Blg01944.7 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01944.7
Unique NameBlg01944.7
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000487:49310..73005+

Legend: exonpolypeptideCDS
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>Blg01944.7 ID=Blg01944.7|Name=Blg01944.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=23696bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:49310..73005+ (Branchiostoma lanceolatum)
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AATTTTGAGGCCACAATTTTGTCCTGGATGCTAGACCGACAGGCTAATAG TGAAGAACGTTATGATTTTGGTGCCTAAAAGATGAAAATATTTCTGTGCA TTTCGTCCCTAAAGAGTGCCCTATGTCCTTGGTCTTGTGTTAGAACCAGA GTTGGTGTTTGTTTTCAATCTGTTCTATAACACAAGCCAGCTGTGCAGTG AGTCGCTCTTGGGTCTTGCTTCGTCCATATCCAGACGGACAAGGTCTTTT TCGACGCCACATCCTTATTCATGGACAAAATAACTTAAAAGGCAGTGCGT GTTTGTACGCCCTACGCAATCCGCCATGCAACGTTGGGGCAATTTTGTCA CCTATAGCGTGCATCTAGCTCGTTGAAAGCCTTGCCTTATCCGTAAGCCC GCCACTTATGCATAACCCAGAGAGGGGCCCCACGATATCCGACACGGAGT AGATTGAATCCTGGCATTTTGTTTAGGCTTCTCCCAGCCCTTTGGGGTGA CCATGGTACCTGATATTGATACAGGCCAGGCTTCGTCTGCCTTTCAAGCA GTAAATGCTCCTGTTGGTAAGGATAATAAAGGAAGCAGTGACAGGTCTGT ATGGGTGAGAAATTTACACTCAATGTATGCCTCGACCCATTAATAGGCCC TATTATTTCACCCGGCTTTACACCACTGAGTTTTGTCAAAGGACAGTGTT TTTCTGACAAACATGGCTACCGTTAACAATTAACACATAAACACCTCAAA TATAGATATGTATACTGGTCACTCTCAGTCTGCAGTGCCCATTTAGATGC AGTGTCCATCGCATTTTCAGTTTGACCACTGTCCCTCGGGTAATCTATGG ACGATGTCCACTGACACATCGATCCGTGTCTGTTACGTGCCGTCTCCTTG GTGATAGTTCCTCATACCTGTCGAACACGTTAGATGGTTTGATTGATCGT CGAAATGCTACAACGGTAGTAGACAGGTGACTAGCACCGAAGGCTATAGA ATTTATCTTTTTATCTCTCAAAAATCTTGAAAGAATTTTCGCATTTCGTG GATTGGTCGCCAATCGACGACATGTCCGACAATACGTCTGTGCAAAAGAC GAGAACACGTCGTCGCTGGAAACGATAAAGTTGTTAACAGCTTTTTCGGC TTTAGAGAAGAGAAGTTTAGTGCTGAATAGTAGAAACACCCTGTGGGGCC CCGCTGCAACATGCCTCACCTATCCTGACCTTTCTGTTGTTGGAATAAAA CACCTTTGTTTCTCGATAGGATTTAGACCACTCCCACTGCCACGTATCCT GGTCTACATTCTTTGGCGATGTGTTCATCGGTGTTTTTATCAGCTATTTT TGTCGACTTTGGTAATTTCTAAACGTCACTGCTGGTTTCTATTTGTTCAG TAAGAGCTACGAAACTTCCCGTGGCTGAAAACAGGGGTGGGGGATTGCCA CTACGTCATACGAAACTTCTGGAAGATTCGGTTAAGACCGGCTGGAACAG GTTTAAACCGGCGTCGACAGGTTAGGTTATGGCTCAAGTATTTAGAGGAA CCACGCGGCGTCAGTGGTACGAATGCTTCTGTGACATTGTAAAATGGCAG CCAGTCGTTAATCAATCAATGCGTCTGAAAAGAAGGCATTGAGCACCATT AATTGAGGCGTATAGTCTTTCGCGTCATCGGCCAGCTTTACCATTGACCA GTGATGACCTTTGACCTCATTAGCATATGTCAACAACGCCAGGTAGTCAC AGTAGCCCCCCAGGATTCAAAATCCTGACAAGACTAATTACCATGACCGC GCAAGGAGGGACTTTCCATCGCATGATCGTGAGATGACCTCTGTCCTTGG TGCTGATTGGTTGTTAGTGCATAACCTCCGGCCGTATGACCATGTATGGT GGTGAAAGCGCCCACCTACTCGACCCTTGTCAAGGCTGGATTGAAGAGAT TCCGTGTCAAGGATAATGTTTACAGTACCGTTCATGCCCTTTGATGGTTG CCATACAGGGGAACTCAAGCGGTGGTGGTAAGACGAGCCGAGAGTTGGGG TGAGTTTGGGGTCTGTGTCGATTGAAGTTTTCGGTGTGTAGTCTAGGCTT GCTGGACTGATATACTGACTTATAAACATAGGCGAGGACTTCTTCTAACG CCAAGGCATTTCACGTATGTTGTAGTTATTTCAACACAGCTAAGGCTTCT ATTATATTTTGTGTCTCTTTTAGATTATTGACCAGAAGAACAATATTGTG TTTAATGTGTCGTTATCGCCCCCCCCCCCTACAAGGGGTGCTGAATACAA AAGACACAGTGGCACTGGTTACGTCTGAAAGCTAAGAAAAGAAAAAGTCG TCTTCAGGTATACCTTGCCTTAAAAGCTAAAAGCTTTCGTGTCTTAAAAA TTGAACATTTTTCTTGTTGTTCGCGATACATTAATTGTAGTAGGTTGGAC GTAAAAATCGTACTGTACTGACCAGGTATAGTCTTTATTCAGGTGTGTTT ACCTATGTGGCTTAGTTGTATTAAGAACAGGTGTGCACAGCTGTGCTTGG TCTAAAATTGTCCCTGTATTGAGGCGAGTTCAGAGGTCGCTTTTCTCAAG GGTCTAGCAATACGTACCGTAAGTTATCTAATACAAGCGACTGTCTCCAG ATCAAAGTTTCTTGTATGCTCTGCAAATATAAGGTATTTGTACAGTGCTT GTTATCTAAGAGTATTTGTTTGCTAGCATTCCTTACTAGCACATCTTGAA ATCAACTGTGATTTTAGAAGGGCAGAATTAGATTGTTGAATATGTTGTAT GATTTACAGTAACACGTTTTTTGCTGCTCTTTACACAGTGTCGGGGCTCA GGGCCACTACCGTAAATTGTTGACACCGAATCCTTTACACTAGGTTAGAG CTAAGCCTAAGTGATCCTTCGACAAAATTGCGGTCAGTGCCTTTTTGCAG CAGTGAGTGTAGAGTTGCTGTTTTTAACGAGTATGCTAAGAGCAAGGCCA GATACCACTTATTCAGTGGTCACCGTGTAACAAGACCCGAAGGACAAAGT TGTTGGCTAAATGGGTAGGTCCAGAACAACCCCCTAAGTCAGAAATCTAA GTCATGAATAAGGATGAGGACCCAGTAAGAGTGAAGGCTAACTGACCCAA TTCTTAATTCCCTACCTTTTTTTTAGAACTGAATGGTGTTGAATTTCAAT GTGATCAAATTTCTCTCCGCTGGCAGCTTTTCTAGACAAAAATATGTAAT TTTGCAGTCATGCACTAGTTAATCATTAGGATTTTTTCCCAGGTTTTCGG GTTATAAGGTTGGGTCGGCACTATCGAAGCTGGAATATTGTAAACATTAT CCCTGTTATATGTTTACGGAACTACGCTCTGTATAATAATATATCAAAGC GTTGTTCTGCCAATTAGTGTTGGCGTTTTTATAAAATGTTTCCATATAAG GCCCGACGACTGTGTTCCTGTTTTAGACAGGCATTGGTTCCTCTTCTCCA GACAGAAATAATCGTTACGTAGTCTGCTTCCCCCTTTCGTGTTTCAAGTT CCTCTTTGTGTAAACATATCGTAGCGGTTTTAGTCCATCTGAATTTACTC GAGTGAAGGTCTGCTCAGCGCAGTGTAATAGGTAATTTTACTGTAATTCT AAGGTATTTACATACTATTGATTCGTCAATAGCTCAACGTACCTTCTGGT TTTTTTTCAACCATCAGTCGACTGTTACGCTCATCAGCTTTCTGTTTGCT GCTTAAAATGTTCTTTCAAGACTTAGTCCTACGTTTCTAATGGTCAGGAA CATTATTGTTGCCACAGATTGAAGCCACTGTTCCACGATGATTGGACCCG ACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGACCGATGATGACCGG CGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCCAGCTGGCCCTGGC CTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAAAGGAGGCCACGGA AGAAAGGTAACACACCCTTTCCATGAGAAACTGCGACCGTTGAACGACCG CTGAGCGACCACTGGGTGACTAACAAAGTGACTCAAATAATTTCATAAAC AAATAACAAATCTTTTTTTACGTATATGTTTTGCTGTCTTTTAAATCGTA CTTTGATATCTTGCATCACATTCCTCTTATAAAATCAAGGGTTATACCAA GCTTATTTCGGTCGGCCAACGGTTTGTCGCCTCGATATGAATGTTAATTT AGTGTAGTATTAACATTGTTCTGTTTGCCAGTTTGGGGCCATACGGCAAC ATTCGTATGTGCAGTCTGAAGTGCCTCATGTAAGCAGATGGTGTATGCCT TTTCGTATGACATCATATCTGACACGACAGTGCTGTGTTTGGGCAGTAGC GAGTACTAGTGCTGAACTATTGTTTAATTACAGTGCTAATTATGTTTTCA TTAAATCTCAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAAAGGCAAGA AGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAGATTCTAGC AGTACAGCAAGAACAAGCAGATAACATTAGAAACATATGGCACTGTAAAT ATTTGTCAAATTATGTATTTTGATACTTTTATACAACCAAGTATACTGTA TATTCAGCTATTCTAATGAGGAAACTTTACTAAAATATGGAAGAGTTGAT GTTATCTTCACTGCAGTTTGAATCGATTCACCATTGCAATATTAATGTGT CTAAAACAACTTTACATTGATACAGATATGATATTTTTCTTCCTCGCGAT ACTTTATCTTGATAGCCAGCTCAACAGGTCCTCCCAATTCAATATGGCGG TAAAAATAGCGCAGCCTTGAAATCCACGTCATCAGGGGTTAGCTGCACCG GCTAATCAAACGGCGACAGTTGAACTATTAACCGTTAACGCAATCGATAT CGATAGTGCCCGGTACCGCCAAGCGGGGCGATCTAACTTGCAGTGTAATT CTGTTAGCAAAGACCCGGACCGGCTGTTAGCTTGTGTTATATAGACTATT CGCTAGAGGAATTGTTATCTATGTAGAGGTTGATTGCTGATGATCTTGTA GGGAACTACATGTCCATAGAAATGCTTAGTGTGGGACTAGTACAGTCATG CTCCCTGGCTGATCGCAGTCGGTAGAATTGTATTTACAGAGAAATACATA ATCATGATGTGTTCTGTTGTACAGTTTATTCTACATTGTGTATTAGCTAT AGATTTAAGTTCAATATCATAGATACAATTAAAGCACTCATAATGTCTTC AAAGTCTGACATGATCTTTGATGCTTCGATGTATACGAGTAAATACGAGT GAATAAAAATATGCGAGGTTTTGTCAAATTCACGAGTTTGTCCCTGTATA TTCCCCCTTCAGTTGCAGGATTGTTTTGATGTAGATATTAATTAGAAAAG TATCATCGTTTCTTCTTGTTTCCCATTCATACAACATATAACAGTAGCAG ATACAAGACCTGAAACACGACTTCCTAAAAAAGATGGGAACTGAAACCTG GCATTGGTTTTTAGTACGAGGAGGGGAGACTATACCAGATGCTTTCGTAA AATAAAGGGATGGAAATATTTCCTATTATTATGATTTTGTGCGCCC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000487:49310..73005+

>Blg01944.7 ID=Blg01944.7|Name=Blg01944.7|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=282bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:49310..73005+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATTGGACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGAC
CGATGATGACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCC
AGCTGGCCCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAA
AGGAGGCCACGGAAGAAAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAA
AGGCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAG
ATTCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.7-exon-Sc0000487-1570713199:49310..50121Blg01944.7-exon-Sc0000487-1570713199:49310..50121Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.7-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Blg01944.7-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.7-exon-Sc0000487-1570713199:71821..73005Blg01944.7-exon-Sc0000487-1570713199:71821..73005Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.7Blg01944.7-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000487genomeSc0000487:49310..73005 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01944