Blg03235.2 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg03235.2
Unique NameBlg03235.2
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000020:752954..776608-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg03235.2 ID=Blg03235.2|Name=Blg03235.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=23655bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:752954..776608- (Branchiostoma lanceolatum)
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TCATGGCGACCACCTGTCCATCGCGACCGTTTTTGCTCGGTCCCCTGGGT GGTCGCCTTGGGCAGGTTTGACTGTATATGATAACCTAATCACTAATGAA AGGGAATAACAACACGATTTCCACAGGTGACCTCCCCCCCTCCCTATAGA GCTGACTAAGGTACTGGTTCAATTCCATAAGACAAGTTTCCACCCAAACT TGTCAACTCGCCTTTTCCAGAAGGATAAACCTTGTCTGCTTTTCCTTTCC CTATCTCTCTCTCTGTAAACCTCCTGACATTACATGATAACCTAATCACT ATGCATAGGGAATAACATCATTTCCACAGGTGACCCCCCCCCTCCCCATA GAGCTGACTAAGGTACTGGTTCAATTCCATCAGACAAGTTTCCACCCAAA CTTGTCACTTTACCTTTTCCAGAAGGACAAATCTTGTCTGCTTTTCCTTT CCCTATCTCTCTCTCTGTAAACCTCCTGACATCATATGATAACCTAATCA CTAAGCATATATGCAGGGAATAAGATCATTTCCGCAGGCAACCTCCCCCC TCCCTAGAGCTGACTACGTACTGGTTCAATTCCATAAGACAAGTTTCCAC CCAAACTTGTCACGTTACCTTTTCCAGAAGGATAAATCTTGTGTGCCACT AGGGATATCTGTTGTTCTATGTCCTGCTGGTTTCAATCAGTAGGGTTATA AGGTGTAATTCTGTGGTAGCTGACATGAATGAGGGTCTGCATGCCCTTTT TCGTGAAGCGTTAGGAGCGATTTTAATTCACCGTTAATCGTTACCAGCCG CCCTGAATTCACCGTTAAGCGTTATCCGTATACCAATCGTGAAGCGTTAC TGGTCGTTTTAATTCCTCGTTAAGCGTTATTTGTCATCCTGAATTCAACG TTAAGCGTTATTGAGTAATTCCTCGTTACGCAGGAAAAAGCATTTCAGTG GGTGAAGATTTCAAAATTTTCTCCAGGGAGCACACGGCTCAGGCGAAAAT ATGTCAGGAGGGCGCCCCAAGCCCCCCACAAAATTTCAAGCTGAAACACT TCTATTTTTCACTCTACGAGCTAAGTTTTCTCCTCAAAATTCAGGAAATT AAGCGTTTCGTGGTTCACGATTTTAAAATTTTCCCCGGGTGCATGCCGGG CCTCCGTCGAAAAATATTGTCAGGAGGGCGTCGACCCCACAAAGTCAAAC TGAAACTCGTCTGTATTTTTTCACAAACAGAGATATCATTAAACTTAACT TGTATTACCAGTAATATTTTCCCGTTGAAATGCAAGAAATAGCATTTCAG GGTGTCAAGAATTTTCCCCGGGTGCATGTCGCAGCTCCGACGAGGTTTGG AGGGCGTGACGCCCCTCAAGCTGCAACTCTTCTGTTTTTGTTGTTGTTTT CTTTTAAATAGAGATGTCATAAAATTTAGCTTACTCTTCAGCAAAATCCC CCCCCCCTCAGAATGCAAGAAATAGCGTTTCAGAGGGTCAAGATCTCAAA ATTTTCGTCGCACCTTCGGCGCTCTTCATCATGATCATGAACATTTCGCC CACCAATAAAAAATTTCCTGTCGCCGCCGAACTTAAAGGGTTCGGAGCAG GCGTGCGAAAATGGCATAGCGTAATAGGTCTCTTGCCACGGACCAGGACG TCGTCTTCAGGGGTACCTCATGTTCTAAAAATGCTGAATTTACCGTTAAG CGTTATCGGCCGGCCTGAATTTACCGTTAAGCGTTATCGGCTGGCATGAA TTTACCGTTAAGCGTTGCCAGGACCCCCCCATGCAGACCCTCATGAATGA GAACCAAATGAATGTGACATGATTTTTGCCTTCCAGTCAGAAGGAGAGAT GCCGTACAAATGCACACCAGCTGATGATTGGGTGGTTAACGTGAACTTGA GATTTCATGTTGTGGTTGAACTTGGCATGCCGGAGGCTAAACATGGAGGT TTTTTGTATCATGCTTCTTTTATTTATTGGTTCAGCATGTACATGCCAGG GTTGCCCTTACCAAGGGTGAACCCATGTGCAGTCATACAACTATAGGATA TTAACCACTCACACCAGGAAGGACCCCTACTCTTTTCGATAAGTGTGGTG GGTTCTTTAACGTGCTTGAGGTGTGGCTCTCCTCAAACACGGAACCTCCA TTTAACGTCCTATCCGAGGAACATCCCTAACCGAAGCTAGGTACTAATTT ACACCTGGGTGAAGTGAGGAAAGTCGTGTAAAGTGCCTTTCCCAAGGGCA CAACATCGGGGCATATCGGTGGTTTTGAACCCAGGACTTCTTGGTTGTGG GCGAAGCACCCTACCGATTGCGCCACAGGATGCCACATCATGCTTCTTTA TTTGCAATAATGAAAAATTATGTGTCTATTTCAATAGCCAGTTTATGTGC TTATCCTCAAAGGATGCTCTATTTGAAAAACTTTTGGAACTGAGTGAAAT ATTCTCTTTTCAAATCTTATAATTTCTGCCATATGTACAAGTTTGATATT AATACAGATCCTATTTAATTTTCAAAAGTTGTACTGACTGAACTTCTTTC TGTGGTGTAGTGCATTTTTATTCTATACCATAAAATTGAAACCATAAGAT TAGCAAAAGTGTTTGATAAACCTCTTAGTTTGAACCCACATCTAAAGGTT ATCTTTTCTAAGATCAAAGATGTTTGAAATGATACCTTTTATAACATTTA TAACTTGAGTTGATGCTAAACATGGTTTAAATTAACCACAGGTGAACAGA GTTCTAGAGGAGATATATATTGTGTCTTCTGAGCAATAAGGTTGGAGAGC AAGAGACACTCGTTATTACTTCCAGGATATCCCTAAGTAGTGAGGAATTC ACCTGGGTACGTTTTGCCTCTTAAGTCTCTAAATGTAGCCATTGGCAAAG GCACAATAACTGATAAGGTCCAGAAATGGCAGCCTGGTCATGACACCAAT ACAGTAAAATGGTTAACAACCACAGAGCACTGGATCACCCCCACAAACCC AATGTGACAGTCAGCTGAAGAATTAAGAACTGGATTAGAAGCGGTTTAAG AGAAGAACTCCTTAAACCTAAACCTCTTAAACTTAAGAGAAGAGCACCTT ACTGAAGATTCAACTCTACTCTTACTAGTAACTGGACATTGGTAAAACTT CTAAGAGTCAACAAAAACAGTCTGTTAGTAAATGTTGTGATCTTCATCTT TCCAGTATTTAATAGATCAGTTTCATTTCACATTTATGCTTTTTAGTGTT TTAGAGAGAGCTTCTAATACTAGTACTCATATAACAATAATAGATGCTCT TATTAAATTACTAGGACTAAACATTATAATTCACAAATGTAAAGTCTGCA GAATGATTTCAATTCAATTGGTTGGTCTCATACAGTCATGTACACGTGAT ACTGTAATGTTTGTAGTCTATACACTACAAAAATGGCATTCTTGTTTTTT CTTTGTTAAAGAAAAGTTATTTTCCAGGAAGAAAACTATTCTTTGTGCAA GAAAGTCAGTGAAGACGTTAATTTTTTCCTTGAATATTTTATAATATACT TATACGACTAGAAACCTCTAGATATATATTTTCTTGTTGTTATAATTTCT GTGGCACAGAATTTACAAGAATTCATTTCAGGTATTTCCCTTATGTATAG GTTTTACTGCATGTGTTTTCAGTCTTGTTATGACCCCTTATGTAAAACTG TCCAGTATCGGCACATTAAGGAATCCATCAAGTCAGGATGAAGGCCAAGG ATTGTCATGGGAAGCGTCTTGCAGTGTCTTCCATGGTTCATTTCTTTTAA ATCAAGGTTGTTGGCAACTCTTCAAATCCGACATTCAACATTCTTTACCC ATCAAAGTTGCTCTGCTCTGTGCCAGGGAATCACGCAATGCTCCAGGGTC TTTATTTATACAGTACCGCAGTGGGTTTATAGGAAATGGATAGAAGGTGT TGAATTGATAAGTAGCCAACTTTATTTCACCCTGTACTATGAAGCTGTCA TAGGCAGTTTGATACAGTACAAGTCATGCATAGCTTCCATCTGAAACTCT TTTAGTAGTCTTTAAAGAAATGTTACTCAGTGCCATAGAGGTTCATTGAC CGAGGATTTTAACAGACTCAGCAGACTGAAATTCAGTTGTACTTGTTGTC TTGTTTCTAAACATTTTAAAAAAATTTTCTAAACATACCTTTATGAGGGC CTGCATGCCCCTTTTACGTAGAGCGTAATCGGCCGTCTTAATTTTACGTA GAGCGTTGCCGACCACTCCATAATTTAGCGTAGAGCGTAGGGGGGCTTTC TGAATTTAGCGTAGAGCGTAGAGAGGCTTTCTGAATTTAGCGCATTGCGT AGCGGCCCTCCGAATTTAGCGTAGAGCGTTGTCGGGACCCCCCCATGCAG GCCCTCCTTTATATCGATCTGTCCAAAATGTTTATACGGTATGAAATGTA GCATTTGAATACTGTAACCCTTCTTGAACTGATCCTTAGTAATTATAAGT TGAGCGTGCTATTTTCCACACATTCCCACCTCAGGGTTTGTTTACAGTAG GTATTTTAGGTCTATCTGTTCTCCATTATCACCACAAGGGGCCTTCTCAG CTGTTTACTTTAGTTTTATCTACAGTAGGATCATACCATTTAGAATTTAG GGAGGTCTGGTGATACTGTAAAATGTATTCATGTTTGCGTGGTTTTGATT TCGCGGTAAGAAGAAAATGGGGGTGTTTGCGGTGGTTTTGAGTTCGCATT TGAAGCAATAGTAGACGTGGTTTTTAAGTTTGCGGCGAAGAGCTTACCAC GAAAACCGTGAACATAAAACCACCTCAAACATTTCTGCATTTACAGTATT CATCTTGCTGTCAGAAATGACAGGGTCCTGGGAAAATATTATGTGTGTTT GGCACAAAATGGAATAGTCATTTTGTGAATGAAATCAAGGCAAAGTGATA TGATAGAATTATTTATGATAAGTTGAAAAATGCTATGTTAGTATTTTAAC AAAATTTTTCAAGGAAAATAGGCCATAAACAGAATAATCATCATGAAAAC TTCCATTTTTTAAATTTTTTTTTACCTAGGTTTAAAATTTTCTCATATGA TCAAACATGCACTTCTCTTATCCTGCTGCAGGCCAATCAGCTGGCAGATC CAGGCTTCAGCTGCCCATCCTGCTCCCAGCCAGCCAATCAGATCAGGCCA GTCAACAGTGTTCCAATCACCATCATGTCGTCATGACAACAGCTTGGAAT AGATTATATCTCTACCTGATTTTTTGGTGGAGAAGAAAAGTATTGGATAT ATCCTTGCTCTGGCTAGACCATCAAATTTTATGACAATATGAAAAGAATT TATATGAAACACCTGTTTTAAAAGAAGATTTTGATTTGGATTTCCACCCA TCATAGTGATGTTGATATGCAGTACATACACCTCGCAATTCAAATTTGTA ATTAATTGATAATTGTAATATCAAAACTGCAATGGTATAATAAGCATATA TTTGTATCTATTACTTTTAAAAATATTGATGACTACTGGTGAGTGTGTTC ATGTCATGTACAATGATAGACAATGATATGGTAAGAAATATAATTGATAA GAAAT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000020:752954..776608-

>Blg03235.2 ID=Blg03235.2|Name=Blg03235.2|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=900bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000020:752954..776608- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCGGCAAGTGAGGAAGAAATTCCACCTGTTCTGAGAGTTAGCCAGCT
TGATGCAGCAGAGTTAGACAGTGCCATCCTCCAACATCTCAAGTCACAAG
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CCAGAAGTAAATGCTTGCCTTAGATTTCTTCTATGGAAGTTTACCATCCA
TACTGCAAGTGCAACAGTAGGACAGAAGCTGCTAAACCTGAGATATAGCG
GAAGTCCATCCACGACAGCCGGCCTAACGGACCGACAGAAACTCCTGTAT
GCGCTTATCGTGGTTGGCGGGAAGTGGCTGCAAGATCGGTCACATGACTT
AGCCAGCTGGACCGGCCAAACGTCCCTGTTTCAATCGGTTAGTAAGGCTT
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CATACGGCCTGTTTACGACAGGAAGCAAGCCATCAGACAGGTCAGCTTTG
AGTACATGACCAGAGAGTTGCTGTGGCATGGATTTGCAGAGTTCTTGTTC
TTTCTACTGCCCTTGATCAACATCAGGAGATGGAAGAATGTTGTGACAAA
TCAGCTGCTAGGTTCGGGGCAGCAGGACAGCGATGTGAACCTGCGCGGTC
CTGTGGAACTGAAGGAATGTGCCGTGTGCGGGGAGTGGCCCACCAACCCA
CACGACATCGGCTGTCAACATGTCTTCTGCTTCTACTGCATCAAAGCCAA
TCAGCTGGCAGATCCAGGCTTCAGCTGCCCATCCTGCTCCCAGCCAGCCA
ATCAGATCAGGCCAGTCAACAGTGTTCCAATCACCATCATGTCGTCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg03235.2Blg03235.2-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:774884..774946Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:774884..774946Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:770041..770238Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:770041..770238Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:766267..766419Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:766267..766419Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:764417..764464Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:764417..764464Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:763611..763817Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:763611..763817Branchiostoma lanceolatumexon
Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:752954..753427Blg03235.2-exon-Sc0000020-1570713199:752954..753427Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000020genomeSc0000020:752954..776608 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg03235