Blg03305.17 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg03305.17
Unique NameBlg03305.17
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000460:59268..82589+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg03305.17 ID=Blg03305.17|Name=Blg03305.17|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=23322bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000460:59268..82589+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TAAATCGAGATGGATATTTATGTCGCCAAACTGACCAAGTCCATGTACAT ACCACCACCATGTTAGTGAACAACCAACGTCGAAAACAAATTGAGCGATG TTTGAGAGCGTCTTTATGCGTACGACTTGTGAAACACTGAAGATCACGAG AAAGGTGGGTCCGGTATTACGACAGCCAAGAAACAACACAGCGTGTTCAG CTTTTGACCTCAGAACTTCACAAATTCATACCAGCGCAGCTGGACCACTA TACCGACTTGTATATAGTAGTCTCTACATCAGGATATCCAGATAGTATAT ATCAAGTTTCCCTACTGCTGGTACTGCTTTTAGCAATATGGAAAAGATAC GCAATAAACGCAAAGTACGTAACAATAAAATAAAATAAAATCTATCGATA CTATTTTGCTAAACCTTAAGACCAAAACTGACGTCTAGCTATAGTATAGG ATTTTCGATTTGGTACAATGTTTTGAGGTAAGCTGTCGAATATATAATTA TAATACATTATGAATTGGCCATCACATGATGCAATTTATGAGGTTGGATG GTTGCAAGTTGAGTCATTGGGTCTTCATTTTGGTTGCAATTATATATGGC TGATTAAGCACATGAATTGGCGTCACTGCTGTCCATTTCTTTGCCACGTT TTCGTCATTTCGGATGGTGACGTAAAGCCGGCGGCCCCGTGTATGAGAGA GCCTCGGGCGTAACTCGTAAGCCTCAAGCGCCAAACCTCTGCACGTAAAA GAACCCAACACACTTATCGAGAAGAGTAGGGGTGACCCAGTGTGCTTGGC CAAAAACGCGAGCCGTGGCGAATTAACGCATTGCACTACCACTAGCTCCT TGAAAAAGCATCACGCTTCACCTCAAATGAGGATGACTGCTTCATCTTTT TACTTGCCACGTTTGCAGGTTCGACTGTCGGTGCCTCGCTATGCCAGCAC AAATCGTCTGAGCCAATGGCTGTACGTGTCCACGCATGGCGGCGGATTGG CCGAGGGACAGGACACGGCGGTTGATGTCACCGCCGGTAGAGGATGTACC GTGGTCGTCACCACACCGTCGTTTACAAGGGTAAAGTCGTGATTTTATAT GATATTTTTTTCGGCGTGTCTGTTTGTCTGTCTGTCTGTTTGCTTAAGCG TGTGTGTCCGTAGCTATTTGATTGTTGTAGCGTATGTAGTGTATGCTTTG CGTCACACTGGCCTAAGGTACTTTACGGTGGGTAACTATTAATAGTATTA TTGGTGTTGAAAAAAATTAACTAAACTTTCGAGTTCTCACTGTGAATTCT AAGTCACAGAAGAGCAAGAGGAGCAATTGACAAGTAACTGGTCATAAGGA ATTTTGACTTTGGCCAGCTCACTCCTATTGGGAATTACTTTTAAAACAAA AGTTTTATCGTTAATTCGGCCCCGATAGGGGTCTGGTGAAGTCTAGGAAG AGAGTATTAACAGTCTCCTGTCTGACTTCTATCTAAAATTTTACTTATAA CTTTTAGGTACTGCAGTGCGACAGACTGGGCTGTGGACAGACCCTGCGCT GTACGGCAGAGAAAGGAGCACTGCTGGCATACCTCCCACATCCAGCCGTC TGCTATAGCGGAGCAACATTCCAGAAGGAGCAGGTACAGAATAAAGAGAA TCTTTGTACACAACCAAGTGATTTATTCAATCGACGTTTTGGTGACCATC TGTCACTTTCCTCAGGGCAATTCTGACTGGTTCACCCACCTATAAGCAGC GACACCTATGCTGCAGTGCAATGTGAACAAGACAGAATTGCCGAGAGGAA GGTGACAGATGGTCACTGAAACGTTTGTTGAATAAATCAGTGACTTGTCA ACCTGGTGAAACTATACACGGAGATATGAGAAGCAGGTACAGTATCGAGA 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CGTAATATTACGTGTAAGTTTGAAACAATCGCAAAGGTTTTTTTCGGATT ATCTAGATATTATTGCCTAGCGCCTACATTGGGGAATTTATATCCGATAT CATATTCCCCTTCACAGGCAGACACAATGGCCTCGATGTAAAAGCGACTC CTATCAACAGAGACAAGAACAACAGGGAAGTGATCGGAGTCAACGTACAA TTTTTCGCTGAGACGACACAACAGGTGACCTACCGCGCCCATTAGTTGCT GCTTTTAGGTTCCAATTTCTTGTAACATCGCCTTTAAACTTCTGTAATTG AATAGTTGCATAATCCATAGTTTCCCTTAAATAGCTGCATAATCCATAAT TTCCCTTCTTTTCTCTTTTTAGGTTTATGACTTTCTCCGGGACGCACTGC AAGATCTTGTCCCGGTTTTTGGTGGTGACCCATTCTGCGACAGGTAGCAG TGTTGTCAACAAGATGCAAGTTTCCTTCAAAGTGATGCAACTTTATTAGT GCGTTCGATCATACTCGTGCAATCTGGTACATATCCTGACTTGAAACACG CCGAACTGAAAACACCCCCCAAGAAAATGTTTTTCAATGCCTTTACCTAT CATTTACTAGCTTACCTATCGATTAAGTAGGCATAACAAAATCTTGGATC GAATATAACAGATTATAAGATCGGTAGCTGCGAGTGAAACTTTTTCAGAT ACTTGTTTTAACCGTGTACATGTTGTTCAGCACCAAGGACAGGTCTGTCC GCATTTCACCGTGATGGAGCACAGCAATAGGGACAGCTCAGACATACATG AAGATATGTTCGCCCGTTGCTTTTAAGGCGTTCTGCACTTTGGACAATCT GATCCCGTTCAGCAATAAGGACAGTTCGGGCACAGAAATGTTCGCCTATT CCTTAAAAGGCGTTCAGCACTTGAAACTGTCTGTTCTCCTGTCAATGGAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000460:59268..82589+

>Blg03305.17 ID=Blg03305.17|Name=Blg03305.17|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=975bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000460:59268..82589+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGGAACCCTAGTGAAGACAATTGAAAATCCTTCTTTCCTTGTACATTT
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CTCTTCCATTTTGGTCAAAATCAGTTCAGTTCAGCAGTTTAATTGGCGTA
AGGACATATGTGAGGTGTTGGGTCCTGCTGGCCGTGTGCGCGCGGATGTA
TACAGGAGAGAAACTGGGGTCAAAGGTTCGACTGTCGGTGCCTCGCTATG
CCAGCACAAATCGTCTGAGCCAATGGCTGTACGTGTCCACGCATGGCGGC
GGATTGGCCGAGGGACAGGACACGGCGGTTGATGTCACCGCCGGTAGAGG
ATGTACCGTGGTCGTCACCACACCGTCGTTTACAAGGGTACTGCAGTGCG
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CCAGAAGGAGCAGGAGTTTTACCTTGACGACGCCGCCAGCCTGGTTGCTG
TTGACTGGTTAACGGCGGGACGAGTTGCCCTGGGTGAGAGATGGGAGCTC
AGAGGTTATCGCTCGACTACCAACATCTACATCAGAGACAAACTTGTGTG
TAACAACGCGACGGCTTTGGGCAACTGTTCCCTCCAGAAGACACAAACAA
TCATGGGAAATAATGACGTCATTGGTACCCTCGTTCTGATTGGTCCAGCT
ACGGACGGACTCTATGGAAGGATACTCCAGGGAGATTTGAATGGCAGACA
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GTTTATGACTTTCTCCGGGACGCACTGCAAGATCTTGTCCCGGTTTTTGG
TGGTGACCCATTCTGCGACAGGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:78825..78950Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:78825..78950Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:79984..80075Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:79984..80075Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:80691..80878Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:80691..80878Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:81235..81341Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:81235..81341Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:81490..82589Blg03305.17-exon-Sc0000460-1570713199:81490..82589Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03305.17Blg03305.17-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000460genomeSc0000460:59268..82589 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg03305