Blg01944.14 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01944.14
Unique NameBlg01944.14
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000487:60353..72119+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01944.14 ID=Blg01944.14|Name=Blg01944.14|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=11767bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:60353..72119+ (Branchiostoma lanceolatum)
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TCCCTATAGCGCTAATAATATTTTGCCAACCATATGTACCTATCCCTCCA TGTATATGTGCGGGGTTAGTGTATGCTGCAAGCATGCAAACAAATACTCT CCGCCACCAAAATAGTCCCCCAATACATTCGATATCAGTTATCAATAGAA AATGACTTTTATTTCTGAATGAATGTTCATGATTTTCACTCAATACCCGT CAGCGCTTGCCATATTTGTGACCCTACGATATATTCAATTTAATAACAAC GCCACCCTTTCTAATATCCTAGCCTTCCTCCGTCCAGTTTTGCCCAACTC ATTTCTATTAATGGCGGGATATTTTCTACATATTCATGTATCCAGTCTGT AGGTGTTGTTGTTTCTAGTTCCACCATCGTGGTTCCGAGGTTTGTAGCAG AAACCCTTGGCCTCCCGCCTAGTCAGACCATAGTTTGCCTCCGTCGGCTG AAACCTTCACTCGCCCCGCCGGCGAGCCGGTCTGCCCACTCCTGTCACGT AGTCCGCAAATCCCCCGATCACGCATTCACCTGTAACAGCCGTGGACAGA GCCCCACCGCTACGTGCCGCCCTATAATTGTGGTAAGACTCTTGTATACT TCTGTGTTCTTTCCCCAGTCGGCACCTGGCGCCATTATTTAATACAAAAG CCGAGCTACTTGTTCCCCTTCCTCTGCGATTGTCTGAACTAGCTAGCTTG TTAACAAATAGGATATTGTCGCGACCAATATTTGGAGACAGGTATGTTTC GTACGTTTCCTTTTGACAAGGCCGGCTAATCTTTCAACATGTACTATCTC TTAGATATTTCTTCACTCACACACACGGCCTAGTGTCTGTAAAAATTCGT GCACACTGTGTGCCTATAGAGTCCTGAAAACCTTAGCAAATACGTGCACA TATGTTTTAGGTCGGGCCTGCGGTCAGAACATGGTTCTGTTTCAAACATG TCTTTATTACATTCGGATATGCATGATCATATACTGTACTGATTGTAATA ACAGGAACACTTCTTTATTCTGGGACTTTCACTGCATTTAATTCTGTCCC AGTGACACTTCCAGATAATATATCTAGCCATAGCTAACAGTTTTAGACAT ATACAACAAGACGTCATTATATTGCTTTCCCCACTTGCCGACCCAGCTTC TACCAAGGCGTGGATAATATATAACAGTGCCTCAGCGGACAGCGTAGGCG GGATAGTTAGGGCATGTATGAGCGTGCTTTCTATTCACCTAACATGTCCA TCATACGTACACCATGTCTAAATCTGTATCCCCAATACTCCTGTGCCAAA TGCACTCAGGCACCATTACCTTTTGTTGTACATTTCAACTAGGGTCATTC TCAGTGTCTTGACACAACTCAGAGTTGCCTTTTAGTAATGTTTGACATGC TCTGCAGCATGTAGGCCCCCAGTCTAGGGTGTTTGTACATTCTTTTCATA GACCATTTGATATACAGCCTTGCTGATACAAAATACAAAATGTACTGTTT AACTAACATAACCGTAATAAGTGTATATTTTGTATAAGATAACACTTAGG TAAAGTATGTACGTATGTACCCCCCTTCCCCTCTGTTGTTAGGTAGTGCC CGTAATACCTTAAATGCCCTTCCGTATTTTGTATGTGCTATGTCCTCTCG CACTCAAGCTAATTACATTTGTCACATGGATCCTTTTAAAGGCTACTCCC TTAAGCGTTTCCACAATCGGTTCCACCATCTACAATCTATAGTGACATGA TAAAATCAACGTGTCACACAAGGAAATATACAGGGCGATCTCTTTCTGCA ATGTATTACATATGACATGAGTTTGACAAAAAATCAGGTCCCAAACAGTT AATGTATTGAGTACCCATGCCCTTTCAAAACATGGCATTTTGTAGCATGT ATACATATATATTGTATGAATTGTCATGAATTCAAACTGAGCCTGCTATA TAACATATTAGATACACACTTGCAGGTCTACCGTGTTAATAAAAATTTTC TCAGATGCAACACTGACGTCTGTGTAAGACATACTTTCCTTCAGATATGA CTATATCCAGACTGTATAATGGTCTTGTATCAGCTATCTCAGCCGGTACA AAAGTGTTTTATTCTGCAAGGTTGTTTCAGCCTTTCACGACTCAGTAGCG CTGAAAATCAATACGAGTGGGAGGGCTGAGTGCTCGGGGCCCCCTTTCAA GGGGATAAACTTTGGACTCTGACAGATACTGTTTTCAACTTGTAGGCTTG TAATGAAAATTTTGAGGCCACAATTTTGTCCTGGATGCTAGACCGACAGG CTAATAGTGAAGAACGTTATGATTTTGGTGCCTAAAAGATGAAAATATTT CTGTGCATTTCGTCCCTAAAGAGTGCCCTATGTCCTTGGTCTTGTGTTAG AACCAGAGTTGGTGTTTGTTTTCAATCTGTTCTATAACACAAGCCAGCTG TGCAGTGAGTCGCTCTTGGGTCTTGCTTCGTCCATATCCAGACGGACAAG GTCTTTTTCGACGCCACATCCTTATTCATGGACAAAATAACTTAAAAGGC AGTGCGTGTTTGTACGCCCTACGCAATCCGCCATGCAACGTTGGGGCAAT TTTGTCACCTATAGCGTGCATCTAGCTCGTTGAAAGCCTTGCCTTATCCG TAAGCCCGCCACTTATGCATAACCCAGAGAGGGGCCCCACGATATCCGAC ACGGAGTAGATTGAATCCTGGCATTTTGTTTAGGCTTCTCCCAGCCCTTT GGGGTGACCATGGTACCTGATATTGATACAGGCCAGGCTTCGTCTGCCTT TCAAGCAGTAAATGCTCCTGTTGGTAAGGATAATAAAGGAAGCAGTGACA 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AGAGGAACCACGCGGCGTCAGTGGTACGAATGCTTCTGTGACATTGTAAA ATGGCAGCCAGTCGTTAATCAATCAATGCGTCTGAAAAGAAGGCATTGAG CACCATTAATTGAGGCGTATAGTCTTTCGCGTCATCGGCCAGCTTTACCA TTGACCAGTGATGACCTTTGACCTCATTAGCATATGTCAACAACGCCAGG TAGTCACAGTAGCCCCCCAGGATTCAAAATCCTGACAAGACTAATTACCA TGACCGCGCAAGGAGGGACTTTCCATCGCATGATCGTGAGATGACCTCTG TCCTTGGTGCTGATTGGTTGTTAGTGCATAACCTCCGGCCGTATGACCAT GTATGGTGGTGAAAGCGCCCACCTACTCGACCCTTGTCAAGGCTGGATTG AAGAGATTCCGTGTCAAGGATAATGTTTACAGTACCGTTCATGCCCTTTG ATGGTTGCCATACAGGGGAACTCAAGCGGTGGTGGTAAGACGAGCCGAGA GTTGGGGTGAGTTTGGGGTCTGTGTCGATTGAAGTTTTCGGTGTGTAGTC TAGGCTTGCTGGACTGATATACTGACTTATAAACATAGGCGAGGACTTCT TCTAACGCCAAGGCATTTCACGTATGTTGTAGTTATTTCAACACAGCTAA GGCTTCTATTATATTTTGTGTCTCTTTTAGATTATTGACCAGAAGAACAA TATTGTGTTTAATGTGTCGTTATCGCCCCCCCCCCCTACAAGGGGTGCTG AATACAAAAGACACAGTGGCACTGGTTACGTCTGAAAGCTAAGAAAAGAA AAAGTCGTCTTCAGGTATACCTTGCCTTAAAAGCTAAAAGCTTTCGTGTC TTAAAAATTGAACATTTTTCTTGTTGTTCGCGATACATTAATTGTAGTAG GTTGGACGTAAAAATCGTACTGTACTGACCAGGTATAGTCTTTATTCAGG 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ATATAAGGCCCGACGACTGTGTTCCTGTTTTAGACAGGCATTGGTTCCTC TTCTCCAGACAGAAATAATCGTTACGTAGTCTGCTTCCCCCTTTCGTGTT TCAAGTTCCTCTTTGTGTAAACATATCGTAGCGGTTTTAGTCCATCTGAA TTTACTCGAGTGAAGGTCTGCTCAGCGCAGTGTAATAGGTAATTTTACTG TAATTCTAAGGTATTTACATACTATTGATTCGTCAATAGCTCAACGTACC TTCTGGTTTTTTTTCAACCATCAGTCGACTGTTACGCTCATCAGCTTTCT GTTTGCTGCTTAAAATGTTCTTTCAAGACTTAGTCCTACGTTTCTAATGG TCAGGAACATTATTGTTGCCACAGATTGAAGCCACTGTTCCACGATGATT GGACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGACCGATGA TGACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCCAGCTGG CCCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAAAGGAGG CCACGGAAGAAAGGTAACACACCCTTTCCATGAGAAACTGCGACCGTTGA ACGACCGCTGAGCGACCACTGGGTGACTAACAAAGTGACTCAAATAATTT CATAAACAAATAACAAATCTTTTTTTACGTATATGTTTTGCTGTCTTTTA AATCGTACTTTGATATCTTGCATCACATTCCTCTTATAAAATCAAGGGTT ATACCAAGCTTATTTCGGTCGGCCAACGGTTTGTCGCCTCGATATGAATG TTAATTTAGTGTAGTATTAACATTGTTCTGTTTGCCAGTTTGGGGCCATA CGGCAACATTCGTATGTGCAGTCTGAAGTGCCTCATGTAAGCAGATGGTG TATGCCTTTTCGTATGACATCATATCTGACACGACAGTGCTGTGTTTGGG CAGTAGCGAGTACTAGTGCTGAACTATTGTTTAATTACAGTGCTAATTAT GTTTTCATTAAATCTCAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAAA GGCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAGA TTCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAACATTAGAAACATATGGCAC TGTAAATATTTGTCAAATTATGTATTTTGATACTTTTATACAACCAAGTA TACTGTATATTCAGCTATTCTAATGAGGAAACTTTACTAAAATATGGAAG AGTTGATGTTATCTTCACTGCAGTTTGAATCGATTCACCATTGCAATATT AATGTGTCTAAAACAAC

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000487:60353..72119+

>Blg01944.14 ID=Blg01944.14|Name=Blg01944.14|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=282bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000487:60353..72119+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGATTGGACCCGACCAGTCCACAGCCCCAGACCTGGAGCGAAGCCAGAC
CGATGATGACCGGCGTCAGGAGGAGTTAGACAGCAGGGAGCGAGAGTTCC
AGCTGGCCCTGGCCTGTCTACTCACCTCTCCCGTCATGAACGAAGTGGAA
AGGAGGCCACGGAAGAAAGATCGTGTGAAACGACTCAAGAGAAAAAGGAA
AGGCAAGAAGAAGAAGAAAAACCTTGCTCAGCAACCCAGAGAGACGGAAG
ATTCTAGCAGTACAGCAAGAACAAGCAGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.14Blg01944.14-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01944.14-exon-Sc0000487-1570713199:60353..60586Blg01944.14-exon-Sc0000487-1570713199:60353..60586Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.14-exon-Sc0000487-1570713199:60673..63120Blg01944.14-exon-Sc0000487-1570713199:60673..63120Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.14-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Blg01944.14-exon-Sc0000487-1570713199:71177..71365Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01944.14-exon-Sc0000487-1570713199:71821..72119Blg01944.14-exon-Sc0000487-1570713199:71821..72119Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000487genomeSc0000487:60353..72119 +
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01944