Blg01627.0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01627.0
Unique NameBlg01627.0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000173:231571..283748+

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01627.0 ID=Blg01627.0|Name=Blg01627.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=52178bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000173:231571..283748+ (Branchiostoma lanceolatum)
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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000173:231571..283748+

>Blg01627.0 ID=Blg01627.0|Name=Blg01627.0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=2154bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000173:231571..283748+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGACATCACTAGAGGCAGTCTGGAGAGCATCACTAAACCGGCGCGGTC
CGGTCGGTCCCGCCCTGACAGTAGGGTGTCCCTGAGCAGTGCCTCCTCCA
GGAGGAGTTACACTGGAACATCCCTGGGGTCGCTGGAAATACTTACTCCA
GAACCACCACTGCTTCAGTGGAGAGGAGAGCTNAGTGGTGAGGAGAGCTC
CAGGTACCGACTGTCCAGTGAGCTGTCCGACGTGCCCCAGTATGACCGCA
GCGGTGCCCTCAGTCTGGGGAGACACATGGAGGAGGCCTACAAGGCAGGG
GTGGAGGCTGCACAGAAGTCCATCGCAGCCAGCCAGCTCATTCCAATAGG
GAGGGAGATGGGAACACCTGATGACGATGATGATGTTTCTCTTAATGAAA
GTGGGACGGATTCTCCACTGCCCATCACGGATGGACAGGCTGAAGGGGAG
GGCGGAGGAGATGAGGACATTGAGGACCCAAAGCTGCGAGCAGCCATCAA
GAAGATGGAGAAACTTGACCGCATCTTGGCCAAGAAAATGTTAAGGGAGA
AAGAAGTCAAGAGACAGCGGATGGACCTCTTTAAAAGGTTGAAGGACGAG
ATGGGTGATATCAAGCCCGAGGGACGGGATGAACAGAAGGAGGTGTCACA
CAACACCATGAAGTTCCTCGCTCTCGCACCTCCTGACAGTCACAACCAAG
TTGTTTATGAGGAGAGCCCAGAGTTTGTGCCAGTGTTCCAGACCCAGGCT
GAGGAGGATGGGCGCAGTACTGCCTCCAGTAAGACTGGGAGTCACGCTAC
CACAGACAGGTCCACAATCAGGGGCACATCAGGAGGACAGAATTCCCGCG
CTAGTTCTCAGCAGAGCTCCGTCGCAGGTGCTGCTAGCGGCAAGGAAGAT
CAAAGAAGAAGAAGACGAGAGAAGAAAAAATCAAGCAACAAGGAGGGCGG
CTCTGGAGACAAAGAGAAACCCGATTTCATCAAGAGAAACATTCAGTTGG
CGTCTGATGCGAACAGCCTGATCGCCATGACAGACGACGAGAAGAAGCGA
CTGGAGGAGCTTCTGGAGAACATTGATACAGAGGAAGACAGTCAGGCTGC
AGACACACCTGTTAACCCGTTCCAGCTGGCACTGGTCCCCGGCACCGGTT
TCACACCAGAGGAGGACGACATGAAGGCGCTCAGAGACATCGACTCTAAA
CTACAGGTGTTGTTACCACCACATGATTATGAGTCGATCTGTAGCAGTCC
CAGGAACTTCGACATACAGAATGACGAGCTGTTCCAGATGACGGACCTGC
GGTCGACGCTGGACGTGATGCAGCTGGGCGAGCGCGTGCTGCGGGACACG
CGGCAGGTCCGAGACCAGCAGCACCGACTGCAGGACATCGAGAGGGAGCT
GGAAGAGCTGCAGACACAGGTGGAACTGGAGATGGAGTCCCCCAGCCTGT
CGGAGTACCAGTTACAGGCCCTCCTGGACCAGTGTGCCCAGGTGTCCTCT
CGAGCCACCTCCGAGACCCAGTCCCTCCAGGAGTCCCTCTCCCCCAGATC
TCAGGCCTCCTCCAGATCCTCCCACCTCACCATGGCCTCCGTACCAACAC
CCAGTCTGCCCGAGGACACCCTCAGGAAGCTACTGGAGGAGGCCAGCAAG
TCGGTCAGAGTGAGACGTACAAGTGAAGAGTCCGACTCTGAACAGCAGGG
ACTGCCTTCCTACATGGAGATGGCAGAGGGAGCACTAGGCAGGAGACTGA
CTGTGTTAGAAGATGTGAATGGAGAGGTGGACGGGCCACCTGAAGATGGG
AGCACCTCCCAGCCCGAGGGGGACCTCGAGTTCTCCTACCTAGCCCGGGC
ACAGGCTGCACTGGCTGCCAGGAAACAAGACATACTAGTTGAGTCAGTGT
CCGAGGACACCATACAGGAACTACTACAGAATCCACGAGCGACATCGCAG
TCGTCCTGTCGGAGCCCGCGACCCCCGTCCAGCTGCGGCAGTCCCAGAAC
CCCCAGGGGGTCCGCCGAGTCGGACGTGTCTCCACGTAGGCCTGCCGCGT
CGCCGCGGGAGGGCCCCCCACAAATGGGAATCTGGCTGGAGCAGGGCAGC
CAGGGTGGAACACATGAGGGAGATTTAATGCGGAGCGATTCCGGGCAGGA
TTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01627.0Blg01627.0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:231571..231738Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:231571..231738Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:232678..232858Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:232678..232858Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:233676..233800Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:233676..233800Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:234752..234864Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:234752..234864Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:235067..235179Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:235067..235179Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:253205..253336Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:253205..253336Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:254008..254171Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:254008..254171Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:262507..262605Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:262507..262605Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:273598..273708Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:273598..273708Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:275715..275786Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:275715..275786Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:278168..278320Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:278168..278320Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:278958..279279Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:278958..279279Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:281737..281862Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:281737..281862Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:283474..283748Blg01627.0-exon-Sc0000173-1570713199:283474..283748Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000173genomeSc0000173:231571..283748 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01627