MSTRG.11016.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.11016.1.p1
Unique NameMSTRG.11016.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:998219..1016238-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.11016.1.p1 ID=MSTRG.11016.1.p1|Name=MSTRG.11016.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18020bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:998219..1016238- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:998219..1016238-

>MSTRG.11016.1.p1 ID=MSTRG.11016.1.p1|Name=MSTRG.11016.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=31914bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:998219..1016238- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCGCATCAGCTTTACAGAGCATTCTATGTACCATTTCTATCAGAGAAAC
ATTGCACTTTTGTTGACTACAATATATTAAGAAGAATCAATCTGACACCA
AAGAGGAAAGCTTAGATTAATGTTGAAAAGTGTCATCTGCTGATTGATCT
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TTAATGTTGAAAAGTGTCATCTGCTGATTGATCTTGATTTGCCAACTGCA
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ATATTCCAAGAAATTTTTGGATGCATCAAGCTGGGAGCTTCACTTTGTTA
AGTCTCAGTTTGCTGGTCAATTACCACAGCCATATCAACAAGGGGCTGAT
GCAACCAAAATCATTCCACGTAACATGAATGATATGAATAAAGAAGAGTT
CAGTCGTTATGTTATCATGCTCCTCTGGATGTTTATCCAGAACTAACGAA
CCTGGTCACTCCTTATGACCCAGAAACAAAACCAATGTTTCATTCTGAGA
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TTCTTTCTTCCAGAAAAGAGTTATATCATCATTTGCTGAGTGCAAAAAAT
AAGCTTCAACACTATTCTGATAGCTCAAATTGGCTTGCAATATTTGTTTT
TGTGGTTTACACAATATTTTCATTCTCAAGATCTTCTGCACTTTATATTG
GAGGAGAGATTTCTGTTTCCAATTTACCCTTTGGTCATCTTCAGTGCAGT
TTTTGCTTTGTCCAAAATACAGGTCCCCTGAATTTACCTACTTGGATTGT
TTTGTCACCCATTTACATTTGGGGATTGGTATTTTTCACAAGACCTCATA
AGATTTTCTGTGACTACATAACCCAGAAGAAAATTGGTGTAGAGTCTTGG
ACATTTTATTTCATAAATGGGTTTTTAAACTTCAATGTCACCTTCATTAT
GGCTTTGCTCTCTCTTCCAATATGTATTCCTATGGTTTCTCTTGACAGCC
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GTTTTTGGACAAGGAGGGCCAGATCTTTATGGCTTCCTATTGCATTTGAT
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AATCTTCCTTGCTATTATGGTAGCAATATTTGGTATTGCCATAGGAACCC
TACTTGGTTGGCCTTTTTTTGCCATTCTTGGCTTTTCTACCAAGCTCATT
TGCTATGTATTCATGCCTGCTTGCTTTTGGTGGATGGTTTGATAGAAACA
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TCTTTTTGCCATAATCAATACTGGAATGTTTATATCTTCAACAGATAACT
GTCTTTTATTATGTACGGTTTATCCTTGGAATTTTATGTGCAGCTTGCGA
AACATACTTTTTCAAACACATTACCTGATGTACGAATCTGGTTTTCAAAC
CTGGGAGTATTCTCCAGAATATGCAATCAGGTCTTACGCCTACCTGTATC
TATATACCATGCCAGCAAAGATTATCAAAGATCTATTTCTGGCAAATAAG
TGTTGGCATTGCTGAAAGTAAATGTTGGTGTCCAAGACTGTCAGTTGTGT
TCAATGTTCTTCTCTCTGCAAGAATCACAGCATCATTCTTGAGTAACATA
TCTGACTGCGATGAAACATTCAATTATTGGGAACCAATGGAAGGACCTCG
TCCAAGATTTGGAAGAAAGGTCCAAAATGTCAAAACCAAAACTGATAATG
ATGCGAGGTCGCATCAGCTTTACAGAGCATTCTATGTACCATTTCTATCA
GAGAAACATTGCACTTTTGTTGACTACAATATATTAAGAAGAATCAATCT
GACACCAAAGAGGAAAGCTTAGATTAATGTTGAAAAGTGTCATCTGCTGA
TTGATCTTGATTTGCCAACTGCAAGTGAACATGAGAAGAACTATTCCCAA
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AAGCTGGGAGCTTCACTTTGTTAAGTCTCAGTTTGCTGGTCAATTACCAC
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AATGATATGAATAAAGAAGAGTTCAGTCGTTATGTTATCATGCTCCTCTG
GATGTTTATCCAGAACTAACGAACCTGGTCACTCCTTATGACCCAGAAAC
AAAACCAATGTTTCATTCTGAGAAAAAGATCAATGTGTGTGTTGGCAGGG
AATGGTATCGTTTTCCGAGCAGTTTCTTTCTTCCAGAAAAGAGTTATATC
ATCATTTGCTGAGTGCAAAAAATAAGCTTCAACACTATTCTGATAGCTCA
AATTGGCTTGCAATATTTGTTTTTGTGGTTTACACAATATTTTCATTCTC
AAGATCTTCTGCACTTTATATTGGAGGAGAGATTTCTGTTTCCAATTTAC
CCTTTGGTCATCTTCAGTGCAGTTTTTGCTTTGTCCAAAATACAGGTCCC
CTGAATTTACCTACTTGGATTGTTTTGTCACCCATTTACATTTGGGGATT
GGTATTTTTCACAAGACCTCATAAGATTTTCTGTGACTACATAACCCAGA
AGAAAATTGGTGTAGAGTCTTGGACATTTTATTTCATAAATGGGTTTTTA
AACTTCAATGTCACCTTCATTATGGCTTTGCTCTCTCTTCCAATATGTAT
TCCTATGGTTTCTCTTGACAGCCACTACTATGGAAAACAAGTGATAGCTC
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TATGGCTTCCTATTGCATTTGATATCATTTTTCGTCAAGGTAACCTGTGG
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ATTTGGTATTGCCATAGGAACCCTACTTGGTTGGCCTTTTTTTGCCATTC
TTGGCTTTTCTACCAAGCTCATTTGCTATGTATTCATGCCTGCTTGCTTT
TGGTGGATGGTTTGATAGAAACAATGCTCTCACTTTTGAATCAATTTGGA
AAACACGTTGCAAGAATGTATTTTCTTTTTGCCATAATCAATACTGGAAT
GTTTATATCTTCAACAGATAACTGTCTTTTATTATGTACGGTTTATCCTT
GGAATTTTATGTGCAGCTTGCGAAACATACTTTTTCAAACACATTACCTG
ATGTACGAATCTGGTTTTCAAACCTGGGAGTATTCTCCAGAATATGCAAT
CAGGTCTTACGCCTACCTGTATCTATATACCATGCCAGCAAAGATTATCA
AAGATCTATTTCTGGCAAATAAGTGTTGGCATTGCTGAAAGTAAATGTTG
GTGTCCAAGACTGTCAGTTGTGTTCAATGTTCTTCTCTCTGCAAGAATCA
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TCTTGATTTGCCAACTGCAAGTGAACATGAGAAGAACTATTCCCAAATAA
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TCTTACGCCTACCTGTATCTATATACCATGCCAGCAAAGATTATCAAAGA
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CCAAGACTGTCAGTTGTGTTCAATGTTCTTCTCTCTGCAAGAATCACAGC
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GAAAAGTGTCATCTGCTGATTGATCTTGATTTGCCAACTGCAAGTGAACA
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TGTCCAAAATACAGGTCCCCTGAATTTACCTACTTGGATTGTTTTGTCAC
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TGTGACTACATAACCCAGAAGAAAATTGGTGTAGAGTCTTGGACATTTTA
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GGAAAACAAGTGATAGCTCCACTAAACATTTTCCTGTACAATGTTTTTGG
ACAAGGAGGGCCAGATCTTTATGGCTTCCTATTGCATTTGATATCATTTT
TCGTCAAGGTAACCTGTGGAAGTTCATTCTATGGTCTGGTGCAATCTTCC
TTGCTATTATGGTAGCAATATTTGGTATTGCCATAGGAACCCTACTTGGT
TGGCCTTTTTTTGCCATTCTTGGCTTTTCTACCAAGCTCATTTGCTATGT
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TTTTCAAACACATTACCTGATGTACGAATCTGGTTTTCAAACCTGGGAGT
ATTCTCCAGAATATGCAATCAGGTCTTACGCCTACCTGTATCTATATACC
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CGATGAAACATTCAATTATTGGGAACCAATGGAAGGACCTCGTCCAAGAT
TTGGAAGAAAGGTCCAAAATGTCAAAACCAAAACTGATAATGATGCGAGG
TCGCATCAGCTTTACAGAGCATTCTATGTACCATTTCTATCAGAGAAACA
TTGCACTTTTGTTGACTACAATATATTAAGAAGAATCAATCTGACACCAA
AGAGGAAAGCTTAGATTAATGTTGAAAAGTGTCATCTGCTGATTGATCTT
GATTTGCCAACTGCAAGTGAACATGAGAAGAACTATTCCCAAATAAAGAA
CAAGTGGCAAATTATATATTCCAAGAAATTTTTGGATGCATCAAGCTGGG
AGCTTCACTTTGTTAAGTCTCAGTTTGCTGGTCAATTACCACAGCCATAT
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GAATAAAGAAGAGTTCAGTCGTTATGTTATCATGCTCCTCTGGATGTTTA
TCCAGAACTAACGAACCTGGTCACTCCTTATGACCCAGAAACAAAACCAA
TGTTTCATTCTGAGAAAAAGATCAATGTGTGTGTTGGCAGGGAATGGTAT
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TGCAATATTTGTTTTTGTGGTTTACACAATATTTTCATTCTCAAGATCTT
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GACTGTCAGTTGTGTTCAATGTTCTTCTCTCTGCAAGAATCACAGCATCA
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AATGGAAGGACCTCGTCCAAGATTTGGAAGAAAGGTCCAAAATGTCAAAA
CCAAAACTGATAATGATGCGAGGTCGCATCAGCTTTACAGAGCATTCTAT
GTACCATTTCTATCAGAGAAACATTGCACTTTTGTTGACTACAATATATT
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AAGAACTATTCCCAAATAAAGAACAAGTGGCAAATTATATATTCCAAGAA
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CTGGTCAATTACCACAGCCATATCAACAAGGGGCTGATGCAACCAAAATC
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ATAAATGGGTTTTTAAACTTCAATGTCACCTTCATTATGGCTTTGCTCTC
TCTTCCAATATGTATTCCTATGGTTTCTCTTGACAGCCACTACTATGGAA
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GGAGGGCCAGATCTTTATGGCTTCCTATTGCATTTGATATCATTTTTCGT
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TATTATGGTAGCAATATTTGGTATTGCCATAGGAACCCTACTTGGTTGGC
CTTTTTTTGCCATTCTTGGCTTTTCTACCAAGCTCATTTGCTATGTATTC
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TTGAATCAATTTGGAAAACACGTTGCAAGAATGTATTTTCTTTTTGCCAT
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GTACGGTTTATCCTTGGAATTTTATGTGCAGCTTGCGAAACATACTTTTT
CAAACACATTACCTGATGTACGAATCTGGTTTTCAAACCTGGGAGTATTC
TCCAGAATATGCAATCAGGTCTTACGCCTACCTGTATCTATATACCATGC
CAGCAAAGATTATCAAAGATCTATTTCTGGCAAATAAGTGTTGGCATTGC
TGAAAGTAAATGTTGGTGTCCAAGACTGTCAGTTGTGTTCAATGTTCTTC
TCTCTGCAAGAATCACAGCATCATTCTTGAGTAACATATCTGACTGCGAT
GAAACATTCAATTATTGGGAACCAATGGAAGGACCTCGTCCAAGATTTGG
AAGAAAGGTCCAAAATGTCAAAACCAAAACTGATAATGATGCGAGGTCGC
ATCAGCTTTACAGAGCATTCTATGTACCATTTCTATCAGAGAAACATTGC
ACTTTTGTTGACTACAATATATTAAGAAGAATCAATCTGACACCAAAGAG
GAAAGCTTAGATTAATGTTGAAAAGTGTCATCTGCTGATTGATCTTGATT
TGCCAACTGCAAGTGAACATGAGAAGAACTATTCCCAAATAAAGAACAAG
TGGCAAATTATATATTCCAAGAAATTTTTGGATGCATCAAGCTGGGAGCT
TCACTTTGTTAAGTCTCAGTTTGCTGGTCAATTACCACAGCCATATCAAC
AAGGGGCTGATGCAACCAAAATCATTCCACGTAACATGAATGATATGAAT
AAAGAAGAGTTCAGTCGTTATGTTATCATGCTCCTCTGGATGTTTATCCA
GAACTAACGAACCTGGTCACTCCTTATGACCCAGAAACAAAACCAATGTT
TCATTCTGAGAAAAAGATCAATGTGTGTGTTGGCAGGGAATGGTATCGTT
TTCCGAGCAGTTTCTTTCTTCCAGAAAAGAGTTATATCATCATTTGCTGA
GTGCAAAAAATAAGCTTCAACACTATTCTGATAGCTCAAATTGGCTTGCA
ATATTTGTTTTTGTGGTTTACACAATATTTTCATTCTCAAGATCTTCTGC
ACTTTATATTGGAGGAGAGATTTCTGTTTCCAATTTACCCTTTGGTCATC
TTCAGTGCAGTTTTTGCTTTGTCCAAAATACAGGTCCCCTGAATTTACCT
ACTTGGATTGTTTTGTCACCCATTTACATTTGGGGATTGGTATTTTTCAC
AAGACCTCATAAGATTTTCTGTGACTACATAACCCAGAAGAAAATTGGTG
TAGAGTCTTGGACATTTTATTTCATAAATGGGTTTTTAAACTTCAATGTC
ACCTTCATTATGGCTTTGCTCTCTCTTCCAATATGTATTCCTATGGTTTC
TCTTGACAGCCACTACTATGGAAAACAAGTGATAGCTCCACTAAACATTT
TCCTGTACAATGTTTTTGGACAAGGAGGGCCAGATCTTTATGGCTTCCTA
TTGCATTTGATATCATTTTTCGTCAAGGTAACCTGTGGAAGTTCATTCTA
TGGTCTGGTGCAATCTTCCTTGCTATTATGGTAGCAATATTTGGTATTGC
CATAGGAACCCTACTTGGTTGGCCTTTTTTTGCCATTCTTGGCTTTTCTA
CCAAGCTCATTTGCTATGTATTCATGCCTGCTTGCTTTTGGTGGATGGTT
TGATAGAAACAATGCTCTCACTTTTGAATCAATTTGGAAAACACGTTGCA
AGAATGTATTTTCTTTTTGCCATAATCAATACTGGAATGTTTATATCTTC
AACAGATAACTGTCTTTTATTATGTACGGTTTATCCTTGGAATTTTATGT
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GGTTTTCAAACCTGGGAGTATTCTCCAGAATATGCAATCAGGTCTTACGC
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GTCAGTTGTGTTCAATGTTCTTCTCTCTGCAAGAATCACAGCATCATTCT
TGAGTAACATATCTGACTGCGATGAAACATTCAATTATTGGGAACCAATG
GAAGGACCTCGTCCAAGATTTGGAAGAAAGGTCCAAAATGTCAAAACCAA
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GACCCAGAAACAAAACCAATGTTTCATTCTGAGAAAAAGATCAATGTGTG
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AGAGTTATATCATCATTTGCTGAGTGCAAAAAATAAGCTTCAACACTATT
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TTTTCATTCTCAAGATCTTCTGCACTTTATATTGGAGGAGAGATTTCTGT
TTCCAATTTACCCTTTGGTCATCTTCAGTGCAGTTTTTGCTTTGTCCAAA
ATACAGGTCCCCTGAATTTACCTACTTGGATTGTTTTGTCACCCATTTAC
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CATAACCCAGAAGAAAATTGGTGTAGAGTCTTGGACATTTTATTTCATAA
ATGGGTTTTTAAACTTCAATGTCACCTTCATTATGGCTTTGCTCTCTCTT
CCAATATGTATTCCTATGGTTTCTCTTGACAGCCACTACTATGGAAAACA
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GGCCAGATCTTTATGGCTTCCTATTGCATTTGATATCATTTTTCGTCAAG
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ATGGTAGCAATATTTGGTATTGCCATAGGAACCCTACTTGGTTGGCCTTT
TTTTGCCATTCTTGGCTTTTCTACCAAGCTCATTTGCTATGTATTCATGC
CTGCTTGCTTTTGGTGGATGGTTTGATAGAAACAATGCTCTCACTTTTGA
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AATACTGGAATGTTTATATCTTCAACAGATAACTGTCTTTTATTATGTAC
GGTTTATCCTTGGAATTTTATGTGCAGCTTGCGAAACATACTTTTTCAAA
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GAATATGCAATCAGGTCTTACGCCTACCTGTATCTATATACCATGCCAGC
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TGCAAGAATCACAGCATCATTCTTGAGTAACATATCTGACTGCGATGAAA
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AACTGCAAGTGAACATGAGAAGAACTATTCCCAAATAAAGAACAAGTGGC
AAATTATATATTCCAAGAAATTTTTGGATGCATCAAGCTGGGAGCTTCAC
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AAGAGTTCAGTCGTTATGTTATCATGCTCCTCTGGATGTTTATCCAGAAC
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TCATTATGGCTTTGCTCTCTCTTCCAATATGTATTCCTATGGTTTCTCTT
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GTACAATGTTTTTGGACAAGGAGGGCCAGATCTTTATGGCTTCCTATTGC
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AGAAACAATGCTCTCACTTTTGAATCAATTTGGAAAACACGTTGCAAGAA
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GATAACTGTCTTTTATTATGTACGGTTTATCCTTGGAATTTTATGTGCAG
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AAATAAGTGTTGGCATTGCTGAAAGTAAATGTTGGTGTCCAAGACTGTCA
GTTGTGTTCAATGTTCTTCTCTCTGCAAGAATCACAGCATCATTCTTGAG
TAACATATCTGACTGCGATGAAACATTCAATTATTGGGAACCAATGGAAG
GACCTCGTCCAAGATTTGGAAGAAAGGTCCAAAATGTCAAAACCAAAACT
GATAATGATGCGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11016MSTRG.11016Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11016.1.p1MSTRG.11016.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.11016.1.p1.exon18MSTRG.11016.1.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11016.1.p1.exon11MSTRG.11016.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.11016.1.p1.exon10MSTRG.11016.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.11016.1.p1.exon1MSTRG.11016.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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