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transcript sequence >TCONS_00005188 ID=TCONS_00005188|Name=TCONS_00005188|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1866bp CAGagtaaacaaaatcaaaattaaaagaaCTGAAGCTAGATGAAACGAAA ATGGAGCAATGTTATCCCATGTTCACTATCCAAATATTTCACGAAGAAAG TTTTATCTTTTTCCAAGCAACTATTGAAATAACAACAGAACTATGTTTGC TGAGTCAACACAGAGAGTGTTCAAGCTCTCAAAGCAAAGAAATCCTGCTC TCTTTTTCAACAATCAAAGAAATTCGTTGAAAGCTCTTTGAGTTTCAATT GATAAATGTTGgagttgaaaaaactttttgttgaagaagaagaaagatag cTAAAATCCCATTGAGGATCAACTTattcaaaatgcagaaattTGTGACC ACAGCTGGTAGATCACAAAGCAAAGATTCACTGCTGGCAATTGAAAGCCT TTCTGACCATGatttGCACCAAGCTGTGTTATCAAAAGAAGAGATGACGG TTTTCCAAGTCAGTGGTGCTCTTCAATCGCACGAGAGTTACATCCGCATC ATGACAGCCATCAATCATGCCGGACTTGAGCTCTACTTCAAAGCGTTCCA TCACAGGGACGAACTACCCGGTGGTCTTGGTCTTCCAACAGAACCGGAAA AACTTTACAAGCATCTACAAAAACATCAATCAGAATTTGACGACCTTCGC TCCAAAGGACAAATCACTGAAAGAGAGTATCTAACCATTTTCCCAGCTGG CAAGAAAGAGACTTATTCTCAGGAATTCTCATTCCcgcttttccaaaaat tgttACAAATGTTTGACCGAGCAGGACTTGATGCGGAAACAGCAAACTCG GATGACGAGCGAAACGTATTTTTGCAAGAAATGTCGAAATTTGAATACAT ATTGAAAGATAAGAAACTGGTCAAAAAGATTAACAATTCTGATGAGACTT TCAATGAAATTTGGGATGACGTCATTCAGatcttgaaaaatgtcaaatat gatataacacgaatcgAATCCTTACGAACAAGCGATCTAgaagaaaataa taaattccGATTCGCTCTCTTAAAATCCGAAGTCAACGCTTTATTGTGGG AATGTGATGATTGTTTCAAGACTGTCAAAATGAACCATCTAGCCTTGGAT CGCCTCAAAGGGAACTTCCAGGCTGCACTCTCTGAAGTCAAAACAGAAAA TAACAACGCTAAAACAGCTAACGAGTTAAAAGAACTGAATACAGTCACAG ATGAActtcaaaaatctgaaaataaaatcatGGTTCAAAAACAACAGCTA AACGAAATTGTTCCAAAtattaaattttggcgggaaaagAACATTGaagg tgacgtcatcatttgtgACGAGAACATTTCGAAATTGAGACATGAAGTAA ATGAACAGACCAGACGAGTCGGTGATTTGTTCAACACCGTATCTTTCGAT ATCATTCACCTGAAGGAGCGAGCATACAGTGCGACTGGAGAAGCTAAAAA CATCGGACTTCCTTTACATAAATCGCATTGAGTTTTGCGActgtttcaga tttttttttttgtacataTTATTAAGGTCTATTATctttatatttattat tttaatgcaagttttatttttaatttgttctagGTCTTTCAATTGATTAT TCCGAAATTGATGCTGAATATTTTGGGAACTTTTTTGGATTGACCGGTTG AACCTTTAGTCTTTTGCTTTAttgatttcagaaaaaaataaaagatagaG AATTTTGTATAGATTTCACTGGCGTGTCATTTCATTGAGTTACTTTAAAC AACACTTCTacgcgtttttttttattagaacctagtttataagaacatat aggctgaaattcgtcgaaaaattaagaacatcttaagaacatgcccagcc tcagtttggaaaaaaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000051:108262..125739- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00005188 ID=TCONS_00005188|Name=TCONS_00005188|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17478bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000051:108262..125739- (Clytia hemisphaerica) CAGAGTAAACAAAATCAAAATTAAAAGAACTGAAGCTAGATGAAACGAAA
ATGGAGCAATGTTATCCCATGTTCACTATCCAAATATTTCACGAAGAAAG
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CACAAATTCTCTTCTTACTCGAAAAAAAGCAAAAGAACAAATGAATAAAA
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TGTTTTGCTTGCTTGCACTCCACCCTACAGCTTCATTCATTGAAAACAAT
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CTTCAAAGACTCTTGTTTGTTAAGCAAAAAAAACGTGTTTGATTTACTTA
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ATGTTTTCGTATACTAATGAAAAATATCTGGTAAAAGTCTTGTATTACAG
TTTGGTGAAACTCTATCGTTTTACGAATTCATGTCTTTCGTGGAAGTTTT
GTGTTTCATTAGCTAGGAAAGAAATCTGTTGGTCACTGAGTAGGGAAAAT
GCAAAAAACTCGGTATTCGCTGAGACGAGGTACAGTAACGATTTCGACTA
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CTGTCTGTCTGTTTGAGCTTAAAAGTCTGGATCGTCGGTAGAGATACTAA
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CTGAGCCTGGATGTGCTTATTTTTTTATCAATTTTCAGCCTAGAATGTTC
TTAAATGCGTTCTTAATTTTTCAGACTACTCTAAATCGACAATATGATAC
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCCAAACT
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TATATGTTCTTATAAACTAGGTTCTAATAAAAAAAAAAACGTGTAAATCT
TTCAGATGCTGATTCAGCTTTATCAATGGTTGCCATAGTAACACATTGAT
GACGTCATTATACAAGTTGATTTATGAGAGAATTTTAGTTTAAATATTTA
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CTGGCTTTTCGTGGAAGCACCTGAAAGATTTCGAGATAGAGTCGTTTGCT
GGGAGTGTTATATAGAATAATTGAGAGCGAAGCATCGAGGGTATGTTCAC
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CTATAGAAGTATATTGCGCTCTTGATGATATCGTGTTGTTATGAATGAAC
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TTTTATAATAGAGCAAACTATACGAGAACATAAGGCTTTGTGGACTCAAA
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TTCTTGTATAAACAGGACAATACTTCAAAGTTAATTACTTCCACCTTCGA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00005188-exon-sc0000051-1575043694:125425..125739 | TCONS_00005188-exon-sc0000051-1575043694:125425..125739 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000051 | supercontig | sc0000051:108262..125739 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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