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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000003:7219567..7230524- Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >BlTCONS00011271 ID=BlTCONS00011271|Name=BlTCONS00011271|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=10958bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:7219567..7230524- (Branchiostoma lanceolatum) GTCGCTGTTTGCTGTTCGGGTTGCTGTCGGCTTCGTGCAGGTGAGAGACT
TGTAGGAATATAGGTTCCGCTGTGGCTTATGTTTCCCCTCTAATGGGGGT
GGGGTGGCTGCCTAGAGTTTTACACTACTATTGGGCCGTGTCACCACCTC
CATAGATACCGTAGCCACAGCAAACCATTCGATATCCATGTACCTCCCAG
TACCATATTGTAAGGTAGTTTCCATCTCGCGCGAACGTTAAATTGAGGTA
TCGGACTAGTTTGCCTAATTATATTGGTTAGATTTCGAAAGAGCTGAAGT
ATCGCAAAGGCATATCTTGATGAGGTCGCGATGAAAGGTCACAGCGAAAA
CCGGAGATATGGAATATACATATTGCAGTCTGTTCTACAAATTTTGATAT
GGAGCATACCATTGTTGCATGGGTAGGGTGAGAGAGTGCAAATGTTGCCT
TTCTAGTTGATAAACTTTTTAACATTCTTCTCAGGGCGTGGTATACCCAA
GTACGTTTGGCATCTTGTCAAGATGGGCCCCGCCTTCGGAGAGAGGTCGT
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TGTACTTTTGGTCTATATGTGTTTGTTTCTCTCGGTGTGTGTCCGCAGTT
TTTTTTTTTTTATATTGTAAAATTGTAGAACGACGTAGACACACCAAAAT
TTTACAAATTACTTGTTTTACGTTAACCTTTTAGTTTAATCTTCAATTAT
CTCGAAGCTGTGTTCACGTCTGCCACGTGCAGTGGGAAGAACTCTGGACT
GGGGACAACCCAATACCCTGCCATATTTCTGGGACCTTTGTTGCTCCTTT
GACCTAACTTTCCGCTATTGTCACCCAGATGCGTCGTTTGCAAATACCTA
TTGCATAAATGGTAGCACACACTAGGAAAAATCAACAACGAAAAAAAAAA
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ATGTCTGAAAAAATAATCTGTGTATGTTAATATGCGTTTGTGTGTATGTG
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GGGAGTCTTTGTGGGTTTCTCATTGACTGCACATCTCATTACACAGTTTG
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TGCTTACTTAACTGAATATCAAAGTCACGAACAGCCACAGCAAAGTCACG
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ACCAATCTATGATCAGCTTTCACATCACATAAACACCATGTTGAATGAGA
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AGTTTATTGTAGACTGTAGTTAAAAAGTGGAAGTAGAAATATTCATTACC
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ATCAAATGAAACTAACAACTTTCACTACCATACGATCACCACCGCCTTTT
CCCCGGGCCCCATCTATAACACCCTCGTATCACTTGATCTATATAACCTT
TCGCTTCCAGGCCACGTGACTACATATTCAGAGCTAAAGAAAGACGACGG
ATGCAGTCTGAAAGATTCTAACCAAGAAAGTTTGAGTTGTGTGTAACACT
TTTAGATCCTCATGTTAAATTTGAGTAATAATATCAGTAATAATACTAAG
GGTTCCTGTGTTTTAACTGTAGGCGTAGCTGGCCTGGCATTTTGCTGTAT
CTGGTGTCTTCTAGCGTTTGACTCACCTGCTGCACATCCGAGAATAACTG
AAGCTGAAAAGAAATACATCGAGTGCAATTTAGAGAGAACGAGAAAGGTA
AGTCGTGAATGGATTGGTAATTTGTATAATTGATTTGTTTCCTTTTGCAT
TACTTAAACGAAGATGTCACAAATGAGGTTGGTGTGCGTGCATACGTGTG
TGTACATGTATGTATGTATGTGTGTATATGTGTGTCTACATGTATGTGCG
TGCGTCGTATGTGTCTGTATATTTGTGTGCGTGTCTGTGTCTGTGTCTGT
ATCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATAT
ATATATTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGAT
TGTGTCTATGCACGTATGTGTGTACTTTGTATGTGAACATGGTCTTTGTT
GGTGATGGTGCTCATTTATCTAATATTCTTAAAACAAACGGTCACTTGTT
ATAGAGGTTAACGGGTCAAACAACACCAGCCAACCAACCAACCAACCAAC
CGACCAACTAACAAAAACACATAGAAATCATGACAGCACAATATTTGATG
ATAACAATCGCCGATACGCTAGAACAAATATCAATATGTTTGCTTTAAAA
TTGAACATGCTTAAAATGTTTCAAATAAAAGCTACCACAACGATTTACTG
TGTGTAAACATTGGGCTAACCTTTTTTTCTCTGCATTAACAATAGGGCAG
AAAAATCCCGTGGTTGAAGATGTTATCATCACCACACCTGTGGGTACTGA
TCTATATCCACTGTACGGACGGCTGGGGATTTTTCATGATGCTAGCCTGC
CTACCCTTGTACATGGATACAATACTCAACTTCAACCTCGATACAGTAAG
TAGCCCACTAGCTTTGTATTGTTGTAGCTTAATTTTGATACCAATATTAT
GATATTTTTACATTTTGATCCTTTCTTTTTACCTTACACAGCTTTAGATA
TTTGACGTCATCAAGCTATTTAAAGCTATTTAAAAAGTAAGCAAAAGAAA
CTGTAATGTCAGGATTAGTTAGTAAAGTAACAAGTCGTTTCACAGTATCT
AGTGATCATGTGCAGTAGTTTTACATTGTGGTCTAATTAGAAGTAAAAAA
ATACGGCCAAAGGAAACAAAAAGGCCTTACACTTTGACATTGAACCCTGA
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ACTGTGATATTGACACAACGTCATTCTTTTATACATCATACAGAATGGAG
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AGTCTCATCATTGATCCTGTCATCAAGCGTTCGGGTTTTAAGAAGGTCAA
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AAAAATGTCAAAGTTCACTTTCAAATTTTCTAAGATTTCTCACTTAGCTT
TTGGTCAGATATTCTGTCCCATACACTTGTGGGTAATCCTTGGTCACCAT
GTCTTAGGAAGAATCAAACATTGTAATTTCTTCTAGTAAACATATAAAGC
TTCAATCAAATACCATCACACTGACGTCTTGAACGGTTAGGCTGCTGTAT
AAGGTATTTCATTTTTTTAATAATGCGCAAGTGTCTATAAAGAATAACAT
CAACCGAGTCATTGAATTGTGCATTTCAAATGACACATAGGATTTCCCAC
CTTTTGACCTTCCAGCTTTGGGTGGCGTTGCCGCCTGCCTTGTTGCGGTT
GGTCACGTGCGATGTGATTCCACTGCAGCCATCGTCAGTTTGTGTCTGGC
CACAATCATGCAGGGTGTGATGATACCGGGGTTTTATCCAAGCTACGCAG
AACTCACACTGGGCTTCTCTGGAGTGGCGTTTGGAATCAGCAACGCTGTA
GCAAACTGTGCAGGGTTCATCGTGCCTCTGATGGTGGGAATTCTCACAGA
TGGAAACGTAAGTGTGGTCAAATAGTTCGACGTCATTTTTTCATCTTCCA
AGTTAAAAGAATTGAGTGCTAGGGGGTACAAATACATCTCATAAAATTTC
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ATGTTTAAATACATATCAGATGGCAGACAAATGAATATTTTCTCTGGACG
AAGTCCAGTTATTGTACGAGCCTTACACTGCGTGATTTGCATAATGATAT
AAACCTCCATAGATTACTTTTTTCATTGATGCACTCTGTACAATTTCTGT
TTTACAGCTGCGTAACACGCGTTTTAGTCATTCAATAACTAATAATTGTG
TTACCAAATACACACTGGGCCTTAAACATTGCCATTTGACAGCAATGTAT
TGCCACTGCACACACGATCTTGACACTATGAACTATCCTATTACCATAAT
GAGTTGGACAAAAAGGACAAATGTCTATATCGTCAATGGAAATTGAAATT
ATGATATTTTACTACCGACAGCAAACAGTAGAAGCCTGGCAGAAAGTCTT
CTACATCAGCGCCGCCATTTCTGTTTCCGGATCCGCCATGGCTCTCGCGT
TCCTCCGGACTGATCCGGTGTCCTGGGCTCAGGACCCGGATGAAGACAAA
CTGCCCCAGCCAGCAGGGGACAAGCTGATATCTGACAAAAATTATGGCGA
AAAGGGAGACACTTGGTCAGTTTACGAGACCACAGTATGAACTGGATAAA
GAAGGATATGATACATTGATAGTACTAACGTCTTGTTATTGATGCCTTTG
CTGCTATATAGGTGTCCAATTTGCATGTCAATGGTACTGAGCCCAGATAC
TATCGGACATTCCAGAATGTTTATGACATTTTATGTATCGTCAAAACCAT
GAATGATTAAAACTCGGTTTAGTAAAATTATGAAATGCGCCTTCCTCTCC
TTGGTGCTAAAGTATGTAACTCTTGATTTCTACTTTATAAAGATCTTAGT
CACGTCAATAAAGCGACTTTATGACAAATATTTGTTCAACGTGGCTGTGT
TCATTCGTGCACTGTTCGAACATTTTACCGAATACAACCCATTGGTGATT
TTTGAAGCACAACCTGTATCCATAATGAGACACGCTTGTATGCTGCTACA
ATGTCGATCTGTTCGCCCATACAAAAATTTTCCTATCGAACTCCGATGAC
TGTTTGACTCATTGTTTTAGTCACTGTGGTTCATCGTTGACTGTCACAAC
GTTGTGCAAAATCAGTAGTCTCTACCAGACTAACTACGCCGGCTATAGGG
AGAATATTTGCCGGTGGACTTTGGCCAGGGAGGGTTATTGGACCCTCTCT
CCGTAGCCAACTCCCTTCATACAATTGACTCTATTTGGCCAATTTCTACT
ATTTTCCCAGCGACCCGCGGAGGCTGGTAGAGCCTACCAAATCAGCACCC
TAATCTCTGGTTTGTAATAACCTGGAATGCAGTCTTCTTTGCTTTCGTCC
GCCTCCAACGGTCATAATACTAGTCTGTTTAATACGCTATATACATTACA
AATCAATTGCCTCCAAATTGCCAACGTTGGCTTCACTATTATTGCAGTAA
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TAACATCTGCTTGGAGATTGCTCTTGGCGACCCCCCTTAATTAGGTCACC
GGGTCAAGCTGTAATTCTACCCGCTAGTTACTATTTCGATCAGCGCTATA
TAAAGCTAGCAGCCCGGCGCGCTAAAAACAATAGCATTGATAGCTAACGT
TGAGCCACCGTTCAACCGTTACCATAGAATCGTAAATGACGCAAATACTC
TATAGCTACAAGCAGATGCTAGGTCCCTGCTTCTTCTTGACGTCCTTTAC
GTGGTTTGCTGGGTTATTTTGTCAGCTATTCTTATGTGTTAACAGCTGCC
TGTCACGCATGCGCGCAGGAAGTAAGGCCGCTCAAAATGGCGTGTCCACA
GAACGTAAGTGCACTGTTTTGATTTAACCACGACGTATTTTGCCGTTTTT
TTTTTTTCCTCGACATAGAAAGCGGACATTTTAGGAAAATAGAACACTGT
TGAACGGTGTATGTAGGCTTTTGTAACAGTAGTAAGTCAAGAATGCCCGG
ATGAATTGCCTTCATGGTTTGCATGACGGTAGGTATGGGATGACAGGGAA
ATCTTCATTCTATACTGTCCTGATATTACTTACTGTATTTCTAAGCTTAC
ATTATCGAACGCCGATGCTCACCGTACACCATGTATTGTGTTAAACGTAA
TCGTTGCTAGGGTTTGCATTTAATTTCTGAGTGTTTAATCGATACTTGAA
ACTCACTACCTTTAACCCTAACGCAGATGACCTGCTGTATCCCAACCCGG
TACTGTTTGGCCGTCCTTTTGATGGGGGTCGTCATTCATTTATTCACCCT
GCGGTCAAACTTCAGTATCATCGTTGTGGCTATGGTGAAACATGCTCCGA
ATAATCAAGGCAACAGCTCCAGGGAGAACGAGTGTTCTATTAACACGACC
AATGTGATTACGTATTCCACACACGAAAATGACACGGTAGCCTTCAACAT
GTCCAACGAGACGGGTATAGTGGGGCATAAAAGCAGTACAGAACATAACA
GTCAGGTAGGACAATTTCCTTTTCTTGCCATATTGTTTTCTATTACCTGA
CAATGTGCAGATTATATCCTAAACACGTGCTTTATTTTACTCCAAATGTA
TTATTCAAATTTTGATTAGTGGTTAATCATGCTTAATGTTTTACTTGTAC
ATTATAGACGACTTATAAACATTGGGATCTGATTCATCTATTAATTATTC
TTTATTTTTTCCTCTCTGCCCTTTCTTACCACCTCCATCTGTTGACAATT
CATAAAACTAATTGCATTTTCATCAGTATTATATTGTAATCATAATATGG
TGCATTTTGTGCTTATCACGCTTATCATATAGAAAGAAAAAACCAAGTCT
CTATATTATAGGATAAATTTTCCTGGGACCCCGTTACTCAAGGCCGTATC
ATCGGTGCCTACTCGTACGGGGTTGTGTTCAGTCAGGTGCTGGGAGGATT
CCTGGAGGCCAGGTTTGGTGGGAAGAAAGTTCTCGGTCTGAGCATGATGA
TGTCCTCTGTTCTGACTCTGCTGACCCCCGCGGCTGCTTTCGCTGGAGAA
TGGTGGCTGTTTGCTGTTCGGGTAGCTGTCGGCTTTGTGCAAGTAAGAGA
TCTGCGTTAATACCGCTGTAGTATCCCCTGTCCCACAATTTAGGGAGTGG
GGTCTGGATACCATAGCAAAAGTCATTGGCCACTGAACATACGGTAAAAC
ATTTTAGTTCCAGGTGGACTTAGGAATAGTAATGTGAAAACGTAAAACCT
CAGTGACTTACTTTCCAGTAAATTTTTATTTTTAGGCCATGGCCCATTGA
TGCAAAATTGATATAAAGATACTGATGTTTTTACTTTGCAGGAGTGAAGT
ATGCTACATTTGCTTGCAGATACTGCTTTTCTTCCTGATAGACTTTCTAA
CATTCTTCTCAGGGTGTGGTATGGCCATGTATGCATGGCATTTTGTCCAA
ATGGGCCCCACCCGCGGAGAGAGGTCGTCTTCTATCAATCGTCTCTGCCG
GTGAGTTTTCACACACGGATAGAAACAGGTACTTTTTATACGTTGATGAA
GGTTAGACATCCAGGTAGTAAGATACGCCAAAAATAGTTACTCAAGCAAC
TTTCAAAATTTTATCCAGTTGCTCGAGTAGCTACTGTATATACCTCCGTA
AAATTCAGGTATGGTTTTCGGTCTATGTGTTTGTTTTGCTTTCTGTGTGT
GCCCGCAGATATTTCAATATTGAAAAGTGACAGGGTGTAATGCGGAAAAT
GGTTTTACTGGATACTGGAAAACTTGGCTTGGTCAGTGTCCCAAGTTGAC
CCCCCAGGATGGGAAGCTTTACTTTGCTCGGGTTCAAAGTTGCATAGGCA
GGAAAATGAGTAGACCGAACTAGCGAGAAATTCATATCGTTATGAGCAAT
AAATCAAATGAAACTCGGACCATTTCATGGAGCCGGAGGTATCAAATCTA
ATTTTTCTTGCTTGCCGTGTAGACAGATACTTAGTTTGTGTGTTTTTGAT
TGTTTAAGAGGTGGAAAGTGAAAGAGAAAAAAGGCAAAAGAAATACAATA
AACTATAGGAGAAAAGAAATTCTATCATGTACATACCAATATTTTCTATA
CATACGTTCTTTTTTATCCAGGGGAAACCCTGGGAGTCGTTGTGGGTTTT
TCATTGACAGCATATCTCATAACAGAATTTGACTGGGCAGTAACGCTGTA
CATCACAGGTAGGTGAAGACCGTCTTTAAAGTGCTGACCTTATTGACTTA
AAGAACCATTTGAAGCTGATTGTGTTTTTTTACGATTTTTTACCATTCTA
TTTCAAACAAAGTCATTTCAACCTACACATTTAACATCGCCAAGAGACAA
AAAGTCAAATTATTCTTTGAACCCATAACATATGCAATTCGATTGTATAT
TAGAATAATATCTCCTATCACTGTATGTCTTTTATTTCTTATTTGAATTT
GTATATGTACCTGTACTAAGCCCCGTAGGATATGGATATGGTTGCAATGA
TTATTGTTATTATCATTTTATCGTTGTGTTGATGTTGTGAAATAGATAAA
ATGCATTCGATGTTATGTCTTATTTTCATTGTCGATTGTCATCCATGATA
TTTCTTATCACTATAATAAAACAGCAATGGCATTCCATTTTGTGCGTCTC
CCAATAGTTTAAACCTGAGTTCCCAAGAGCTCTATCAACTGCATTTTGTA
TTTGAATTTCTCAATGCAACGCGTTCCTGTGTCTCTACTGTAGGCGTAGC
TGGCCTGGCGTTTTGTTGTATCTGGTGTCTCTTGGCGTTTGATTCGCCTA
CCGTTCATCCGAGAATAACTGAAGCCGAAAAGACATACATTGAATCCAAT
TTAGAGAGAACTAGAAAGGTAAGTCATAATATGTTTGGTTTGGATATAAA
AGTTAATCTTCTCTCTTATGACGGCACCTTGATAAATACGTCAGGAAAAT
GTTCCTATGTACGTCTGCATTGTACGTGTGTGTGTGTTTGTGCGTGCGCA
TGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTGTGTTGTGGAGCATGTACGTGTATAACTC
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TCATCAACAACACATATGTATGTATATACCATGATGGGTGTGTGTTTTAT
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CTCCCGTCGCCGGGCGCTGCGGCCAGGACTCCTTTATTGAAAGGTCGAAG
GACCTGGTAAAACTATTCAATAAAGACATGCTTGAATGTTTTAAACAGAA
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CTGTGGGTACTCATCTATATCCACTGCACGGACTGTTGGGACTTTTTCAT
GATGCTGACCTGCCTTCCCTTGTACATGGATACAATACTCAACTTCAACA
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AATGTTGTCCTTATCTTAGATGGAATGTTTATCCCTAAAGCACCCCAATA
TTATTTGTGACTATGTTGTCAAAACGGGGACCAAAAGGACCCCATTTTGT
TTGGTGATCAATGTACACACCTTGCTTTGTCAATGTAGAATAAATATATT
GTCGTGTTTGGATGTAACTGATTCCTGTTTGAATTTGAAAATAGTATTCA
TAACATTATACATACATTTTATCCTCTCATTTACCAAAAAAATCAATGTA
GCATTTTCTCTTTGATTGGACAACTGATGCCATTTGCATGATTAATATAT
CTAGTTAGAATTGTCACCAGTTTGAAAGTCGTATCATGGAAAAATGAAAT
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ACATAAGG Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000003:7219567..7230524- >BlTCONS00011271 ID=BlTCONS00011271|Name=BlTCONS00011271|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=603bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000003:7219567..7230524- (Branchiostoma lanceolatum) TCGCTGTTTGCTGTTCGGGTTGCTGTCGGCTTCGTGCAGGGCGTGGTATA CCCAAGTACGTTTGGCATCTTGTCAAGATGGGCCCCGCCTTCGGAGAGAG GTCGTCTTCTAACAATCGTCACTATCGGTGAAACCTTGGGAGTCTTTGTG GGTTTCTCATTGACTGCACATCTCATTACACAGTTTGGTTGGGCTGTTAC CCTGTACATCACAGGCGTAGCTGGCCTGGCATTTTGCTGTATCTGGTGTC TTCTAGCGTTTGACTCACCTGCTGCACATCCGAGAATAACTGAAGCTGAA AAGAAATACATCGAGTGCAATTTAGAGAGAACGAGAAAGGGCAGAAAAAT CCCGTGGTTGAAGATGTTATCATCACCACACCTGTGGGTACTGATCTATA TCCACTGTACGGACGGCTGGGGATTTTTCATGATGCTAGCCTGCCTACCC TTGTACATGGATACAATACTCAACTTCAACCTCGATACAAATGGAGCTTT GTCTACCCTGCCTTATTTCACTCTCATGGCATCAAGGATCCTGTCTAGTC TCATCATTGATCCTGTCATCAAGCGTTCGGGTTTTAAGAAGGTCAACATA AGG
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7230485..7230524 | BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7230485..7230524 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7229953..7230040 | BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7229953..7230040 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7229248..7229334 | BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7229248..7229334 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7228378..7228502 | BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7228378..7228502 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7227580..7227729 | BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7227580..7227729 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7227074..7227181 | BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7227074..7227181 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7219567..7219572 | BlTCONS00011271-exon-Sc0000003-1564993656:7219567..7219572 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| Sc0000003 | genome | Sc0000003:7219567..7230524 - |
Properties
| Property Name | Value |
| GeneID | BlCUFF005644 |
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