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transcript sequence >TCONS_00008155 ID=TCONS_00008155|Name=TCONS_00008155|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1921bp CGGTTTGTAATAAGAAACCATGTAATTCAGCAACAGTAATAAAAACGAAG ATTGAAACTCGTCTACCATTATGAATTTCACCGAACACAAAATGACAGCA ACTGCACCCAATAAGAACAGCTTGGAGATTCTTGAGCTTGTCTTCCTGTG TGTTATCTGTGCGTTGACATTACTTGGTAACTGTCTGGTCATCTTGGCTT TCTTTTGGGGACCACGAAGTTTGAGAAATTACACCAACTTCTTTGTGGTA AATTTGGCTGTTTCTGATTTGATGGTCGGTTGTCTGTCGTTACCTTTTTG GATTGTCTACAGGGCTGATATTGAGCTGGTGGACCGTGAGAAATATACTT TCTTTATATCACTTGATATCTTGTGTGGAACGACATCCATCCTCAGTTTA TCAGCCATCAGCTTGGAACGAATGTTTGCTGTCAAATTCCCTACAACTCA TTTCAATTTGACTTCTAAACCAATCAAACTTGGTATTGTAGTCACATGGT TCTTAGCAATCATTTTTACTGGCTCCAAGTTTGCTATCAGAACGCCGACC CAAATCCGCGCCTACACTGCCTCGATTTTCACACTCGCATTCTTGGTACC TTTGTTAATCATCGTCGCTTCCTACACCATCATTTTTATCGCAGCTGTGA AAATGATGAATGAGGCTAATACAACTGGTAAATTAGCCCGTGAAATACAC GTTGCAAAAACGATATCAGTCATCATTACTCTGTTTGTGATTTGTTGGAT GCCCTTCTTCGTGATCAACATGGTATGGGTGTTCTGTTCTGATTATTGCG ATCAGAAAAGGAATTATCGCTGGGTTGTACACATCTCCAAAATGATGCAT TATGCAAACTCTATGATGAACTTTTTCGTGTACGCAGTCAGGCTGCCAGA CTTTCGACGGGCGTTCAAAGCCATTCTCTTCAAGTGTGACACAAGTGGTT TCAGGGAGCGCGTACGAACTTTCTCGGAGTCAATCGTGACGCGCGGTCGA ACGGCGTCCGAGAGACAAAGTTTCTTTGCTGATCAAACAATGAACACTTC AAACGGTACATTAAACAATAATCACTCTCCAATTACCGATAAGGTAAAAA AACATCAACAACAAGGATCTATATGTAAACACAATAATCAGCAACCACGC TTATCGAGTCACAGTAATTGCACAGAGGTTTCGATCATGGATGATACGTG GAGCCCTACCACCATGAACAGTAACACCAGTTCAAACGATACATCATCGA GCAGTAACCCTTTACTAGCGTCTCATCACGACATGACAGTGAGCAgtatt tgaataaaattaatGATTTACCGTTTTTTAAATTAACTGATCCTAATAAT TAGAGCTAATGAGAAGGAAATTTAGTATAAGCTTTTACCTCGAAATTACC AGTCAACACTAATCATCCCTTTAAAGGTTTGAATATATTTCAGAGAGTGC GCCTTGTCTAAAATGTAGCAATGGcgaaaatataagaaataaatATTCGT TTGTGTTAACCCACGTAACCCaccatttttaaattatttttgatgaattt taaaatcataTAGTTTGTCAGGGGGCTAAAAAAGGTGAGCACCATGCCCG TTAGAAGAAGTAGAGCTTTATCCTTCTCTTTGCCCTTTTACTTTTCTGAA TGACTGATAGAAAGAGGAAGATTTTTCATCATAAGTCAATGATCTTGTGT TTGCATTGTCTCTTCCCATCTGAATTTGTGCAATGATTATGAATATGTAT ATATTAAAAGGAATTACTTAATGGGTTTGTTATCTCGTTAGAATTTGTAG TGCATTCACTTTGTCTACTTCCTTTAAAACGCCAGGTCTGAAACAAACCT ATCCATGTACTACCATTTCAGTTAAAGATTCTAGAACATTATTGATCTTC GCATATTGGTGTACTCTCGGG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000082:203578..220341- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00008155 ID=TCONS_00008155|Name=TCONS_00008155|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16764bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000082:203578..220341- (Clytia hemisphaerica) CGGTTTGTAATAAGGTATAAAAGCTAATTAGAGAAGTGATTCTAGATAAT
ATTTACCATTACTCTTTCTTTTCTTGATAATGTCATCATCAGATTATGGC
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GTACCTGCGTGTCTTCGTGCTTTGGCGTGCACCATCCAAATTTCAGTAAA
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GCTTCCTTTAACTTTCCGAGTTATTTTATTTTGTAACTCGTGAATTTTTG
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TTCCTTTAACTTTCTGTAAATAGATTTACGTTACACTGTTAGGCCTAAAA
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TATTACCCTTTCGGTGACGTCATTTAGGGCCAAAGTGACGTCATCATCAC
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GTATGATATTCTTTTGAGCAGCGGATGGATAGCCTCCACCTCTTCTTTCG
CTTTGCAAACACGAGACTCGTTCTCCGTGGGTAACCCCTTTTACGATTGA
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CCGGAAACTTAAAAAAGGTCAAAATTATCTAACATGCTCTAAAATTGTTT
TGATGCTTATAAAACCTCGAGTTTGCTTTTTATAGTCAATATATTTAGTG
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GACGCCAGAAAATACCCTGGTGTATTATTATACTTCTCAAAACAATACGT
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GTCACGCCGGGCGCAAAACAAGGGGTTAACGAGAATGCAAAAGTCTGAAA
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GTTTGCGGAGTCAGAAGTCGTATCTTTTCAACAAAAATATCAAAAAATAT
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CAAATTTCTGCATTTATTTGACTTTTTAGCCTAAAATATCGCTGAAAAGA
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ATTCACCTCTCCTATCAAGACCCTCTATCTTCTATCAAAACCCCCCGTTC
TTCACTTATTTGTTTCGAGCATTTCAATATTTAAGACCAAAGTTTCGTCA
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GCTTCTTTGTGCTCATAAATTTTACTGTACCTTTTTACTCATTCAAAAAC
GTCATCGTCTTTCTTCGTTTTATTCTGATAAGTGTTACATATATAATATT
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CCTTCCTTTTAATATCAGTTAATTTCCAACTACTGTGCCAAGCAATAACT
CGAAAAATCTGTTATCCTTGAAAATGTGTCGAGTGTAAATTGTTCTCTTT
TTGGGCCTACCTCGGAGTTTCTTTAATTTTAAGTGCGTTAAACTCCAGTT
GGAAATTAACATGAGACTTTAGTCTTAGGACCTTCTTAGGACCGCTCAAA
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AAAAATGTTATGCCTTTGACGAAGTTGCGTTAGTCTAGCATTAGTCAGTG
GCGTTAAAAAGGGGCGAGAGACAATAATTTTTGAGAAATCATATACTTAA
CATATAACGATTGCGACAAGTTAGACTAGCTCTTAACTAAAATTTCAGCA
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GGACCGGTCTGTAAAATACCAACCGCTCACGTGAATGAATCAAAATTTTG
CACTGCCTTAGATAGTCAATATCTATCAGCGGTCTGCAAAGTACCAAAAA
CTCAAGGGAATGAACTTTTTCTATTACTAGTGTCTTTTAATTTGACAAAT
TAGCCTTCGGGAACAAGTTTCAGTCAAATCTAACGAGTTAATCAGCCAAT
ACATCATTTTAAATTACATTATGTGGTCTAAAATACTAACTAGACAGGTG
GCCGAACCAAAATTTTGCAAATCATCTTCAATTATTCATTTCTACCACTG
GTCAAAGTTTCAAGGTCATAGCACTTATCAATCTTGAGATTTTAAAGGAG
GCTCGAGCCCCCCCCTCCCCCAGATGTTTTCCCTAGTAAAAAAAAAGGAA
GATGCTGGAAGGGTAAAAATCCTCAAGTTGTCTATTGTGTGGAATATAGC
AGATGGTTTTGAAGCCCATTTATTTTCATGTTATTTTCTTTGCCTAAAAT
CTGATAAAATGTACAAAAGGCAAAGTACATTGTTAACTTGGGGGTTGTCC
CTCCCAATTTTGATTGGTACTAACGTCATTATCACTTCAACATGAACTGT
AAAGTAAAAGAGCGATAGACCGAATCGTTCAAATTGTGAACAAAATGTCA
CCCACCATTAGTAGACATCCGTAATAACTCTACATAAAGGAAACGCCGAG
AAGAATTAGCTATCATTTGATTTTGAGAGTTGTGAGAAATAAAGAGGCAA
TAAAAATACGACTGTAAGATTAAATCAAACACCTTACTTACGCATTACTT
GGAGTTACTAAGGCACTGGTCACTGCCTTTGTTCGTCCTTACTTTGACTC
TGGAAGCCCAAGCGTCTGACTCTAAGATCACGAAGGTTAACTTTCACTAA
CGCAGTGAGACAGTGGGACACTAGGCTTCCTTAAAGTGACTTGAAAATTG
CCATGTACGGTCAAAAGATGATGAGGATGGCGTGGTATTTTAAGGATCCT
AACTTAAAAATCGCTTTGGTTCTTTAGATTTGACCGATCATTGTGAACAA
ATGATGAACAAATCGAAATCTAGAAATAAGAAAATGCTTAAAAATAAAAC
ATTATTATCCAAAATGAAAATTCAAAATGCGAAGTGAGATGTTATTAACA
CGTCGTTTAATAGGCGTTAATCTTTCAAATTTCAAGGGGACGTAAAGGGA
CCATTTTTACTTATTTTTTACTTAGAGAGAAGAACAATTGTTAAATTACC
TTTTTAAAACGTTCATTCGATATTCATTTTTTTTCGTACATAAAGTGGTA
TCAAGATAAAAAGGCAGGTGAAATTCTGTTTTGATAAGATTTATTTTTTC
TTCATCGTTTAATGAAACGAAGTTTTCATGATCTGTAATTTTTTTAAATA
TTACTGTAAATCGATAAATGTCCAGTAAGAAAGACAAGTGGAAATCATCG
GTTGCCAGTGTGTCTTGAAAATTAGACATTTCTCTTGATTGTTTGTTAAT
TTGAGAATTTTGAATCGATTGTCAAAAGGGAAGGTTTTAGGTAATATTAA
TTAAAGGTTTTGTTTTTAAATACTCTCGGGTACCTAATAGCCGTCCCCCC
CCGCTAATTAATTTTTCGAAAATTTTCCACCCAGGACATTCTTATTCCAA
CCCCCCCGCTTATTAATTTTTGGGAAAATGTTTTTGAAAGTTCCCTCTTT
TGTCTTAATTCTGCTGTATTAGCCTACTTTTCAAACATTTTCCACCCAGG
ACATTCTTATTCCAACCCCCCCGCTTATTAATTTTTGGGAAAATGTTTTT
GAAAGTTCCCTCTTTTGTCTTAATTCTGCTGTATTAGCCTACTTTTCAAA
CATTTTCCACCCAGGACATTTTTATTCCAACCCCCCCGCTTATTAAATTT
TGAAATTTTTTCTAACCCCCCTGCTTATTCCAACCCCCCCGGCTATTAGG
TACCCGAGAGTAAGAGTGATGTCGTTTGCTTACTCGTCAAATTTAATTTA
CAAGCTTTTCACATTGGATTGAAACGACTGTGGAGCATAGATTGGTCTGA
AAAAGAAAAAGAAAAACAGTTTTTTGTTTATATCACTGTCCTGATATGAA
ACTTGTGTCTAATATGAACCGGAAAATAAAACCTTTAATGAATATTTTTA
AGCTATAGCCAATATGAAAACTTTCTACTTGTTGTAAATGAAATGTATCT
CTCGTTTGATAAACTTTGTAGCATAACCTATCACATTACATTCCAATGGG
ATTCTAAGGCTTGGTATCTTGCTAACAAAATGAAGTCAGCAATTAAAAAG
TACAAATTGTCCTCCTTTTTGACTTTCGTACTATTGTTTCTTATAATCGT
GCCAAAATTTTCCTCATTTGGCAAACATTTTCAAAGTTGTAAGTGAACAA
GACATGGGTACGAATATATGCTGCTGGTGATACAAATTACCCAAACCATG
CATTGATTCTAATTTCTCTTTTCGTTCACAGAAACCATGTAATTCAGCAA
CAGTAATAAAAACGAAGATTGAAACTCGTCTACCATTATGAATTTCACCG
AACACAAAATGACAGCAACTGCACCCAATAAGAACAGCTTGGAGATTCTT
GAGCTTGTCTTCCTGTGTGTTATCTGTGCGTTGACATTACTTGGTAACTG
TCTGGTCATCTTGGCTTTCTTTTGGGGACCACGAAGTTTGAGAAATTACA
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TTGCTTTTAGATATTGAGCTGGTGGACCGTGAGAAATATACTTTCTTTAT
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TCAGCTTGGAACGAATGTTTGCTGTCAAATTCCCTACAACTCATTTCAAT
TTGACTTCTAAACCAATCAAACTTGGTATTGTAGTCACATGGTTCTTAGC
AATCATTTTTACTGGCTCCAAGTTTGCTATCAGAACGCCGACCCAAATCC
GCGCCTACACTGCCTCGATTTTCACACTCGCATTCTTGGTACCTTTGTTA
ATCATCGTCGCTTCCTACACCATCATTTTTATCGCAGCTGTGAAAATGAT
GAATGAGGCTAATACAACTGGTAAATTAGCCCGTGAAATACACGTTGCAA
AAACGATATCAGTCATCATTACTCTGTTTGTGATTTGTTGGATGCCCTTC
TTCGTGATCAACATGGTATGGGTGTTCTGTTCTGATTATTGCGATCAGAA
AAGGAATTATCGCTGGGTTGTACACATCTCCAAAATGATGCATTATGCAA
ACTCTATGATGAACTTTTTCGTGTACGCAGTCAGGCTGCCAGACTTTCGA
CGGGCGTTCAAAGCCATTCTCTTCAAGTGTGACACAAGTGGTTTCAGGGA
GCGCGTACGAACTTTCTCGGAGTCAATCGTGACGCGCGGTCGAACGGCGT
CCGAGAGACAAAGTTTCTTTGCTGATCAAACAATGAACACTTCAAACGGT
ACATTAAACAATAATCACTCTCCAATTACCGATAAGGTAAAAAAACATCA
ACAACAAGGATCTATATGTAAACACAATAATCAGCAACCACGCTTATCGA
GTCACAGTAATTGCACAGAGGTTTCGATCATGGATGATACGTGGAGCCCT
ACCACCATGAACAGTAACACCAGTTCAAACGATACATCATCGAGCAGTAA
CCCTTTACTAGCGTCTCATCACGACATGACAGTGAGCAGTATTTGAATAA
AATTAATGATTTACCGTTTTTTAAATTAACTGATCCTAATAATTAGAGCT
AATGAGAAGGAAATTTAGTATAAGCTTTTACCTCGAAATTACCAGTCAAC
ACTAATCATCCCTTTAAAGGTTTGAATATATTTCAGAGAGTGCGCCTTGT
CTAAAATGTAGCAATGGCGAAAATATAAGAAATAAATATTCGTTTGTGTT
AACCCACGTAACCCACCATTTTTAAATTATTTTTGATGAATTTTAAAATC
ATATAGTTTGTCAGGGGGCTAAAAAAGGTGAGCACCATGCCCGTTAGAAG
AAGTAGAGCTTTATCCTTCTCTTTGCCCTTTTACTTTTCTGAATGACTGA
TAGAAAGAGGAAGATTTTTCATCATAAGTCAATGATCTTGTGTTTGCATT
GTCTCTTCCCATCTGAATTTGTGCAATGATTATGAATATGTATATATTAA
AAGGAATTACTTAATGGGTTTGTTATCTCGTTAGAATTTGTAGTGCATTC
ACTTTGTCTACTTCCTTTAAAACGCCAGGTCTGAAACAAACCTATCCATG
TACTACCATTTCAGTTAAAGATTCTAGAACATTATTGATCTTCGCATATT
GGTGTACTCTCGGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00008155-exon-sc0000082-1575043694:220328..220341 | TCONS_00008155-exon-sc0000082-1575043694:220328..220341 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008155-exon-sc0000082-1575043694:205708..206010 | TCONS_00008155-exon-sc0000082-1575043694:205708..206010 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008155-exon-sc0000082-1575043694:203578..205181 | TCONS_00008155-exon-sc0000082-1575043694:203578..205181 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008155-exon-sc0000082-1510915933:220328..220341 | TCONS_00008155-exon-sc0000082-1510915933:220328..220341 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008155-exon-sc0000082-1510915933:205708..206010 | TCONS_00008155-exon-sc0000082-1510915933:205708..206010 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008155-exon-sc0000082-1510915933:203578..205181 | TCONS_00008155-exon-sc0000082-1510915933:203578..205181 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008155-exon-sc0000082-1491911889:220328..220341 | TCONS_00008155-exon-sc0000082-1491911889:220328..220341 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008155-exon-sc0000082-1491911889:205708..206010 | TCONS_00008155-exon-sc0000082-1491911889:205708..206010 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008155-exon-sc0000082-1491911889:203578..205181 | TCONS_00008155-exon-sc0000082-1491911889:203578..205181 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000082 | supercontig | sc0000082:203578..220341 - |
Blast
BLAST of TCONS_00008155 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: AA2AR (Adenosine receptor A2a OS=Homo sapiens GN=ADORA2A PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 105.531 bits (262), Expect = 2.975e-24 Identity = 111/401 (27.68%), Postives = 177/401 (44.14%), Query Frame = 2
Query: 155 ICALTLLGNCLVILAFFWGPRSLRNYTNFFVVNLAVSDLMVGCLSLPFWIVYRADIELVDREKYTFFISLDILCGT-TXXXXXXXXXXERMFAVKFPTTHFNLTSKPIKLGIV-VTWFL--AIIFT--------GSKFAIRTPTQI--RAYTASIFT--------------LAFLVPLLIIVASYTIIFIAA---VKMMNEANTTGKLAR-----EIHVAKTISVIITLFVICWMPFFVINMVWVFCSDYCDQKRNYRWVVHISKMMHYANSMMNFFVYAVRLPDFRRAFKAILFKCDTSGFRERVRTFSESIVTRGRTASERQSFFADQTM------NTSNGTLNNNHSPITDKVKKHQQQGSICKHNNQQPR---------LSSH---SNCTEVSIMDD 1195
I L +LGN LV A W +L+N TN+FVV+LA +D+ VG L++PF I FI+ +L T +SI SL AI+++R A++ P + L + GI+ + W L AI T G + +Q A +F LVPLL+++ Y IF+AA +K M G+ AR E+H AK++++I+ LF +CW+P +IN FC D C W+++++ ++ + NS++N F+YA R+ +FR+ F+ I+ R V E G +A + +D G N +P ++ G + + Q+ + L SH C E +DD
Sbjct: 16 IAVLAILGNVLVCWAV-WLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIAVGVLAIPFAITISTG--FCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGLVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPMNYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKSLAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPD-CSHAP--LWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIREFRQTFRKII--------RSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHPERRPNGYALGLVSGGSAQESQGNTGLPDVELLSHELKGVCPEPPGLDD 402
The following BLAST results are available for this feature:
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