TCONS_00004566 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00004566
Unique Name	TCONS_00004566
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1771

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000045:648923..663514-

transcript sequence

>TCONS_00004566 ID=TCONS_00004566|Name=TCONS_00004566|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1771bp
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CAACTTTTCAAGTAGAGACATAGCTAGATGTCCTATTATACAGATATGCG
ACAAAGACTTTGGCAGaCGCAGAACCCATCGTGGTCGTTCGACATTTCAC
CTCACGCTTCGAAACCGCCTCACCTTTCACACTCGTCCGCGCTTCCAATG
ACACACGCAGACCCTttgaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaa
caacaacaacaacatcaatAATAACCATCACCATCATCAACTCGATTCAG
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aaaacaaaagaaacgagggatttttcccaaaatggcCACCAATATCATGA
AAGCTTGGTTATTTCAACATTTAAATcaTCCATACCCCTCAGAAGAACAA
AAACGTCAACTGGCAAATGAAACTGGTCTTACCATACTTCAAGTTAATAA
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CAAACCGGGCAGGTAAATCACCGGTTGTCACAGTATATAAATCACGTAAA
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ACCAATGGGTGGCCATTATTCGGCGCCATATTTAAACGAACATTACTCTG
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CCGCATGCGCACTACAGTCCAAGGTCGTACGGGTGTGGCGCATCTGATCA
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CCTACTCCACAGTCTCCCTTCTTAGGGCACACACATCCTTCAATGATGCC
ACCGTCTACGAATACGCCCAACCTTCATGGTTACCACCAGACACACCCAG
CATCTTATCCGCCCCCTCCGCCTCACCAATACACGCCCCACGAAGAACTC
ACGCCCCATACCGTTCATAGTGTTATGAATATGCATAATATATAACACTT
GCCTCCCTTCTTTCTCCCTTATTACGATATAAATAGTTTTcaccattaat
tttttctgtgtGTTGTTTTTTATactattttttaagaaattttatgTTGC
TGTTATATTAAATAAATCATAGTTCATTCTCCTTAGGGCCATGTAATGGT
CTggagaattttttaaaagaaattttaaccattttgttagataaaaaaaa
gttaaaagcggTCGTTAATATATGTTTTctataatatttttaacctaacT
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GAAGCTATTTCTAATGGATTCCTTTTGAAAATGCAATCGTTTGatgtatt
ttgagttttttaaattctaatttttcttaaaattccaGTTGCTTTTCTGT
CTTAActttaaattaattaaaaagtgcttaatatttattttatattattt
cgcttgattttttaaagaaaatacttttttctgcttttagaaatttttga
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ttttaccaTATTTTAATTAAAAGCAAGAACTTTAGTTCTTACCTTATTAT
atgagaaaatttgaaatagaa

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000045:648923..663514-

Legend: exon

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>TCONS_00004566 ID=TCONS_00004566|Name=TCONS_00004566|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14592bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000045:648923..663514- (Clytia hemisphaerica)
CTTAACTTCAAAAATTTGACTTGTGGCAATATCACTTTTCATCTTCAAGA
CAACTTTTCAAGTAGAGACATAGCTAGATGTCCTATTATACAGATATGCG
ACAAAGACTTTGGCAGGTATAAATCATTTTTATCGCTAAAAGGTTCTCGT
TTGATGGATATTTTAGGTTCGAACCTTCATATAGTGCTAAAATCCTGAAT
CATTAATTCACGAAGGTTAGAATTATTGAAAGATTTTCCATTTTGATCAA
AAGTAGGTCTTTATTTTATCAGTTGTTGATGATTAGGAAAACCTTTTGGG
TGAATTTGAAATTTAGGAATTTTTAACGAAATATTGAAGTTATAGATTAC
CATCTGTCTCTCTACAAAGGGTTGGTTGAGATAGTTAAAAATGTTCAGGA
CTGCCTCTTTCATTATTCCCCTGACATTAATCCTTAAACCTAATCTATTT
CACGTCTGTTTTCCAACAAAAGAAGGACGTCAGCTTAACGTCTTAGCATG
GTTTGATCTATACAAAATGAACATGCAGAACAATTTAACTTAAAGAAAAG
AAAAATTTCTAAAATAAAGTTTTTGACCCTTTTTTTTGTTTTAATCAAAA
TGCGTGGAAATTAGAATGACTTTTAACGAGGGATACAGGTTTCTATTACT
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AAAGAGAAATGATGAGTTTTAAGTATTTTGAATTTCCAATATGGTGGAGA
CTTTTGGTTTGTTGTTAAATTGATTCGAAGGTGTGATAAAATTGATGACA
GTTATCAATGTCTGATCATGAAGATAATATACAATGCTTTATTGTTATTA
AAACAATGCGTCTATTATTTAGTTTTTATTGTTCTTCTTCGTTAGTTTTT
TATCGTTTATCACCTTTTCCTTTTCACTTAATCCACAAAAAAAGAAGAAA
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TTTATTATGTCTTCAATCTTCTTTCACTCAAAATTGTCAGGTATCTTTTC
AAATTCTGAAGACTAAAATTTCACTAAAGTGATTAACATCATAATCAGGG
TGTTTGATCGTGTTACTCCTCCTAGTATTTTGTTGTTGATCCCTCTGGGA
AATTTTTGGTGTATTATCTGAAAGATTTATCTTGTGTGGACTGCCTGTCA
CCGTTTTAACGTAAAATGAAATTGTTTTGTCATAAGCCTTGATGATGAAA
AGCGATAAGGGACTTGAATGTCGTACAAGGAAAAAAATGTTACTCTAAAG
TATTGTATTATTTTTGTTTAACATCATTGGGCTATTGGTCAGTAAAATGA
GGTGGAAAATCCAGGGTGGTCAGTAAAACGAGGTCGAAAATCCAAGGCGG
TACAAAAAAAGAGAAAAACAATCGAAGGACCCCCTTTGACCCCCCCCCTG
ACAAATTGAAATAAAATCCAGGGTAAACATAGGGGGTACAAATCTTTCGG
GAATTATTTAAATCGTTTCAAAATTTCAATTCGTGAATGTGTAGAACTAT
CATTTTAAGGTTGCCAAGGTCAAAAAAATTTCTTTAAACGTTTTTTTTCA
CGAGAGAAAAAAATCTGGGCAGATTCTTCAGATCGATGCCAACCTCATTA
TATTTGTTTTGCATTCTTGGATTTACCGCAATTTCAGAATCTTCTTCTTC
CCAGTAATGAAAGAAAAAAATTTTCACAGCAGGCATTTTTCAGTAAATGG
ATTTATGACATAATTTCACAAACCTTTCACTCAAAGAAATTTACAGCCAA
AGGTAAAAAGGAAAAAAGATGACTTTCTCTCCACCTTAATGATTTTAACA
TGGCTTCAAATTAGATTAGCGTTAAATTGATGACAGGGACGATTTTTTTC
TCGTTATTCTCTAACTTCTCCTTATATTCTTATAAAACTTTTCATGGTAT
GGAACATTTTTTAATTTCATTAATTGTTTAATTTAATCAATGTATTAATA
TTTATTACATCCCTTTTTTTACACTACCCACGCATCTGACCTTAAATTTT
TCATCCAGTTTTGAATCTTAAACTTTAGGAATTTTCAAATTCTGAATTAT
TTCATTTCAACTTCTGGCAATTGAATTTATGAAAGTTGATTTGCGTTAGG
TCTTCACCAATGTGAGTAGATGCGTTTCTTTAAGGATGGATTAAAATTTA
ATTTTGCAACTACAGTCGATTCTCTCTTATTCGAATTTTTCTGTAATTCG
AACTATGATATTGGTTCCTCAGCTGGAAAGTAGTTTAAATTACTCTTTGT
GATTAAAACCTTCCTCTAAATCTTTGAAGAATGACAACCGATGACAAGAA
ACTGATTTATAGGAATTTTGTTCAGAAATTGATTCCAAGGCACATTTGAG
ATGTGGTAAGATATAATCCTCAAGCTGGATTTGGGTAGCCAAAAAAAATG
AAAATGTCAGAGTTAATTAAGCGGTGGGTAGAAAAATGATTAAATTTCGA
GACATCCCCACCATATAGTAGTTTCTATAAATACGAAATAAAAAAAACTA
AATTTAATGATATTCGTCTGGTTGTTGTCATTATAAATTATTCTGAATGA
CCAATATAAAGATCATTTTCCATTTCCGGTGCTGGCCGAAAAAAAATCGC
CTCTTTGGTTTTTGGCTGACATTTGCTTTCTGATGCATACTCCAAATATC
TTAATTGTTCTTTGTGTGTTCGTGCGTCCGGATCAGAAGTCATTGAAGTT
CGTCGCGATATTGAATTTTTTGGAATAGAGTTTCACAAGGAAGATGAAGA
TATTATTTGGCTATCCAGTCTTAGAGGTAAATCTTTTGATCCCTTTTATC
TGGTCCTGGTTTTTATGTCCTTTTGTCATGATCTGACATAACCAATCACA
CTAGCTGTATCCAATTGCGGTATGTATTTACAACGATTTCTAGATTTTGA
ATACAGCAAGAGAGGTTTTGGCTACTATTATCGGGCGAATATGGTTCATT
ATTCAATATCTCGTTATCTATTTCTGAATAGATTAATACACCCACTTCTC
ACTGATCCGGTGGACCCCCTCCAAATGGAAAAATTTACCAAAATATGGTC
CCTTTTGAAAATTATATTTCAATTCTTGGCTGAAAGTAATCAAATAAACT
AATCATATCGGATCTGTGAGAAAAGGGTGTATTTTTTTGTATCTTACATT
TCTTAGAGCACTCTATCACACCTTTTCCTGTTAACCACGTGATCAATGTG
GTGATTTCTTTAAGTTTGAAATTTTCTGTCTTTCCTGGAGTTGTAGTAAA
AGTAGTTCGTTTTGGGTAGTAATTGTATAAGATATAGGAACTGGAATAGT
TTTAAAATTACACGCACCACAAAATTCAAACTTTGAGGTTTGAAAGTAAA
AAAAATCTACTGATTCTAAACATTCTGGTCTAGCAAGATTTCTAGGCCGA
ATGAAATACAATTTCGTAATTTTAAAAGAAATAAAATTGTTATTTTCGCC
TACGCTTTTTTATCAGGTACTTAACCGATGCAACGCCGCCCACGTAATTA
CTCAGCAAATTATTTTACTTTCCCCTTCTTCAATGCCAAGCAACCTTTCG
AAAGTTAAAATGTAATACGTATTTAATTTACAGTAAAGTACCTCTCCTGG
TCTTTCCAATGGAATTGACGTTTTCTTAATTTTTAATTATTTCTTATTCT
GGGGGAAAAGCTTTCTATAAATCAGTATTTCGACAATTGATTTAGAGATG
TGCATAGATTTTCAGACGCGGTATTAAACTGAATTTAAAAATTCCAATGA
CCTTTTTCAAAAAATAATTTCGAAATATTATGAAATATTTAACTTGAATT
ATTTTTTGTGCCAAAATCAATAAAACTTTCTTCAGCCAATAGATCTAAAA
TAAACAGAATTTGATCCTTTTTAGCGGTAATTTATCCGTTGAAGTGTTTT
GTCTGTAAAATATAAAAGCTCAAAAATTTAGGTCCGAAATTTTATATTTA
AATTGGGTTAGCCAATTTGTTCAAAAATTGCGTATACTCCATTTCAATAA
GAACCCTTTGTATCTGAAAAAAGTGTAATAAAATGCCATCATTTGATTGG
ATAATCATTTTGTAAACAATGCATATGATTGGTTGTCTGTTATCATTTAA
AATCCATCTCATTTTCCCGCCATTTCATCATTTGATACTTAGATAGTCAC
ACATGTGGTCGAGGCCTACTCATAATTTAATCATTTTTGACATTTTATAA
ACAAAGCGTTTAAGTTAATTGTAGATGAAATTTTTAAAAAGATCCTGCAG
ATAAAATTTTGATCACTGGCCTGCCACTGTATATTGATTTGTCATTGTTA
TTTGGTTACTTTTTGGAATCTCGATTGGTGATTGGTCAACCACAAGACAA
TAAATAGCAAGTTAACAAAATCGTTTTGTGGAAATTTGGGTCACGTTAAA
TTCACTTCTCATTGTATATGTCAGATGTCATTTCGCAATTGATTTGAAAG
AGTCACCAATGTATTACCACGGCAAAGAAAGCAAATATTGGGTAAATTGA
AGATGTATTATTGATTTACACGTTTTATTTTTTTATAAGAACAAACTATA
TAAGAACATAAGGCTTCGAGGCCCAAAAATTTAAGAACATTCTAAGAACA
TTCTAAGGCTTTGGAGACTTAAAAACATGCATTTTCTCAAGAAATTAGAT
CAAAATGCTCAAAAAATGCTGAAAATAAGAACATTTTAAGAACATTTTTA
GGCTTCAAATCCAAAAAACTAAGAACATCCGAAGGCTTCGAAAATTTTTG
ACGTTCTTATAAAAAAAAAAACGTGTAGCACCTTTTTTTACCCTCAAAAC
AAAGTAATGAAAGTGTAGAAAAAAATGAGACATTCTAAGTAATTAAAGGT
AAACATGGGGAATAAATTTGAGAAGTTGTCAATGTAAACGCGGGGTAGAG
ATTGACTTTTTGTCAGTTTTCTTTTTTTTCTGCCACTTTGTCAAGTTGTC
AACTTTCTTTTTTTTATTGTATTTGAAGGTCATCTTGTCTTGATTGATGT
CTTCCAAATGTCCCTTTCTTTGAATACGTTTTTCACTATGTACATTTTGC
TATTTTCTTCTACGTCAACTAGTTGCAGTGGCAGAGTGTTGTTACTTTCT
GTGTTCACATTGTTTTCATACCTAAACCTAAAGTCATTTTGTGAGTCATG
AACTGTATCGCAAATTAATTGTTTTTGGAGTTTTTTTTGGAAGAATAGTG
TTTTATTTTCTAATTCGAAACATGGTCGCAATGCTTGGATATAATTTTAA
GGTATTTATCATTTTTGCAATTTGAAATTTCGCTTCATGCTGGAAATTCC
TTAATCTTTCAAAATCAATATTGTTTTTTTTTTCAATAATACGCATCAGA
ACATCACCTAACATTTTATAATTCTGATATATTTCTTCCCTGCTAATCTA
ATGAAAATCCTCAGCGCTGCTACATCTTAGGTTCTGCAGTTTTCAAAATC
TTTTTTATCAAATTTCGTCATCGGTTGATTTAGTTGCAACATTTTGCCTT
GTTTTTTAATGGGGTGAAGAAATTACGAATGGTGGTTCTTAGGACTTTGG
CATTGTTGATAAAAAAATGTGTTTTGTTTATTTGTTTCTTTTCTCGAGTA
GAACCGTAGGAAATTGTTAAGAAGAGGTTGAGTTTATTTTTCTAACGCAT
CGAGTTCATCTCTACTTCACGAACTGCAGCAGTGTGGAATCATTTAATTT
GCCTTTCGTTACTTCGAGAGTGTGTAGCTGCAGTTAATAATTGACAATTT
TACGATAGTAGTTTGTTGTAATCAAAAAAAACATTTTTGGAGTCTGAGGC
TTAATTTGTAAGTTGTTCTCTGTTATACTAAACTATGATATTTAAATGTG
TACTTCTTCTGATTGGATTCAATTGACGTCATAACTCGGGTTTTTCATAA
CTCGGGTTTTCATAACTTGGGTTTTTTAACTCGGGTTTTCCAAGCCTCTT
TCAGTTCGGATTCAATTGATGTTGTGGTGCAATAATACAGATCTTGACAA
ATCCCAGCTACATTAAAGTAAAAGACCAGCACTGGCATTCCAGTCTACAA
TGTGCCGGATACCGATTCCATTGGAACCCTCAATACTTTCATATCTTAAT
CTCAACCTTCTCAATCATCTTTCAATCTGTTCATCAATGGGTTTGTTACT
CTGCTTGGCTGGTTGGATTTGGCTTTAGGTTTGTTGAAGTTGCTTGTCGA
ATAAATGATTCTGAGGGACCGAAAGATATCTGCAACATCTTCACATGAAA
ATTTGTTTGCCTGTTTACTTACTAAAAAAAAGCTTGAATAGAAAGAGCCC
TTAAGAATTCCTTAATTCATCATCAACTTCTAATGTTTTNTGTTTTCCTG
TTTACTTACTAAAAAAAAGCTTGAATAGAAAGAGCCCTTAAGAATTCCTT
AATTCATCATCAACTTCTAATGTTTTTTCCAAAACACTAATGACGTCATG
CTAAAGGGGCCTTTTCTCTATTATGAAAAACGTTAACCAAGTATGGTCAA
TAATTTTTCCTTGACTGGATAGGTAGTAAAATTGACTAAATCTAAACTGC
AACAGTTTAAAAATTTCAATTTGACTCTTCGCTGATTCAATCGAAGTGGA
ACGGGGATCTAATGTTTTTGAATTAAAAAAAGATTCGAATATTAGAATAA
AGCATTTTAAGAGGGTTCCCTTTGGCGCGGAATGAGGATTAGTTTGAATT
ATAGAAATATTCAAATACTAGAAGTTCAAATTAGCAAGATTGTACTGCAT
TCGTTGGTATGCTGCGTCTAGTTAATTCTAGGCCAATAAATGACTGTTTC
CTCAAGAAATGCAATACAAATCATTTTTCCAGCAATCTAGCAAGGAACCT
TGGCTTTTTTAAGGGTAAGAATGAGGGATAAGCTGACGAAAATAAGAATA
CAGTTAGAGTGCGAAAAGAAGGCCGTTATCCTTCTTTGTTGACAAAACAG
GAAACCATCTCTTTGTTCTTAACACCTTTCGTGTTACCTATATTTTTTTC
TCCTTTTTTTTGCGTTTATTTTGTTTGATACTTTGATCAGGTGCTTTTTC
GTGCCTTGACACGAGCTTTTCTGAGAATGATGATAGAACTTTCATATTTG
ATATTTGCTAAATGTTAGTCACCTGTGGAGTTTTCAATTACGTAAGGGTT
TGAGTTTTATTTTCCTTTTCTGATATAAAAATAATTTATAAAAACAATGA
GGCTCAAAAACGACCAAAAGTAAGAACAATTTTAGGGTCAAAGTAGTAAA
TATTAGGAAATTTTAGGTATAGAGTACCTCACTTTTGTTTTAAAAACAAG
AACAGGATAAGAACAATTTGAGGCTCAAGGTACAAGAAAAAAATAATCTT
CTGATTCCGCTCTGATAAAAAATTGGTTTATAACAAAAATTACCCAAATT
ATTTAAAGTGGTAAAGTTTTCGCCTCATTTAAGTCACTTAAAGCTAAGGC
TAAACAACACCTAAATTCTTCATTTTTTTATGAATCAAATTAATTGATTT
TTTATTGATTGGAAAAGACCTCGCGTGGAAAATAGCCCGTTTTCTTCCAC
AAATATGAAAGAAGCTTAGTCAGCGGTATTGGTCTTGGTGTCCCAGCTCT
CGGAAATAGCCTCTCATGGAATTGTTGACTCTTCAACCGCAGCACTTCCT
TCACAAAGGCTTGCAAATACATGCATACAACAAAGCAAGTAAAAATTTGC
GGCTCAAGCACTTTGTCTTATATTATATCACAGTGGTGTGCGAAGTCTAA
CAGGTTGGACCATTATTTCATGATATTCACCTTTATCTGGTATCGTTATT
TTTCACCTATTTTCCTCAACTTTGAATGTCTTTCAGGCCTCCTCTTATAT
ACCGTGAAGCTTCATTCAAAAAAGTTGGAGTTAGACTTAAATTCGCTTAT
TTTTTGAGTTGTTATAAAAGCATTTTAAGACTCTCTCGTGAAAGAATTCA
ATTTGCTTGACCCTTGACCTAAGCTACTAAGCAACTATGGGATATCGTGC
CAAGAGGAATTTTATGACTCCTTTCTCAAAGACCACCCTATGCTTATAGA
TACAATAAGTAGGAGAGAAATTTGTTCAATTTTAGAGGAAGGATCTGAAA
AATTCGAATGAACCTTCAAGTCATTAAGTGATTTTATTGTTATTTTTGTC
TAAATATAGTTATTACCTGTTTCTAATCCGGATTCGAAATGAACCTCATC
AAAATGCAAATATCCCCAGTTACTCGAGGAAGTTTGCAACTTTTTATTGT
TATTGATTTTGACTTTAAAAAACCGCAAAATTTGTTTAGGAAACGGGAGA
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TATCTTCTCTAAAGGCCGGTAATTTTCTAAAACATTATGCGGTTTAAGGC
ATTGTTTCCACTTCAAAATAAAAGCAATTTTTTTGTTTTCTTATTAAACA
TACTTGTATTATAGTTATAAAACTTTTAGGGTATCGCAGTCTTTCAAGAA
ACTTTTAACATTTACATTTTTTGTTTTATCCTTTGGGCATCAGGATATTG
GTTAAATGGTTTCATTGGGTTTTTAGGGAAGTAATTTGATTAATATAGCG
TTTGGTGATCTTGAATATTTATAAGGAGGAGCAAAAGAGATTTTTGTTTC
ATTCAATTGAAAGGGTTTGTTCGTGTTTTCCCACTCACAATAAAAGGTAA
AAAATTTCTTGACAGGTCCCATCAAACATAAGATCCCTTGGTATTATTTC
AAATGACAGAATTATGACAAAGTGGTTTTTGAACTTGATGGTTTAGACTG
AAAGTGCCTAGAAGCTGTTTTAACCATTGATTGGACTTATTTTTCTTAGA
ATTTAATGTTTCAGATTTAATTTCATAATCTTTTGGAATTTTTCCTGGTT
CCATTTTTTCTTGGCAAGGTTGAATTTTTTGAGAACTCTTCCTGAAGTAT
ATAACAATATAATTAGGTACAATAGGCACAGAAGAAGGTTGAAATGAACT
TGTCTCAATGTAATTTAGGTATAAACCATCCCTGTATTTCGCTTAGTTCG
CCAGCTCTCATTAAGAAGACCGGTTGAAGTACAGTACCACTAGTTGCAAT
TAAATCAACCGAAGTCGTTAGAAATCAAAAGTTCAATCACAACGACCCTA
CCATTGGTGGATATACTTAAAGAGCGTGTAAATATTGAATTACTTTTATT
TTATTCAGACGCAGAACCCATCGTGGTCGTTCGACATTTCACCTCACGCT
TCGAAACCGCCTCACCTTTCACACTCGTCCGCGCTTCCAATGACACACGC
AGACCCTTTGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACA
ACAACATCAATAATAACCATCACCATCATCAACTCGATTCAGTGCCAGGT
GAAACAGGTAAATAGTTTTCTCTTTATTCACTTACATGAACTGAACCTTG
AGGAGTGGAGACCATCAAATGTGGTGGATCTCTGAAGTTTCAAAATTTAT
GACGAAGGGTGTTTCTTTTATCCATACTCCTTATAAGGAAATAACACTCT
CCCTCATAAAATCTGAAGCCTCCTTCGATCAGCAACTGTGATCTATAATG
TTTCCCGCCCGTCCACCTACGCCACAAAACGCCATAAGAACCGTTTCTAA
CCGTTTCTGTATATCGTCAATGGAATGTTTTTTGAACATTGAAGCTAGTC
GGCTCAAATCCACACTTTTTCGATATTCATTCAATCGATAATCAATCAAT
GGACATCAGACGATTGTATGTAAATCACCTTAGGTAGGAATCTCGTTGGC
ACCTGCTTCAGTCTGATGGGGAAATTTAACATTAAAATAAAAGATGAGCT
TGGAGATTGATTCTCTGGTGGCGAAAGTGAGTAAACCATCGCACGCAGGT
TCATCTGTAGTTGTGCTCAGAACTAATTCAATTTGATCGTTGAGAATGAA
TAGTCTCCATTCACTAAACGAATGGCAACAGTCACGCGATGGGTGCGCTA
AAAATTATCAGCATGATCAGAGCTTCGAAATCAGAATGTATATTCATCAA
TTCAATTTGTTCTTTGTTAACAATCTAATAATCTATACTTATGATGGCCA
AAGACTACACGTTTTTTATAAAAACAAACTAAAGAACACGAGGCTTTGAC
AGCAAAAATATTAAGAACAACTTGAAAATATGTTGAGGTTTTGCCAGGAG
TTTTGCGGAACCTTGAACACCCGATTTCTTAGGAAAATAGCCAATGTGGT
AAAAATATGAATATGTTAAGAAAATCTTTTGGCTTAAAACGCAAAAATCA
AAATCCGTAGGCTTTAAAAATTTTGGATGTTCTTAAAAAAATGTGTATTT
GAAGAACGGACCTATCCCAATCTAAGACCACACCCATGTTCAAAAAATGT
TTTCCTCCAGGAGTATTTATCGAAGATTTGTTTAGATGTGATAGCTGATA
ATAATTCATCATTCATTTATTTCGAAAGTTTTGACACTAATATCAAGTGA
TCACCTTGAGCTGCTTGATTGATTACAATCTATCCCTCTTTCTTTATTTT
CTAATCCATGAACAGGAGGATTTGGAATCCTATCAAATTAATATTTTTTT
TTACTTTTCCCGACATTAAGTAGTTTTGATCCGGCGACAACCTATTTTTT
CTTCTCCAGCCAAAGTTCATAATATCTGGAATGGGTTAATTTTTTACAAT
AAAAGTGGACGCTGAAATTTGACCCAGTGAATTGATAAATATACAACAGT
AATATGCGTTTTTTTTTTTATAAGTACGTCAAAAATTTTCGAAGCCTTCG
GATGTTCTTAGTTTTTTAGATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTATAATGTT
CTTATTTTCAGCATTTTTTGAGCATTTTGATGTAATTTCTTAAGAAAATG
CATGTTTTTAAGTCTCCAAAGCCTTAGAATGTTCTTAGGTTGTTCTTAAA
TTTTTGGGCCTCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAA
AAAAACGTGTATGCTTCTAGCTATACCAGCCTTGTTAATCTAATATGATT
ACACCATTACACAATTTTAAGATATTAGATTACAATGGACAATCAATACC
CATTTTCGATGAATTTGTAGGACAATAGAATTGTTCTCAAAGAGTGCTTA
ATTAAGCTCTTCATTTGATAGCGTGAAATTGTAACCTACTACAAGTCCCC
GTAATTGAATTTATAAGCCACACTTTCCTGTCACAGTTTCAAACAGATTC
CATTTTAAATGATTGAAATGTCTACTAAAGACGGCGTGTGAATGAATGGA
AGGTTGGTTTTCTGTGGAAGTTTTTTAGAGGAAGAATTTTCTTTTGAAAT
TTTGCTTGTGATGAAAGGCATTCAAGCGTGTGAAGTATTTCTTTCAAAAG
TGTCAAAAAGTTTATTCGTTTCTTGTCTTCAGGCTGTAAATGTTATCAGT
TTTTCAATCAAAATTTCTGTTTGGTTCAAATATGGTTCAATCAACATATT
TTTGGTTCAAGCAGTAATTTTTAGAAACTATTTTTGTAACAAGGTTTATG
TTATAGTTAGTGTAATAATTCGTAAACAAATGTTCTTCGCTATACAGCTG
GTGCGAAAATTTTCGAACATCCTGTCGTAAACTTGTCATATCGAAATTGC
TCGTAGCTATTCAAACAGTGTGAAAAGTGTCGAAATTTCATGTCGAAAAT
AAACTTGTCTAGGGATTATCTGTCATTTGCTAATTATTTTTTTGGTAAAT
TTTTTTAACATCTGTTTACGGTAAGTGGCATTTCTTGTCGTGAAAAACTG
ACAAATAAATTTTTTAGATGATACCAAAATAAAATTATTTTGTGAATTTC
ATTGATGGTTAGCTATATGGGCTCTTGGTTTTCTTGTAAATTTTGTAGAA
GAGTTTTTGGGTAGAAATCGCAAGTTTAACCATCATGGGAGAGAAAGATG
TTTATTGTATTGATAAAACTATGGCTGTACTGTATAACATTATAATGTCA
TTGATAGATTGCAGGTTTGTTAGCTTTGAAAATCGGAATGTGTCTTTTGT
AGATGTTCTAAAAGAAGTTGGCGTGAAAAATTACGGAGAATATACGTGAA
TGTATTTTTGGTCTAAAATGTGAAGTTACAGTGATGGTAAATAGCCAAGC
CTGGCTATTTCAAACGAAGATGTGTTGATGAGACCTCGACCAGTAATCAC
GTGGTCAAATTTCGCCGTTAGATTTCTGTTGACCCTAAAATTGCACACTT
TTTATGAAAAAAATTCTATATGGAGATTGAGAAAAGTCACGATAAGAAAA
TTTATAAAATGTAACCCAAAGGAATTATTATCTTCGGTAATTAAAAAACG
AATTTATTCTTCTTTCACCAGATTTGAACAGTGCTGTATCATCAGAAACG
ATGCCAGATTCCGAAGATTCCATTTTCAAAGATGACGAAGATGAGAAAGA
CAAAAGAAAACAAAAGAAACGAGGGATTTTTCCCAAAATGGCCACCAATA
TCATGAAAGCTTGGTTATTTCAACATTTAAATGTAAGCAGTATATTCAAT
ATCTCATTTAGGCTTTGCGAAATTGAATACGATTGTAATTTTCAAAACCA
CTCTTGTTTGAGTTGATTCTACTCACATGTTACCTACTTAGGCTCATTAG
TTTGGACTCCCACAGTAATAATGTAATAACTAAATTGATGCCTAAGCAGA
TTATTCACGTTAAAGTGTTACCCCATCTATCAATGCATTCATGAACCTAT
CTGCCGCATCTGTAACTGAAACTTTTATGAATATTTAACACTTCTTTTTT
TTCTAGCATCCATACCCCTCAGAAGAACAAAAACGTCAACTGGCAAATGA
AACTGGTCTTACCATACTTCAAGTTAATAATTGGTATGTTTTCCAACAAT
CTTTTAACAACCTGGCTATTCGTAAACGATAGACAGTATTCCGGTTCTAG
AAGGCTGCCCTGTCCGTAGACGTCAAATTTCATTTTTTTACCTTGCGCTG
TAATTTTACATAAAACTATTTGTTTTTTTTTTAGATTGACGATGTGCTCA
AGCGCTAAACATTGAATTTCAAAAATTTTCATCATCTGTTGAAACTATAG
TCCCCGATCAATACTTTTCTTTTCCCTTTTCAGAAAAGCTTATCATCGTC
AATATTTTTTCATATTTCATGTAGGTTTATCAATGCAAGGCGGCGTATCG
TCCAACCCATGATCGATGCATCAAACCGGGCAGGTAAATCACCGGTTGTC
ACAGTATATAAATCACGTAAACGTAAAAATTCGGGATCGGACAGTATTTC
ACCAGGACCTTTTCCCTATCCACCAATGGGTGGCCATTATTCGGCGCCAT
ATTTAAACGAACATTACTCTGGGATGTATTCACAATACCATAATGACATC
ACAGGAGCTTCAACGACTACACCGCATGCGCACTACAGTCCAAGGTCGTA
CGGGTGTGGCGCATCTGATCAACATTCGATGGGTGTCTCTCTACCTCCAC
AAACCAGCTGTGCTCCTATGAGACAGCATTCTTCATCTTCTTATGGAACT
TATAGGACCTCCCCGGTCCCTCCTACTCCACAGTCTCCCTTCTTAGGGCA
CACACATCCTTCAATGATGCCACCGTCTACGAATACGCCCAACCTTCATG
GTTACCACCAGACACACCCAGCATCTTATCCGCCCCCTCCGCCTCACCAA
TACACGCCCCACGAAGAACTCACGCCCCATACCGTTCATAGTGTTATGAA
TATGCATAATATATAACACTTGCCTCCCTTCTTTCTCCCTTATTACGATA
TAAATAGTTTTCACCATTAATTTTTTCTGTGTGTTGTTTTTTATACTATT
TTTTAAGAAATTTTATGTTGCTGTTATATTAAATAAATCATAGTTCATTC
TCCTTAGGGCCATGTAATGGTCTGGAGAATTTTTTAAAAGAAATTTTAAC
CATTTTGTTAGATAAAAAAAAGTTAAAAGCGGTCGTTAATATATGTTTTC
TATAATATTTTTAACCTAACTTCGGAGAATCGGTGATGAATATCCTTAAA
TAACATATTTTCACATTTTAGGAAGCTATTTCTAATGGATTCCTTTTGAA
AATGCAATCGTTTGATGTATTTTGAGTTTTTTAAATTCTAATTTTTCTTA
AAATTCCAGTTGCTTTTCTGTCTTAACTTTAAATTAATTAAAAAGTGCTT
AATATTTATTTTATATTATTTCGCTTGATTTTTTAAAGAAAATACTTTTT
TCTGCTTTTAGAAATTTTTGACCGTTTAATAATGGGCTGTAAATAATGAT
GTAGCTTTGTCCTTTTTGTAATTTTACCATATTTTAATTAAAAGCAAGAA
CTTTAGTTCTTACCTTATTATATGAGAAAATTTGAAATAGAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_002564	XLOC_002564	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000045	supercontig	sc0000045:648923..663514 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0.0288324	2.89303	5.60485	0	1.12821e-09	0.525111	0.0179939	0.00226665	0.254221	7.46964	3.95008	0.955363	1.65903	0	0	0.723886	0.948728	1.05968	0.992751	3.77629	6.67661	63.7266	39.9204	4.58602	3.51765

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00004566 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ME3L1 (Putative homeobox protein Meis3-like 1 OS=Homo sapiens GN=MEIS3P1 PE=5 SV=2)

HSP 1 Score: 135.961 bits (341), Expect = 1.124e-35
Identity = 59/73 (80.82%), Postives = 66/73 (90.41%), Query Frame = 3

Query:  414 RGIFPKMATNIMKAWLFQHLNHPYPSEEQKRQLANETGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDASNRAGKSPVVT 632
            RGIFPK+ATNIM+AWLFQHL+HPYPSEEQK+QLA +TGLTILQVNNWFINARRRIVQPMID SNR G+    +
Sbjct:  165 RGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFS 237

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00004566 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00004566 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
ME3L1	1.124e-35	80.82	Putative homeobox protein Meis3-like 1 OS=Homo sap...	[more]

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TCONS_00004566 (transcript) - C. hemisphaerica