TCONS_00070386 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00070386
Unique Name	TCONS_00070386
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3913

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_55:17025..76969-

transcript sequence

>TCONS_00070386 ID=TCONS_00070386|Name=TCONS_00070386|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3913bp
ttcaggtataaaATATACATAAGTTACAATTAAAgaaagtattttgaaaa
taaaaatgaaagaagaaagcTTATTCCGTGTTTTTGTTGGTGGTCTTGCC
CCTGAAGTCAAGGAAGAGGAACTAAGAGATCGATTCAAGAGCTTTGGTAC
GACGTCAGATGTATGTTTGTTTCAGAAAAAGACTTCAGATGgggTAATCT
CAAAGACATTTGGTTATGTTAACCTCACCACGACTGAGCAACAACTCAGG
AAATGTTTCGCAATCTTTGGTGGCACGAAATGGAAAGGACACAGCCTGAA
AGTGCAACTGGCCAAAGACGATTTCATGAAAAGGTTACAAAAAGAATGGG
AAAATCCTGAACCAGTTAAAATCTCTAAATCAAGAAAACGTAAACAGATC
GATCCTATCCGCAGCTACGAAGAATATATTGCTAAAAGTAAAAGCACAAA
GAAAGCCATTCCCGGTATCCCTTTGGAAGGTGAAAAGAACTGGGTCATCG
GCAAGTTTGGTCGACCGTTACCCATTGTCCATATCAATGGTAAAGGCTCT
GGCAGGAAGTTTTTGAAACACGATCCATCAAAGCATTGCCATTGCATCCG
AAGAATAGCTACTGATGTGCCCGAGGACAGAATTGATGGATTGACTTGGG
AATTGGATGAATGCCAACATCTTCAAGATCGTATTATCAGAAATAAGAGC
ATAACCAAGAAAAAGGATATTGCGAACGGCGTTGTTGAGCTTGATGGTGT
CGATGAGGAAAAAGAATCGcctaagaaaaagaagaaaaagaaaaaagcca
GTTTGGAGAGTATGGAAGATGTGGTGAATGAAAACGAGAGAGATACTGCT
TTATTAAAGACTAAAGATTTGAATGGAAATGATTCTGAGGAACTTTGTAA
TGGTGCTGGAGAACTTGAAAATGACTTTGAAATAGCTTCTTGTGAGAATA
TTGAAGATAAATCTGACAATGAATCAATGGAAATTTCTTCGAATATAAAC
AATATATCTGAGGATAAAGAAAGTGAGGAATCGTCTGAATCTGAAGACGA
AGAAGTGCTCGTAAACGGTACTCTCAAAAATATTGGCGATGAACCGGAAG
ATAACGGCGTTTCAATTTCCTCTGAATCTGAAGTCGACAGTGAAGACGAA
GAAGATTCTCAATCAGACAGTGGAACGATTCCAGGTCAACCGACTTTCCA
TACAACTTCAATGATTGCTTCAACTCCATTTGTTGTTCCTTGCGTTAAGA
AAAATCTACGCGAGAACCCGGGTGATAACATTGTAGCTACACCAAAGGTA
GCTCACAATAACAGCAGTCTTGGTAAAAGCATTATCGAACAGTTGAAATC
GAGATCAATGGCTGAACCATCAACAACAGGAACACCATTACCAGAATCTA
AGGACTCGAATGTAGATAGTGGTTCTGAATCTGAAGGTGAAAGAACGAAT
AACTTTTTCGACTTTGATATCAACGATATGAATAAAGGACCTAAATCCAA
TGGAGGAGTTTCATCGAGTAATGAGTCTGACGAGTCTACCGATGACAGTG
AAGGTGAGGAACCCATCAATCTGTTTGATTTCGAATTCGAGAATCTAAAA
GGAAAACAAGGAACAGAGTTTCTTAGTAGTTTTGAATTGCGCTGGGAAAA
AGAAGATGTGGGAGAAGATTCAAGTGGGGAGAGTTCAAGTGAAGACTCTG
AAACGGATAGCGATAAGTCACCCAAGGCGTCGAAAGAGGGTGAAAAAGCT
GTGCCAGAAGCAAGTTCTGATGAACCCGTTGAGAGTGAATCTCCCCAAGA
AGATAATGCGGAACcagtcaaaaagaaaaagaaaaaatcgagaaaaGATA
CCGAAGATGAACAAGAAGAAATATCTGAAACAAAGTCTTCttcgaaaaag
aagaagaaagagaaAGAATCGACATTGAGTTCGAATGATatagatgaaaa
tttgaaactaaACCTTGAAATTGACGAATCCGCCACACaagaaatgaaat
caaaaaagaaaaagaagaaaaccgaaaaagaaaatgaaaatgaaaccgAA
GAATCGACAGCTTCTACGAAGAAAGAGAAacgcaaaaagaaaaaagaaaa
atccgcATGCGAGTCACAGGTCAAACACCATAAACCGCAAGATTCCGAAC
AGTTACGACAAAAATCAGTCGAAGCTCATAACCAACGCACGCAACAGAAT
AAAGAGCTCATACAAAACGCACTTCGGGGATTGGACACGAAGGACTCGTC
ATCTGCGAACAATAAAATACGATTCAGCGACACGGACGACGATGATGACG
AAGTCACCTTCCAAAACTTGACGACAAATGAAGCATCGAGTAAAAATGAT
AGTGATGACAAAGGAACGAAAACTAAATCTAACAAAGACGAGAAGAAGAG
TGCACTTTGGGATGGTGATAGTGACGAGTCAGATGATGGAGGGACGATGA
CACGAACGAAACATAAAGATGAAAAGACAGTCGATTTCCTTGGTGATGAA
AACGATGAAGATGATGAAGATGAGGATGAAAACAGATTTTCAGTCAAACC
ACAATTTCAAGGAGAACACGGCAAAAAGCTTTTCAAAATGCAAATGCATT
ATGGTGGTGATGATCGTTTCCGGATGGACGAACGGTTTGCCGAAGATGAC
AACGGCGGCGATACTGATTCAGAAGATGAAggcgaaaaatcagaaaacaa
gaAGAGAAGTATAGAAAGAGAAGACGAAgaaacgaaaaatttgaatgCAG
AAGAAGAGAAGGAGCGGAATATGTCTGTACTGGAAAGCATCCTTGGCAAA
AGCTTGAAACACaacaaatcaaagaaagaattgaaaaaagaattaattgC
TACATCTGCCAACCCATACCAACGATATGATCCAACAAAATCAGACCATA
CCGAACTCGAAGTTGAAAAGGAAGAGAAACCTTCAAACAGCAAAAAATTA
AACGAAACATCAGTAGGAGAGAAAGATGTCGAAGAGGATGAAGCGAACCC
TGTACCCGAAGTCTCCAAAGAACGTTTCTACAAAGTTGAAACTTCACTGA
AATCACTCTTCTCCGGCACTGCTACTGCTGCTGAGAGCGAGGACAAGCCT
GCACCAGCTTTTACATTTTTGTCTGCTGCGCCAACGAACGATGACGAGGA
AGATGACTCTGGTAAAGTTGTAAATAACACCATGGATGTTGACGATGATG
ATGGAGAAGATGAAGAAACTGTTGATAAAGCCAAACCCATCAAAGAATTA
AGCTGGAAAAAAGGTTTACGGGAAGATCGTGACAACAGGGACGTCTCTAT
GgaaaacgaaaaagaagaagagtCGGAAGAAAAAACGAAAGAAGGAGAAG
GAAAAAGTTCTTCTGCTGGTggattcttcttcttcaaagaaaatgatgaa
CGGCTGTTAAAAGGTGCAAGTTTCATGCGCTCAGAAGGATTGGAAGAGAT
CACAAAACAATGGGAAGATATTCGACAAGGACTACGCGAGgACTTTAGAA
AGAAGCACAAAGATGCTGTCCGACGCGTCCGAAAAATGAAAGAACGGAAA
AGAGTACCTAACAACAGCGGCGGAATTTCAAATAACGGCATacacgcaac
gttgtttcaacgttcttCTAATATTATATGGACGtcgtgaacgttagata
aacgttaaaagaaCGTTATATGCCAGCTGGGAAAAAACGGCAGACAACCA
GACACCCACCTGGCAGATGCTTCTGATCACCGACGCCTGTAATAGAAGTG
AAATTGATTCCTTTGTTTCATATGCGAATTCCGATCTACCAATATATAAT
TTTAATTGGAATGCTATTTATAGTTCTttgttcttcttcatcttcaccaa
ttattttcatttgattgaagttgttgtctttttaattaCTTCCAATGATT
TTTTTCAGCAAGT

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_55:17025..76969-

Legend: exon

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>TCONS_00070386 ID=TCONS_00070386|Name=TCONS_00070386|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=59945bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_55:17025..76969- (Clytia hemisphaerica)
TTCAGGTATAAAATATACATAAGTTACAATTAAAGAAAGTATTTTGAAAA
TAAAAATGAAAGAAGAAAGCTTATTCCGTGTTTTTGTTGGTGGTCTTGCC
CCTGAAGTCAAGGAAGAGGAACTAAGGTAAAAAGATTATGCTTTGTTATA
TCTTTTAACGAATTTAAGGAGAGTTGAGTCATGGCCTCAAAAGATCTATT
TCAATACGCTGTTCCAATGAATTTCCATACAGGAGATACAGGTGGGTGGA
CGAACCTTTTCAAGTGAAAACAAATTTCTTGGAAAAGTGTAGATACCCCC
TGAAAAATGGCAAAATTTGCAAAAGAACCCTTGGAAAAATTTTTATCTCT
TATAGTGAGGGTTTTTCCCCTGGAAAAATGAGAAAACACTTCTTACACCC
CCTGGAAATTCTTCTCGGATTACCCCCAGGAAATGTTCGTCCACCCCCTG
TATGGTCATAAAATGGAATGGCCCAATCTTTGCACGGGACATAGATTCTC
TCATCTAACTCAGAATCTTACTCAGTACGTAAAAACAATGAAAGTTTCAT
ATTGTGAACATGAACTTTGTATCATACTTTCAGAGATCGATTCAAGAGCT
TTGGTACGACGTCAGATGTATGTTTGTTTCAGAAAAAGACTTCAGATGGT
ATGACGTTTAAAAGCTTTCAAAGGATAATCAAACAAATGGATTTATATTA
AAGAATCTGCAGTCAAAAAATCTCAAATCATCTGTTGTTCCTTATTAAAC
ATTAGATACTACCAATTTTCTGGCATCTCCATTTATGTTGCAAATGGTTT
CCCTAAAGTGCCAATCATTGTAGTGGGTGGTTGTACTTGATGGGGAATCA
TTAGTGATAACAGTACTTTACTTTTGGGTTAATTTGTTTTCTGAAAATTG
CAAAACTTAAACCGTAGCTTATCCTACAATAAGAAACGTATAAGAAAGGC
ATATGATCTTTAAAACAACTTCATGTTTTGTCATTCATTTACTTAAATTT
TGAGATGCAAAACTTTGCAAGCTTCGCCTTCTTTCGAGATTACTTTATTC
ACTACCTCAAATTGTTCATATATTTTTTCTTTTCTTTTTTTCAGGGGTAA
TCTCAAAGACATTTGGTTATGTTAACCTCACCACGACTGAGCAACAACTC
AGGAAATGTATGTAAAGATTTGAAAGCGATTGTAATTTTTTGAGATTTGT
TTCGTGTGAGAATTGTTTCATTCGTCTTGTATTTGCTTCCATTGAGCTCT
TTCGAATAGTTTCGCACACTGTATTCAGGGACTCTAGGCTGCCGTTTTAC
ATGAGAAGAGTGGTCTTTTTTTTATCTTTTATATACTTTTTGAATTAGGT
TTCGCAATCTTTGGTGGCACGAAATGGAAAGGACACAGCCTGAAAGTGCA
ACTGGCCAAAGACGATTTCATGAAAAGGTAACCCTATCTTATGAAGTTTT
ATGAAAAAAGTTTAATGTAAGTAAAAAATGTAAGTAATCGATATTATATA
AGTCATAGTACTAAATTCAAGGAATGATATTATTGCGCATAATTGAATTT
TCACAATTCGACCTAAAGTTGACCTAGAAACTTTTCAGCAAACCAAGATT
TACTAGGCTTCTTCGTTTCGAGTGTAAAACTCCTAATGAGAATAAGACCT
AAAATCCCGGAGGTTAAAAGAACTACAATTTCCAATAATCATTTATTTAT
ACACACTCATAGGTTACAAAAAGAATGGGAAAATCCTGAACCAGTTAAAA
TCTCTAAATCAAGAAAACGTAAACAGATCGATCCTATCCGCAGCTACGAA
GAATATATTGCTAAAAGTAAAAGCACAAAGAAAGCCATTCCCGGTATCCC
TTTGGAAGGTGAAAAGAACTGGGTCATCGGCAAGTTTGGTCGACCGTTAC
CCATTGTCCATATCAATGGTAAAGGCTCTGGCAGGAAGTTTTTGAAACAC
GATCCATCAAAGCATTGCCATTGCATCCGAAGAATAGCTACTGATGTGCC
CGAGGACAGAATTGATGGATTGACTTGGGAATTGGATGAATGCCAACATC
TTCAAGATCGTATTATCAGAAATAAGAGCATAACCAAGAAAAAGGATATT
GCGAACGGCGTTGTTGAGCTTGATGGTGTCGATGAGGAAAAAGAATCGCC
TAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAAAAAGCCAGTTTGGAGAGTATGGAAGATG
TGGTGAATGAAAACGAGAGAGATACTGCTTTATTAAAGACTAAAGATTTG
AATGGAAATGATTCTGAGGAACTTTGTAATGGTGCTGGAGAACTTGAAAA
TGACTTTGAAATAGCTTCTTGTGAGAATATTGAAGATAAATCTGACAATG
AATCAATGGAAATTTCTTCGAATATAAACAATATATCTGAGGATAAAGAA
AGTGAGGAATCGTCTGAATCTGAAGACGAAGAAGTGCTCGTAAACGGTAC
TCTCAAAAATATTGGCGATGAACCGGAAGATAACGGCGTTTCAATTTCCT
CTGAATCTGAAGTCGACAGTGAAGACGAAGAAGATTCTCAATCAGACAGT
GGAACGATTCCAGGTCAACCGACTTTCCATACAACTTCAATGATTGCTTC
AACTCCATTTGTTGTTCCTTGCGTTAAGAAAAATCTACGCGAGAACCCGG
GTGATAACATTGTAGCTACACCAAAGGTAGCTCACAATAACAGCAGTCTT
GGTAAAAGCATTATCGAACAGTTGAAATCGAGATCAATGGCTGAACCATC
AACAACAGGAACACCATTACCAGAATCTAAGGACTCGAATGTAGATAGTG
GTTCTGAATCTGAAGGTGAAAGAACGAATAACTTTTTCGACTTTGATATC
AACGATATGAATAAAGGACCTAAATCCAATGGAGGAGTTTCATCGAGTAA
TGAGTCTGACGAGTCTACCGATGACAGTGAAGGTGAGGAACCCATCAATC
TGTTTGATTTCGAATTCGAGAATCTAAAAGGAAAACAAGGAACAGAGTTT
CTTAGTAGTTTTGAATTGCGCTGGGAAAAAGAAGATGTGGGAGAAGATTC
AAGTGGGGAGAGTTCAAGTGAAGACTCTGAAACGGATAGCGATAAGTCAC
CCAAGGCGTCGAAAGAGGGTGAAAAAGCTGTGCCAGAAGCAAGTTCTGAT
GAACCCGTTGAGAGTGAATCTCCCCAAGAAGATAATGCGGAACCAGTCAA
AAAGAAAAAGAAAAAATCGAGAAAAGATACCGAAGATGAACAAGAAGAAA
TATCTGAAACAAAGTCTTCTTCGAAAAAGAAGAAGAAAGAGAAAGAATCG
ACATTGAGTTCGAATGATATAGATGAAAATTTGAAACTAAACCTTGAAAT
TGACGAATCCGCCACACAAGAAATGAAATCAAAAAAGAAAAAGAAGAAAA
CCGAAAAAGAAAATGAAAATGAAACCGAAGAATCGACAGCTTCTACGAAG
AAAGAGAAACGCAAAAAGAAAAAAGAAAAATCCGCATGCGAGTCACAGGT
CAAACACCATAAACCGCAAGATTCCGAACAGTTACGACAAAAATCAGTCG
AAGCTCATAACCAACGCACGCAACAGAATAAAGAGCTCATACAAAACGCA
CTTCGGGGATTGGACACGAAGGACTCGTCATCTGCGAACAATAAAATACG
ATTCAGCGACACGGACGACGATGATGACGAAGTCACCTTCCAAAACTTGA
CGACAAATGAAGCATCGAGTAAAAATGATAGTGATGACAAAGGAACGAAA
ACTAAATCTAACAAAGACGAGAAGAAGAGTGCACTTTGGGATGGTGATAG
TGACGAGTCAGATGATGGAGGGACGATGACACGAACGAAACATAAAGATG
AAAAGACAGTCGTGAGTTTTATTTCATTTTTGTCTTTCAGTATTTTTCGG
TGTATTTTTGGAATTTCTTTTCGTGGATGTAAGGCTAATGAACGATTGAT
AAGTTTATTATCAACAGCCTAGAACTTTGGGACTATTGTTTCACTTTTTC
TTGACCTTTCACTGAATTTCAAAGTTTTTTGTCACTTTAAAAGTGGACAT
TTCTAGATCGAATCTTCAAGGAGAGATTGCCAAGTCAAAGGCGTCAGTGG
TTCGAGCCTTGCTCCTTCCCATGTTCCTTCCCATGTTCCGTTCAGCTCAT
AGAAGGCCGAGCCGGCTGTGAAAACAATCGTAGGACTGTGTAAAAGACCT
AGATTACAGGGCTATCCACGTAAAATATCGCCATTATCTAGTTCGCGGTT
TGCCTTGTCTCTCACTCTTTGATCTGAGTCATATGTACACAATTCTTAGC
TCGGTGATTTACATCTCTGAGTCCATTCCCTATTACAGGATTTCCTTGGT
GATGAAAACGATGAAGATGATGAAGATGAGGATGAAAACAGATTTTCAGT
CAAACCACAATTTCAAGGAGAACACGGCAAAAAGGTTTGCATCTTGTTTC
TCGTGATTTTTTTTGCAGCTTCAGTGCACCCGAAAGTTCGGTGAAACATT
GAGTTAGATCTTTCATGTTCAAGCCAGATGAGAGGGTACATTTTCAAAAG
CTTTCGGAATCGAATTAGGATCATTTTTCAACTTTTAAAGTTTTTATCAA
TCTTATAAACATTTTCGATTTTACGAGATTTTTTCCACTTGACCTTTTGT
CCAACATGTCTTCCATCCCATATTGGGTTTGAATTAGTGGATATTGGTAT
AAAAACTTTCCTTCATTTCCTTCATCAATTATAGCTTTTCAAAATGCAAA
TGCATTATGGTGGTGATGATCGTTTCCGGATGGACGAACGGTTTGCCGAA
GATGACAACGGCGGCGATACTGATTCAGAAGATGAAGGCGANGACGAGTC
AGATGATGGAGGGACGATGACACGAACGAAACATAAAGATGAAAAGACAG
TCGTGAGTTTTATTTCATTTTTGTCTTTCAGTATTTTTCGGTGTATTTTT
GGAATTTCTTTTCGTGGATGTAAGGCTAATGAACGATTGATAAGTTTATT
ATCAGCAGCCTAGAACTTTGGGACTATTGTTTCACTTTTTCTTGACCTTT
CACTGAATTTCAAAGTTTTTTGTCACTTTAAAAGTGGACATTTCTAGATC
GAATCTTCAAGGAGAGATTGCCAAGTCAAAGGCGTCAGTGGTTCGAGCCT
TGCTCCTTCCCATGTTCCTTCCCATGTTCCGTTCAGCTCATAGAAGGCCG
AGCCGGCTGTGAAAACAATCGTAGGACTGTGTAAAAGACCTAGATTACAG
GGCTATCCACGTAAAATATCGCCATTATCTAGTTCGCGGTTTGCCTTGTC
TCTCACTCTTTGATCTGAGTCATATGTACACAATTCTTAGCTCGGTGATT
TACATCTCTGAGTCCATTCCCTATTACAGGATTTCCTTGGTGATGAAAAC
GATGAAGATGATGAAGATGAGGATGAAAACAGATTTTCAGTCAAACCACA
ATTTCAAGGAGAACACGGCAAAAAGGTTTGCATCTTGTTTCTCGTGATTT
TTTTTGCAGCTTCAGTGCACCCGAAAGTTCGGTGAAACATTGAGTTAGAT
CTTTCATGTTCAAGCCAGATGAGAGGGTACATTTTCAAAAGCTTTCGGAA
TCGAATTAGGATCATTTTTCAACTTTTAAAGTTTTTATCAATCTTATAAA
CATTTTCGATTTTACGAGATTTTTTCCACTTGACCTTTTGTCCAACATGT
CTTCCATCCCATATTGGGTTTGAATTAGTGGATATTGGTATAAAAACTTT
CCTTCATTTCCTTCATCAATTATAGCTTTTCAAAATGCAAATGCATTATG
GTGGTGATGATCGTTTCCGGATGGACGAACGGTTTGCCGAAGATGACAAC
GGCGGCGATACTGATTCAGAAGATGAAGGCGAAAAATCAGAAAACAAGAA
GAGAAGTATAGAAAGAGAAGACGAAGAAACGAAAAATTTGAATGCAGAAG
AAGAGAAGGAGCGGAATATGTCTGTACTGGAAAGCATCCTTGGCAAAAGC
TTGAAACACAACAAATCAAAGAAAGAATTGAAAAAAGAATTAATTGCTAC
ATCGTGAGTCGCTTCTCTAATTTTACCATTGGTACCATTTTTATTTCATA
CAAGGCTCCGAGTTTACTGAATTATTGGGCCATTCCATTAAATTCCCATA
CAGGGGGGTGGACGAACCTTTTCAAGTCAAAAAAGATTTTTTGGAAACGC
GTAGATACCCCTTGAAAAATGGAAAGATTTGCAAAATATCCCTTAGAAAA
TTTATTTTCATACCTTAAAGTGACGTTGGACGAACCAAAATTAGTCTTTT
ACCCCTTGGAAATTTTAAGATAATTTTTAACCCCCCCCACAAAAAACTCT
TTCATCCCTAGAAATGTTCCTCCACCCCCTCCCTGTACGGACTTATAATG
GAATGGCCCATTCTATTTTCGTGTTTCTTTATATATTAGTTCTGACACAT
TGAATTAGAGGTGTCTTCATTACTCTTCTTCTTGCAGTTATGTTTTTATT
TACTTGAACTTAAATTTTCGATTCTTATCAAATCCTTCTTTCGAGCAAGA
ATGTAAGCCTGCTTCAACTGAAGACACATGTTGCTTATCTTTAATAATTT
GTTATACTTATAAATGGAAAATATATTATTTAACATGGTCCTTTTTTTCG
GTTTTCAGTGCCAACCCATACCAACGATATGATCCAACAAAATCAGACCA
TACCGAACTCGAAGTTGAAAAGGAAGAGAAACCTTCAAACAGCAAAAAAT
TAAACGAAACATCAGTAGGAGAGAAAGATGTCGAAGAGGATGAAGCGAAC
CCTGTACCCGAAGTCTCCAAAGAACGTTTCTACAAAGTTGAAACTTCACT
GAAATCACTCTTCTCCGGCACTGCTACTGCTGCTGAGAGCGAGGTTAGGC
TTTGAACATTGTAATCTAATAAATTTAATTGACTTTCGCTAATTTGAACT
CAAACATGGAATCTTAAAAAATCGAATTACAGAAAGGTTTGATTTATGGA
AAGTATTTTAAGGTTTATTTCTTGACCCGGGGAATTAGCTTGAACTGTTG
AAGTATTCGAACAAAAGAAATTTCTTACAAAAACCAATCGAAGAAATCCG
TAGCTTGTATGATTCAAATAATTTAGTATGTATGCCAAATTTCTTCAACC
TTTGCTTTTAATTTGTTGTTGTAGCATTGGTATTTAAATCAACCCGCTGT
CTATCGGATTTGAAACTATATCTGACTATTTTCCTTTATTAGACTCTTTC
AGCCATCTCATTTATTGGTATTTCGTCTTATCTTTATCTTATCCTTATCC
TTAGGACAAGCCTGCACCAGCTTTTACATTTTTGTCTGCTGCGCCAACGA
ACGATGACGAGGAAGATGACTCTGGTAAAGTTGTAAATAACACCATGGAT
GTTGACGATGATGATGGAGAAGATGAAGAAACTGTTGATAAAGCCAAACC
CATCAAAGAATTAAGCTGGAAAAAAGGTATCTTTATTTAATGTGATCATT
ATTTTATGATGCATGTCACATTGAATCTTTGTATTCAAGTTGAAAGGTTG
TTTTGATATTTTGCGAATCTGTTCATTTTAGTCCTTGATTGGGAAATTTG
CCCTATTGGAACGATTCCTTGACTTCTTTCTCATTCATGTTAATGTTATA
TTAAGGTTTACGGGAAGATCGTGACAACAGGGACGTCTCTATGGAAAACG
AAAAAGAAGAAGAGTCGGAAGAAAAAACGAAAGAAGGAGAAGGAAAAAGT
TCTTCTGCTGGTGGATTCTTCTTCTTCAAAGAAAATGATGAACGGCTGTT
AAAAGGTATCGGTTTTGGTACTTCTCTCCTATCTTAAACAAATTGAACAG
TGTCGCACTACCAAGGGGGCAAAAGGGGGATCTAATAATGCTTAAAATTA
TTGATATGATACCTCTTTATCACCATACTATTCTGACTAAATTTTCATTT
TCTCAAAATATTTTATCAAATAATTTTCTCAACCGATAGGTGCAAGTTTC
ATGCGCTCAGAAGGATTGGAAGAGATCACAAAACAATGGGAAGATATTCG
ACAAGGACTACGCGAGGTATGATTCAATTTCTTTGACAATCACTTTTTTA
CGATACTGCAGATTTCTTTTTAAAACATCGTGACCTACTTTGAAGAAATA
AATCTTTTGCGGAAAGAGAAAAGGATACACACGTAATGACAGATCTATTT
CTATCCTAGGCACATAATATTCATTGTAATATTAGCTCAATGAAAATTGT
AGTACTCAGGAAACACATCAATCGTGGATGAATGAAATTTCAATTTACAA
AGAAATGGTCCGAAAATATTCTATTCCTTTGTTTAACTGCCTTTTCGTAA
TTGTTTTAAAGTTTTAAAGGAAAGAAAACAGGAGTGGCCTCGGGGGTGTA
TTTCTGATGCTATTTTTCTTTGTATTTAAAATCTTCACTTTGAATACAAT
ATAAGAGTTTGATAAATAGAATGACTGTACAAAACAGAATCCAAAATTTG
TTTCATCTACAATATTAAGTTTTAATGTGCACGTTTCTGGCTATTTTTAT
AGCTTTCAATAAATAAAAATACGCGTCGTCAATATTGTTAACGATCAAAA
CAATCTTCAGCATTAGTGTACATTCATGAGTGTTAAATTGCCTTAATGCC
TGTTAATTAGGTCCAGTCCAATTTTACTCAAATTATACAGATCTATTTTT
GCGAACTTTAATTTACAAAATCGCGAAATTGTCTTTTTAATTCAGATTGC
TCTAATTTTGATCTCATTATACACTTAGCGATATTGATCGAAAATGTTTT
TTTTCGTAATTTGTGAGTTCATTAAATCTACTGAAACGCTAATAAAANTC
TATGGAAAACGAAAAAGAAGAAGAGTCGGAAGAAAAAACGAAAGAAGGAG
AAGGAAAAAGTTCTTCTGCTGGTGGATTCTTCTTCTTCAAAGAAAATGAT
GAACGGCTGTTAAAAGGTATCGGTTTTGGTACTTCTCTCCTATCTTAAAC
AAATTGAACAGTGTCGCACTACCAAGGGGGCAAAAGGGGGATCTAATAAT
GCTTAAAATTATTGATATGATACCTCTTTATCACCATACTATTCTGACTA
AATTTTCATTTTCTCAAAATATTTTATCAAATAATTTTCTCAACCGATAG
GTGCAAGTTTCATGCGCTCAGAAGGATTGGAAGAGATCACAAAACAATGG
GAAGATATTCGACAAGGACTACGCGAGGTATGATTCAATTTCTTTGACAA
TCACTTTTTTACGATACTGCAGATTTCTTTTTAAAACATCGTGACCTACT
TTGAAGAAATAAATCTTTTGCGGAAAGAGAAAAGGATACACACGTAATGA
CAGATCTATTTCTATCCTAGGCACATAATATTCATTGTAATATTAGCTCA
ATGAAAATTGTAGTACTCAGGAAACACATCAATCGTCGATGAATGAAATT
TCAATTTACAAAGAAATGGTCCGAAAATATTCTATTCCTTTGTTTAACTG
CCTTTTCGTAATTGTTTTAAAGTTTTAAAGGAAAGAAAACAGGAGTGGCC
TCGGGGGTGTATTTCTGATGCTATTTTTCTTTGTATTTAAAATCTTCACT
TTGAATACAATATAAGAGTTTGATAAATAGAATGACTGTACAAAACAGAA
TCCAAAATTTGTTTCATCTACAATATTAAGTTTTAATGTGCACGTTTCTG
GCTATTTTTATAGCTTTCAATAAATAAAAATACGCGTCGTCAATATTGTT
AACGATCAAAACAATCTTCAGCATTAGTGTACATTCATGAGTGTTAAATT
GCCTTAATGCCTGTTAATTAGGTCCAGTCCAATTTTACTCAAATTATACA
GATCTATTTTTGCGAACTTTAATTTACAAAATCGCGAAATTGTCTTTTTA
ATTCAGATTGCTCTAATTTTGATCTCATTATACACTTAGCGATATTGATC
GAAAATGTTTTTTTTCGTAATTTGTGAGTTCATTAAATCTACTGAAACGC
TAATAAAACTTGAATCAAAAATGATTAATGANCACAAAATATTTTATAAT
ATATCGACTTTTTTTTCAATTTCTAGGACTTTAGAAAGAAGCACAAAGAT
GCTGTCCGACGCGTCCGAAAAATGAAAGAACGGAAAAGAGTACCTAACAA
CAGGTAGCCAAAATTATTATTTTTTATAAACTTAAACCATATTTTTATCC
CCCAAGAATACTTTATAACTTTTTTTTACTTTTTTATTTTATCGGGTTGA
AAAGATTTTTGGTTTATTTTGATTCGAAAATTGAATCTAACTGTCTCAAA
TTATCTTTAACTACTCTAACATTTCTTGGCATTTGCTGACAAAATCTTCA
TCGTTAAATGCTTTGGGACTATTTGCCTTTTTCAGTGACCGAAATTATAA
TCTCAACAGGGTCTGTGAAAAAAAGTCAAGAAACTTCGTTGGGAAATTTA
TTTTTCGCTTTCGATCAAATTGACAAGTTCGCCTTGAGAAAAAGTCTAGA
AATATTTTCTTGAAAACTTTAATTTTTCAAATTCTTTTAAGTTGGCTATG
GTGGTCTACCATGTACACTAANCCGGTTCCACAATGGAGAATCGGTTAGG
GTAGTGTGGTGCCCAATGAAGTATAAGCCCGAAGGGCTAGAAGTCAATCT
CCTTGGTAGGATTTGAAGCCAACAAATCCTACCAAAGTTGCCCGGCCTTG
AGCGGCTCGCCTGGTTTTCACACAAATGACAGATAGAAACTAAAGTTTAC
CGCTAAATTTCGAAAAAAATATCAATCGTAAACAAAGGAATTGCTAGATT
CAATCTGTCGTCAAAAATGCGGCGCATTTTTTAAGGCTTCACTTTTTCTT
GCCTGAGAAAGGTTAGAGATTGAACTCTAGCCCTTCGGGCTTTAAACTCA
ATGGTGGTGCCCCGACCGTAGTGCAAAGGTAGAGCATTCGGCTACGGTGG
TTAAGTTCATGGGTTCAACCCTCGGCTGGGTCATACCAAAGACTTTGTAC
TTAAAACAAAAATGGTACTTGATGCCTCTCAGTTTGATGCTCANATATTT
CATCTTCCTCGATCTAATTTTAATTGATATAAATCGTCCTGGTTACTGAA
AGTTTAAAACTAATTTTATTTCATTATTATCTTTTTGCAAAGAGCTTGTT
TTTTCCTTTGCTGCACATTTGAGCGTAGGTGCGTGGGATCCAGTTCGTTC
TTTATTACTATCGTCACGTTTTAATTATGAAGCCTATATTATCTCTTTTG
CCATGGTTTGTCTGTCTGGATATTTTCAGTTGCCAATATATCGTTTATCA
TAAAAATGACTTGCAAATATGTTTAGTACCATGTGATTTAAATTTTCTTA
TGTCAACGAGAAAACGTCTCTCTAGTATTCAATACTATTATTCGATGAAA
ACCATATTCCCCTTAAAAATTGTCAACTGCACATGATTTTGATTAGAACC
AATAGAATTGCACGCATTGTTTTTCTTTAGCACACTCAGTCTGAAATATG
ATGTTATTCAATCTTTTTTTAAGCATAAATTTTTATTCTCCAGTGGTGCA
TATCATGAATTCAATCTTTTTTATTTAAAGCATAAATTCTAATTTTAGTG
TTATTTTTATTCGCTATAACCGCTCAGAATTCAGCCGTTGTAAGTACAGT
TCTTACAAAAATATTCTTAGAAATTATTTCAGATATCGGTATTAATGAAA
GGTCGTTTGCAATAACCGGATAGTTGTCGTCACCGATACGGGATACGAGA
AATTTGAAGAACATCAAGTTCATTTGACCAGCCCACTTCTCCTTTTAACT
GCTTTTCATTTCATTCAGGAAATTCTTATCCGTAGACATGTCATGTATTT
GATGAACGAGTTTTTTTGTCTTCTTCTTTTTCTTTCAATACTGGTACATG
GAACATGGTAGTTGCTATGGAGCGTTCCCATGTCAATTGGCTAATTTGTC
GATCTTCTAGGTCAAGCCACCATATCGTAACCATTAATTGTTTGGTTAGG
ATCTGGTTTATCGAGATACAGTTGACGCTCTCTAATTCGACGTTCTACTA
TTTGATACGCTCCATTATTCGATAATTCTGAAAGTCACCGTTAACAAGTA
ACTCTCATAAATGACANATTCAATCTTTTTTTAAGCATAAATTTTTATTC
TCCAGTGGTGCATATCATGAATTCAATCTTTTTTATTTAAAGCATAAATT
CTAATTTTAGTGTTATTTTTATTCGCTATAACCGCTCAGAATTCAGCCGT
TGTAAGTACAGTTCTTACAAAAATATTCTTAGAAATTATTTCAGATATCG
GTATTAATGAAAGGTCGTTTGCAATAACCGGATAGTTGTCGTCACCGATA
CGGGATACGAGAAATTTGAAGAACATCAAGTTCATTTGACCAGCCCACTT
CTCCTTTTAACTGCTTTTCATTTCATTCAGGAAATTCTTATCCGTAGACA
TGTCATGTATTTGATGAACGAGTTTTTTTGTCTTCTTCTTTTTCTTTCAA
TACTGGTACATGGAACATGGTAGTTGCTATGGAGCGTTCCCATGTCAATT
GGCTAATTTGTCGATCTTCTAGGTCAAGCCACCATATCGTAACCATTAAT
TGTTTGGTTAGGATCTGGTTTATCGAGATACAGTTGACGCTCTCTAATTC
GACGTTATACTATTTGATACGCTCCATTATTCGATAATTCTGAAAGTCAC
CGTTAACAAGTAACTCTCATAAATGACGCTCTACTATTCGATACGCTCCC
TTATTCGATGAAAATCCGATTCCCCTTGAAAATCGAATTGGAGAGCATTG
ATAGATTGTCATTTTTTATGAAATTTTTCTTGCGTTCAAGATTTCCAGGC
TGTCCGTTCAACTGTTTCGAATCTCTTTAAATACCCATCACTCAAAAAGG
CAGACCGTCTCCACGATTATGCTATAGGCTAAGTCAAAATTATTTTTTGT
GTGTTATTTATTTTGGAGTAGCTGTTGTCGTTTAATTCATCACTCCGATG
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TGTAAATTCACAAGCACCCCATGGTCTGTCCAAAATGGCTGCCCTTTTCG
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GATGGGTAATCTTAAGGCTCTTGTTTTTTAACAATATGTAGTTCCATTGC
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CTTCCCTTCCAGAGAAAGGCGGAAAGTTTGTTTTGGCTAATATAAATCAT
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CATGGCCAGTCCACCAGTTTTAATTGATGACTCTTACATTAGCCATAATG
TAAATATTTTGATGATTGGGGCTTAGCGGGTTGACGATTTTTCTTCTTTC
TTCGGGCACATTATTGAGCAGATTAGTCTCAGATTATAAGAGAAACAATC
TACATTTGTGCGTCATATTACTATTTAGTTCAGACTCATCATCAACAAAA
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TCTTTCCCATCCCCAATGAATTTCCTGACTTGAAAACAAAATGATTTAAA
TCACCGGCCATAAAAAAATATGTGACTATCAATCCCCATCGAGTTTCAGA
CCGTTATTATTACCCCCACTGGCTGAAATAATTCTACCAGGTCTTTGAGA
AGGGGTTGTCAATATAAAAAACAAGCTTTCAATATTCCCCTGAAAGGGTC
TATCCTTACACAAACCTTGCAATGGGCTTTGAATATAGGGGGTGGAGGAT
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GGTTTTACCCCCCGGACAAGCATCGGTTGACCCCCCGGACAACCCAAAGT
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CCACCCCTTCCCCATGTACGGACATTTTCTGAAAGAGCCCAATTGCATCC
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GCAATAATTACCTGTTATGCAAGTATAATGTTTCGGTGTTAACCACCTTC
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TCAGTCCCACCTTTAAAACAAAAAAATAATAAAAAATTCCAAAATCACTA
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ATTTCGATTGGCCCCTACCAACCCACACGTCTAGACTGAATCAGTTGGAG
ACTTGTTTTTAATAAAATATCGCGCACAGTGGAAAATTANACTCCTCTTT
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TTTTTAGGTTTAAGCCTAAAATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTGGTGTC
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AATCACATGATTTTTTAGTTCACCAGGGGGGAATTCACCGGGTGGGAATT
TTCCGGGGGGGGGGATTCACCAGGGGGAATTGTCCGGGAATCATAAAAAC
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TGTAATTTTTTAAACACCAATAGCACTCGCCAAGAGGTGTTCATTCATAC
CTTTTTGAAAGCATATTAGGGTGTAGAATAGGAAAAGTGCTGTTCAATAA
TTGTTTTGCTTGCCTAAATAAAGATATATGAATAAATATTGCAAAAAATG
TAAAAATGCTGACGTCAGCAAAACTTATTTTTTGAATAACTTTTGATTGG
CTTAACTTTAGATGCTGATATTTTGCAGAATGCAAAATCCTTAGAATGCC
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ACTCCGCGCCGGCACGTATTCACTCTAAAGGTTCCGTAGTGAGAAAATCT
GCCTAGGTTGGCGCACCGCTTTTGATCTTTTTCATCCAGTTTTGGGATGG
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AAAATAATTGCCACGAAATCAAACGCCAATAATAAACATAAACATTGGAA
ACTAGCCACTTTTGCTTTCGTTTTCAAAAAAAAGCAACCCGGTTTTGAAT
GTTTTGGCTGAACAACCCAGTCAGATTATCACATCATCCCTTCAGAGCAG
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_043838	XLOC_043838	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00070386 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NOL8 (Nucleolar protein 8 OS=Homo sapiens GN=NOL8 PE=1 SV=1)

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Query:   77 RVFVGGLAPEVKEEELRDRFKSFGTTSDVCLFQKKTSDGVISKTFGYVNLTTTEQQLRKCFAIFGGTKWKGHSLKVQLAKDDFMKRLQKEWENPEPVKISKSRKRKQIDPIRSYEEYIAKSKSTKKAIPGIPLEGEKNWVIGKFGRPLPIVHINGKGSGRKFLKHDPSKHCHCIRRIATD----VPEDRIDGLTWELD 658
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Sbjct:    9 RLYVGGLSQDISEADLQNQFSRFGEVSDVEIITRKDDQGNPQKVFAYINISVAEADLKKCMSVLNKTKWKGGTLQIQLAKESFLHRLAQERE------AAKAKKEESTTGNANLLEKTGGVDFHMKAVPGTEVPGHKNWVVSKFGRVLPVLHLKNQHK-RKIIKYDPSKYCHNLKKIGEDFSNTIP---ISSLTWELE 196

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00070386 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00070386 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
NOL8	3.284e-36	37.88	Nucleolar protein 8 OS=Homo sapiens GN=NOL8 PE=1 S...	[more]

You are here

TCONS_00070386 (transcript) - C. hemisphaerica