Blg03289.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg03289.0
Unique NameBlg03289.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000020:1103850..1123258+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg03289.0 ID=Blg03289.0|Name=Blg03289.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=19409bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:1103850..1123258+ (Branchiostoma lanceolatum)
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CAGACAGCATCCGCTGTCTTTCGTCAGTGACTAAAAGGAACAACTGGAGA ACCAGTTGCTTGAGTAACTGTCTTTTGTCGTATCTTGTTACCAGGATGTT TGCCATGTAATATATGGATTGTCACCCTTCATTGAGTGATTGTAATATAA TTTCAACAAATTTGTCTTAAATTTTGTGTTTTTTGAGCAAACATACATGT ACCAGAGACATTCTTTGCACAGACTATGACATGATAAACAGGGTATCACT TAGAAAGTTTGTCTAACTGGGTGGTCTAGTCCTACCGTATATAACTACTG TTTATAGATAGCCTATAAATCTAGAATTGCTCTGAAACCACCTATCACAA ATCACCTTTGGATTTATTTTCTAAAAGAGCCACATTTCAGACTGTCTTTT GTGTCTTTACAGTCGCAGAGCGGGAACAGAAGACACTGGAGAAGATCGGG AACGCCAGAAAAAAGATTAGACTAGAAATCGCCGACTTAAAGGAAAGGCT AAAGGGTAACAAACAGACCATACAGATGTTTAAGGAAGAAATCAGAAAGT TGGAAGAAACAGAACAAGTCGAGACAGAGACATGACCGTGAAGAGGAACA AGAAACAACAGTCCATGGGCTAAGATTGTTTTTTGTACCACGGAGTAGTA CCATATTGTTGTTGTTTACCCCGTAGTGCCTAGTGGCACATGGGTCAGCA AGTTTCCTTGCTGTTTCTGTAGCAGGGTATATTTTTACAGGGAGGGGTTG CTAGCCCATCCCCTTTAACATGCTTGAGCCACCTCCTTGAACATGGGACC CCCATTTTACGTCCCTTCCGAATGACGGGTGCAGCCCCAACCGAGATGTC CTGTCCCAGGATTTGAACCAGGGTCTCCCACTTATCAACTAATTGGAACC AGGAGCTCAACTGTGAGGCTGCTACCGGATGGGCTACAGGGATATCCGAA GTGGTACTACAATAATGTAGTGCTACCATGAATTTTTTTGAGTCTGCAAT AACAAAAATTTATTTTTGTTCTTGATAGTCTCTGTAAATAGCTTTCTTTG TGTAATCACGTGACCAAATGACGTCATCTAATTGGAATTTACTAAATTGA AAGAGCCAGGATAAAATATAAAAAAACAATAATTTTTGGTGAAACTTGGT GTATAGGTAAAACATACCCACACTCTTGGCCCATGGACTTATTAAAACAA GTAGTTATTGTTATGTGTAACTTGACAGGACCATTTTTTTGTCTCAGGAC TCTTATGTATTACATTATGATACATATCTCTATATGTCAAATGTATTAAA ATGATATTGTGAAGAAATCTTGTCTATCTCTTCAATGTCCTATGTTTTGT ATATAAGAG

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000020:1103850..1123258+

>Blg03289.0 ID=Blg03289.0|Name=Blg03289.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=699bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:1103850..1123258+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCTCAGTATGTTCAAGTCCAAGATGGCGGAGTATGGTCCGGATTCGGG
CGGTCGGACAAAGGGTCTGATGATGGTGAAACCCATAGTGTACGGGAACA
CAGCCAGGTACTTTGGCAAGAAGAGGGAGGAGGATGGACACACCCATTCC
TGGTCTGTGTACGTCAAGCCATTCAAGAACGAGGACATGTCGGTGTTTGT
TAAGAAGATCGAGTTCAAGTTGCACGAGACCTATGCCAACCCAGTCAGAG
TGGTGACAAAGCCTCCATACGAGATCACGGAGACTGGGTGGGGCGAATTC
GAAGTCATCATCAAAATTTATTTCAACGACCCCAACGAGAGACCGGTCAC
ACTGTATCATTTCCTGAAGCTATTCCAGACAGACACTAACATCATGCTTG
GCAAGAAGACCCTTGTGTCTGAGCACCATGAAGAATTGATCTTCCAGGAC
CCCACACAGATGATGCAGACGATGTTAAACAGCACGAGACAGATCACCCT
GGGGCCCTGGAAACACGAGACAGACTTCGCAGAGCGGGAACAGAAGACAC
TGGAGAAGATCGGGAACGCCAGAAAAAAGATTAGACTAGAAATCGCCGAC
TTAAAGGAAAGGCTAAAGGGTAACAAACAGACCATACAGATGTTTAAGGA
AGAAATCAGAAAGTTGGAAGAAACAGAACAAGTCGAGACAGAGACATGA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1103850..1104186Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1103850..1104186Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1106311..1106430Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1106311..1106430Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1108859..1108925Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1108859..1108925Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1118773..1118867Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1118773..1118867Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1120859..1120951Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1120859..1120951Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1121435..1121522Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1121435..1121522Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1122312..1123258Blg03289.0-exon-Sc0000020-1570713199:1122312..1123258Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03289.0Blg03289.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000020genomeSc0000020:1103850..1123258 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg03289