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transcript sequence >TCONS_00051410 ID=TCONS_00051410|Name=TCONS_00051410|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2972bp gaaaatatcacaAGGTGAAAGCTAACTTAAGTAAAGAATGTCACGTAGAC CACGTCCAAAATCTGCAATTTTTGGTAGTAAATATCCTTCACGGCGTTCT TTCATTGAAGATTTGATCGACAGTGAAGATGAAGAATtggaggaagaaga agaagatggacAGAAGAATATCACAATGAAAGACAAAGATGAGatGCTTC AAGAACTGAAGAAAGAGAATTTCGACCTCAAACTTCGTCTGTATATGACG CAGAAGAACAGCGAGAATGCTGAAGGGAAGGTGGGAGAATACGAACAGCA ATTGGCTGCACTCTTAAACAGTCTTGAAGAACAACAACGACTCTCCGATC AACAAACTAGAGACTTAGAAGAATCGAGACAGCGCGAACGACAGTTGTTG AACGATCAAAAGAAAATGGAGGTCACTATGAAAGAGCAGGATGAACAAAT ACACAACCTCTCTCTCAACCTTTCACAAGTTTCCAAAAGTATGCATAATA TCTCATTAAGTAACAAACCAACACATCAATCAACGCCCGTTAGAACTGCA ACGTCAGCATATTTCCATTCCGCCCACCACCATGGCAATGACGGCGATGG AGGTGCAGCGAGCGGGAGTGAATCGGGCGATCACGACACGTCCGCCACAA TACGCCATATAAACCACATGAATATTTCACACGTAGCGCCCATGCAGCGC GAACCTCAAGTCGCTTCATCGGTTCCACAAGGCGACCGCTCGCATCTCCT CGACAACGACCAAGGCTCGAATACGAGTTACACGGAAGGCAATAAATATT TAACAAAGAACTACCATTATCATAACGATAACGATAATCGGACTATTAAC CTCCCGGAAGGACCCCCGGATATCGTCGGTGTAGTCCGACCAAATAATAC AAGGACAGTAGTTGACGTGGAAATACCACCGGAACCGATACAAGAAAAAC CGATaccgaaaaagaagaaaaagggtATTATGAAGGTGTTTAAACTTTGT ACAGGGAAGTCCGGACAAGCTAAAGAGTACGCTAAGGATGATATGTATGT TAAACGAGAACCGGTCAAAGTGACTATGAATACATATTCTAATGAAACAT GTAGTTAAGTAAGGAATATTTGTTCGTGGTTATTGATCAAAGATGCTTGA ATCTTCAATTCGAAAGAATGTCGAGCTCTCCTTCTAAAGATGGATTTGGA GAGGGCGTTAGTTGGAGTATTTTGATTATTCTGATATAGATTTTGACCTT TTGAAAGGGTATCATTAACAGACAACTCGTATCTTCGAATGATTTTCTCA TATGTTTAATCCATTGAGTTTACTGACGTGACTCACTCTATTGGAGCTTC ATGTGTTTAGTTTCTTAAAGCAATGATCTCTTcttcttattttcaaataa agcagacATCGCGCGGACAAAAAGTTACAGTTCTTTGTGATAATAATATC AGTTGTGATAATAATATGGTACATGGcgacaaaaaggaaaattttttata atgGTTGAAATTTATGATTTGACGGTGATAGAAGTCTGGTAACGAGGCTT CTTTTCCCGTTCGCTGATTGGTTGGttgttcattattttttattgtttta tttttaagaactTTTGTGTTGGTTGATTGTAATTACCTTAACGGCCCTAT TTCACGCTGGTCGTTATTATGCCAAAGCTCAATTTTTCTATGATTAGGCC GGCCTTTATTTAATTCTAATCCTGTACACCGGCCCTTGTTACGACAACGA TGAAAAAATAACGTTAATAAGGTCTGGCATAAAAAAGTCAGATAAGTTAT TAGTTGTAGTCTGTTCATTATCATTCGGATAATAGTTAACAACTTTTAAG AAGTAGCAAAACcaccattgaaaaaaaaatatgatagCGGACTATATATA TGATTATAAATTAAGCCCCATTTACATACAAACATTGTATAATAATGTAA CCGATAGGGCCAAAGGTGGCCGGTAGGTGTTGACCGTACTACTGGCACTC GGCCCCATTTTAAGAATTAGCAACCTTTAAAGATTACTCTTGGGCGGAAG AGTCTATACTGAATCTCTTTGAAATGAAATAGTGTCACGAATTTTAAACT GATGCTTAGACCAAGTCCACGCCCAAAACGTAACCCATTATTTTAATTGT TAACAATCATGTCGATGTTTTAGAgagataatttattttttagaatattt ttttttcgttattttatGATGAATTTTATGGCATACCTTTGCAAGCAAAC ttggaaacatttttttttatttttcaaaactttgataaAATCTTATAATG TAGCCCTTATATATTCTTTTActgatgatgtaatgttttattttgtttta aatttcaatcCTCTATTTTAATAcaaacctttattatttttatatcaTAT TCCACAGCTGCCGCTTCTCCCACAACCAGTAATCTTGTAGTAAATTAGTA AGTTACCAGTAAATTACCTAATTTTTAGcgaaaactaattttggcgaaaa ctatttttttgagagctttagaaaaaaattatgagttcTCCTACCTAGAA AATCATACTTAATTTCGGCGAGGCGatattttttgctaattttgacGAAA TTTGGTGAATTTTACCAAATTTGCAAAGATAAGTTCCCGCTAAAATCAGT TCCATTAAAGGTATTCaaaagattattttgaaattccttTATATCTTTAA GAATTCTTGAATGATGctctgaaaaattttcttattcttCAGGAAATCCC AAAACACACTTAGTATAACTGAGTTCCCCAAAAATGAATTCTCTGAAGCA AATGTATAACTTACCCTAGTTTTTAATTTGCTAGCTCGGATAattttctt tagttttattGAATAAAGGTGTATATATCTCAATAGCGGTGCCTTGTATC ATAGACTTTTATATTCGTTTTAAAACAACAAATAACAAATCAATTTGAAT TGTATACAATATAATTACCGTC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_201:390596..412447- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00051410 ID=TCONS_00051410|Name=TCONS_00051410|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21852bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_201:390596..412447- (Clytia hemisphaerica) GAAAATATCACAAGGTGAAAGCTAACTTAAGTAAAGAATGTCACGTAGAC
CACGTCCAAAATCTGCAATTTTTGGTAGTAAATATCCTTCACGGCGTTCT
TTCATTGAAGATTTGATCGACAGTGAAGATGAAGAATTGGAGGAAGAAGA
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CCTTTTTAATCGCTCAACTAAAATGTTATTGTTAAGATTGTATTTGAATT
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TTCACGTGTATTGGGCTTTTTAAATCCCTACTAAAATTCAGAATTCCAGA
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TTTTTTTGTGTGTTGAGGAACCCATATATTTCTTATCACTATATTCTCTT
GTGTGTTTTAATTTTGATGTTTTTTGTTTTTTGTTGTAGGGCAAATTCAG
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GGGCCGTTAGTGATCTAGGTCTTTTTGATAGATTCAGTATTATAATTTCC
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TTATGGTGTGTTTGTAATTTTGTGTCTGTTATTTATGAACTAGACTCCCC
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TTGGAATTTCCTTACTAATTATTTTAACTTATCAAATGATTCAGCATTAT
TGAAAATATTAATATGAACTAATAAATACAATCACACAGTATATTGAAGA
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TTCAAATTTGTTTTATCGTTTTGTTTTATACTTTCCTTCTAACATAGGTA
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TCAGTTTAAGATTTATTCGGTCAAAAAATTATAATAATTTCATATTCTAT
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TGGCTATCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAACA
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CGATTAAAAATGGCGGTCAAAAGAGTAAACCAATTCTCAGGTTCATTGAC
TTCATAAATAAACCTGTTTGCATAAGATTTTTTTATCTGTAGTATTGTAG
GTAAAACTATCTGACGGTTTGATGAACCTGCTTCTCGAAATCTTGAGAAT
TTTTAATTTTCACTCGGAAATTTTGCCGATTTAATGTAGTTTAAAGTAGG
CTCATCTTTAGCAGGCTGTACATTGAACTGTAGGTCACACGTCTTGCTAG
GGCGAGAGCTTGCTTGCTTGCCTACTCAATTTTCGCAGCATTTCATGAAA
GTCTTTGCCTTGCAATATGTTGCTTCATTTGNGAATTATTTTTTGTTTTT
TTGTGTGTTGAGGAACCCATATATTTCTTATCACTATATTCTCTTGTGTG
TTTTGATTTTGATGTTATTTTTTTGTAGGGAAAATTCAGTATGATGATAA
TTGTGTTGTGTGTAAGAGAGAAATTTAAAGGGACCTTTCATTTTGTTTGT
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ATAACCCTGATTTAAAGGTTTTGACTTCGTCCCCAGGAAGAGGCTAAGAG
GTTCTTTCTAGCAAACAAAGCCAAAGATGGGAACGGGTTTTGAGTCTTTT
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TGAATGGAAAGCTTAAAAGTTCAAAACTATGATTAAATTTTGAGGGTTTT
TGTTTTCATAACATTTTCTTTCTCCGGATCCCTTTAAAAATGTCAGCTGA
TTGGGTTTTGGCAGTAGTAAATAGTTTCTCTTAAGTTTATGGTGTGTTTG
TAATTTTGTGTCTGTTATTTATGAACTAGACTCCCCTAGTAGAGGGTACA
TCAGAACGGTGAACCAATATTTTCTGAGCCCTTTTTTTGGAATTTCCTTA
CTAATTATTTTAACTTATCAAATGATTCAGCATTATTGAAAATATTAATA
TGAACTAATAAATACAATCACACAGTATATTGAAGATGTCGCAAACATTG
CCCCGAAACCGTACGGCGCCCCGCAGCGGCAGCCTTTCTCGTGAATTTAC
CATGGGAACTTTACAGAGATCAGGAACACTTTCACGAGGGGAAAGTATCG
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GCTGTACATTGAACTGTAGGTCACACGTCTTGCTAGGGCGAGAGCTTGCT
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ATATGTTGCTTCATTTGTGTTGAAAACTNTGTTATGTCGTCAGTTTAAGA
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TCTTTGATATATGGCCTTTTACACAGTACCTATTTCGTTCTTGAAAATTG
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CCCTTGGATGTTTTTAACTTTTTCTGTATTAAGCCTAAAAATATTCTTAA
CATGTTCTTATTTTCACCATTTTTGACCATTTTCCTAAGAAAAAGAGTGT
TTTAGAGTCCTCAAAGTCTTTAAAATGTTCATTACATTGTGGCTATCGAA
GCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAACATTTAGACCTTG
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TGACGGTTTGATGAACCTGCTTCTCGAAATCTTGAGAATTTTTAATTTTC
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GCTTGCTTGCCTACTCAATTTTTACAGCATTTCATGAAAGTCTTTGGCTT
GCAATATGTTGCTTCATTTTTGTTGAAAACTGACTCGAAATTTCACAAAG
AGTGAGTAATGAAGTCCATTACATACTTGTGAATCGTTGTTAATTCACAC
CTTTTGATTGGTTGTTATGACAATCACGAGAACGAGGCTATATTCATCAA
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ATAAAGGAGAACAAATTTCAAGTGTGGTTTTTTCATCTTCTCACTTTTCA
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TTTAAACAGACTTTCTGTTTGTAAAAAAGTTGATATTTTTTGACGTTGCC
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ACTGAAGAAAGAGAATTTCGACCTCAAACTTCGTCTGTATATGACGCAGA
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TGAATAAGCGGGGAGTTGGAAAAAATCTCAAAACTTAATAAGCGGGGGGT
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GCCCAATTAAATCGAAAACAACAAAATCGGTTAAAATTTAAATGTACAAA
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CTTTGGCTTGAAACTCAATGAGCATTCCATATGAATATTAATTTAGCTCT
CTTTTCATTGGTAGAATGCTGAAGGGAAGGTGGGAGAATACGAACAGCAA
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ACAAACTAGAGACTTAGAAGAATCGAGACAGCGCGAACGACAGTTGTTGA
ACGATCAAAAGAAAATGGAGGTCACTATGAAAGAGCAGGATGAACAAATA
CACAACCTCTCTCTCAACCTTTCACAAGTTTCCAAAAGTATGCATAATAT
CTCATTAAGTAACAAACCAACACATCAATCAACGCCCGTTAGAACTGCAA
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TC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_201 | supercontig | scaffold_201:390596..412447 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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