Blg01865.3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01865.3
Unique NameBlg01865.3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000228:161447..178133-

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01865.3 ID=Blg01865.3|Name=Blg01865.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=16687bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000228:161447..178133- (Branchiostoma lanceolatum)
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TCCATTATTTTAATGTTAACAGGGATAGAACCCATACATGTATCAAACGT ATTTATGTTATTATTTCTCCTTGTCCCTAACATCGGGGATCAAATATTCT AGTGATGATGGTCTCAAAATAACCCATGTGTATACTGTATAATGATCACA TCTATAAGAACAGTAACTATCCAGCTTGCACAGCACTAAAGCAACAGGAA CTGGTTTATGTACTGTTTGTTGGAAATTCTTTTATTCATGTACATGTGCA ATAGCCATGTAACTTATACTTAGGAAACTTGCTGGTATGCATTGTGAATA TGAAGGTATGTACTGATGATGCATGTAAAATATTGTAACATTTTAACAAA TGTAAAAAAATCAGTCATCTTGCAGATTTGAACCATGGATCTGCTTCGGT TGAAGTCCTAATGCAATGGGCCACACCAATTTAAATATTTCCTTGGTTCT CAAATTTTAAGGTGAAAGTTTGGCAAGAGAACATCATGAAAACAGAGGAC AGGAAGGATTGTACCAAGAAATAGAATGATAAACAATGAACGGTCCTCAG GCTTTGTTTTTTCTAAAATCGGAGAACCAATGAATTGAATATTGGTGTGG CCTTATTCAAGTTATTGTACCTACATGTAAGTATTGACGTGATGTTTTCA GTTGCTGATGCCTGTTCTTGCCCCCTCCTGTGTTGCAGGTGGCATCCTGT TGTACCTTATAGATCACAAAGAGGTGATCAGAGACCTGCAGTTCGCTCCT GATGGCAGCATGTTCCTGGCATCCGCATCCCGAGACAAAACCCTCAAGGT ACATGTACAGGCGGGCGCTACCCAGGGTGTCAGTCCTTACCTCTGCATGT GGCTGTTCCATCTTCCAGGACCACCCAGCTCCAAATTTAACTCTTTTCTT TTTCTTTTTTTTGCAAGTTGCAGTTGAACAATTCAGTGCAGCTTGGCAGG 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TAGGCCATCACAGGTTGCATGTATGTCATTCTTGTGTATAAACGTTTTCA CAGATTAAACTGTGCATGCACAACTAGATGCACTGTGGGTGATATGTAAA AGTTGAAGACCCCTGAGACATAAAAAAACATGTCTGGACATATATTTAGC ATGGTCTAGACAAGAACTGTTAAAAGTTTGGGGCCTTCACCTTTGACATA TTACCCCCAGTGCTGCACATGCGCAATGGAAATCAAGAATAGGCTTCTCG ATAAGATTCAAATGATAAAATATGATACTTTTGTGTAAGATTTGAGTTTT TCAATGTATGATTTTTCATAGAATTCCACTTGCAGATATGACAGTCCTCT AGTGTAATTTCTAGACATTCTGTTTTGTGCAATTTTGCTTGATGATAGTT TTGTTGTAAATACATTTTTTTGGTTCACCATTTTCCTATCTCATAAATTT GATTGTTGCCAGTTCCCATGTATAACCAGTATGTTAACATCCTCCAATGT ATATGTCCATGTATGTTCTGTAATGTTCATTACCATTGAAGTTAACCATT AATCATTACAAACACATATGAATATTTGATGATAATGTCAACAGGCATAT GTACCCCCCTCCCTCATTTCTCATGATGGGCGGAGCCAATGACTACTGGC TGCGAGCACTGAGCTTTTCCCATGACGGGTGCCATGTGGGCACTCTATGT GACGACAAGTAAGCCCATCTTATAGTAATTCAAGATTGCATGTGTGTCAA AGTGTGCAGTTCCTTTCTGGTCCTCACAAACATAGTCATTTTTAGTAGCT ATCTATGCTGAACAAAAGATATGTGATGCCCCCCATTTGTTGAAAGTATG ACATTTCCGGCACCCTATTTTTAGCTATTTTATTGATTGCAGTCCCCACA ACACTAGGCCATAACAATCAAAGATAAAAACACCTTAAAAGCCCAGATGC CTTCTTTTCTTCCAAACCCATCTTCTTTTGATTGATACATTTGTACATTG CAATAAGGTTGGAAGAAAAAAAGGCTTAGAATATTATACAATGGCCCAGA GGACCACAAAAGGAACTGCAGACTTGTAGTATAAGGAATCTTAAGGTGTC TGAGAAAGTCACGGTTGGTGGTGTTTTTCCAGGCACCTCTTCCCTCCCCC TTCATGCATTTTCTCTGGTGGCTCTAACGACTTCTGGGTGCGACACATCT CCTTCTCGCATGACGGCTGCCATATTGCCACTCTGTGCGACGACAAGTAA GAGCACAGAGCTGCACTACGCTTCACTTCGGTCACTTCAATTCTGTGTAC AAATTTCTCTCGCCGACATGTTCAGTTTATTTATTTGAAGAAACATCAGT GTTTCCTCTGCCATTGGTATTATTTGGTGGCACACTCTGCAGAATGATTG GACCACCAAATTTGTTTTCATACTAAATTATAGCTCCTTGTCTGACTTGA AAAAAGGCAAAAAGTCCCAAACTCTAGAAACAAGGTTTGGGGTTACCCAT CCACTACATGTAGATCTCAGTGCCACAAAAGAAAGAGATACAGGGAAAAC ACTGAATTTTGATTTCTGAATTGTACTTATCCTGTTGCAAAGCTTAGAGC ATGGCTACTGTGTCTTCCCTTTCTCAAAGAGCCAGCAATTGAGACTGCAA TTGAATGGCTATGATTTGTTAGTATTTGTAGAATTTCATTGCATCAATCA ACAGTTGTTTTATGTTTATGCCTTTGTGCAAGTTGTTTTACTCATAGCTT ACAAGTTTGCCTAACTATTTTGTGATTGTTCAACTGGTTGACTAAAAACC TTTGTCCTTTCTTGTTATTTGAACTTTACAGTTGAAAAAAAATAGAATTG TAGAAAAACGTAACAATTCTAATAATTACTGCAAAAAAAAACTGTGTACA 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TGAAGAGCTGACTATAGCCATGTCTAACAACTCTCCAGTTTTATCCTTTC ACTTGTGGCTAGGGGCATCAGCCGTAACACTTGTACCAAGGATATATTTT GCTTTGGTTATGTTTCTTACTTTGTTTATAGGTTATATATATGTATATTC TGTACGGCATTGCTTTAGTGTATCTTGTCCAAAATTATTTGTGCTGCAAG TTATGCTACAATAAAGCCGCATAAAAAGTACCATTGGCATTGTCATGTTT TTGTCAAATTATTTCATTGTATCATCAGCTACATATTTCTTACTGTTCAG TTAGTAAGACTAAGAGTTAACATTTCTTACTGTTCAGGTGGTAAGACTTA ACAAGAGTTAACCATTTCAATCACTTTATCACAACAGTGAATTCGGACAG ATTCAACCAAATCAGCATTCTCAAGTCATCATAATATATATTCAGATATG TAGATAGCTTACATGAACATCACAATAATAACTAAAGTATATAGATTATG TAGATAGTTTACATCCCAACAATAAGTAAAAAACGAT

Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000228:161447..178133-

>Blg01865.3 ID=Blg01865.3|Name=Blg01865.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1419bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000228:161447..178133- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGAGTTATACTATGAATTCGTCAGAAACTGTGTTTCAAGTAATGCGGA
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TCCACATGAGGATTATTACAAACAAGCGGACGCAGAAATACTCTACCAGC
TGAAACCAGGCGGAAACCCCAACGACCAAAAAGCCGGAGCGGAGACATGG
TGCAGTGCGTTCGCTCCCGATAACTCGTACTTTGCCTGGTCGTGTGGTCA
CAGGCTGGTGAGACTGGTCCCATGGAAACACAAGATAAACAATAATGAGA
TTGAAGACGATGAGGGTAGACAACAAGGAGAACCGACATTGCCAACGCCG
AAGGAAAAGGTGATAGACTGTGGAGAATATGTGTGGGCCGTAGCGTTCGG
CTCGTCCGTGTCTTCCAAATGTCACCGCACCGTCAACATCAGCTTCCACC
GCTTCAACTTCGGCAAAGACCTCATTCTGGCTACGGGGCTGCAGAGTGGA
CGAATCAAAACATGGGACGTTTCAACAGGTGGCATCCTGTTGTACCTTAT
AGATCACAAAGAGGTGATCAGAGACCTGCAGTTCGCTCCTGATGGCAGCA
TGTTCCTGGCATCCGCATCCCGAGACAAAACCCTCAAGGTTTGGGATTTG
AACGACGACGGCAACATGAAGAAGACCCTGAAGGGTCACAACGGCTGGGT
GTACAGCTGCTCGTGGTCTCCTGATGCGAAGATTCTCGCTTCAGTTGGGC
AGAATAAAACAGTCATCCTTTGGGACATGTCGGACTATTCCATGATGAGG
AAACTGACGGGGCATCAGAATGACGTGGTGGCCTGTGACTTTTCTCCTGA
TGGTGCCCTCCTGGCGACGGGCTCCTATGACACGAGGGTTATCTTGTGGG
ACCCCTACACAGGCCAGAAGATCAGAACATTTGGGCATATGTACCCCCCT
CCCTCATTTCTCATGATGGGCGGAGCCAATGACTACTGGCTGCGAGCACT
GAGCTTTTCCCATGACGGGTGCCATGTGGGCACTCTATGTGACGACAAGT
ATGTGAGATTCTGGTCCATCTATAATGAGGAGGTTCCTGTGAAGAAGGCC
CAGTTAGTGAATGCCTTATGTTGTAACTACTCACCTGATGGCTGCTGCTT
GGCTACAGGTACCCGGGATGGCAATGTGGTGTTCTACATGGCTCCCATGA
GAGTACAGAAGCTGCAGCACCTGTGTCGCCTGTCCGTGCGCCGTGTCCTC
CCCTCCACCAAGGTCGATGCCTTGCCTATCCCACAGAAGCTCATGGGCTA
CCTCAAGTACGAGAACTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01865.3Blg01865.3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01865.3-exon-Sc0000228-1570713199:177856..178133Blg01865.3-exon-Sc0000228-1570713199:177856..178133Branchiostoma lanceolatumexon
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Blg01865.3-exon-Sc0000228-1570713199:166549..166659Blg01865.3-exon-Sc0000228-1570713199:166549..166659Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.3-exon-Sc0000228-1570713199:163873..166024Blg01865.3-exon-Sc0000228-1570713199:163873..166024Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01865.3-exon-Sc0000228-1570713199:161447..163816Blg01865.3-exon-Sc0000228-1570713199:161447..163816Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000228genomeSc0000228:161447..178133 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01865