TCONS_00054608 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00054608
Unique Name	TCONS_00054608
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2963

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_243:274507..286915-

transcript sequence

>TCONS_00054608 ID=TCONS_00054608|Name=TCONS_00054608|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2963bp
TAACACTCAAACACAATCAATACGATCGTCATTTTAATGACGTCTTGCAT
GACGACGATTTTGTCATTTAGTTTAATTGTGTTTAGATGAatcattttat
taaaagatgccatggtcaattttttttctcaaacacttTTTGAAATCCTG
AGTAATAAGATACTCAATCAGGATAAGTTTTGTAGAATTATTGAGTTGAG
GTAATATATGAAAATAGGTTTTCGGGGATGTTGCTGGGACTGGGAGCCAG
TCCAAGTTTTGCGCAAAAAATGGCATCCGTATCGTCATAGACTAGAATTT
TGTTGTTTGATCTGTGTGCGTTATCATTTTATCGGTCATGGCAGAggcaa
ttttttgtttactttagcgcctttcaaaataaaaagggcAGCGGAGCTTC
GAAAAAGATTACTGGCTTGAAAAGTTAACTCGTTCATGGTCAGTCAGTCA
GTTTTTCGTCTATGTTTATAGAGAGaagtaatatattttttgtattttaa
accTTTGTCTAGATAACTTATTGAAATCTAAAGAAAATACTAAAAGTCAT
GGATACCAAATTGCTTTTTGCCATTGCAACCTTTTGGTGTATTGGTTGCG
ATGGATCATACTTCACAGATGTCATTTCAACGTTTTCACTGGACCCCGGT
AATCCACCAACTGGAGCTAAAAAGGTTCCTGGTCCTCCTGGTACCAAAAT
AGAAGCTTTAGAATTCACACCAGATGCACCACCAATTCATCTATCAGGTC
CTACAGCAGCTAACCTGATCACAACAGTGCACAATTCAAAAGATTTGACA
TTTTATACAGAATTTATGATGCCAAGAGCTTTAGATAAAGATGAGGTTTG
GGAATTCTTCTCTCTGCAAGGAGGATTTCAAGAAGTTTTTTTCTCCATTG
GTTTAATGAAAAGATCAGATGCTGGAGGGCCTATTGAAGATGGTAACTCT
GCTAAAGGAAACTTGAAACAGATTTTGTACATCAGCCAATATATACCGAA
ACAGAAAGGATCTGTAGAACATATCTATATTATGAAAGACGAATTCAAAC
CTGGTCAATGGTACAAACTTTTGGTACGTATCCGAACTGGTGGTAAAGAA
GTCAAACTAGATGAACCAGCTAATATCCGTGTTCGAAAACGAAGAGAAGT
GGAAAAAGTGGTGGCACAAATCAGAGTCAATTGTAATGAAGTTGGAAGAA
TTCAATTGAAGAATGGGCCATTTGATGATTATGTACCCTATGGATTTGCA
AGTTTTGGATGTGTTCTTGAGAAAAATGGTAGTATGATAGCCAAGAGGAG
ATTCCCGggcCCAATGATCAAAACACAAATTATAAATGGTCCATTGGCCT
TCGATTTTTACAGTCCATGTGATGCCGACTTCGATCCACAAGAAATCCCA
TCAGAGCCACTCGAAAATGAATACAGCGATGCATCACtgaaagagttttt
ggcttTATCTGCTGCAGCTTCCATCAAGACAAGTTTGACATGTCCTGATA
CTAGTCCAACCAAATATCGTGGAGAGACCTGGGCCGACCCAAAAGACGAT
TGTATAATATATAAATGCAACAAAAACGCAAAAGTTGAAGAAACTTGGGT
CTGTTTATTTTGCAAAGATCCTAAAACAGGGCAACAACATCGTAAGAAAT
CAAAATGGATCGATTCCCAAGATATTTGTTTGGAAAATGAATGCACTGGt
GGTTTCAGACCAATCAAGTCTCGCACCATTACTTGTCGTGATCCACCGCT
GACAAAAGATGATTGTGGAGGACTGGAACCTGTTAAATTGGCAAACGAGT
GCTGTGCCAAATGTGGAAATGAAACCTGTTCATCAGACAGAAAATATTAT
TTGGGTTGTAAGAGAACGTGCAGTGACGGACCTGATTTCGTCTGTCCGAC
AAAAAAACCTGGTTGTCATTGTCCGGAGGGTTATGCTGAAAATGAGGAAG
GACTTTGCATCAAACTTGGAAATTGTCCATGCAGATCTGGAAGAGTTGTT
TACAAGCCTGGACAAACAGCGGTACGAAGCTCATGTACCACATGTGTGTG
CAGTAATGCTGAAATGAAATGTTTCAGTCGATGTTAATAAGTGTATAATA
AGCGATGTTTTACGCATCACGTGACCAGGGAATGTACTTCATTCAAGATC
CTGTCAAAATTGATAGGCTGGCGACTTTCGATGTCGTTTTGTgtgttaaa
actatttttttaaagcagtcaaagtatttcaaagaactgaaacttttttt
aacttcattttaacctttttatgaaacattttgttttatatctttttttt
cacAGTTTTTGTGTACATAGcattaatttttaagtttacCTCTTTTCTAA
ACATTACCTAACCAATCTGATTATTACTTTCACTCATTGGGCATTAGAGA
TTTCACTATTACTTCGGATTGTTTTGTTTGATGTATATAAAAAGAGTCTT
TCATAAGTTTtaagaaatctttaaaagaGCGAACAAAGTAATTAGTGCTG
AGATTTAATCTCCACATAAAATATCCACATAATTTCGAGGTCGGAGGATT
ACTTTCGCCTATTGATGACTTGTTTCTTAACATTTGCGAATAGTATTATG
TAAAATTACATTATTACACATTTTTGACCTAAATTAGGCTAATAGAGATT
TTTAGGATTTCATCCTAACAGCAATTTTCTAAATACCTAATTAAAACCTT
TCAATAATACTACTTTTCAGTCATTTTTAGGTCTCAAACTGCTTAAGCCT
TGGCAATTACTGCTTCTACAAAATGTGTAGTATTATTTGTATTAATGTAA
TATATGATTACGAATATTTTATGATATGTTGATATATGATTATAGATTAG
CTATTTTtcctcttatttctcatttagAATAAAGACACCAgcaactttga
atttttttcactctTTATGCTTTTTTTAACTCTTGGTATTTAAGGTAAAT
Aaagattagtact

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_243:274507..286915-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00054608 ID=TCONS_00054608|Name=TCONS_00054608|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12409bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_243:274507..286915- (Clytia hemisphaerica)
TAACACTCAAACACAATCAATACGATCGTCATTTTAATGACGTCTTGCAT
GACGACGATTTTGTCATTTAGTTTAATTGTGTTTAGATGAATCATTTTAT
TAAAAGATGCCATGGTCAATTTTTTTTCTCAAACACTTTTTGAAATCCTG
AGTAATAAGATACTCAATCAGGATAAGTTTTGTAGAATTATTGAGTTGAG
GTAATATATGAAAATAGGTTTTCGGGGATGTTGCTGGGACTGGGAGCCAG
TCCAAGTTTTGCGCAAAAAATGGCATCCGTATCGTCATAGACTAGAATTT
TGTTGTTTGATCTGTGTGCGTTATCATTTTATCGGTCATGGCAGAGGCAA
TTTTTTGTTTACTTTAGCGCCTTTCAAAATAAAAAGGGCAGCGGAGCTTC
GAAAAAGATTACTGGCTTGAAAAGTTAACTCGTTCATGGTCAGTCAGTCA
GTTTTTCGTCTATGTTTATAGAGAGAAGTAATATATTTTTTGTATTTTAA
ACCTTTGTCTAGATAACTTATTGAAATCTAAAGAAAATACTAAAAGTCAT
GGATACCAAATTGCTTTTTGCCATTGCAACCTTTTGGTGTATTGGTAAGG
ATTTTTATAAATTTTGATTATTTCTCAATGCCACACCCACTTTTTACTCA
ATCATAATGTAATTTCCAATAATTGAAAACTCTAGCATTAAAAGAAAAAC
ACACTAGGGAAGGCATTTACTTGAAGGGGCATTTATTTGAGGGGGTGTTT
GTTGAAAAATGTTCTCATAAGAAGGACGACCCTGCCGGTTGCCGGTGCAC
TCGACAGTCGGGTGCTGTCGGGTGTTTTGTTGTGTGCTGACATTTCTAAA
TTTGCAAAAACACCCGACAATAGCGCACCCGACAGTCGGGTGCTAAAATT
CCTAGCTTTGTTACATGTTGGGTGCTGTTAAAAGCACCTAAGATGTAGCT
AGCACCCGACAAAGTGCACCCGACTGTCGGGGGTTTAAATTTCTAACTTC
GAACACCCGACAACAGCACCCGACTGTCAGGTGCACCGGCAGGGTCGTTC
CTTGCATGCCGTGAAGTGAGGTNGCGATTGAATACATGATTTTGAGAAAG
TATTAAGTCAAGAAATTTCACATAAATTATGAGGATTTTACCTTATCTCA
AAATTTGTCTGCTTTTTAAGGGACATACTATAACTTTGAGTAAATATGGC
CATTNGGCAGGGTCGTTAAGAGGGGTGTTTAATTGAGTATCGTCAACTGC
TCTAACTTGGGACAATCTGACAAAACATGGGACTGCAATTCGGCCACCAT
TTCACAGAACTTTCAAAGCCACCATTTCACAGAACCTCCAAAGTCATTTG
ATTTGAGTTAATGAACGGCGTATTAAAAAATACACGATTTCTCTTTCGCA
CCCAGTAGGCTTTTAAATCGAAATATGACACCATTAGTCCTGTAACTTGT
CATAATGGTAACTTTTCAAGGACGGTATCTGCTGAGAAAAATTTTTTGCA
AGTGAAGTAAAAACAGGTGAGAATTTGATATCACCAAACTTTATAAGAAT
AATAAAAATACACGTTTTTTCTTTATAAGGAACCTTAACTTTCCTCTGAG
CCTGGAGTTCCTTATTTTTACAGAGAATTTCAGCCTCAAAGTTCCTTATC
GAGTTCTCTATTTACATAGCTGCTAAGTTTGGATAACCATCTCTTACTGT
TCCTTAAAACTTGTTTTCTTATTCTCAGCCTGAGCAGTTCCTAAACAATT
CCTTATTTCAGTTCCTTATAAACGTGTTCCTTATATAAAAAAAAAAACGT
GTAAGAGTTCTGATGAGTTACAGTGTCTGCCAAAAAAGCATTCTCTGTTC
AATCAATAGATATTCTATTGCCAAGACATTGAATACAGGATTTTGAGAAA
GTATTAAGTCAAAAAATTTCACATAAATTATGAGGATTTTACCTTATCTC
AAAATTTGTCTGCTTTTTAAGGGACATACTATAACTTTGAGTAAATATGG
CCATTTTGACTCAAGGGGAGAAGCCACTAAATCCTGCCCTAGCGGCAAGT
GCGTGTAGTGCAAGCGTATAGTACGCGCGTGTGCGCCACAGGCACACCCT
TAGGGGTAAGAAGTATGTTCCAGGTTGGCTGCCTAACAGATTTTTACTGT
CAGAATTGCAATTCTCACCTTAAAGGACTGGGAATGATAACAAAGTTGCG
TGATGAAAATAGACCATATTAGGAAAATTTAGTTTTTAACTTTCCAACGC
ACAACAAGATTTTTCTTGTAGAAATTTCAGCAGGAGGATTTCTCTCCTCA
TATGTTTAAATTTTCAAGCGCCTTTTAGAGGTTTACTGGTGCGTTAGAAA
ATTATGACCAGCTGTTATCAGGTTTTTTTAAGTCCTACAGTAATGGGTTT
CAGATTTGAACTTTTTGCTGGAAGTTGCAGAGGAATCTTTTAATCAAAAT
TCCTTCAAAAAGATCACAATTATCAAGAATAATTTATCAAGAAAAACAAG
GACTATTTTTTTCTAAATGAAATTAATAACCTAAACTTTTCAACCTAGGT
TGCGATGGATCATACTTCACAGATGTCATTTCAACGTTTTCACTGGACCC
CGGTAATCCACCAACTGGAGCTAAAAAGGTTCCTGGTCCTCCTGGTACCA
AAATAGAAGCTTTAGAATTCACACCAGATGCACCACCAATTCATCTATCA
GGTCCTACAGCAGCTAACCTGATCACAACAGTGCACAATTCAAAAGATTT
GACATTTTATACAGAATTTATGATGCCAAGAGCTTTAGATAAAGATGAGG
TTTGGGAATTCTTCTCTCTGCAAGGAGGATTTCAAGAAGTTTTTTTCTCC
ATTGGTTTAATGAAAAGATCAGATGCTGGAGGGCCTATTGAAGATGGTAA
CTCTGCTAAAGGGTAATTTTTGTCCTTATTTCCCCAACTTTATGAAAATA
TATGCATGATGTTACCTTTTATACAAAAATGTTTTTAGACATCCCTGTAT
CAGTGTCCTGGTCCCGTGCAAAAGCGCTGATTATAAAAATCTTCGAACAT
TTCCTACATTTAAACCTTATCCTTAGAAAACCGAAAACCTGTATCTGTAA
AGTTCAGCCCGGAAAAAAATAAGTTGTTATTTGTCTCCACACTGCCTGTT
TCACGTCAAATTTTCAAAATTTACAAGTTACCCCTGTGTGCATCAGTCAA
GGGCACTAATATAGCGACACAATCTTTTGATTTTCCTTTACTTTAACTAG
AAACTTGAAACAGATTTTGTACATCAGCCAATATATACCGAAACAGAAAG
GATCTGTAGAACATATCTATATTATGAAAGACGAATTCAAACCTGGTCAA
TGGTACAAACTTTTGGTACGTATCCGAACTGGTGGTAAAGAAGTCAAACT
AGATGAACCAGCTAATATCCGTGTTCGAAAACGAAGAGAAGTGGAAAAAG
TGGTGGCACAAATCAGAGTCAATTGTAATGAAGTTGGAAGAATTCAATTG
AAGAATGGGCCATTTGATGATTATGTACCCTATGGATTTGCAAGTTTTGG
ATGTGTTCTTGAGAAAAATGGTAGTATGATAGCCAAGAGGAGATTCCCGG
TAAGTTCTCTATGTATAAATCGATCATAAAAATCCCCCATAAATTATAAA
TCTTGCATAAAACTGCAAGTTAGTGGATTCTGTCCAAATATTTTGTAATT
TTTAGTGATTTTACTACTTTGTGTTGTCGTGTTTACATCATCTGTGCCTT
CTGCTACTTTTGGCGTAGAGTTTAGGCTCTTCAAAATTAAAAGAAAATTT
AGTAATGAAGAATTTAAAACAAAGGGTCAATACAAACAAGANGTCAATTG
TAATGAAGTTGGAAGAATTCAATTGAAGAATGGGCCATTTGATGATTATG
TACCCTATGGATTTGCAAGTTTTGGATGTGTTCTTGAGAAAAATGGTAGT
ATGATAGCCAAGAGGAGATTCCCGGTAAGTTCTCTATGTATAAATCGATC
ATAAAAATCCCCCATAAATTATAAATCTTGCATAAAACTGCAAGTTAGTG
GATTCTGTCCAAATATTTTGTAATTTTTAGTGATTTTACTACTTTGTGTT
GTCGTGTTTACATCATCTGTGCCTTCTGCTACTTTTGGCGTAGAGTTTAG
GCTCTTCAAAATTAAAAGAAAATTTAGTAATGAAGAATTTAAAACAAATG
GTCAATACAAACAAGTAAGCAGAGCGCTTGCTAATTCTTTTTTTTTTCTT
TTTTAGGGCCCAATGATCAAAACACAAATTATAAATGGTCCATTGGCCTT
CGATTTTTACAGTCCATGTGATGCCGACTTCGATCCACAAGGTATTTACA
CAAATTTAAGTGTTTTACAGTCCGTCCCGGAAGAAGTATTATGTCAGACC
AATTCTATGAGTAGAAAAATATATTCTTATATTCTTATTGTTTCTTTTTA
AAGGTTTTGTTTTTAAATAAGAATGGTATCGTTTGCTTACTCATCAATTT
TAATGCACTAGCTTTTTCACATTGGATTGACACGGACGTAGAGCAAGCTT
GGTCATAAAGAGGAAAAGAAAAAACTTTTTTTGCTTATATCAGCATAATA
CGACAATAGACAGTACGGATGAAACACCCACCCACCCCAGGATACATGCC
ACCTTCTGGTACACTGACCCCCCCTGGATAGTCTAGTGCAGATTCTGTTA
AACAATCACAATTTTTCTCTACATTTAGAAGCACTTTTTTTGGGACAACC
TTAACATTCAAATCATTATTATTCATTGTCTAAGGTCCGTGAAAATATAT
AAGGAATCGAATCCTCAAATGTTTTACTATGGAATGGAATCTAGTAATAT
ATTTCGACAAGGAAAGAATAAATTAAGCCTAGCTTTTAAATATCTCATAG
ATAGATAGATCATAGATAATTTGCATTTTCAATAATCACATGAGTGTAAA
TAAACATTCTCATTCTCGTTCTAGAAATCCCATCAGAGCCACTCGAAAAT
GAATACAGCGATGCATCACTGAAAGAGTTTTTGGCTTTATCTGCTGCAGT
AAGTATTTGCACCTGGTTTAGCCATTATTGTAGTATTTTCTAAGTTTGAG
AGGAGCTCCGAAAGGAGTGATGACCGAGAAGTTTGAGTTTAAGGCGTCAA
CACTTCGAATCAGGGATTATCTTCTAAACTCCAGTTCTTCTGTTGTTCCG
TTGTGTTCAATGATAGCCGATCCGGTTCGGCCGGTGGACCCTGTGAGAAA
CAAAATTGCGTTAAAGTTCTCGATTACTTGGCCATCTTGTAAAATATCTA
ACTCTAGTTTAAGAAAAAAATTTATTTTCAACTGATGATCGTCTTCACGG
CTTGAAACTATTAGTATTGAAATAAAACACATTTATATACTTCCGATTCC
GATTGGTCAAGCACTCTTCTGATGAATGAGAGTTCAACTCAAAAAGAAGT
TAACTCTACTTTTATGTACCTATCTATTTACACGATCACTCTCTGATATA
TTTCTTGATTTTAGGCTTCCATCAAGACAAGTTTGACATGTCCTGATACT
AGTCCAACCAAATATCGTGGAGAGACCTGGGCCGACCCAAAAGACGATTG
TATAATATATAAATGCAACAAAGTAAGCTTGCGGTTGAATGAATATTTAT
CAATACACTCCTATTTAACAGACCTAATTGGACCCCTGCCCCAATGAAAA
CTTTGGTCAAAATTTTGTCTTCTGTTGGAAAAATACCTTGTTACCTTTTC
AGCTTCATTCGGGAGTTGATTTTGATTTCATCACCATTTGAAATGCAATG
CAAAAACTTGCTCTCCTTAACCATCCCTACTGGACTTTTTAGCTGGGAAA
TTCTATCCCTATTGGGATTTCGATAGATATGTTCATCCCCACTGTGGGAA
AAAGTTCTAGCGGGACACTGCAACAGGCGTGTTTTAAGTCCAGATAAAAT
TCTAGCCTTTCTAAGGTGCCGAAAAAGTTGTTTTTGTTGTTTTTTTTTAT
CAACCAACATGCACTTCATCTTGTTAGAATCATGCACAAGACAGTCGCCA
GGCTACATAATTTTGCTGGCTTTCTGTTGACGCTCTCTAATTCGACGTTC
TACTGTTCGATACGTTCTATTATTCGATAGTGCTGAAAATCGCTGTCAAC
AAGAAACTCTCATAAACGACGCTCTATTTATTCAATGAAAATTCAATCCT
CCTAAAAAATCGACATAGAGAGCATCAACTATTTCATCTCAAACAATTTT
CTCGATAGAACGCAAAAGTTGAAGAAACTTGGGTCTGTTTATTTTGCAAA
GATCCTAAAACAGGGCAACAACATCGTAAGAAATCAAAATGGATCGATTC
CCAAGATATTTGTTTGGAAAATGAATGCACTGGTGTAAGTTTTTTTTGTT
TTTTATCTCCTAAGATTTCTTTAAAAAGCAAAACACGCTTTTTTTTGTAA
GAATAGACTATAGAGAATGTCCATGATGAAAATGGCCAAAAAATTTAGAA
TAATGCTAAGAATATCACCATCGTGGAAATTGGCTACTCAAGTTAAAAAT
GCCATCTGATCTTTAGAGCATTTTCTACTATAAATTGTCAATTACCCCCA
AGTAAGGCTCCTAACCTAAGAATGCTGTAAGAATATTTTAGGATGATTTT
CCTAAAAATGTTAAGAATATCGATGATGAAATGGATTTACACCATTCTTA
TTAAAAAGCGTGTATTGATAAAAATTTGTTAAAAGTTATACTTTTACATA
TATGATCCCGTTTCATATCAGACACATGTTTTATATCAGGCCAGTGTCTC
CTGTGTCCGATTTTGTGCTGAATAATAAACAAAAAGTTGCCTTTCTTTCC
ATCTTTCTAACCAATATTTCTCCACATCCGTGTCAATTCAATGGGCCTCC
ATAAACCGCTCGTACTTTTCACAATGATGTATGGTTTTAGCATTCATTTG
TTCGGTTTCCTTACACCATTCTTTGATTATTCGTCTTTCATTTTTGGTTA
AATCCTCTGTCACTCGGTTAAGAAAGCCATTTTCTTTTGTTATTGCTTGC
AACACTTTGTTCTTGTCTTCTTCATTCGTAAACGTGACTTTGATTGGTCG
ATATGTCCCTTGATCTTCCCTTTCTTTCGTAAATTTCCCGATCCGTTGCA
TTTGGTAATCTTTATATTTTCAGACGGAGCCGCCAACCAATAATTTTGTC
ATGGATGAAATGACTTTGAACTATGTCTCTCGATTGAATAATATTTTTAG
AAAATTAAGATCAGATACCCAAAAATTTGAAAGATTGCACTCTATGCCTC
ACTCACTATTTTTATAGGGTTTCAGACCAATCAAGTCTCGCACCATTACT
TGTCGTGATCCACCGCTGACAAAAGATGATTGTGGAGGACTGGAACCTGT
TAAATTGGCAAACGAGTGCTGTGCCAAATGTGGAAGTAAGATTTTTGTCT
TTGGGAAAGTTTTTTGTTGCTAAATTTTAAAACCTGCGTCAATTTCAGTT
TCTTTAAAGTGAAAGTCAATAAGTGAAAAAAAACAAACGCATATTTAAAT
ATTATCTTGTTAGAATGTTAAGCTTGAAAAATCACAAAACGATTAAGCCT
TAGCTGAAATTTATAAGGTTTATTATATTCACAATAAATTGAAGTTGAGA
TTGAAATTGTTTGATACTCAAAGTTTCACGTAATTTTTCGTTACGATCTT
CAGTCAAAAATTCTATACTAAAAATTCGTTTCAAGTTTACAAAAATATAT
TATTTGTTTTTTTCCCCATTTAGTATTTGTATTTTTGAGCGATAAGAAAA
CTATTCGAATGTTTAAATTAAAGATTTTATATTCCCGTGCTATATTTTAG
ATGAAACCTGTTCATCAGACAGAAAATATTATTTGGGTTGTAAGAGAACG
TGCAGTGACGGACCTGATTTCGTCTGTCCGACAAAAAAACCTGGTTGTCA
TTGTCCGGAGGGTTATGCTGAAAATGAGGAAGGACTTTGCATCAAACTTG
GAAATTGTCCATGCAGATCTGGAAGAGTTGTTTACAAGGTTTGTTTCATG
AGTCTCCATTGTTCACAGCTCTACTGTCTCAAACGGATTTCCGTCTATGT
CAAGTATAAAAAGAAGCTTTTCCGCCTAGTTTCGAATTTATAGAGAAAAT
GCAGCGAAATATCGAAAATCTATATGTGTCCATTTTCCTTCTCAGACCAT
TTGATACCCTCGTATTTCGCCTTTTTTTTACTTTTTTGAAAAGTAATGTT
TTATAGCATTTAGGACATAGCTTTTGTGATATGATAATATACGAGTTGCG
GGTTACGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTAGAACCACGAGTTGCGAGT
TACTTTTTACGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTAGAACCACGAGTTGC
GAGTTACTTTTTACGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTTAACAAAATAA
AATCGCGAGTTACGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTTAACAAAATAAA
ATCGCGAGTTACGAGTTACGAGTTGCATTTTAAATCACAAAATTCGCGAG
TTGCAAATTGAAAGTGCGAGTTGCAAATTAAAAGTGCGAGTTGCAAATTA
AAAGTGCAAGTTGCATATTAAAAGTGCGATTTGCAAATTAAAAGTGCGTG
TTACAAATCGAAAAGTCAGTAAGAGTGAAAATTTCTATTGATAAAAGGAA
AGATATTTTTTAAATGATTAAATAATTATTGCTGCTCACTATTATACATA
AGAAGAGCAAATATTTGGTGGAGAAAGAAAAAAATGTACAAAAAGTATTT
ACATTGCATGAGTGTAAAGAACTGTAGAGAAAAGTGCTCCCGGGCGGGGG
TAATAGGTTTGGATGCGTTGTTACTAAAAAGGGTAACATGGGGTAACAAG
GTAACAGGCTGAGAATGATGGCTCTAAAAGGTTGTTTCACCTACAGTAAT
TATAAGATCACATGCAAAACGTGTACAATCATGGTCGTAATATTTTAGAA
AAAAAGGAAATTACCACGAATTTTCAAAACTAAAAACGATTTTGAAGTGC
TCTAAGTTAAGTTGGAAGGATAGAGTTTTAATTCTGAGTTTTAACGCTAG
ATTTAAGACTTTAGGATCTGAGGATCCAAAAGTTAAAAAATGGTCCAATA
CGGCTCAGAATATAGCCTTGAAATCTATAAACCCGTGCCAAATTGAAATA
TCCGATTAAATTTAAGAGATGGCCCAAAATCTCGCCCGAACTTTGAAAAA
TTTTGAAAAACAAGGAAGTAAGCTAAATTCTCAATAGATTTTTAACATGA
TTGTAGAACAGCCATTTGAAAGCTATTGAAGCTTGAATAGATTGTCGATT
TCTATCCTTTTGTGTTATCAGCATCAAATTTATAAGTGACAAAACCCCAA
ATCAGTCCTTCGTAGAGTGCCTTTTTCGAAAAATTTGGGGGAAAAGTAGA
AAATCTTAGAAAATTTTGGATTTTCAGTTCCAATCAGGGAAAATTCGGCA
AAATTTTTGAAAAAACGAGTCCCATGTAGAGTCATATTTTGGAACCTCAG
CGGAGTATCCCCGTCGGTCGGCAAGGGTAGTACCCCCCACCCCCGGGGAC
AAAACCTTTGCTGGGATTGCTTAAAAAAGCTTTATATTTGACCATCAGGT
CATTATTTTATAAAAATAAGTGATTTTATCAACATAAGGACAATAGAATA
ATTGATTAGAATTGTATCTCTAAAACTGCCCTTCCCAAAGTTTGTCTCTT
GACAATACACGTTTTTTTTTTTATAAGAACGTCAAAAAATTTTGAAGCCT
TCGGATGTTCTTAGTTTTTTGGATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTAAAAT
GTTCTTATTTTCAGCATTTTTTAGCATTTTGATGTAATTTCTTAAGAAAA
TGCATGTTTTTAAGTCTCCAAAGCCTTAGAATGTTCTTAGAATGTTCTTA
AATTTTTGGGCCTCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTCTTCTTATAAA
AAAAAAACGTGTACTTATCTATTTATATCAAAGGCATCTCATTCTGTACA
ATTAAAATATTTGGTGTAATAAAGCTTGCAGGTATCACACTTAAGTAGCC
TGTCAATAATTTTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTGTCAAAAAGTGTCACTTTGTCTTGAAAA
TGACAGGTAACGTCCACGTTATTAAAAGCAACATTAAAGATGTTTCTCGA
TAGGAAGAAACACGCGCATTTCCTCTCAAAACTTAAAGTTATGTAATGCT
CTGTTTTGTTTTTATACAAAAATGAGCGAAAAAATGTGTGATTTAAGTGG
TTTCACAACTTTAGTCACAAAACGTAAACAGTTTGGCTGAGTTTTCCATG
CTTTGCTTAGACTGGAGTCGTTTATAATGCATGTAATACTAATAATAAAC
ACAAATAATGATACGGGATTCAGTTTGTATAAACTAAAATTTACTTTTTT
GCTTTATTTCTAATATGTCTGAATTAGTCGTCTAGCTTGCTAGACTATGC
TTTGCTTTGGGTTTAGCTTTTTTTGTGCTGTTATTATTTAAGATAACAAT
CTCAGACTTGATTTTAATTCNTCCCGTGCTATATTTTAGATGAAACCTGT
TCATCAGACAGAAAATATTATTTGGGTTGTAAGAGAACGTGCAGTGACGG
ACCTGATTTCGTCTGTCCGACAAAAAAACCTGGTTGTCATTGTCCGGAGG
GTTATGCTGAAAATGAGGAAGGACTTTGCATCAAACTTGGAAATTGTCCA
TGCAGATCTGGAAGAGTTGTTTACAAGGTTTGTTTCATGAGTCTCCATTG
TTCACAGCTCTACTGTCTCAAACGGATTTCCGTCTATGTCAAGTATAAAA
AGAAGCTTTTCCGCCTAGTTTCGAATTTATAGAGAAAATGCAGCGAAATA
TCGAAAATCTATATGTGTCCATTTTCCTTCTCAGACCATTTGATACCCTC
GTATTTTTTTACTTTTTTGAAAAGTAATGTTTTATAGCATTTAGGACCTA
GCTTTTTATCTAGTTGACCAAATTTAATAAATGACCAAAATTTAAGTTTA
TCCTTCCTCTTTCTAATGCAAAAAGATTCATTCTTCAACGGTTCATAGAA
CGCGAGAAAATTCACTTTAAATAAGGGGACTTTTTTCTGGGACAACTGGT
ATTTCTTATTTTTTGGACCAGACCAGACCCCCTGGATGTTTTATACAGAT
CGGGATACAAACTATTTCTGGAATAGCCCATTAACTGCGCCGTACGAGAT
TAAATTTTGAGAAGTTGTTTTGTTAATTCTGCTTTCTCAGCGTAAAAAGC
ACATCTTTATTCTATCTTTATCATAAAAAAGAAAATATCTTTTCCATTTC
AGCCTGGACAAACAGCGGTACGAAGCTCATGTACCACATGTGTGTGCAGT
AATGCTGAAATGAAATGTTTCAGTCGATGTTAATAAGTGTATAATAAGCG
ATGTTTTACGCATCACGTGACCAGGGAATGTACTTCATTCAAGATCCTGT
CAAAATTGATAGGCTGGCGACTTTCGATGTCGTTTTGTGTGTTAAAACTA
TTTTTTTAAAGCAGTCAAAGTATTTCAAAGAACTGAAACTTTTTTTAACT
TCATTTTAACCTTTTTATGAAACATTTTGTTTTATATCTTTTTTTTCACA
GTTTTTGTGTACATAGCATTAATTTTTAAGTTTACCTCTTTTCTAAACAT
TACCTAACCAATCTGATTATTACTTTCACTCATTGGGCATTAGAGATTTC
ACTATTACTTCGGATTGTTTTGTTTGATGTATATAAAAAGAGTCTTTCAT
AAGTTTTAAGAAATCTTTAAAAGAGCGAACAAAGTAATTAGTGCTGAGAT
TTAATCTCCACATAAAATATCCACATAATTTCGAGGTCGGAGGATTACTT
TCGCCTATTGATGACTTGTTTCTTAACATTTGCGAATAGTATTATGTAAA
ATTACATTATTACACATTTTTGACCTAAATTAGGCTAATAGAGATTTTTA
GGATTTCATCCTAACAGCAATTTTCTAAATACCTAATTAAAACCTTTCAA
TAATACTACTTTTCAGTCATTTTTAGGTCTCAAACTGCTTAAGCCTTGGC
AATTACTGCTTCTACAAAATGTGTAGTATTATTTGTATTAATGTAATATA
TGATTACGAATATTTTATGATATGTTGATATATGATTATAGATTAGCTAT
TTTTCCTCTTATTTCTCATTTAGAATAAAGACACCAGCAACTTTGAATTT
TTTTCACTCTTTATGCTTTTTTTAACTCTTGGTATTTAAGGTAAATAAAG
ATTAGTACT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_034412	XLOC_034412	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_243	supercontig	scaffold_243:274507..286915 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.06991	3.44154	6.26027	6.854	50.5299	38.8634	24.9209	25.299	24.4921	27.8659	30.1993	17.4683	16.8093	14.5399	12.2226	14.3924	19.944	23.3338	22.2973	24.8084	17.8518	18.5038	10.741	12.942	13.9239	17.7085	85.668	70.973	110.697	127.523

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00054608 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00054608 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00054608 (transcript) - C. hemisphaerica