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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00054320 ID=TCONS_00054320|Name=TCONS_00054320|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1141bp
ATAATGTGGATAGATGTCGAGGGCTTCACAGCAACAAACCATCTAAGATC
GGAAGTCGAGGTCCAGTCTGAGCAACACTAACTTAACAAGCAGTCAGAAC
AGCAATATCAACAACGGCAACAACAAACAGAACATCGCTTCTTATGGCAG
TCAAACGCAGTTCAAAGCTTCATTCACCATATCACGTGATAAAGATGACA
CTCCAGCTTGCTTCAAACAGGACGGAGAACGCTTCACAAATGAACAGACC
CTGAAATTATATTCAGCTGCAGACTACACTGTTAAAATGGAAATTGCACC
GAATATGGAATTATTGTATATCAAATTTGGTGGCGTTGAAACTCCCTTCA
AATCAACCAATGATCCTGAAAAAGATCAAAAGTCCATCTACCAATTTTTA
TGGTCCACTAAAGGGATTGACCCTACAGAAAATCGACATCGAACAGACGT
TTTATGTTCTATGAAgttcaaaaacttcaaagaaataGAGTTCAGGCTAC
AAGTCAAATTTTATACTTTACAGAAAATGAAACATGCAACTTGGGGCGAA
AAATTGAACAGTATTTCTATGGATTGTACTGCTGGGCGTGGCACTTATca
atcttttgttgaaaaaatgaaatatatttaatGCTAATGGGTCCAAGTCG
TTCCTTCATTGGATGCCTgagaaaatttattattttctgCGGTTGGGTTA
GAGATGTGGCACAGCCAATCCAGATATTGAAATTCTGTGGATTACCTTAT
TCCAATATTTGTTCTGCGCAGTTATTTGGTTCAGTTCTAAGCTTGTGATT
TACGAAGGCTCTGCTGTTTGAATATTCTCACAGAGTAAGATCAAGATACA
AATACAGATTGACGTCATGAGTTACTATGGAAACCGTTGTAAACCACTCC
TTTCTCTGGTAGAAAATAGAGTTTGTGTTGTAAACTCATTGTAACCATGT
CAACCAGCAAAAGAGCCTTGAAGCTGGTTTTATCCaaggataaacttttt
aaaaatctatgaTAATATGAACTATAAgtatcttttataaaatgttaatt
tttagtTCCAGTTATTTATTTACGATTATATTATCTGacgaaagaaaata
tttttaccccTTATCTACCTACCCGATTTTCTTCTAATGCC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_242:168714..183415- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00054320 ID=TCONS_00054320|Name=TCONS_00054320|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14702bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_242:168714..183415- (Clytia hemisphaerica)
ATAATGTGGATAGATGTCGAGGGCTTCACAGCAACAAACCATCTAAGGTA
AGATTGATTCTGTTTTTAATATATTTTAAGTTCTATTTGTTTTTTTTGTC
TCACCCCTGTCTGAAGTAGTTGCATGAGATCCATCTGCGTGATTTTAAAA
ATTGCGTGTGAAATATTTTTTTATACATTCGAGTCTTCTAATATCTGTAA
ATAATTTCATAAAATTATGGCTAAGTGGAATTTGTTTTAATCAGCTGCAA
TTCTTTCACAAGACTTCACATGAGAGCTGAGAAAGCTTGCAATCTTGTTT
GCTGTTTAGTATTTGATGGACATTTCTACCTACCATCAATTTCTTTGTCT
TCGTGCTTTGCGTTTGAATGTTTATGAAGTGGATCTGTGTTTTGATTCTT
TGATGGTTGTTGGTGGTAGATGATGTTCCTTTTTTTGAATTTCTCATGAT
AAAAGGTTCCTATGGAGCTTGTAAAGGGGATTTGCCAAGAGTGCATGATG
TATTTTATTGCGACACAATACTTGAGTCTGTACTTGAGTTGCCATGTTTT
TACACAAAAGGTTTTAATCTCTCAATTTTCAAATAGGTCCGTACGTGTTC
TGTCTGCACTGTTCGAAGTACTTTTCTTATAAGAAAATATAGATAGGATA
TCAGTATCCCCATCTGGAATAGATTAATAAAATACTTTTTGAAAACTAAA
AACATTAAATTGTGTGTAAATTAATGTCATTGCGGTCAAGGATGAGTCCA
TGCTCATATCCAAGGGAATGTCGTTAAAAGTCAATGGGCGAAATTACGTT
ATGGTCACCAAGAATGCTATTGCTCAAAACCACCCAATTCATGCTTTGAG
AAAGGCCGTTACAAGTTTATTTCGAATAGGGTTTTATCGCTTAAATATGC
TAAGCTTTCTATTCTGCTTATAAAGATGGACGGGTTGAGTAAGGGCACAA
AGTCTTACGTAAAAAAACAAAAAGCCACTAAATTTATGACTTAGAGAGAA
ATTAGAGGTCGCTTATTTTATATAATTTGGTCAGACCTCACAAAAGGAAA
AGAATAAAACATTTCGTCCCTCACATGTATAGGATTTCTTGATAAGCTTT
TTGTCCTCTTTTTGATGGTGTGAGATGCGAGCATAGACTCCATTGATTGA
TTGATATTATTGAAATTGTTGTTGCTTGGAGTTGACATAATACATATTGC
TGAAAACTATCGTATTTTGTTGGAAGAATTAGTCTCAACATTAGTTAATA
CTACTCATACGTTAATTTACAATGAGAAGACTTATACTCATCTCGTCCAA
TCATAAACGTCGAAATGAACAGGCTAACAAACAACCAACGCAAAAAGGTA
TTGACCACTCTGCAATTTTTTTTTGTTTATATTCGTTTATTGTGAGTAAT
TATTTCAAAAATGGACTATTTTTGCCATTTTCGGCCTTGGTCAAACATAT
TATGAGCAACCTTTCTAAAATGAGTGGTAAAGCCTCCCCAAAAATCGATT
TCAGGGTAAAAAGGCCTTATAAAGGGACAAGTAAGAAATAAGGGTGGGTT
AGTATTTCAAACAGAGAGGTAAAAAAAATTGAATAATATTTTTCTGAAAA
TGTACAATAAAGCTTTTGGTGTGAATTTCATATAAACAATTATTTCCAGT
TTTTAAATCATGTAATATTTTGAAATTAGTATCTAATTTTGCCAATTTTT
TTATAAAAACACTGTAAAAAGTTGGCTTTCCGAGGGTTGGAGTAAGTAGA
TTTTGTGAAAGATTGAGGGCAATAGATGAATTCGTATTTGGTGTTAAGCT
TGATACTCTAAGGTCCGAAAGGGTCCGGGGAGTGTCCGAAAAAAATTCGA
AAATCAACAAGCGGTGGAAGAGGTTAATTGGAACCTTAGAGTAATGGCGT
AGTGCAGTGTCAACGGAACCTGGATTTCGATTGGCTTTGGTTAATATCTA
TTTGAGTGATCGTAAAGCTATGCATGATTTTACAGTACTTCTATTTAATC
GTTTAGTTAAGTTCAAATCTAGCATTTTTGAGGTTGGGAAGGAGCATCAG
GAAGGAGCACCCTTCACACACCTACCTCTATTATGTGTTCGATTTAAAGT
TCATGTTTAGTTTGGTAGATTTTTCAATCGAAATAAAAATTAAAGGAAAA
CTGTCACGTCATTTCTCAAACTGTTTAAAATTTTTGCTCCTTATCGGAAC
TTATTGAACAAGACTCGATGTTTATCGAGAAAATTTCACTTTCTTCTTGA
TTTTACAATTAGAATGAACCGTCCTTTCACCGTCAAAGGCTAGCTGCAAT
GGCCCTTATTTTTGGTATGTTTTCTATTAGACTAACTCGATGAAAACTAG
ATTCGATCTTCAGGGTTCCGATGCAGCTGAAACTGTGGTTTATTCCTCTC
TTTCCCGTCTATAAAAAAAAACTCATACTCATTTAGATATACGCCTTCAG
AGTAATCCATCTATTTTAATTTAAGTACAAAATCTGTTAGCATAGTGGAT
GAGGAAAACGAATGATAAGAATTGTTTATGGATCCTTTTACTTGAGACAA
TACCTTTGTTGTGACTAAATTTCATACTTCAGTTATTTTTGTATGCATTC
TTTTTCCTTCGATTTTCATCTTTTCTTCGAATGATTTTCAGACAGAATCT
TTTATGCACGTTTTTTAGAAGAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTCA
ATAGCCAAAATGTTAAGAACATTTTAATTTTTCTTAGGAAAATGGACAAA
AAATACTGAAATTGGCGAAAATAAGAACATGTTAAGAATATTTTTAAGCT
TAAAACTCAAAAATTTAAGAACATCCCAAGGCTTTAAATTTTTTGGGATA
TTCTTATAAAAAAACATGTATTTTTTTCTCAAGGAATAAAACTAAAATTC
AAAACAGCAAATGAGAATTATCAGGTCGAATCTACAACATTTTAGAATAA
GAGAAGCTAGAGTCTTCTAAATGTGTTTTTGTATCCTGGTTGTTGTCTAA
GCGTTTACCGGTGTTCGGTTTTAATCCCGCTAGTATGATACACGCTTTTT
CTCGTAAGCCAGTAAATTTTGGCTATGGCTTGGCGGCTCCTACATTTTTT
TTTCCTACATGATGCTCTTTATTCGTTTGTTCTTATGGTCTGGCCAAAAC
AGAGCCTTATGTTTTCATAAAATTGTTCTGATAAAAAAAAACGTGTTGTG
AGTGAGGTATTTTCTGGCGTGGTTGCATAATTGATTTTTCGATGTGATTG
TAATTTGATATTCAAACGTGTTGTGCGTGATACATCCCGAGTTCGTCCTG
ACTTCACTTGGAAGTGCGTGGTGAACGGGCAACTGATGTACTTTGCTCTT
TGAGTTCCTAGTTCTGAATATTTACACAACTTTCTGAGAGATTTGGTTCA
GTAGAAAATATGACAAAGTCAATGAAATTCTGTCCGAAAAACTTTTTCGG
ACACCTTATGCGGTGAAACAATCAAATATGACTCGAGACACATAACCACT
TCAAGAGGAATTNTTTTCGGACACCTTATGCGGTGAAACAATCAAATATG
ACTCGAGACATAACCACTTCAAGAGGAATTTCTTCATTTCTTCCTCAATT
TAGAACATGCTTTTAAATATTTTACGAGTTTTCTATGCAGGAGCCTTTTG
ATTTTCATCGCGTATGTTATGCTTCTCTTGTTGCTAAAGGAGAGAATAAT
AAAGCGCTCAAGTGAAGTACGAAAGAGGGGAAATAATACGAGGTGAAAAA
TAAAATGCGCTGTTGTGAAAGAATTGGACAGCTTAGCTCTTTTTTATTTG
TTGGTATAATAAAATGTGATTAGAATTTAACCTCCTGCCAATTATTTGTA
AACTTGTCCTTTTGGATGGACTTTCATCAAATGTAAATGAGGAAAGAAGG
ACTTATTGTCATTTCGTCAAGAGGGGAAATATTTTCTTTCTCATTTTCAT
CTTTGTTTCACTCTGCATATTCTATTTTTCTATATTCTATTTCTCTTGAA
ATTCATCGAAAATGATCTGTTTTTAGTTCAGTCTTACGTCCACTCTTCTT
TGAAATATTTTTGTAGAATTATATTTTCGTTTTCAATATTTTTTCTTTAT
TTTCAAAAGTTTTGGTTTTCGTTTGTCTTTTACTAACTACAAGAGAAATG
GAATTGTCTAAGGTTTTGACAAGTTTTGATAATTTCATTTTTTTTGAAAA
ATATGATGTCAAGATGTGTGTGATGATATGATTGTGTCTGGTGATAATGA
GAATCGAAACCAAAACCTTCCTCTTTTTCCAGAAAGGAAAGGTCTTGACC
TTGTCAGTTTTCTACTTCTGCAATCACATTTTGGGATGTTTTGAGACCTC
CCCAGTAGATGAATACGATAATGATTTGTTTATATAGATTAACTCCTGAG
TATTGATTTAAAGTTAAGCCAGAAGATGTAGCCACGTCAAATTGAATTTC
TTGAATAGACTGTAATATTAAGCTTCGAATTAAATTGTAAACCAGTTAGT
TACACTTGTTACATGATGAATTGATCTCGTACAGGATAGAAATATTCCAC
CCAAAATCGATTTTTGCAAACTTCAACGCAAAAAAAAAACAACAAAAAAA
AACAGTGAAGCTGGTGCTCTCGTATGAGAGACAGTTCATTTAATGTTTCC
AGACCATCTAAAAAGAACGACAAATAGCTATTAAAAAGCGACAAAAAGAA
CGACAAATCCTAACCCTAAACCTAATTATCAAAGAACGAAATATTTTGTC
GTCCCAAACCGCGACCTTGTGGTCAGTGACTACCACCCCTACATATTCAT
TACTTTTTGTACTTTACGCTTTTTAACGACTAGTGGTTTAAGAACGATAA
ATTACGCACGCGTATAAGTCTCTGTTTGGGTGAGCTGGAAACATTAGATG
AACTAACTCATAACTGAAAGTCCCAGTACAATACAGTTATTTCGAACTTA
GGTCAAGCACTATTATACAGTCATCCTATCCCCAAGTATTTTTTTGTGAT
AATTATATCAATGATTAAATATAGACAGAGGCGTATAAATTAGTGTGCTT
GTGATTTGTTTTGCTCCATTTTCTCGGTTTCAGCGATTTAGAGACAACCA
ACTATTTTTTAATTTTCAAGCATATAGAACGGCTAATTCTTATCAAATGT
CTCATTTAGGCTATAGTGTGTTTATGGAGGTAGTAAAAATTTTAGCCAAA
ATAGCGCAAGACTTTGGCATGAAAACGAGGCAAATTTAATTGTATTCACC
ATAAAATAACATTCCATTTTTTTTTCAACTGTCAACTAATCAAAAGTCCA
ATCTGACGGAAAAGTGACTTGAGATTGTTTTCCTTAAAAAATATCTTTTA
ATGATAAATTTGAATTTCGAGATTTTTCAAAATATAAGCAAGTTAGCCAC
TGTATAACATACCCCAAATTAATAATAGCTGTTATGAACAAGATCTCTTA
ACACTGTTTGCCCTAGACTGAAATTGCTACAATTTGATTTTGGGCAATTT
GTTGTATTAATTAATCACCCTTATTTTTGAAAGACTTCTTTAAAAAGGCT
TTCAAGGATACCCTACCTAGTTTCGCATAATCAATTATTCTCTTACTAGC
TGTGATATTGACGTAAAAAAAGAGAAGAACTTCTGGCTTTATTTTGTAAA
TTCTTCAAAATATTGTCCTAAGTGAGGAGTTTTTAAACGTGTTTATGTTG
AAGAAAGAATCAGCTGACTTGGTTCAGTTGAAGAGTATTTAGTAAACGTT
GACTAGTAAAGTTGAGTGGTGATTAACGTTGAAAAGATTATTCAGAATTT
GTTAGAAAACTTACCAGAAATAATTCTAAGGATAAGATTGAATACTCCGT
ACATGTGTACAAAATATGATTCGATTTTAAAATTTTTGTGTATATTTTTG
CTCTATTTTTTGACTTTCCATTCTTGGCCGTTTTGTTTTGATTTTTCTCC
CGACGCTTACCCAGTCCCCCAAAAGTCAACGCGGTCATATTTTGCACATG
TGAAATATTACACACTGTATAGAGAAATTCCTCTCTCTCTTCTTGTTTCG
TAATGGAATTAGTGAGAAATTCTTACGGTGATTATGGTTAAAAGTTGGTG
TGAAATTTTTCTTGTAATACGATTAGGACGTCAAAATTCGGCTTTTTCTT
GGTTTTCTTTCGTAATGTCAATCTGCTTATGGTTTCATGTTTTTTTTCAT
TCTTCTTATTTCTTCAATTTTCAATGATCTTCTCCTCCCTTGGTTTCTCT
TGGCTTTCCTGTTTTCGAATTCTAAAGCCTGTGATCTTCATTTATATTAG
AAACGTATGTTTGTATAAGAAGAGTCTAGGGTGATATAATATACGTCCAG
GGATCTGGGTCGAAAAATCGGAGAGAGTTTCCTTTTCCAAGGATGAATAT
TCAAGTTAGTACGTTAGTTGTTATAATAGTTAATCTATAAGTATTTTGTA
AATCTTGAGTGATCAAACTTTGGTTTTTAGGTCTCAAAACAGCTCAAAAG
GCAGTATTTGATCACTTCCTTAGGCTTCTTTAGCACAGAGGGAGGAAACA
TGCTCGCCAGTTTTCATACTTGAAGGAGTCTGTTTACATCCAAACACTCT
CCCTTCTCTTTCCCTCTTTCTTTTCATTCCACTAATTATATCAACATTCT
CATTGAGAAAGATCTTCTCGTCTTCATTTTTTCATCTTTTTCGTTTGCTT
TTTCATACCCCTAAGTAAATATGATTAAGTATAATAAGTGCTTAATCGTG
TGAAATTCAAAATGTGAGCTTCAACCAATGATAGATTGCTTTCTTTTTTT
TCCGTGAAGATAATTCTGTTATCCATTTTCTATTTTTCTTCCTCTCTTTT
CCTCCTTTTTCCAACTTGTCTTATACTTTGTTATGTTATGACTCCCCTGG
TTGGGTGGACCGATGTTGAGCGAATGACTTGGAAAATCTGTTCATGCAGT
GCCTTGCTTCTCTTGTTCACCATGTATAAAGGGCCTAAAAGGACTTGTTG
GACTTTCCGCTTGTGGTTACTACGTTTCCTTTGTAGTGGGATTAAAGATT
CTTCTTCTTCTTTTCGTGAAATCATCTTCTTTTAAATGGTATTTGCTGGT
TGATGTTTTTTTCAATCTCTTTTTATTTTGAGCCCAATTAAAGCTTTTAA
CCATTAAGAATAAACCATAAGAAATAATTACAATGCAGCAAATTCTTAGT
GCTTTCCTATTAAATTTTCATTATATAGTCTTCTTTTTTGCAGTCTTTTC
TTTTAGTAAAGGAAAATTGCTACAAGGTATAGTCAGTTAAAATCATTATT
TGAATAATTGGTTTCAAAACTTAAGTTCAAAATATCAAATTCACGATATT
TTGAATTCATTGTTTCGGAAAGGTGTTTACCTCTTTTATTGTCGTTCTTA
AGACTCGTTACTCAGACCTCGTTCCCACTTTACTGTTCCGTTTTGCCCTG
GTATGATTTTCGTTACGGATCGAGTGTGTTCATATTGGTTTCGGAACGTT
TCGGAGCAAGAAAACGGAGCGATTCCGTTCCGATGAAAAAAGTGGAGCGA
AATGATCTGTTTCGATCTGTTTTGCTTTGTAACGTCTTCTTTTTTGACGT
TTCGAATTCTGACGTTCACACTTGTTTCGGAACCATTTAGTTTNCGTCTT
CTTTTTTGACGTTTCGAATACTGACGTACACACTTTTTTCGGAACCATTT
AGTTTCGGAACGGAACGGAACCGTAACGTCTGAACATGGTCTTCAAACGA
TATATTAAACAGACTGTAGGTTAGTCCTCAAGTCGACTCGTTCAGTAGAA
GAATCACCCCGTGCGTCGATCTTCCTTCTCCTCATTTTCTTCCAATGAAT
AAAAGAAAACAAAGTGTGAAAAATATGGGAAACTGTAATTTTTATATCGT
ACTTAATTTTTAATCTATTCTTCTCTTTTCCCCTCTGTACTCTTCAGCCT
CCTCTCACAAGTCTTTTGAACTGTTTTTCTACTTTACTCTGCATTATTTG
CTTTTTTCCACTCCTTGTTTTGAAGGTTGTCGAGCTGTGCTTTGTAGAAA
GAGTTATGAAGGAATATGATGTTGGGAAAGTCTATTTGGAAATAGGTGGA
GTCTTTGGCCTGCAGGAGCCATCTTTTTGTAGAAAGAATCCCCAAATGTG
GTTTTCTTAAACGAAAAGAAAGATAATAGAGAGAGGAAAGGGATATATTA
TAGTAAGTTCAACTGCACTTTATATCAAGGGCAGGCCGTTTTAGTAGCTT
TAGTACTAAATATTTTATAAACCCTAAGATTTTTTTATTCGACTGCAGGA
AGCAAAAGGGAATAATTTTGGATGTTCTTTTCTGATGTATGTAAAAGAGA
CTTATTGTTATGGCTATATTTTCAATATATACTTATCTTCTCATCTCTTA
TAGCTTTGAAAAAATGAAAAAAATAATCAGAATATAAAGTTTGGGTTATT
AAGATCGCGTCAAATAAAATAATCCCACTCTCAAATACTGAATATTTCAT
TAAAAAATAGATTTTTATGACTTTTGGGTTTATTTATTGGGGTTGATTTG
TTATTCAAAGAGGAAAGAGACGTCTCAAAATGGCTTATTTTTAAAAGAGA
GTCCAAATCCGTTCATATGATTTAGTTCTCCCTAACAACAACAGTTCTGT
GACAGCAATNAAAAGAGAGTCCAAATCCGTTCATATGATTTAGTTCTCCC
TAACAACAGCAGTTCTGTGACAGCAACAAACTAACCTGCAGCCATGCCTA
TTATGCGAGCATCGGCTGCTGTGCAGTCTGGTGGTCCACCGCCAACTAGA
CGGAATAACTCTAATGTGGAAAATCGCAAAAGTACCTTTACTCCTGAAAG
TAAGTATTCATGGTGCAATCCAACAAAATTTAAATTAAAGACTGGATTAG
ACTGCATGGTCAGCCCTTGCCCCTACCTATAACAAAGGGAAATGGTGGAT
TTGTTTTAGATTACAAATAGTTTTATGAGAGCTGAGTGGAAACGTAAATA
AGTTTGCGACTTTACTTTAACACATCCAAATGGCTAGCCCAGTCTAGAGT
TCGTTGTATACATCCCCTTTGAAAATGATAGAAGATGCAGGATGGGATAT
GGGAAACGACGTCTGTAACGCTCGTTTATCAAATTTTTGATAATGTGAAC
ATCGCTAGCTTGGTACTATAGTTACCTCTCGCTAATACGAACTGGAATGG
GAATTCCAATCCTTTTGAACAACAGAGGGTAGTACAGGAATACACCTTTT
CGACTGTGGTCAGGTGCATACCACTTTATTATTTAATTTATCACCATAAA
CTCGATCCAATCCTTTTTTTTATACTTTTTTCTATTGTCTTTAGGTGCGA
AAAAAAGACTGGGACGGTTTTAGGGTCGTAAAGCGGACGAAAAAATGCCC
GTGCGGTAATTGGCGGCTACGGTCGAAAAGGTGTATTACAGAGACTTTTT
TACGAGTGTTACCCTTTGACGGGAATTGGAAATGAGTTCCATTTATAGAA
AAATTCGAATAATAGAAGTTCGAATTAGCGAGAGTTCACTGTAAGCATAG
CTAATCTCCAAGCAGATTCTGATACTCCACGCATGCCACGTAGACACTCT
AAAGCTTTTTTCCCATGTACGTAAAATTTTACTTAAGACCTTGAAGGTGG
GGAATTTCCCTAAGCTTATGTAGTGTTTTAAGGCCTTATGTAAAGTTTGC
TTACGTTCAAAAAGTTTTAAACGGAAGGAAAAGTCACGTAAGACCCAGCT
TTTTTCACATGTACGTAAAATCTTACTTTAGACCGTACGAAAAATCGTTC
GTAAGGCTGTCCTTTGGGAATTTCCCCGATATTATGTAGAGTTTTTGTTG
ATTAAGAGGTTCTTACGTGACTTTTCCTTCCGTTCAAAACTTTTTGAACG
TAAGCAAACTCTACAAAAGGCCTTAAAACACTACATAAGCTTAGGGAAAT
TCCCCATTCTTCAAAGTCTTAAGTAAAATTTTACGTACATGTGAAAAAAG
CTTAAAGGCCATAGCTCCGTAACAAAATCTGCCCAGGTTTGTGGGTCTCT
TTGATCTTTTTCCGTTTGATTCGTGATGAATAAATGAGCTTCTCAGCGCC
ATGGCTGGCTAAATGAAAACAAATTTTATACATAAATATTAGAACCCGGT
TGCTTTTGCTTTTGTTTTAAAGCAAATAGCAAAGTCACTATGATTTTTTT
GGTTTAGATATTCGCCAAGCCCCCACGGTGCGCAAAATGGATGATCTGTT
ATGAGATTAAGTCATATAGTTGGTTTCATTTTTACAAATAGAAAATTAAA
TTCTCAGCTTAAGTTGAGCTAGGATCTGACACTGTCTGTCTGTCTGTCTG
TCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTC
TGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTTTTATAATGTGTATGTCGGACGGAAATGG
TTATTTAGGTGTGTGGCATTGGGTTGATGGATGTCTACTAAGTGGCAGTT
TTTACACTAGGCTTTGATAGTGGTAGTATTCGAGCACTTGTTTTGAACTA
TTTCCATCAATGATCTTTACCATATTGATTTTGTCGTATATTTTTTCTTT
GGATTGGTTTCACTAGTTTTGGGTTCAAAATTTTTCTTTTGCAAAGGTGG
GTTTTGGCCTTCATCAACAGTTCTGAATTGCTTTCTTCATGTCCTTCCGT
CCGGCTGTCTGTCTGACTGTCTATCTGTCACAAAAACTTTAGGACAGCCT
GGAGACTTCTAAAATAGTTGCATTTGGCTAAAATTTGGCACACTTTTTCC
CAGGTTGAATTTTCAGGGACGTTTTTTCATTTTTCAAATTTTGATTTTGG
GTTTTCACAAAAAGGAAGCTAAATCTTTGGGGCAATCATTGAAAAAGTGA
TTTTGAAAATTTTCACCAAATATGGAATTATTTGATTATACTTTTGCTTT
GTACATGAGTTTGTCACGTACTCTTGGTAAATCACTGCCACTCCTTTATT
CTTCAAATGAGTAACTCAAAACAAAGACAGAGTACCTATTTTGTCATCAT
CCCCTCCTTTTCAATTAATCATCACTAAGTGTCAATAATGATTAATAATT
AATTACATTCTCTCCCCCCTAATCAACCCATATGGGGCTCTTTTTTCCTT
CAAAAATATGGATATATGACGTCATGGACAAAAGGTTTAATCTTTCGAAA
TCTTTCTTAAAATTAATTAATGTCAAAAAGGCTAGTTCATCCTCTTCAAA
AAAAAGGAAATAGCCTTTTTTTTTGAATAATTTCATTGTAAAGCTTATGT
TCTTTTGAGGGGACTAAAACAATAATTTTGATGGGATTGACTGATATTGA
TTGATTGATATTGATTTATGTTTTCACCAAGAAGTGAGCAAATGACTTGA
TGACTACCAAGCTAATGTAACGCTTTTTACTCAATGATGAGTTTTTCTTG
ACAATGTGACATTTGTACACAAAGTAAACATCCAGGAGTGTCTGGTATCA
AAGGCTTTAAAAAGGGCAAAGAAGAAAAAAAGCAGTTAATTCGACATACT
TAAAGATAAAAAGAAGAAAAGGACATACGAGGAAAGAATTTTTTTTATCA
AAATCGATCAGAATACAGTCGTAGTTATAAAAAAATAAAAATAAAGGAAC
GTAGAATTATATAAGAGAAAAAGAATACTAAGAAAAGAATACGAAGAAAA
AACTTCAAATCATCAAGCAACATATGTGGATGGTTTCCTTTTTAAAACTG
ATCGAATTCTTATCCTCGTTTTTATCTGTCCTAAAAAATTCAATTTTTTT
GGTGGTGTTCTGACTGAAAACTGTCTATGACGTCATTTTTGTTTTGACCA
TTCATCAATCAAAGAAAATCATCTCTAGACACAGAAAGTTTATTTGTGTT
TGGTCAGTGGAGTCAAGAGGAGAAAATTTAACTGTTTTTGTGAATTTTGT
ATAAAACGTCATCCTTGTTTTGATGTCGGTCGAGGAGGATTAATCCAAAT
TGAGTGGCTATACAAACATTGTTGAACATACTCGTGAAAAGAATTAACTT
AAGTCAATATTACTGAGAGACCTCCAAAGAGTGACTTTGTAAAAAAGGAA
TATCGTAATAATTTTTGACAATCTATAGTTGGACGCTGATGGTTTCGGTG
GTCAGTGGTTTCTATAGTGTGTTGAAACAATAAACAACTTTTTGTTTTGA
TGTGCTTTTTGTAGATGTGTTGTTGTTCTTGATTTTATTTGCCGTGCAAT
AAATGGCAACGAAAACTGGTAAAACGACTTTTTGCTACTGTATTCGTAAT
GCAGGGCTTTAAGAACAATAATTTTAGCGATTCATTGAAATAGTTGCATT
TTTACCAGTTTTCCTTTTTTTCAAAGGTTTGTTTTTTTCGAGCTTCAAAT
TTTCACCGGTAAAATATTTAGGATCTAAAGAGATCTTGTGTGAAACACAT
TTGGTGTAACAAAACCTTGTTACTACCTACGGTCATAACGTTTATATAAC
ATTAAAGTAATGTCGAAACACTCTGTGTCGAATGTGTACTGACCAGATAA
TTTAAGAATTTCTGTTCTTTTTTACCAGATCGGAAGTCGAGGTCCAGTCT
GAGCAACACTAACTTAACAAGCAGTCAGAACAGCAATATCAACAACGGCA
ACAACAAACAGAACATCGCTTCTTATGGCAGTCAAACGCAGTTCAAAGCT
TCATTCACCATATCACGTGATAAAGATGACACTCCAGCTTGCTTCAAACA
GGACGGAGAACGCTTCACAAATGAACAGACCCTGAAATTATATTCAGCTG
CAGACTACACTGTTAAAATGGAAATTGCACCGAATATGGAATTATTGTAA
GTCCTGTTACTTCGGCTTATATCTAGTGCTGTTCAGATTATTCAGACATA
CCATCATCAATCAGGTTGACAGAAGTAAGATTTAGACGGGGCTTCATTAT
CAATGTATGAGATTTGTTTTTCTCACATAATCTAGATTTGAGTGGTTAAT
TCTTCCCACAGGCTCGAGTTTTCGTCAGTTATCGATTGCGTCAAGCGCTT
AAACCTGATCAAAGGATAAATGCCATGTTCAGATGAATGAGCTGTTATGA
AATTCAACAAGAACATTAAAAATCTATTATTTTTACTCTCAATAACACCA
TTGAGGGCTTAGAATTTGTGATTTTTTGTCAGTATTAAGGAGCCACCATA
CAAACAGTCCTTAACTTTTTGTTTCGTCTCAGTATCTTGTTTCAAAAGAG
ATATCCTACGTTATGAAAACATTAAATTATGTTTTGGCCTAGACGAGGAC
TGGATATAGCGCACTTGTTTATCAACTTTATGTTAATCATGTTTATATTA
CAAAAACTAGAGAGTTTTAAAATCTCCCAAGCTCAATTGAGACGAGATGG
AGTTTTTACAAGCTCTTATTTGATTTGGTTGGTCGTTAACCAGTAATAAA
ACAATTTTGTTACTTTTCCTAAAGAACGCGTCATTTTTATTATTTTAAAT
GACCAATTATTAAAGTATCTTATAAAAACTCCATCTCATCTGGCTCAAAT
AGGAAATCCCCACTCATCCTTTTGACCTACAACTTCAAGAAATATAAAAT
AAAAACTTTCGCTCTTAGGTATTGCTATTTTCCGGTAGATTTGATACCTT
AACCTTTGATTTAAGGTCGGCGTATACTTGAGTTAAATGAGTAAACTTCC
TCTTTCACATATTCTTTAGAATACTTCATCCACTTCCAAAAAGGTCATTT
CCATTTTGAGAATACATCAGAGCATTTTCCCATGGCCATGACTTTAGGAT
CTAAAATAATTTCTCGATTTCCCACTTAAATTTTCTTGAGCACTCAATGA
TTTTTATTTATCACATATTTTTTCAGGTATATCAAATTTGGTGGCGTTGA
AACTCCCTTCAAATCAACCAATGATCCTGAAAAAGATCAAAAGTCCATCT
ACCAATTTTTATGGTCCACTAAAGGGATTGACCCTACAGAAAATCGACAT
CGAACAGACGTTTTATGTTCTATGAAGTTCAAAAACTTCAAAGAAATAGA
GTTCAGGCTACAAGTCAAATTTTATACTTTACAGAAAATGAAACATGCAA
CTTGGGGCGAAAAATTGAACAGTATTTCTATGGATTGTACTGCTGGGCGT
GGCACTTATCAATCTTTTGTTGAAAAAATGAAATATATTTAATGCTAATG
GGTCCAAGTCGTTCCTTCATTGGATGCCTGAGAAAATTTATTATTTTCTG
CGGTTGGGTTAGAGATGTGGCACAGCCAATCCAGATATTGAAATTCTGTG
GATTACCTTATTCCAATATTTGTTCTGCGCAGTTATTTGGTTCAGTTCTA
AGCTTGTGATTTACGAAGGCTCTGCTGTTTGAATATTCTCACAGAGTAAG
ATCAAGATACAAATACAGATTGACGTCATGAGTTACTATGGAAACCGTTG
TAAACCACTCCTTTCTCTGGTAGAAAATAGAGTTTGTGTTGTAAACTCAT
TGTAACCATGTCAACCAGCAAAAGAGCCTTGAAGCTGGTTTTATCCAAGG
ATAAACTTTTTAAAAATCTATGATAATATGAACTATAAGTATCTTTTATA
AAATGTTAATTTTTAGTTCCAGTTATTTATTTACGATTATATTATCTGAC
GAAAGAAAATATTTTTACCCCTTATCTACCTACCCGATTTTCTTCTAATG
CC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1575043694:183369..183415 | TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1575043694:183369..183415 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1575043694:170570..170837 | TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1575043694:170570..170837 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1575043694:168714..169539 | TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1575043694:168714..169539 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1510915933:183369..183415 | TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1510915933:183369..183415 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1510915933:170570..170837 | TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1510915933:170570..170837 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1510915933:168714..169539 | TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1510915933:168714..169539 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1491911889:183369..183415 | TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1491911889:183369..183415 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1491911889:170570..170837 | TCONS_00054320-exon-scaffold_242-1491911889:170570..170837 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_242 | supercontig | scaffold_242:168714..183415 - |
Blast
BLAST of TCONS_00054320 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CNRP1 (CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1 OS=Homo sapiens GN=CNRIP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 82.4185 bits (202), Expect = 1.946e-18 Identity = 42/140 (30.00%), Postives = 74/140 (52.86%), Query Frame = 2
Query: 164 KASFTISRDKDDTPACFKQDGERFTNEQTLKLYSAADYTVKMEIAPN-MELLYIKFGGVETPFK-STNDPEKDQKSIYQFLWSTKGIDPTENRHRTDVLCSMKFKNFKEIEFRLQVKFYTLQKMKHATWGEKLNSISMDC 577
+ S + +D P +K DG+RF +T+KL + + Y V+++I P+ +++ I GGV P + + +P+ D + +Y + T+G+ PT++ R + +M F + E QVKFY K H WG + I +C
Sbjct: 9 RLSIALRIQPNDGPVFYKVDGQRFGQNRTIKLLTGSSYKVEVKIKPSTLQVENISIGGVLVPLELKSKEPDGD-RVVYTGTYDTEGVTPTKSGERQPIQITMPFTDIGTFETVWQVKFYNYHKRDHCQWGSPFSVIEYEC 147
The following BLAST results are available for this feature:
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