TCONS_00067548 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00067548
Unique NameTCONS_00067548
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length618

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_471:112558..133139+

Legend: exon
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>TCONS_00067548 ID=TCONS_00067548|Name=TCONS_00067548|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20582bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_471:112558..133139+ (Clytia hemisphaerica)
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TATGATTTCAGAGGATGATGGTCCGGTCAAGCAAGTTTAGCAGTAAAATT GATTTCACGGGGCTGCTCTAAATGAAATCTATATAAATACATTCTATCTG ATTATTTTCCTACTGTAATAATATACACTTCATTCATCTTTCGTTGGCGC CCGATGAGAGGGCATACAAAGCTACCGCCCTCTAAAGACAATTCCTTTGA ATCacacattttggaaaaaagtttcgaTTAAAGGCTACACAAATTTTCTC ACTTTTATAAACAAGTTTAATCATTTAACCAAAATTTAAAACTAAGGATG TAAAGTTTAGAGTAAAGTAGTCCATACTTTGTATCTGTAGTTTTGACAAG TgtaattaaagaaaaaaaataattcgtaAAAGTGAGAAAATATAATAATC CTTTAAattaagttttaaattttttgagaattacacattaaagattgaaa aattctttcagcCTTTGAGTCATGGTCTGTAGTTTATGTCTAGACAAAAA CGAATTTAaagaaagaacattttaaatatttaagcGACTATGTTCTAGCT GAGAAAGACCTTAAAAGATAGGGAACATTAAAAGAAGTAAAATTTCAACT TAGAAGCTATTACGAAATAAttaggaaaattttattttcgacTTGAAATT GAATTCCTTTTTAAGtgatataatttttataaaatgatGAAGACGCCTTC TAGTATTAAACTTTCAAGCAGTTTTGTCTCAAGGAGGAGAAATATATTTG TTCTTATAGTTGAGAGCAATAAAGGAAAGAGTCTTATTAAATAGTCTTTG ATACTTTATTTTTTGGTCAACAATTTTTAAGAAGAACGTAGTGCGTGCTC TTTACACTATTTTTGCCACGTCAAGTAGTGGACAAACGGTGGTTGACAAT ACTATACAATTCTAACGCCCTAGGTCTAAGTCTAATAATGTCTCTAGTTC 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ATTCACCGTGCaaagtcattaaaatgttcAGATGACGGATAGTAACCAAC CAATAACCATATTGACCATTTAGTTGGACTTGATGTTTTGTTTGTCTTCT TTAAGGTGCTGATAAAATGCCTGCATATAGACCATTTTATGTCGTCAACG TAATAAAACGAATTCATCTTTTTTAGGGTGTATTGTGGAATAACAAAAAC ATGTGGTGATAATGCATTGCGAATTTGGACATCATTTTTCGATCAAATCT CCCATGAGCCTTTGCGCAGCATAAGTGGTTGTTGTTGGTGAGTGTGAACC ATTCTTTCTCTTCCATTATAATAAGTgcaatataacatttttttaaacac tacttctttttttaataatttctttttaaaaccaTAGCCTCGCTTtcaaa tatttcactcgtttcCATCAGCCAATCATCTTCCACGTCTCTCGAAGAAC TCGTCTGGTTCGTCGTGTATTTCCTTGCATTTATACTTGTAACGTGTTTT CTTTCTCATCTTTTGTTTGGACCAAGTTTTCATCTTTTTGGACCAGTTTT TCCGTTCAACTTTGGTGCAGGTCAAACCAATGCCACATGAACATTTATTT CGCACAATACTGCCTGTTTTCAATTCCAAGAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_042188XLOC_042188Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1491911889:112558..112612TCONS_00067548-exon-scaffold_471-1491911889:112558..112612Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_471supercontigscaffold_471:112558..133139 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.737911 1.18541 0.375053 1.0858 0.571213 0.255701 0.787885 0.307784 0.505705 0.605129 0 0.411425 3.26245 2.32482 0.173102 0.37001 21.0376 16.4632 6.04734 6.45088 54.6472 47.5207 25.6341 47.2736 32.1633 27.0339 0.95612 1.16054 1.8643 1.14522
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00067548 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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