TTACTACCAGGACGTGGTAAAGTTCACGTGCGATCATGGATACGAGCTTG TTGGAGTTCCCAGCTTGATCTGCCAATCGGACAGAACATGGACCGGGGAC 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TCCACCGCTGACAGCTCCTGACAACGGTGGAAAGACTGGCATCAATTACT ACCAGGACGTGGTAAAGTTCACGTGCGATCATGGATACGAGCTTGTTGGA GTTCCCAGCTTGATCTGCCAATCGGACAGAACATGGACCGGGGACGTCCC AACCTGCACACGTATTCAGTGTCCTGTGCTGCCACCTCCTGCAAATGGTG TATCGAGCGGCTCCAACTTCTACCTGGACGTGGTGACGTTCACGTGTGAC TCAGGATATGATCTGGAAGGAGACTCCAGTTCTACCTGTCAGGCAGACCG CACCTGGAGCAGTAACGTCCCGTCATGCAACGATATTGACGAATGTTCAG CTGCAAATGGTGGCTGTGACCATGCATGTACCAACACAGCGGGCAGCTTC CAGTGCTCCTGTGTGGTTGGATTCAACTTGAACGTAGACAGCCACTCCTG TGACGAAATCGATGAATGTATATTTGGAAATGCCGGCTGCCAGGAAAACT GCAACAACATCATCGGCAGCTACCGGTGTTCATGTGGAACTGGCTACAGA TTGAACGGCGATGGTCATACTTGTGATGATTTGGACGAATGTTCGGCTGC CAATGGTGGTTGTGGTCAGACTTGTACCAACATTCACAGTAGCTTCTATT GTTCCTGTGGGACTGGCTATAGCTTGAATGCCAACGGTTTTCTTTGTGAC GACGTCAACGAATGCTCCAATGGAAATGGTGGTTGCGACCAAACGTGCAT CAATCTTATCGGAAGTTTCCAGTGCTCGTGCCAGGATGGCTATGGTCTAA ATAGCGACAGCTTTACTTGTGGCGGTATTTTTGTCTTTTATTCTGTGATA TCTTGGTTGCAATCATATTCTTTTCAATAATCCATATGGAGTGGGGACGT CCCAACCTGTACACGTGTGGAGTGCTCAGAGTTACAATCTCCTACGCATG 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000691 | genome | Sc0000691:2636..6694 + |
Properties
Property Name | Value |
Transcript id | BL96821_cuf1 |
Biotype | protein_coding |
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