|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL96410_cuf12 >transcript:BL96410_cuf12-protein ID=transcript:BL96410_cuf12-protein|Name=transcript:BL96410_cuf12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=176bp
MPEEDSITARQTSLRLIRTESPDGGDSTPGGRALRRSSSEDISRGGVTLL
TRGLSVDSATVRRPVRGESLDSSLRPGMRRGRSFDRPKMLSPASIPTRGS
GVEEFAPVFREKLKDEAIAEGCPVLLSCLPAGSPQPTVQWFKNNELIIES
ERIKLSSADDGKHTLHVPQVQLARDV Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000008:5978320..5991641+ Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL96410_cuf12 ID=transcript:BL96410_cuf12|Name=transcript:BL96410_cuf12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=13322bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000008:5978320..5991641+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATCAGCGCAGATCGTCTCAAGTTCTTCCACTCCAGGCGCAAGTGGCAGGT
AAGAAAGTGTCAAGCCTTATGTAAGCTTGTGGTTGTTAGTTGATGGCAAA
TGACACTTACTAATAGTATGATATATCATTGTGTTCTTTTGTTGGACCCC
ATTAAGTTCATTTCTATTTATCTGAACTTTGAGAAGAGCATTTTGTTGAT
ACCGCAATTAAAAAACTGATTAAAAATTGCTAGATTTGTTTTACTATCTG
TGCAGTTCTTAGGCTACAGCAATTTGATTTCTTGGTTCTTGGTTTTCAGA
AAAAAATCAATTTTACTAAAATAGGAAGATCAAAATGAAAAAAAAGGGAA
AGTCTGTACCTTTGGTACACAGTGTCAGGGAGCGAGCAGAGTCAGACGCA
CATTTTGACATTATGTTTTTGTGATGTCCCGTTGCTTAGATTTTACATTG
AAATGTCTCAGAACCAACTTGGTGTGGCCTTATCACGGTTGTGTACTGAT
CAGAAGACAATTCTCACCTTTCCAGAAATCTCTGATCTCAGTGGCCTTAT
CATGATTGTGTACTAACTAAAAAATGAACTGGGAAAAAAATGAACACTGA
ACTCGTCGGGCACCCCTCAAGCCATTGGCCACCTTAAAACTGATTAATCC
GACTTTGTACATGTATGTGTAAAAAATGACTGACTGATTGTCATCCCTAC
AGAAATCTCTGTGGGTGCTTCCCTGAAGATGCATCCGATATCGCAGGTTC
TGGCCATAATTTGTATGAATACTCAGGCACCCCTGGTCAATCAGTGGGCA
AATATTGTTGCAGAAACAAAATGCAATGTTGTACGATGTTGGGGTAGTAT
GTCATAATAAATTATACATATAATTATACATATAATTAATTATACTGCTT
ATAGCGGTGAGAAGCAGTACTCCAGTCAGAAGCTCTGAAGAAGGTGTCTG
ACAGACACCGAAACGTCAGCAGGTGAGAATTACCGGTTGTGTAAAAAGAA
TCTCCAATACTCAATTATACATATAATATGTGTAAATAATGACTGTATTC
CCACCTCTACAGAAATCCCTGATCTCGGTGGGCGCTCCGCTGAAGATGCG
GCCGATCTCGCAGGTCCTGGCGTCGGCGGGCGGGTCCCAGTCGCTAGGCA
TCAAGCGTGGCCCTGACGACAGCGACTCCCCGCTGTCCTCCGAGGCGGAG
TCCACCGACGTCGAGGGGCTCACGTCTGAGGTAGGAACACGGGGGGATTA
TTATCATGATCTAGAGTATTTTTGGGTGTAATAACATCATGTTCTTCATC
TTCATCATACTTCATCTAACACTGGAAAGTCTCTTTTTTGTTAGTAAGAT
TTTAGAGCTCATTTTTATTTCCATTTTTGATTGTGCAATTTGAGCTTTAA
ATTTCCACTTTTGGTGGACACGAAAGTGTCTGTGATGTCCTCTTCCCTTT
AACTTAAAGAAACCATTAGAGATTGAATATTTGTAACATCGGTGACCAGC
GTTGCTAATTTCATCATTTCACCATTGCATCATTCATTCCATCCTTCATT
CCATCCTTCATTCTTCCCATCATGTCTCTTCCTTCCCTTCGTCCATCCTA
ACTCTCCCCCCACTCCTCAGTCCTCCCATAACCGTTCTCGTTCCCAGGGT
CCTCAGTCCTCTCGTAACCGTTCTCGTTCCCAGGCTGACACAGTGGACAC
CGACAGCGACCACGCGCCCTCACCCATCCCGGGGCGGCGCCCCCTGCCAC
CCCAACCCGGTACTGCAGCGGTTAAAACCCCAAAGAAGCCAGAAAAACGG
GAGATTCCAAAACTCCCGCAGTTGGTGATTCGGAGACCATCGTTAACAGA
TAGCGATGATAACCCTCTCAGTCCACCGCTAAGCCCACCCCTACATAGAG
AATGGGACAAACCGAAAGGCCAGGAGAGGTCACCGAAAGGTCGAGAGAGG
TCGCCCAAGCGTAGACCACGGAGCCCGAGTCCACGAAGGGGAAGGAGGGA
AGAAAAGAGAGATGAGAAGGAGGAAGGAAAGACACAAGGAGAAAGGACAC
TCAGACCTCCCCATTTAAGAAAGTCACGCTCATTTGAGAGCGATCGTTCA
CGGTCTCAAGACAAAACAAAAACCTCCCCCAAACTGATCAAAAAGAGCGA
CTCGACGGAAGACTTACGGAAAAAATCGAAAGAGAAGCCGCGGCCAATGA
GACGGGCGCATTCCGCAGACCGTTACCTGTCGTCCCGCGGTATCGAGTTA
CCAGGGAAGGACGGGGAAAACCTGGTTCACATGCTGCGCCGAATGGCCTC
AACAGAGAAACCGTCCCAGCTGGAGACCTTACCCGAGGATTCTGCAGAGG
AGGGGGCGACCCCACGTAGGGTCGGGTCGGAGGTTAGGTCAGAGGGCACG
ACCCGGCCGGCGCCCAGGGTGCTGTGGACTGTGGGGTCGGAGGAGACGAA
GAAGAAGAAGGAGGAGGGAGGGATGAAGATTCCCAGGAGCTCCATCATCA
GGTAACTACTCACCTGTAGATGGAGGCAATAGAAACCTGGCAATAGATAA
TTGGAAAATTTAATAACTTAGTACTTATGAGAAAATGTTAACACAATTAC
ACACAGCAAAAACATTTGCACCTTGGGGAGCTTTCAAGACGCACTCTTCA
ATCCAATCAGATTTTAGCATGTCCATCGTTCTTGTACATGTAGGCTAAGA
TGTCTGACAGGTGTAATTTTGCACTGAACTTCACTAACAGTAGACATTTC
TAGGTCACTGAACTGGAAAGGAAACCTTCCTTGACACCTCAAAAGTACAA
GGAAATAATTCTACAGCTTAAAAAACACTCACAAGCAAATAGATTAAACC
TACAAATAAAGCACATGTGTGTTTGTATCTAAGGCCACACCAATTTAATT
TCTTGGTTAACGGATTTTTATTTTCCCCCAAAAAAACTTTTAGAAAAGAA
AAATCATGAAAACAGAAAGCTGGCCCAGCCTACTGTTTTCATGATTTTTT
TTTTCTAAATTTTTTTTTTTTGAAAATAAAAATCCGTTAACCAAGAAATT
AAATTGGTGTGGCCTAAGCTGCATTAATTTCCGTTTCTGCCACACATTAT
TCTCCACAGCGGAGGCATGCGTGACCTGGACACGTTGGAACGCCCGCGGC
TGAAGCGCGGGAAGTCTGCGGAGGAGAGGCTAAAGGTCGCAGAAGGTCGG
GAAACGGAAGAACGCAGACGGAGGCTCAGGAAAGCCGGGAGCGCCGAGGC
TGCCCTCACAACATCTTCAGATGACGACTTACCGAGGGGTAAGGCCATGA
TAAGGCCACACCAGTTTAATTTCTTGGTTACCAGATTTTTATTTTCTAAA
AAAATGTTTTCATGATTTTCTTTTTCTAAAATTTTTTTTGGGGAAAATAA
AAATCCGTTAACCAAGAAATTAAATGGGTGTGGCCTAATAGATGAATTTG
AACCACAGGAACTGGTTTTGTCATAGAGGGGATTTTACTCGCAAACTGTC
TATGTCACCACGCATGTCCGTTAAGAATAGAACAACTTTTCCCAAACTCG
ATCCTCACCTCCAATAAATACTGAGAAAACATTAGATAGTAATCAAAATG
TCCATGAAAAATTCTTTAGCCATGAAAATGAAAACAAATCTCCAACACTT
TCATTGACATTTTGGCGACGCCTTAGGGGCGAGCCAAATTGGTATATATT
GTGTGCAGTTTGCAAGAATTCTAGGAATTGCACAGGAATGTGAAAGTCCA
TGGGACGATAACTCAAGAATGCCTGGATGTATTGTCTTCATATTTTGTAG
GTGGGTATGTCTGTGTGAGAGCTTGACATGATTGGATTTTGGGCCCCCTA
GCAATTTTCTATGGTACTGCAGGGGAACTATCTTTTTATGTTGCCAATCT
TGTTGATCTTGTTTTCCCTTTCGCACCCCACAGGAGAGGTTGCCAGGGAC
GACCGCAGATTAGGGGCGAGACGACCGGGGAAACTGCGCAGAGCGATCTC
CGCTGACGCAGACATCTCACGACCACTCGAACTCAGGTGGGTCGGGAATA
TAAGTACCAGACTTATCAACCTACGATTGCTGTGTTCAAAAATTTGTATT
TTCCTATGACTATAGTAGAGTGGAACTTGTTGCCACCAAGTAGTGTAGAG
GCATCCTCACTAGATAGCTTTAAACAATACTTGTAGAAGGATGTGCAAAG
GTTAGGTCGTCATGTTACACCTAAATCACATTTCAAAGGGTAAGACACAA
CCACACAAAATCCAATCTTTAATCAAGCCTTAAAGCATGGCAAAAGGTAA
TGGTTACCTTTTTTCATGAAAATATGCTTTGCATGTATACGCTTTACATT
CGTGAAACAAAAGAGGTGAGTAGAACAGTCTCCTGGCTCCTGATAATCGA
ACCCGGGCCCGCCAGCACACAGACCGCACGCACTAACCACTAGGCTAGTT
ATAATAGACTGGTCATTTGGTGGTGCTTGAACTCCATTGTTACATTTGCT
TCCAGATCAGATTTTTTTGCTGTACAGAAATAAAAAATCTCCCAACATCT
CATTTCTCCAACTGAGCAGGAGGCAGTCGTCGTCTGTCCGGATGCCGGAG
GAGGATTCCATCACGGCGCGGCAGACTTCGCTCCGTCTCATCCGCACAGA
GTCACCCGACGGGGGCGACAGCACGCCTGGGGGTCGCGCCCTCAGGAGGA
GTTCAAGCGAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAA
GGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTA
AGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGT
AAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGG
TAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAG
GTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCA
GGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACC
AGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAAC
CAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAA
CCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTA
ACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTT
AACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGT
TAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTG
TTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTT
GTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCT
TGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACC
TTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCAC
CTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCA
CCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTC
ACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGT
CACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGG
TCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGG
GTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGG
GGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAG
GGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGA
GGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGG
AGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGG
GAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGG
GGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAG
GGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCA
GGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCC
AGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTC
CAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCT
CCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATC
TCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACAT
CTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACA
TCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGAC
ATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGA
CATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGG
ACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAG
GACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCA
GGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTC
AGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGT
CAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATG
TCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCAT
GTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCA
TGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTC
ATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGT
CATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGG
TCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGG
GTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAG
GGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAA
GGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTA
AGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGT
AAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGG
TAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAG
GTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCA
GGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACC
AGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAAC
CAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAA
CCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTA
ACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTT
AACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGT
TAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTG
TTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTT
GTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCT
TGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACC
TTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCAC
CTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCA
CCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTC
ACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGT
CACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGG
TCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGG
GTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGG
GGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAG
GGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGA
GGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGG
AGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGG
GAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGG
GGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAG
GGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCA
GGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCC
AGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTC
CAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCT
CCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATC
TCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACAT
CTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACA
TCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGAC
ATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGA
CATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGG
ACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAG
GACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCA
GGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTC
AGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGT
CAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATG
TCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCAT
GTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCA
TGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTC
ATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGT
CATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGG
TCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGG
GTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAG
GGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAA
GGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTA
AGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGT
AAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGG
TAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAG
GTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCA
GGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACC
AGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAAC
CAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAA
CCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTA
ACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTT
AACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGT
TAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTG
TTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTT
GTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCT
TGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACC
TTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCAC
CTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCA
CCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTC
ACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGGT
CACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGGG
TCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGGG
GTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAGG
GGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGAG
GGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGGA
GGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGGG
AGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGGG
GAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAGG
GGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCAG
GGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCCA
GGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTCC
AGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCTC
CAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATCT
CCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACATC
TCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACAT
CTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGACA
TCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGAC
ATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGGA
CATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAGG
ACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCAG
GACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGGTAAGGGTCATGTCA
GGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTCGTTAACCAGGTAAGGGTTGTGTT
AGCGAGGGCTAGTCCACTGGTAGTGGTGTATATTCAACTTTCACACTTTT
TGAAAGAGTTGCGATGGATCGAAGTGAAGTTTCCAAACTTTTCGTGTTAA
AACTGTGTTGACAGCCACTCAAGGAGTATGGCAAGTCCACATGGATTTAT
ATTGTTCAGTTCTGTTGTAGCCAGGGCTGTCTCCAGGTCCCATCCCTGTG
GGGAGTCACTAGACAGCTCACTTGGGTCCTGAACATAGCCCTGGTACAAA
GAAAACTCTTAACTTTGTGAATGTTGCTGTTATCTTTTAGAGGCCTGTCT
GTGGACAGCGCGACGGTGCGGCGGCCGGTACGCGGGGAGTCGCTGGACAG
CTCGCTGAGACCGGGCATGCGGCGGGGACGCTCATTCGACCGGCCCAAGA
TGCTGTCTCCGGCCAGCATCCCCACCAGGGGCTCAGGAGTGGAAGGTAAT
ATAAGGCCATGATTATTAAGGGTTAGCTATAGGGTCTAAGCTATCTATCC
TGTCTCCTGGATAACTTGATATTTGGCAGGGTACTTTCTAGGAAAAATTA
CAAGGAATGACCAAGTGGTGGAATGGCGTGGAAGGGGGAAAATGGGTGGA
TTTTTAAAGAATCTTAAGTTAAAGTGATGCATTCTAAGGCTTTCTGAGAC
CCAAAATTACAGTCAGACATTTAAGAAAAAGGCCTGTTTAGTTATTGCTG
TGGAAGATGTTCATTTTCTGGTATATGACCCAAATATCCTTCCCACTTTC
AATAGTTTGTGCTTGTGCTCAGAGAGATATTAAAACACATTTGAACTAAC
GTCAAGTATCACAGATGGTCCCACATGTACTGTATGTCCCATTTGTTGTA
CTCGCAACACATGTTAATGCATACATATAACAAACATATCCACATTCCTT
CTGCCCTCCAGAGTTTGCACCAGTGTTCAGAGAGAAGTTAAAAGACGAGG
CGATCGCTGAAGGCTGCCCTGTGCTTCTGTCCTGCCTACCTGCTGGCAGC
CCTCAGCCTACTGTACAATGGTAGGTGGGACAACCTATCTGCATGTAGTG
CTGCTCATCTAATCTAACATTAATGATGCTGGAAAGTTTTACTGTCCTCA
GGACAGGATATTCTAGTAGTCTACTGTACTATATGTGTATATCGCCATTG
TTGTAAATACTAAACCTGTATAATACCTTTACTGCCTAATGATTACATTG
TGATGCAGCCAATTGCAAGTCCAACTACACTGAGACACAATTTCCAATAT
GCAAATGAGGTTGAACCTGTTCTTATTGGTCTTTCCCAAATATGCAAATG
AATCCCTCCAGGTTCAAGAACAACGAGCTGATCATCGAGAGCGAGCGGAT
CAAACTTTCCTCCGCGGACGACGGGAAACACACGCTGCACGTGCCACAGG
TGCAGCTGGCCAGGGATGTGGG Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000008:5978320..5991641+ >transcript:BL96410_cuf12 ID=transcript:BL96410_cuf12|Name=transcript:BL96410_cuf12|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2112bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000008:5978320..5991641+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCCGGAGGAGGATTCCATCACGGCGCGGCAGACTTCGCTCCGTCTCAT
CCGCACAGAGTCACCCGACGGGGGCGACAGCACGCCTGGGGGTCGCGCCC
TCAGGAGGAGTTCAAGCGAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTA
ACCAGAGGCCTGTCTGTGGACAGCGCGACGGTGCGGCGGCCGGTACGCGG
GGAGTCGCTGGACAGCTCGCTGAGACCGGGCATGCGGCGGGGACGCTCAT
TCGACCGGCCCAAGATGCTGTCTCCGGCCAGCATCCCCACCAGGGGCTCA
GGAGTGGAAGAGTTTGCACCAGTGTTCAGAGAGAAGTTAAAAGACGAGGC
GATCGCTGAAGGCTGCCCTGTGCTTCTGTCCTGCCTACCTGCTGGCAGCC
CTCAGCCTACTGTACAATGGTTCAAGAACAACGAGCTGATCATCGAGAGC
GAGCGGATCAAACTTTCCTCCGCGGACGACGGGAAACACACGCTGCACGT
GCCACAGGTGCAGCTGGCCAGGGATGTGATGCCGGAGGAGGATTCCATCA
CGGCGCGGCAGACTTCGCTCCGTCTCATCCGCACAGAGTCACCCGACGGG
GGCGACAGCACGCCTGGGGGTCGCGCCCTCAGGAGGAGTTCAAGCGAGGA
CATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGAGGCCTGTCTGTGGACA
GCGCGACGGTGCGGCGGCCGGTACGCGGGGAGTCGCTGGACAGCTCGCTG
AGACCGGGCATGCGGCGGGGACGCTCATTCGACCGGCCCAAGATGCTGTC
TCCGGCCAGCATCCCCACCAGGGGCTCAGGAGTGGAAGAGTTTGCACCAG
TGTTCAGAGAGAAGTTAAAAGACGAGGCGATCGCTGAAGGCTGCCCTGTG
CTTCTGTCCTGCCTACCTGCTGGCAGCCCTCAGCCTACTGTACAATGGTT
CAAGAACAACGAGCTGATCATCGAGAGCGAGCGGATCAAACTTTCCTCCG
CGGACGACGGGAAACACACGCTGCACGTGCCACAGGTGCAGCTGGCCAGG
GATGTGATGCCGGAGGAGGATTCCATCACGGCGCGGCAGACTTCGCTCCG
TCTCATCCGCACAGAGTCACCCGACGGGGGCGACAGCACGCCTGGGGGTC
GCGCCCTCAGGAGGAGTTCAAGCGAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACC
TTGTTAACCAGAGGCCTGTCTGTGGACAGCGCGACGGTGCGGCGGCCGGT
ACGCGGGGAGTCGCTGGACAGCTCGCTGAGACCGGGCATGCGGCGGGGAC
GCTCATTCGACCGGCCCAAGATGCTGTCTCCGGCCAGCATCCCCACCAGG
GGCTCAGGAGTGGAAGAGTTTGCACCAGTGTTCAGAGAGAAGTTAAAAGA
CGAGGCGATCGCTGAAGGCTGCCCTGTGCTTCTGTCCTGCCTACCTGCTG
GCAGCCCTCAGCCTACTGTACAATGGTTCAAGAACAACGAGCTGATCATC
GAGAGCGAGCGGATCAAACTTTCCTCCGCGGACGACGGGAAACACACGCT
GCACGTGCCACAGGTGCAGCTGGCCAGGGATGTGATGCCGGAGGAGGATT
CCATCACGGCGCGGCAGACTTCGCTCCGTCTCATCCGCACAGAGTCACCC
GACGGGGGCGACAGCACGCCTGGGGGTCGCGCCCTCAGGAGGAGTTCAAG
CGAGGACATCTCCAGGGGAGGGGTCACCTTGTTAACCAGAGGCCTGTCTG
TGGACAGCGCGACGGTGCGGCGGCCGGTACGCGGGGAGTCGCTGGACAGC
TCGCTGAGACCGGGCATGCGGCGGGGACGCTCATTCGACCGGCCCAAGAT
GCTGTCTCCGGCCAGCATCCCCACCAGGGGCTCAGGAGTGGAAGAGTTTG
CACCAGTGTTCAGAGAGAAGTTAAAAGACGAGGCGATCGCTGAAGGCTGC
CCTGTGCTTCTGTCCTGCCTACCTGCTGGCAGCCCTCAGCCTACTGTACA
ATGGTTCAAGAACAACGAGCTGATCATCGAGAGCGAGCGGATCAAACTTT
CCTCCGCGGACGACGGGAAACACACGCTGCACGTGCCACAGGTGCAGCTG
GCCAGGGATGTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000008 | genome | Sc0000008:5978320..5991641 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL96410_cuf12 |
| Biotype | protein_coding |
|
