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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00003427 ID=TCONS_00003427|Name=TCONS_00003427|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1275bp
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TACAACGGGTATGCATCACCTAACC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000028:406973..418216+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00003427 ID=TCONS_00003427|Name=TCONS_00003427|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11244bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028:406973..418216+ (Clytia hemisphaerica)
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AACATACGTCGTAAAACCAATAGATACATTGACACaagatttcattgaaa
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CAGCGCACAATTGGACGAGCACATGGCAAAAGTGGTACAAGACTACCCGT
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TGATGTCGTTCAATAATTTCTAACAAGCAACAGatgaacatatttttgta
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GGTGTATGCTACCTGATCCATACCAGTCATGGCCCTAGGTGTAAAGTATA
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TTCGTTTTGATTTGTGATTTTCTATTGGGGCCATAATTATTGACCTGATT
TCCAAAAGTGTAAGGGATGGCACTTGAGTCTTGATAAATTGAGAGTTCAG
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ACTCAAATCTCCCAGTAACCAAGGCCAGGTCAAGTAGGTCATCATACAAA
AATGTCAACTTGTaacatttgagaaaaaaaatcaattaaaaatctTAATC
GTTTTGGGAGCTAAactaattttaaaaagaaataaaaagtaagaaaTTGT
GAAGTGAAATTAAAATACTGTATGTGACACGAAAGGCATCTTTTATGCAA
TCATTGCGTTTATAGCAAAACATACGATAAaaagatttcagaaaaaaaat
tttaatgaatttttcgtgatttttttttacaagttaaAACGGCCCCATTG
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tGAAGGATGTAACTCAAATCTAATTCTTCGATCTCATTTTAACGTTCCCA
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ACGAGGGCGGCTCAGAATCTTTTGACGAACACGAGACATTTGACGAAGAC
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GAGCGCTCCGCCTNAAAAACTCGcattctcaaaaactaaaaacgaaagta
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GTTATTAACGAAAAGTGTCCCATAAAAGGGTTCCTTgttaaacaaaagaa
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TAAGAAGAAGTGTTACGGATACAACGGGTATGCATCACCTAACC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00003427-exon-sc0000028-1491911889:406973..407062 | TCONS_00003427-exon-sc0000028-1491911889:406973..407062 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003427-exon-sc0000028-1510915933:406973..407062 | TCONS_00003427-exon-sc0000028-1510915933:406973..407062 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003427-exon-sc0000028-1575043694:406973..407062 | TCONS_00003427-exon-sc0000028-1575043694:406973..407062 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003427-exon-sc0000028-1491911889:413424..413915 | TCONS_00003427-exon-sc0000028-1491911889:413424..413915 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003427-exon-sc0000028-1510915933:413424..413915 | TCONS_00003427-exon-sc0000028-1510915933:413424..413915 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003427-exon-sc0000028-1575043694:413424..413915 | TCONS_00003427-exon-sc0000028-1575043694:413424..413915 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003427-exon-sc0000028-1491911889:417524..418216 | TCONS_00003427-exon-sc0000028-1491911889:417524..418216 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003427-exon-sc0000028-1510915933:417524..418216 | TCONS_00003427-exon-sc0000028-1510915933:417524..418216 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00003427-exon-sc0000028-1575043694:417524..418216 | TCONS_00003427-exon-sc0000028-1575043694:417524..418216 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000028 | supercontig | sc0000028:406973..418216 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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