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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00053294 ID=TCONS_00053294|Name=TCONS_00053294|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1906bp CCGTCATTCAATTCAAAATCCCTTCATATATTTAAtgagaaaaaagtttt aaagattATTGTGTCGTCTGTCATATCTATGATGATACATTCTGTCGAAA TGATGATTTCGTAAGACTTCGTAAGAAAATTTACTTTCGAAGAAGGTGGA CAGACGGACGGGGTCGAAGGTGTTTTATATTTAATCGGAACATGTCGGAA GtatatcaacaaaaacaaagagTGGTCGTTGTCGGAGTAGTTAGTGTAGA AGAAACAAGAATTGTGTCGAATATGTCGTTGTTGGTTGAAGCTGTTGAAT CTTGTCATACTGGTTACAATTACAGTAAATGACAACAAAAGTGTTGGTGT TTGCATTGTGTGTGTGACGAAACTAAACAATACAAAAGAGTGTAAACAAG TGGAAGAAAGGAGGCTGCTACCCTTTTAAAATATAATCCATATAAAAGGA CCAAGCATCATTTAAAGATAATCATTTATCATTGATCTGTCAACTGTCAA TTATCAAGGATAAAATTAAACCTGATCTGTCATTATTAACGTTCACGAAA AATGCGTTATTCAAATACAACCATCGGTTGCTGTGCAGTCGATCAGAAGC AAACAATCGGTTGCTATGGTGGAGTCGGTGCTGGCAAAGATACAGCGTCG TTGATACGGTGTACTTACACACGTCGCTTCACCGTCAATATTCAACAGAA AACTACGTCAAATGATATTTTTCAACTCGATCCGAAAAAAGTACATCAGA AAGAACGCAAACGTGTTCGCTTTGCAGATGACGAGGGTGGTTTATTATGT TCCGTcaaaattttcgaagaaaaGTCGTTCGTCTATCAACCGAGGCTACA CACGACACCTGCTTTTTCCAAAACGAACTTAACCAATTACAAGACTGTTT ACAACGAGACCAAATTGTCATTAAAGAATGTATGCATGGTAGCTTACGGT CTCGTCGGCGGCTCTAATTTATTCGGTGCTATTGCCGTACGTAATATTGC CTTCCGTAAGGACGTTAAAGTACGTATCACGTTAGACGGCTGGAAAACGT CATCAGATTTACCTGCAAAGTTTGTTCAACAAGAATTTAACGGACAAATA GATCGCTTCTTTTTCATGAAGCCACTCGGCGAACTTGATTTTGATGATGT TTGTAATGACATTGAATTTGCTGTATGTTTTACAGTTGATGGTGTTGAAC ACTGGGACAATAACAGTGGACTCAACTATAAATACCAATCATCCAACAAA TGTCTatagtattttttaatgaaatcagTTTTTGTTTGTTATGTCAAGTT GATTAATTGAACGTTCCCGCCCGTTGAATATTTTCCCGCCTGCTTATTTA GCAGATGCGCGATTTCGAGGCCGTGTCGTCGCATCGCCGTCTGTAATACA AGTTTATTCCGCCAAGTCCCGGAAAAAGATTCCTTTATTCGTTCTTACGC TCAAAGTCTTTGTTCTTTAGATAAACTATAACAAATTTATTCAACATTTA TTCCTTTCTTACTGGCTTATGTAGAAatagaaaattcgaaaaaaaaagga gaaaaacattttcaaagcaTTCATCATCGCACGCAAAAATGTTAATTTGT AGAAAAAATGGTATAATCGCGCATGCGTTTTCAAATACATTGAATGCTTT GGAAAAAAGTtattaataatataataatattgtagaaaaaaaaaagaaag atctaATGAAGGCAATATTCtgaaaatattctcaaaatattcttttaaaa gtaatttAGCCCTGAAATCTTTCAATCTTTCCTTCATTGATTCTTGcttt gtatattttgtatataatttagcattttttttagtttgtttgAATGGAGC ATTATTTTTCCTCTCTAATATTTTGTTTTAGGGAAGGGAATTCTTTTAGA TTATAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_228:377995..388820+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00053294 ID=TCONS_00053294|Name=TCONS_00053294|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10826bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_228:377995..388820+ (Clytia hemisphaerica) CCGTCATTCAATTCAAAATCCCTTCATATATTTAAtgagaaaaaagtttt
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00053294-exon-scaffold_228-1491911889:377995..378306 | TCONS_00053294-exon-scaffold_228-1491911889:377995..378306 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00053294-exon-scaffold_228-1510915933:387227..388820 | TCONS_00053294-exon-scaffold_228-1510915933:387227..388820 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00053294-exon-scaffold_228-1575043694:387227..388820 | TCONS_00053294-exon-scaffold_228-1575043694:387227..388820 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_228 | supercontig | scaffold_228:377995..388820 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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