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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00072177 ID=TCONS_00072177|Name=TCONS_00072177|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2977bp
CGACAGCATGCAATCCGTACCATGACATCCATCCACAGAACTACACTACA
CTGCACAGgctTGATCTCTATATATTCCAAAATAATGCAAGCgagatcaa
ttttattttggttgaaAATGCGAGACAGATATTCTCAAGATGCACCCATG
GAAGGAGCGTTTGGCTGTTTGATCAAAATACATTCAAGTATACAAATTGA
GACAAGTGGAAGATAGCAAAGTAACGTCAGCTTGGTCAACTCTAACCAAC
TCAAGAACAACAAATCTAAAAGTCTTGAGAATAAATCTTCTATTGCAAGC
TGGATGCATTTTTTAAGGAGATGTTTGTACATTTGATTTCATGACGTTGG
ATAGGTTGTTTACTGCCAGTGAAAATGAAGTAAAACTATCTATCGCCCAC
ACTgaagaaaattcacaaaaacaTATCAACAACTAgcaAACTATAAGAGA
GGGTCTTCGATTCTCAGAAATGAGTCAACATTCAATGATTACTGAACAAG
CAATCAACCCTTACCTTTCATCGCGTGGAACTTCAAATCATATGATTCAG
TCTATGGCCCTTGGTAACCATCTGACTGACAATAATAATTCAAGCAATAA
TAATTACTTCAGTGAAATACAAATGGATGACGGGAAATGGACCCGACATC
AAACACAGATCTTAATTGACACCTGGAAAGAGCATAAAGATATCTTATTA
AGTACTGGATCAAGCTCAGCTGAACATTTTCGTGTCTGGAAACTCATTGC
GACTGAAGTTAACAAATTCGCACCACCCAAGAGTCTCCAGCAATGCAAGA
AGAAGTTCCGTAATATACGATACATTTGTAAAATGGCCATGAATAATAAC
AAACAAGAGGGCGGTAAGAAACATTATCCAATGTTTTATTCAGATTTCCT
TGAAATCATTTCCGAGAGTGAGCGCATCAAAGAAGGTGTCAAAATAGAAT
CACCCAATGTCGAGGTTTTGAACGATTCAAGCAAAGATGGCGACCTGTAC
GGGACTGGATATCAGAATCCGTCACCACAAGACAGCCAATACGACGAACG
ATCGTCATCCGAATTAAACACACGTCGCGAAGACGAACTAGACGAGCGAC
GTACTCAGCAATCGGGTAACGTTAATAACAGTGAAGGTTCTGGAAGCTTT
AACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAGTGTGAGAACGAGTATCAAACAACGAC
GTCACCAAATCATCAACCGACCGTATCCGAAACGAACGTCACAAACGAGC
GAAGGGAAACCGCCACTGAAAGCCATCATCATTCCTTACAAAACGGGGAT
CTCGAGAACGGCCATAGTAGAATCAACGAACGCTTATCAAATTATTACTC
ACACCACGATTCTATGTATCCGCCCATTTATTCGACCAGCTCTNCGCACC
ACCCAAGAGTCTCCAGCAATGCAAGAAGAAGTTTCGTAATATACGATACA
TTTGTAAAATGGCCATGAATAATAACAAACAAGAGGGCGGTAAGAAACAT
TATCCAATGTTTTATTCAGATTTCCTTGAAATCATTTCCGAGAGTGAGCG
CATCAAAGAAGGTGTCAAAATAGAATCACCCAATGTCGAGGTTTTGAACG
ATTCAAGCAAAGATGGCGACCTGTACGGGACTGGATATCAGAATCCGTCA
CCACAAGACAGCCAATACGACGAACGATCGTCATCCGAATTAAACACACG
TCGCGAAGACGAACTAGACGAGCGACGTACTCAGCAATCGGGCAACGTTA
ATAACAGTGAAGGTTCTGGAAGCTTTAACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAG
TGTGAGAACGAGTATCAAACAACGACGTCACCAAATCATCAACCGACCGT
ATCCGAAACGAACGTCACAAACGAGCGAAGGGAAGCCGTCACTGAGAGCC
ATCATCATTCCTTACAAAACGGGGATCTCGAGAACGGCCATAGTAGAATC
AACGAACGCTTATCAAATTATTACTCACACCACGATTCTATGTATCCGCC
CATTTATTCGACCAGCTCTGAACATTACATGCGTaagcataaaaatattg
acGTCAGTATAATGGGGCGTGGGTACCCCAGTGCAAAGCGTGTTAAACGC
GCCATGGATATTTACTCATCACCTGCCCCTGCGCCCTACAAATACGCAAG
CCGACACCATCATAGAGGATATCCGCCCACGATGGCCACAATCGCCAGTA
ATTCTTACCCATATCACATTAACAACCACTATTCGACAACACCGCCGCTT
ATTCGACCCGTATCTACACCAAAAGATACATCCCCGTCTCCCCGTAATAC
TGTTTCTAGTACCAATAACGTAGCACCGAGTCTGTCCAATGATTCGTCTT
ATATGAAAGCAGAGCATACGCATATTAATGACGCACCGCCTGCGCTGAAA
TCGTCTCCTGGGTACAAGAATAGAGAGATGCACGCACCTAAAGACTTAAC
ATTAAGTGAAACTTTGAACTTTTACAATCAACGATTCTTAGATATGCAAG
AGAGACAAACTGAATTATTTAGTGAAATGATTTGTCGGCATGAACAATTT
CTTTCCAGACTTTTAGAACAACAACGAACGGCTGCTGAAGATGCTCAAAA
AAGAGACAAAGAATTCATGTTAAAATTGATAGAAATGTTCGTTAAGCAAT
AGTTTCAAACGTTCTCAactttttagtttttacaattttttcttctgatt
ttcaatttcttctgatagaatttttctttcgtttttttttttcttttaaa
attttctgctCCAGGTTTTTGAGCAGATTTGTAAATATATTTATCTAAAT
GCGATCTTTAAATTGGGTAATTCTTAATTTTTACAGTTGACTTGCCTGGT
TTTTGATACATTCTTAAAACTGTCAGATCGTTGTGTACGACAGGGGTTTT
ATTCAAATCTCCCTTGTCAACAAAAATTCTTTAAGAATTCATCTTTGAAC
CCTTAAATGAGGCCGTTGGAAAATTAG Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00072177-protein >TCONS_00072177-protein ID=TCONS_00072177-protein|Name=TCONS_00072177-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=397bp
MAMNNNKQEGGKKHYPMFYSDFLEIISESERIKEGVKIESPNVEVLNDSS
KDGDLYGTGYQNPSPQDSQYDERSSSELNTRREDELDERRTQQSGNVNNS
EGSGSFNGSPQSRECENEYQTTTSPNHQPTVSETNVTNERREAVTESHHH
SLQNGDLENGHSRINERLSNYYSHHDSMYPPIYSTSSEHYMRKHKNIDVS
IMGRGYPSAKRVKRAMDIYSSPAPAPYKYASRHHHRGYPPTMATIASNSY
PYHINNHYSTTPPLIRPVSTPKDTSPSPRNTVSSTNNVAPSLSNDSSYMK
AEHTHINDAPPALKSSPGYKNREMHAPKDLTLSETLNFYNQRFLDMQERQ
TELFSEMICRHEQFLSRLLEQQRTAAEDAQKRDKEFMLKLIEMFVKQ Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_71:426415..510814- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072177 ID=TCONS_00072177|Name=TCONS_00072177|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=84400bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:426415..510814- (Clytia hemisphaerica)
CGACAGCATGCAATCCGTACCATGACATCCATCCACAGAACTACACTACA
CTGCACAGGTTTGTATTTCATTCTTTGATCACAAAAAAATTTTCTTAACT
ATTTATTCTTTGATTTCTTGATTTGTATGCCATCAATCTCCTCTCATTGA
GGGTAGAAAAAAAGCCTGAAAAGGTCAGGAAAAACTTTAAGTAGACATTC
GCTACATTCCTCCCTTTCTTTTCACAACCCCACTAAGATTCATCCTTCCC
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CAAATGAATCAAACGCCGAATTAATTGAACACAATCAATTTCGATTCAAT
TGTCAAGCTTGATTTATTCAGTTTGATTTATTTTTTTGTTTATAACAGTT
TAGAAATTATTTAAAGTTTACCCAGTTGGCGCTAGTCTTACCCAGTTTGC
ATGATAAGACTCAAATGAAAATATTGCACTCAAAATTGGATTAAAATGCG
TCAATTTGTAGATGGATAGAAGCTCAAACCCTTTATCTTTCAATTTTTGT
GGTAAAATTCAGTATTCTCCTTATATTTGCGGTATTACAGAGTTATACAT
GGTCGTAGAGGAAAAAGAGGTTTATGTTATTTTTCGTAATTTTGTTTTTT
TTGCTAGATTTTTTTCAGTTTTTCTAGTTCATTCTGACGTCAATTTGAAA
GTACGTTAGAATTGCTTAATACACTACAATGACTTCTAATGCTATTTTTA
GTTATCCCATTAATTGTAAGCTCCAATTTTTTCTTGGTACCCTTTTATCA
GACTTCTTGAATAAAGGGAGAAAATCCATTGGTATTGTATCGGTATATTA
GCATGCTTTCAAGGAAGATATCTAAATCAAAACAACATTTTGCATGTGAC
AAATTTTTTAGTAGGTCTTTTTATTTTGTATAAAAAGAACCTGGTTTCCT
TTTGAATTTAATGTTACCGCCATACTGCCAACAACTCCGCCGTCATCTGG
GCAATCAAAATGAAAATAAGGAGTTGTATGTGCGTGCAGTCTCTTGGCGC
GTGTGCTAAAAATAAGTTATAAGGAGGGGGAAACTAAGTGTGCCAATTAT
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GAGAAATTTTGTATGCGCTTCTTGTGTTGTGTAAAATTACTTTTCATTTG
GCTGTTTTTTTATTTAAAGAATTTTGCAATGTTTACTGAACTAGTTTGAT
GGATGAACTTGTTTGATAAGAATAATACCAATTGAAGGTTTGTTTTGACT
ATTTTGCAGACCTGGTGTCGAGATTAAAGGAGGCAAGTTGATAAAGGCGA
ATCTTTGTAATTAGGGTAAAAAGAGGTTAGTATATCTGTATTAACAAGTC
CTGTTTGCTCCTTTAGGCTCTGAAGATATCTGACAGGGTCTCAAATTTAC
TAATTTTCAAAATTTGTATTTGACAGGGTCAACTTTTTGCTATTTTGGAA
AATTTTCATGGTGGAAATTTGATCGATTTTTTATTCAGACAGGGTCCCAA
AGTAATGAAACATTCACATCTGACAGGGTCAACTTTTCAAACTCCAACAG
CACGTCCCACACGCCCAACAAGGTAAGTGTCCCCCCTCAAGTAAGACAAT
TGCAATTTCGAATGGTTTGTCAGGGGGCTGAATTGAGGATGAAAGAAGGT
TTTTGTGCTTGTCTTGCCAGGTGCGAATTTAGGTTTGTTTATGTTTAATT
ACAGTAAGCTTGGTTATGTTAAAAGGTCCTTACCACTTGTCTTCGTAGGT
TTTTTATTAAAAACACTGGTTCATAAAATTGACACTGAAATTAGACAAGA
GCATAATGACAGACAATGACAATCAAAAAAGCAATCAAACAAAGTCAAGA
AAAATTCAGCTTCAGCATCATAACAATAACACATGACAGCATAATTAGTA
AAAGTGTTTACTTATTATTTTCTAATCCTTGTTTTGATGCTGGAGTTGTT
GAGTTTTTTTAAATTAATTCAACATTGTGTCCTACAAAAGATCGGTGACA
AGAAAATTACAAATAATTTTGCAATTTGATTTATCTTTCCTGGAAATGAC
AGTCATAAAAAGAATTTCTGTCAATAGATGTTTTAGAATTAAAAAAAAAG
ATTGCATTGAAAAAATTTGTTATGTTCCGGCTTCATTACCATTTTAATAT
CAGCATGCAGGTCTCCTTATTTGAATGAGTTTAAAGATCAGCCACCCACC
CTCCTCCTTAACACTTGTAACTGTAAATACTGTAACTAGTCGATAAATTC
AATTTGTAAATGTTTGTTTAAGGGATATGTACAGTGACTTTAGCAGCAAT
TACAATCACCAACATAATATTTGGCACAAAAGGGGAATTCCCTAAAAACT
TTAAAACTGCAAGTGATTTTTAAGTGTTTTAAAGTATGGTTGGAAAGTTT
TAACATCAGACTTAATAAGACTTAAGACCTTTAGGATCTCAGGATTTAAA
AGCTCAAAAATGTTCCAATATGGCTGAGAATATTTAAGCGTGGAAGCCAT
TTAACCCATTCGGATCGAATAATCCAATGGAAGAAAGCATGAAATTGCAG
TTCTTGCCTGAGCTTTAAATTCTGAAAAAATTTAAAACACCGAAATTGTC
AATATATTTTGGTGCTGATTGTACCTTGAGGGAAGAAAATTTGACGGATT
TGGCAGATATTTAGCCAAAATCTGTCAAATTAAGTTCCTGCAAAATTTAC
TTTTTCAAGCCATCTGCCAAATTAAATTCCTGCCAAAATTAAATTGTTGT
ATTCAATCCCCAAATGTATTTCAGGCCATAAAACAGGGCTTTTCATATTT
GATAGGGTTTTTTTGGCCAAAAATATCCTTCTTCTGCTTTCAAGCCATCT
GCTAAGTTAAATTCCCTCTGATAATACTTTTTTGGCCAACTGCCAAATTA
AATTCCCGCAGAAATCTCTTCCCATAGGTAATTTTAAATTATAATTATCC
CTTTATTTTAATTTGTGTATTGTTTCTGAAAATGAAAGAATAGAAGAAAT
GTAACTTAAGAGGATTAAAATTTGTGTGGATTAATTTTTGCCCTCGTGAA
AAAAATTAAAATCCGAATTTTGGCCTTAAATCTTAGGAAAATGAAAGAAA
TTTGAAAAAGAACGATTCGCGAACTTTACGCGAAATTTTTAGATTCTCAA
TTTGCAAATAGATATCAACGTGAAAATTAATCCAAGGTTTATCTAGTTGC
TGATTTTCAAGGGTGGTTAGTATGATAATTGCCCGGGGGGGCAGCTGGGC
AAAAGGACCGACGGGTATGTGCGGGTCCTAAGGGTACCTTTTCCAATATG
TTTAAAATGCACTGTAAGGGTCGGAAAAACTAGAGATGCACTGTAAGGGT
AGAAATTTCAGAAAATTCTTAAAAAATCTAGATATTTTGACCAAAAATGC
TAGAATTTTGACCATTTTTTGCACGAAAGGGATCGAAAATTTGGGGGAAA
ATGCACTCTAAGGGTAGGATTTTCACTGATTTTTGCTGCACTGTAAGGGT
GCAATTTTAAAAGCCAATTTTTGGCCCGCACATACCGTCAGTCCGCAAAC
CCAGTGCCCCCCCCCCCCCGGGGATAATTGATGTCTTATATGATAACTGA
ACACTTCCATCACAGCCAGTTTTTAATGTAGGCTAATTTTACTTGGTTTT
AAAACTCTTAAGGTTTTTTTAGAGCTTTTTCGCAGAGAATCCCAATTCTC
TTTACTTTTAGCAAAGAAAAGCCAATTAGTATGGAAAATATTCGACAATT
AAAGTGACCACCTGAGTCGATTCTTATTAGGTTTTTCAAGTTGTTTGTAT
TATAACACTAGATGAAGATATTTGCTGTGATTGCTATTTTAGTAACATGA
CGTCTCCTTAGGAGATTACACTCCTTATCATTTTTATAAGCATAACGTTT
ATAAGCATACTGAAGCTCAATTTTCCAGAACAATTAAGCATGTGCTAAGC
ATACCTTGAGGCTCAGCCAAAGAAATCATAATCCCTATATAATATCAAAC
AGCACCAAGTCAAGAGAGGTGCTGCAGTCTGTTTTTGAAACATGAACACA
ACACAAAGATTCGAAATCATATGGTAAACATTCGATAACAATAGAATGTC
TTCATTTCTCTCAAGATTAAAGAGAGGGGAAAATGCGGAAAATTTACCCC
CCCCCCCTCATAATTTTTTTTACCAAGCATAGGGTTAAGTATAAGTCGAG
GCTCAACATTGAGCTTTACTTAAGCATAGTGAGCTTCAGCCGAATTTACC
GTATGCTTATAAAAGAAAATGAGTGTAGTCAAATTTTCCAAATTAGGATG
ATGTCCATTAGTAGAGGGAATACTAACATTTTTTGTTTCCTCCTGATTTA
CATACATAGAGATTAAAAAATCTATTCCAAGCATGTACCATGAACTTCAC
CCACATTAAACTGATTTTTTTATTTTTTCAGGCTTGATCTCTATATATTC
CAAAATAATGCAAGCGAGATCAATTTTATTTTGGTTGAAAATGCGAGACA
GATATTCTCAAGGTATTTTTATGGTAAAATTTTAATATGACAATGAGGTC
CGCCCCTCCCCCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNGGGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGTTTATTAGATTTTGAAA
GAATTTCGAACCCATCTTCTATTTGGACCCTACTATTGGGGACCTTAGAG
TAAATGGCATAATCAGTTGAGAAATAAGTAAAATTAATTTTATCCCATGG
TCAAAGCATTATGGTTTCTAGCATGTGGTTTCTATTTTTGATCTAGGCAA
AAATACATACTGTCCTCCCCCCTCTTTATATAGGGGTGAGGGAACCAATT
TTCCAATTTTGAATGGGTGAGGAGGGGAAATGAAAATTTGAAAAGTAAAG
GGGGGAAAGACATCGATAGTTGGGAAATTTGGTGGGGGGGGGGGGGGGGG
GAGTGTGAAGGATTTTAATTTTTTATTTCGTTGTTGTTTTAAGTCTGCTT
TCCTAAGCATGTTTGTTTACATTAAACCTTTTTTGTTCTATCTGTCTAGT
ATTCTTTTTGCCGCAAAATTTTACGTTTTACGTTTATATGGGTATATGGG
GGAACTGATTTTTTTCAGAATTTTCTGGGGGGAAAGCAAAAAGGAGGGGG
GGGCTAAAAAAATGAAAAGTCGAAAGGGGAAAAAAAGAGGGGGGAGATTT
AAAAAAATCAAGAATTTGGTGGGGGAACAAACCCTGGAGGACACTATGAA
ACAGCTACTGGGTATTATGCTGCCAGTAAGGATAGTTTTTTGAGGTCTTG
TCAGCACATACCCGCCATTCTCCAACTCTAGCACCTTCTCAATTCTGGTG
ATTAGGTTATTAGATTATTATTTGGTTATTTTAGTTGGATATTTCATGTC
ATCCACTTCTAATAGATAGTCTTTAAAAGGGGGCACTCCAAGTGATTTGA
TACTGTTATAAAAGGGGTGTAGAAAAATACAATCATTCTTTCTTTGTATG
TATTTTTATCGTGATCATTTTGACATAAAGTGTCAAATCCACGGGAAATA
AAAACAGACTTAAAAAAGATCAAATTACCTTTTTGGAATATCTGTCACTT
ATCTACTTTGACCTTTCTTTTTGCTCTCAATCTTATTTCGTCTGGAAATC
AGATATGCGCCTTTAAACGGTTAAAAAGATGTTGCAATATTTGAAAGTCT
GAATACATAACTGTTTTTAAGTAATTCATTATAAAAGGATTCATCAAGAT
TGAAAATTGCTTTTACTTGCATTTTCAAGTGCTTGAAAGAGTAGTATTTA
TACACTGAAACAAAACGTCGAAGATTAAATTTCTTTTTATTATAAGAACT
AATAAATTTTGATTGAGCCTTGAAAATGCTTATGCCTAAAATACTCTAAA
TGTCTACTTTTTTCTCAAGGGCTTACCCAGCTAGCACACAACGTCGTTGC
AACGTTCATCTAATGTTTACAACGTCCATATAACGTTAGCTGAACGTTGT
AATAACGTTTTGTGTCAGCTGGGTAAGATTTACAGAATCAATTTATCTTC
CAAACCGTTTTCTCAGATTATTATAAGTGACAAAAATATTTTGTATCTAC
AGATGCACCCATGGAAGGAGCGTTTGGCTGTTTGATCAAAATACATTCAA
GTATACAAATTGAGACAAGTGGAAGATAGCAAAGGTATACACTTTTATTA
AATGTAATTTATAAAAAAGGATTTGGCTCGGGCGACAGTAGGGCAAAGGT
AGAGCATTCGACTACGGTGCGCAAAGCTGTTGGTTCAAATACCGGCCGGG
TCAGCCTTCGTACTTAGCATAAAAATGGTACTTGATGGCCTCTTTGCTAG
GTATTCAGTAGTTCAGCAGATACAAGGACTGGACCAAGGGTAGATAGCTA
TCAAAAGAAGAGCCTTTAGGTCGCCTCTGACTGTGATTGCAAACGACTTA
GTTACTCAGGGTTGAGCTGATCAATTTTAGATAAAGGTTTTGTTTTTTAA
TTAGAGTGATATCGTTTGCTTACTCATCAATTTTAATGAACAAGCTTTTT
CACATTGGATTGACACGGATGTGGAGCAAGGTTAGTCAGAAAGAGGAAAA
GAAAAACATTTTTTGCTTATATCAGCACAATTAAACAATAGACATCCACT
GTCCTGGTATAAAACATGTGCCTGATATGAAACGGGGACCCTTATGTAAA
AATAAAACCTTTAAGTTAATTATTATCTGTAACTGCGAGGTCAATTTAAC
ATTGATCGATCTTGGTAATCTCGAACCCAATCACTTCTCCTCTAACTGAA
AGGTGTGGCAACAAGCGTGAATCTCCTTCGCTTTTGTGGGTCGTTTCTGA
ATAAAACAATACTTAATCTTATTTAACCAATAAGAAAGCAATAAATATCA
GTCTGAGCTGTCAATTCAATAAGTGCTAAAAGGTTTTTTTAAGACCATTT
TTAATGTCTACGCGTGTTTTTTATAAGAAGAACTATCTAAGAATATAGGA
CTTCGGTGGTCAAAATCTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGTCTTCG
TGGGCTCTAAAACACCTGTTTTCTCAGGAAAATGGACGAAAATACTCAAA
ATATGTTGAAAATAAGAACATGTTAAGAACATTTTTAGGCTTGAAATTCG
AAAAGAACATCTACAGGCTTCAAAAATTTTGGATGTTCTTATAAAAAAAA
GGTGTATTTTTAAATAGTGATATAAGTAAAGGTTCTATTGAAACTCAAAT
TGTTGACCTCATTGCACAATCATCTTTGAAAAGTTTTTTCCAGATAAATT
CTTTCATTGTTGACTTGAATTACTTATTATTTAAAAGCTCACATTCTCAT
GTTTCTACTTCTTGTCAAAGTGAGAAACACGTACGCTTTTTTCACCCTCT
ATTCGGGCGGTCGGTAAATTTAAATTCCGGTCAAAGTCCGGGCTCGATTC
TTGACTTTGATTGTTACATAAGTTAAGTTCTTTATATCTTATTGATTTGA
ATTTTCAATCTGATTGTACTGCTTATTAAGAGACCTTTTCATAAATTAAG
TCACGAACATCACTTGCCTCGTATTCAAACAAATACCATGATGAATATGT
CTCTTGAGACATTAAATGATATTTTTATGCATAGAAAGTAGTTTTAATAA
AACCTGCTTGGAGTTAATCACCATGGCAATAATTTCAAAACGAGGCAAGT
GATGTTCGTGACGTATTTTATGAAAAGGTCTATTGCACTGCTTATTAATT
CTTTTCAATTTCTGAAAATTTTAAGTCTTGTGGGTTTGATTTTTCCGAGA
CTGTATGGGCGATATTGAAGCAGGGGATTTACTGAAGAATGAATTCTTGA
TATGCGTAAGTCAAGATGACGTCATATTTTTTAACGGAAGCACCCAAAAA
AGCCGGTTTTTTACCTCTGTGTTTCTATTTTTAGTAACAGAGAGGGATCA
AATCCCGGATTTTTTCGGGTGTTTCCGCTAGAAAAATGACTTACGCATAT
CAAGAATTCATTTTCACCAGGAGATTGAACTTTCATAAATTACGTCACGA
ACATCACTTGCCTCGTTTTGAAATTATTGCCATGGTGATTAACTCCAAGC
GAATTTTATTAAAACTACCTCTTATTCATAAAAAGATAATTTCATGTCTC
AAAGGTCATAATCGCCATGATAATTGTTTGTGACGTAATTTATGAAAAGG
TCCATTGATTTAGATTATTTGTCAGTGGTGGATCTAAGAGGGCGTTCTAA
ATCAATGACGGAGAGTGCGGGGAGTGTTTTTTTAGCCATACTCCTTTTAT
GGAAATGAAGACTCTCCTTCGTAAACCACATATCGTTTTTTTCTACCACG
AATGAAAGGACTTGTGATATAATTTTGAAATAATTTCTCGTAACCACGTA
TGTGGAAAATTTTGGTAAATAATTTAGAGTTTTGTCAGATATAATTGAAA
TTTTCAGGAAGAACTTTAAGGCCTTGATGGAGGATGTCAATGTTGTAAAT
TTTGAAAAATAAGAAAATAATATCGAAATTTTCAATTAATTTTGTTTTAC
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ACTGGATGACTCAAATAAAGGCTTTAGCTGTTTCAAGAGACAACCTCAAA
AAAGCTCAAGACTTTAGGTGTAACATACATTTTGACCCTTAATTGAAGTT
ACCTTATTAGGAAAGAATTTTGGGCATTTTGGCCCGGCACGTTCGTTCGT
TCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTC
GTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGAACCTTTCTTATT
TAGTGTAGTGAGTGAGAACCTGTTAAAACATTGATTTTCAGATTTCAATA
TTCATGGCTATATATCGCTATTCAATTCTTTATGTTTATTACAATCAACT
GAACTGCAATGCCTCAATTACTTCAGAAAAGTCCCTCTAATTAAGGTTGA
GAATCTGGCGGGGAAACGAATTTTTCAGTTATTCGAATTCCCCGTTACAC
TCCTTTGTTTGTAAGCATAACGTTTTTTTTTAAAAGCATACTTAGGCTCA
AACTCGGTGAAAAATAAGCATAATGCTAAGCATGCTTCCAAGCTGAAATG
CAAAAAAAAAACTCTGACCTTTTTAGGGTTACTTTTAAAGCTGTTTAGCT
GCGGCGCCAAATTACAAAAAAACTGTAAATGTTTTAGCCGATTCAATGTT
CCGACTTAAAAATTCGAAATTTCCATGGACTCAAAGAAAATCAACAAAAC
GAAGTATAAGTATATAAATAAGCATAAATTAAGACTGAAAATGAGATTTT
GTTAAGCATACTGAGCCTCGATCCAATTTTCCCGTATGCTTATAAAAAAA
GAGTGTATTCGAAGTAAATTCTTATCCCCCTTGGAGCTTCGAATAACTGA
GAGTCTCCTGTATTTATTTACTTTAGGTATTTTACGGTGATGTTTTCCAA
ACTTTGCATCGTTTGATTTCCAAAGAAACCAAACCATTTTTTAAACCGGA
GTTCTTTAGAATCGTTAGTCTGAATCACAGGCCTCTACAAATCCCCAGGT
AGTATTGATCTGTTTAATGAGCACGAACCCGTTAGTGGATACCAGCAGCC
TATAGAATCGTTGGAACAGTCGAAAACCGGCGTAAAACGAATTTCCTTCA
TTTTTCGAGTGACACTCGACAGACTTTCATGATTTTTTTTGCAAAATTAA
GCAAATTGAATAGTTTCGAAAAATTATTTTTTAAGGTCGTCAGAACCAGA
ATACGTCCAGAAAAAAATGATTTCTTGTTTATTTTAAATTTAATGTTTTT
TGTTGATTAGCCAGGTAGGTCCATAAAAGTATAATTTGTTTGCATTTGTT
TGTCACGGTTGCCTTTTTGTCAGTAACCTGGTGGTAAGGGCATGGGGTTG
ATTTTTCAGGGAAGTGCTAAAGAGTAAAATGGCGTATAAAATGCATCTCT
GATCACAAAATTTTGGAACCCCTTCCCTAGCATCAATATCAAAACACTAA
AACATCGGCTGTATTAATGTTATTTTGATGTAGTTTGAGCCGGGCAACAC
CAATTCTGATTAAGCTGCTTAAAAAATGATATCTTTTAGGGTGTGGTTTA
AAACTTTAACGTAATCAGGTCTTTATTTCTGAGAGGAATTGATAGAACTA
GAAAATAAAGAACCGCTCTGGTGCCAGAAAGTCTAATCTTTTCTTTGGCC
TCGCTCTTGATAAATGTTTAATGTGTGCTTCTAGAAATGTCTGCTCTTCA
ATTCTAGATAAGCTCATTCAGTTGAGTCTCTATAACTCGAACCCGCACGG
GGAACACAAATTTATTCGAGTTAAGGAAATTTCGTGTTATGAAGTAAGGT
TTTGTTACCTGAAGGGACAAGAAAACTTGTTCGAGTCAATATGACATTTA
AGTTGTAGAGGTTCGAATTATAGACTACTGTAACTTGATGGTCAATTGTT
ATCTAATACACGTTTTTTATAAGAACATCCAACATTTTTTAACCCTTCGG
ATGTTCTTAACTTTTTTAGTTTTAAGCCTTAAAATGTTTCTTAAAATGTT
CTTATTTTCACCATTTTGAGAGTATTTTTGTCCATTTTTCTAAGAAAATA
GGTGTTTAAGGGTCCAAAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGCTCACAAC
ATTTTTGCCATCGAAGCCTTTTATGTTCTTATAAAAAATGCTTCATTCAG
CTACTCGAGTACTGTATCCCTCACAAGCGACCGCAGTACAGTGGTAGAGC
ATCCGGCTACGGTTCGCAAGGTTGTGGGTTCAACCCCCAGCCGGGTCATA
CCAAAGATTTCCAAAATGGTACTTGATGTCTCTCTNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TAGTTATCGAAAGAGGAGCCTTCGGGTCGCCTCCGACTGCGGTCGCAGAC
TTACTTACTTACATTACTTTACAAATGGTATATATAAGAACATCCAAAAT
TTTGAAGCTTTCGGATGCTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAGCCTAAAAAAT
GTTCTTACCATGTTCTTATTTTCACCATTTTGTGGGTATTTTTGTCCGTT
TTCCTAAGAAATCGGGTGCTTTTGAGTCTCAGAAGCTTTAAAATATCTCA
ACTTGTTCTTAATATTTTGGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATACTTT
GTTCTTATAAAACAAAAGGTGTATAGAAAAGAGATGTCTGTCTTATGCTG
ACAAAGCTGAAATAACAAAAGGGATTCTCAAAATTCTTGATATTCATGAC
GTAATGTTTTCTACGGAAATACCCCGGTTTTAGCCAGTAGTGGAACATTT
AAACTAGACAAGAGTTTAAAATTTGCCACTACTGGCAAAAACCGGGGTCT
TTCCGTAGAAAACTTTACGTCATGAATATCATGAATTTGTACTTGTACGG
CACGTTAGCGCGAGAAAATTGCTCTTTCTTTTGTTTAAAACTGCTGATTG
AAAGTCAATAGATGATGAGGCATGCGGAGTGAGGTTTTGGTGCGTCAGCA
TAAAAATCGTATACAGTCGACTCTCGCTAATTCGAACTTGAACGGTGAAT
CTTATTTGTTCGAATTATAGGGAGATTCGAACTATAGACATTTTAAGAGG
GTTTCTCATTGGCGGGGACTGGAAACAAGTTCGAATTATAGGAAGATTCG
AATAATGGAAGTTCGAATAAGCGAAAGTTTATTGTACGTTAACGCTCTCT
AATTCGACGTTCTACTATTCGATACGCTCCATTATTCGATAATATTGAAA
GTCATCGTCAACAAGAAAACCACATAAACGACGCTCTACTATTTGATACA
ATCACTTATTGGATGAAAATCCTATTCCCCTTGAAAATCGAATGAGATAG
AGTTTACTGTAGTCGAGTTGACTCGCACAAGCACTTTTATTGTAAATTAA
AAAGTTAAAAAATGAGCAGACTAATTTTCTTTGCAAGTTACTTGAATTCG
CTACTTTTATTCACAGCATGTTTATTCATGCTCGGTGAGGTATTATCAGT
ATGTAACTGGATTATATATACCTTTTTTAATGTAAAGAGCTTGAAATCAT
GAAAGAGAGAAAAATAGACAAAAGACGGATGACCTAGCGTCTAGACATGT
CTGAAACGTCTGAAACTTCATCATTACACATGCTTTTACACTATAAAACT
GATTTAAAGTAATTATAAAATTGAAACTAGCTCCAGGCCCGGCGGAACAA
CCATAAAAGTGGGGAGGCTGACGGCTCAAAATGAGCTAAAATTCGCTAAG
TATTTGAGAAAAAAATTGTAGCCTCTGAAGCCTCCCCGCTTCCGCCGGGC
CTGAGCTCTCGACATGGAAAGGAAGGTTTACCAACCAATATAAATCAAAG
TTTGAATCCTCGATGGAAACTTGTAAACTGGAGGTATATTCATATACCCC
CCATCAATTGTTCTTAAAATCACTTCCTTACAATGCAGCAAATCTTACCC
TTGTGTCACAGACCCCACTGGGATATTGGACAAAATTTTGTCCAAGTGGG
AAAAATACCCTACAGTTTCAGCCCCACTAGGAAAGTGACTTTTATTCCAT
TACCATTCGAAATTAAATGGAAAAACTACGCGCTAAATCATCTCTACTGG
ATTTTATAAGACGGGAATAATAGAAAAATTTCTATCCCAATGAGATTTTC
ATCATGATCGTTCTTATAGAGTATATTCCTATAAAATTAAAAAGTATTTG
GACACTAGATTTATTTACTCTTTCCTGGAGGATATTCAAGCTGCAGCATC
ATCAGAGGAGATTGCAAAATTGACTGAAATTTACGAAAATGACACATCTT
CCAGGAGATATTCGAGGCCCTCCCTTCAGAGCCTGTTTCTTAGATCTTTC
ACGACAAAGATCTTTCACAATATGAAACTCATTTTAAAAATATTACAAAA
TCTTTCTAAATTTTTGTGAAAAACTTCAAAAATGTATGATATCTTTATAG
AAGAATGAAAAAATGAAGTAATTTCTATCTTTCGGAAAAGCTTATAATAT
TAGGGGGCTGGAACATTTTCTCTTATCACTGATCTAATATTTAGATACTA
TATATAATTTTCTCTTCAAATCTTAATACCAACTTCAACTGTAGAGAGCT
TTATCTCTTTCCTTTAAAGGTTAAGTGGGTGGAGCAGTTGAGAAATTAAT
TTTTAACAGGTGCTTCAAAAGGAATACTGTAAATTCGTTTAAAAAACTTT
ATTAAAAATATTATTATTTTAGCAGGTCAAATTCTTTTCCTTTTTTGATT
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TTCCTTGACTCTAAACCATCCTGGCTCCCCCAACATCAATTTGTCGGTGT
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AATGGTTTTGACTGTCCCAGAAAAACTATTTTCTGTTTCATTTTCTGTAT
CATCATTTCTTAAAGTCAAAGCCAGCGGTTCGCGTGTTGGCGTGATTTGA
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TCGGTATAGTACTAAATTGATTTCAATACTCAAATTTAAGATCTTATACC
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CGATCCAAAACTAAAGTCGTTTAAAATGAATAATGATATAATGTCCGTCT
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CCAATGTTTTATTCAGATTTCCTTGAAATCATTTCCGAGAGTGAGCGCAT
CAAAGAAGGTGTCAAAATAGAATCACCCAATGTCGAGGTTTTGAACGATT
CAAGCAAAGATGGCGACCTGTACGGGACTGGATATCAGAATCCGTCACCA
CAAGACAGCCAATACGACGAACGATCGTCATCCGAATTAAACACACGTCG
CGAAGACGAACTAGACGAGCGACGTACTCAGCAATCGGGTAACGTTAATA
ACAGTGAAGGTTCTGGAAGCTTTAACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAGTGT
GAGAACGAGTATCAAACAACGACGTCACCAAATCATCAACCGACCGTATC
CGAAACGAACGTCACAAACGAGCGAAGGGAAACCGCCACTGAAAGCCATC
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GAACGCTTATCAAATTATTACTCACACCACGATTCTATGTATCCGCCCAT
TTATTCGACCAGCTCTNCGCACCACCCAAGAGTCTCCAGCAATGCAAGAA
GAAGTTTCGTAATATACGATACATTTGTAAAATGGCCATGAATAATAACA
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GAAATCATTTCCGAGAGTGAGCGCATCAAAGAAGGTGTCAAAATAGAATC
ACCCAATGTCGAGGTTTTGAACGATTCAAGCAAAGATGGCGACCTGTACG
GGACTGGATATCAGAATCCGTCACCACAAGACAGCCAATACGACGAACGA
TCGTCATCCGAATTAAACACACGTCGCGAAGACGAACTAGACGAGCGACG
TACTCAGCAATCGGGCAACGTTAATAACAGTGAAGGTTCTGGAAGCTTTA
ACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAGTGTGAGAACGAGTATCAAACAACGACG
TCACCAAATCATCAACCGACCGTATCCGAAACGAACGTCACAAACGAGCG
AAGGGAAGCCGTCACTGAGAGCCATCATCATTCCTTACAAAACGGGGATC
TCGAGAACGGCCATAGTAGAATCAACGAACGCTTATCAAATTATTACTCA
CACCACGATTCTATGTATCCGCCCATTTATTCGACCAGCTCTGAACATTA
CATGCGTAAGCATAAAAATATTGACGTCAGTATAATGGGGCGTGGGTACC
CCAGTGCAAAGCGTGTTAAACGCGCCATGGATATTTACTCATCACCTGCC
CCTGCGCCCTACAAATACGCAAGCCGACACCATCATAGAGGATATCCGCC
CACGATGGCCACAATCGCCAGTAATTCTTACCCATATCACATTAACAACC
ACTATTCGACAACACCGCCGCTTATTCGACCCGTATCTACACCAAAAGAT
ACATCCCCGTCTCCCCGTAATACTGTTTCTAGTACCAATAACGTAGCACC
GAGTCTGTCCAATGATTCGTCTTATATGAAAGCAGAGCATACGCATATTA
ATGACGCACCGCCTGCGCTGAAATCGTCTCCTGGGTACAAGAATAGAGAG
ATGCACGCACCTAAAGACTTAACATTAAGTGAAACTTTGAACTTTTACAA
TCAACGATTCTTAGATATGCAAGAGAGACAAACTGAATTATTTAGTGAAA
TGATTTGTCGGCATGAACAATTTCTTTCCAGACTTTTAGAACAACAACGA
ACGGCTGCTGAAGATGCTCAAAAAAGAGACAAAGAATTCATGTTAAAATT
GATAGAAATGTTCGTTAAGCAATAGTTTCAAACGTTCTCAACTTTTTAGT
TTTTACAATTTTTTCTTCTGATTTTCAATTTCTTCTGATAGAATTTTTCT
TTCGTTTTTTTTTTTCTTTTAAAATTTTCTGCTCCAGGTTTTTGAGCAGA
TTTGTAAATATATTTATCTAAATGCGATCTTTAAATTGGGTAATTCTTAA
TTTTTACAGTTGACTTGCCTGGTTTTTGATACATTCTTAAAACTGTCAGA
TCGTTGTGTACGACAGGGGTTTTATTCAAATCTCCCTTGTCAACAAAAAT
TCTTTAAGAATTCATCTTTGAACCCTTAAATGAGGCCGTTGGAAAATTAG
Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_71:426415..510814- >TCONS_00072177 ID=TCONS_00072177|Name=TCONS_00072177|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1194bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:426415..510814- (Clytia hemisphaerica)
ATGGCCATGAATAATAACAAACAAGAGGGCGGTAAGAAACATTATCCAAT
GTTTTATTCAGATTTCCTTGAAATCATTTCCGAGAGTGAGCGCATCAAAG
AAGGTGTCAAAATAGAATCACCCAATGTCGAGGTTTTGAACGATTCAAGC
AAAGATGGCGACCTGTACGGGACTGGATATCAGAATCCGTCACCACAAGA
CAGCCAATACGACGAACGATCGTCATCCGAATTAAACACACGTCGCGAAG
ACGAACTAGACGAGCGACGTACTCAGCAATCGGGCAACGTTAATAACAGT
GAAGGTTCTGGAAGCTTTAACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAGTGTGAGAA
CGAGTATCAAACAACGACGTCACCAAATCATCAACCGACCGTATCCGAAA
CGAACGTCACAAACGAGCGAAGGGAAGCCGTCACTGAGAGCCATCATCAT
TCCTTACAAAACGGGGATCTCGAGAACGGCCATAGTAGAATCAACGAACG
CTTATCAAATTATTACTCACACCACGATTCTATGTATCCGCCCATTTATT
CGACCAGCTCTGAACATTACATGCGTAAGCATAAAAATATTGACGTCAGT
ATAATGGGGCGTGGGTACCCCAGTGCAAAGCGTGTTAAACGCGCCATGGA
TATTTACTCATCACCTGCCCCTGCGCCCTACAAATACGCAAGCCGACACC
ATCATAGAGGATATCCGCCCACGATGGCCACAATCGCCAGTAATTCTTAC
CCATATCACATTAACAACCACTATTCGACAACACCGCCGCTTATTCGACC
CGTATCTACACCAAAAGATACATCCCCGTCTCCCCGTAATACTGTTTCTA
GTACCAATAACGTAGCACCGAGTCTGTCCAATGATTCGTCTTATATGAAA
GCAGAGCATACGCATATTAATGACGCACCGCCTGCGCTGAAATCGTCTCC
TGGGTACAAGAATAGAGAGATGCACGCACCTAAAGACTTAACATTAAGTG
AAACTTTGAACTTTTACAATCAACGATTCTTAGATATGCAAGAGAGACAA
ACTGAATTATTTAGTGAAATGATTTGTCGGCATGAACAATTTCTTTCCAG
ACTTTTAGAACAACAACGAACGGCTGCTGAAGATGCTCAAAAAAGAGACA
AAGAATTCATGTTAAAATTGATAGAAATGTTCGTTAAGCAATAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:510757..510814 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:510757..510814 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:506153..506233 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:506153..506233 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:504431..504512 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:504431..504512 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:492796..493009 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:492796..493009 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:426415..428956 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1575043694:426415..428956 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:510757..510814 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:510757..510814 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:506153..506233 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:506153..506233 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:504431..504512 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:504431..504512 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:492796..493009 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:492796..493009 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:426415..428956 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1510915933:426415..428956 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:510757..510814 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:510757..510814 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:506153..506233 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:506153..506233 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:504431..504512 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:504431..504512 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:492796..493009 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:492796..493009 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:426415..428956 | TCONS_00072177-exon-scaffold_71-1491911889:426415..428956 | Clytia hemisphaerica | exon |
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_71 | supercontig | scaffold_71:426415..510814 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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