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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00063878 ID=TCONS_00063878|Name=TCONS_00063878|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1166bp
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GCTGACAAAATTACGC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_404:257547..269647+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00063878 ID=TCONS_00063878|Name=TCONS_00063878|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12101bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_404:257547..269647+ (Clytia hemisphaerica)
CAACAATTTTGAATCTAAGAAGGCTGGGTACGAACTTGTCGTCACAATTA
GTGGCCGCCATTTTGACGAAAACATTCTGCGAGTCaaccaaggaaaattt
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AACAACACTGCACAGCACAATGtaaaatagtttattttaaccttttttta
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AGTCTTGTGAATTTTGTCGTGTTGTTGGATGCTTGAGATTTCAAATTATC
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ACCCCTTCCGTGAACGAAAAGGTGGATGTAACGTTCTGTAAAGTCGtcgt
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AGACCTTTTGTCATTTATATATCTTGTACCTAAGTTGGAGTAAGAACTTT
AACTTTTGTAGTGCCAATAATATTTTCAGTCTTTTTTTGGAGGAAAGAAT
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tttACTCGCCTTTTAACAGTAGCTTGCCTCAAAATAAGGAGTTCTACTTA
AAAACCGGCATTATTAACCGTTTCGGGAAGTAAGAGCTGACAAAATTACG
C
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1491911889:257547..257843 | TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1491911889:257547..257843 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1510915933:257547..257843 | TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1510915933:257547..257843 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1575043694:257547..257843 | TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1575043694:257547..257843 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1491911889:268779..269647 | TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1491911889:268779..269647 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1510915933:268779..269647 | TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1510915933:268779..269647 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1575043694:268779..269647 | TCONS_00063878-exon-scaffold_404-1575043694:268779..269647 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_404 | supercontig | scaffold_404:257547..269647 + |
Blast
BLAST of TCONS_00063878 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: GBG4 (Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-4 OS=Homo sapiens GN=GNG4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 75.8702 bits (185), Expect = 7.495e-17 Identity = 33/66 (50.00%), Postives = 45/66 (68.18%), Query Frame = 2
Query: 206 SVQVDQMRKTNEQLKRELNIKRAKFSDSAKELITYCESNQRNDPLIVKIPASENPFRERKGGCNVL 403
+ + Q RK EQLK E + R K S +A +L+ YCE++ R DPLI+ +PASENPFRE+K C +L
Sbjct: 10 TTSISQARKAVEQLKMEACMDRVKVSQAAADLLAYCEAHVREDPLIIPVPASENPFREKKFFCTIL 75
The following BLAST results are available for this feature:
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