TCONS_00021641 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00021641
Unique NameTCONS_00021641
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length560

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00021641 ID=TCONS_00021641|Name=TCONS_00021641|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=560bp
CTctctttgaaaataatatttgtaaTTTGGTGTATTTGGTGTTCACGGAA
GATAGGTAGTTAAAAGAAAGgtTGGTTAATTGGTTGTTCGAATTGCGGTg
gtatatttctatgtttttgattGGTCCAATTTAAAACCTTTGTCTGCAAA
ACAGAGATTTACGGAGCAGGTTTGTCTGTTTTTATATATTATTCTCTCTA
ATTATTTGATCGTTCATTCTATATATCGGTAAGGGAGGTTTCAGAAGGGG
GATACTTAACAAGGcttgttcaatatttttggtcagctcccagctggcac
acaaaaTTGGTTCAACGTTCttctaacgttatttggacgttgtgaacatt
agattaacgttgaaacaacgttgtgtgccagctgggttgtgTATTATTTG
ATTATTCATTCGTCTTTCGTTTTTCATTCGGGAGATTACGAGAGGGAGAG
TTTACACTTTATGAATTTTAGAGTTagataaaatattataaatgtGGTAA
GTTAATTAATGAGAATGATGGACTCAACAGAGAGGTATTCAACTtatttt
tcaatgtttc
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000391:195294..206096+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00021641 ID=TCONS_00021641|Name=TCONS_00021641|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10803bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000391:195294..206096+ (Clytia hemisphaerica)
CTctctttgaaaataatatttgtaaTTTGGTGTATTTGGTGTTCACGGAA
GATAGGTAGTTAAAAGAAAGGTATTTCTTAAAAGGTTCATGGACCAATAG
AAATTTGCTGAAAGATAGCTGATGCCCCTGTCTCTTTTGATGTTTTAGTC
CAACAATTTAAACTTAAACCTCATAGGGTACACCCCTGACATTTTTCACA
AGTAGGGGTAAAAATAAAGTAGACTGGCTAATTTGCGTTATTACAGCCCA
GGTAGCAAGTAGGAGTTCCTGGTTTCTACCTCGTGTGCTtctgggatgag
ctggagttttcaTAAGATatttcactaattggtcatttgaaatgatagag
atgacgcgttatttagaaaaagtaacaaaactgTTTTATAGCGGGtaaac
gaccaaccaaatcttACCTGTAAACTGAAAATAAGCAATATGATCAAAAT
CGCCATACTTTTGCTTCAAGTATGTATCCCATGTTGAATTTCGGTTGAGT
TTGGATCCTAACCAAAAAAAGCCTAAAGACACCCTCTTCTTACAGACCTA
CTGGGACCCCTtcacactggaaaaattggccagaacatcgtccccagtgg
aaattTTTTGTTCCCATCATAAATAATCAAATTAATCAATCCTCAATGTA
AAATGTTATGCTTTtatcccatccccactgaaatttctgatctgacttga
aaataataaaatttaaatcCCCTGATATTAAATAATATGGGAATAAAAAT
CCCCATCAAGCTTaaatccgttatttttacccccactggctgaaaaagtt
ttaccgggtctttgagaagggggtgtctaatgaatttttcataatgaatt
tcctaaaaaatttaaaaatcataaCGTCTAATGAAATGGAAAACCACCAT
ATTTAAAAATGCCTATTATGAGActattcatctaacgtttccagatcatc
taaaaagaacgacaaataactattccTTTTTGAATATCACGGGAACTGCA
TGTGGTTGAAAAGAACGGTAAATTACGCATGCGttaagtctctatttggg
tgagctggaaacattacatGAACTAACTCTTATGAAAAAATGCACAATTT
GTTGGGGCAGAAACAATGAAGGGTGACAATAGAAGGCTGTGTTCGTAACA
CTTGATGTGAATGTGTTCAAACTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGATCATGTTGTTTGATTGGACGTAtttcca
tgatgtaatgtctgTTAGTCGGTGAATCTCGTTTACACGGTTGCGGACCC
ACTGCTTGAGTTGTAGTGAGGTGTTGTTGATCCAGTAGAGGGCGATTTGC
GAATCTGTGAACTTGGAAGCTCCAGTATGTGTTGAATGAAATGACTTTCT
TACAACTTCACTTGTGTGGGTATTGATGATTAATGCATACAGTTCCCCTC
TTGGTTGAGTATATTCATCCGGTACAAGTAGTGAGCGGGCGAAGATCAAT
TGACAGGAGTAGTCGCCTTGTTTTCGTTTGAATCGAGCATAGATAGATGA
GCATGCTAGATCCTGGCTTGCATCACCAAAATCGAGAGTTGTGATGTCTA
GATTAACTGCATCTGGTGGCACAATAGCACGGTTGAANNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCGGATCCTCATCGTTTGAATCG
TTAGCAGAATGGAAGGTCAGCTTTATTTCTTTGGAGTAGGCTGGCACAGG
TTGTCGGATGATGCATCTGGTCCTGTAATGTTCTAGGATGTCCAGGTTTT
GTTGGTTTGTCTTATGTTCTTCACAAACAAGGATATGCTTCCTTGGCTTG
AAAGGTTGATGGTAAGGAGGCTGGCATATGAACGTCTGTTGACATTGACC
TTCTTTGTGTTTGCCTTGGTCACGTCGTGCCCCGGGGAAGAGACACTGGT
AGCAGAGATTCTTCTGTTGCAAGGTTTTGAATCGCTCAGCTGGAGTCATT
TCGACGAAAACTTTGCAGGAGAAATATTGTACTAGCTTTGTTCCACTAGG
ACCATTGGTTTGTGTATGATCTGTTGCTCCACAGATGTAGCATGAAGATT
GGTCAGGAAACGTGTTGTAAGTTGATCAACCTCCTTTACCACCTCCGCCT
TTGGGTTTTTCGGTGTCAGgttgtttgtttgatttttggaTGGCAGCTCT
CTGTTGGTGAACTTTCATCTCTTTCTCCAGAAAATCAATCAGTTGTTTCC
ACTTGTACTTGCCGCTCTTTGGTTCTTCACAAGTAAGAGTAAGCCATCTC
ATCATTCGTTGATCACCAAGTTTTTCACTGACTTGGTTCAAGGCGTTACT
GTAGTAAAGTTCATTTTCAATATCATGAGTGGCTGCANNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNGGTTTGGAGTATGATTTTTCATAATCATCCTT
TGATAATTGTAGTTTGATCTTTCTATTAGTGTTTTTGTATTCAGTACGCA
ATGTTTCTAGCCTTGTAACGCATTCTTTCATCCTCTCAGGGTGTATCATA
TCGACCGGATTGTCATCAATGGTATCTGTGATATCCTCATGAAGTTGCGC
CATTAGAAGAAAAAGTTCATTTGTACCCGTATTTGTTGTATCAGTTGGTG
GAGTGTCACATGGTTTGACATCCATTGGAGTTGGTTGAGGTGGGTTCACT
CCGGTCCGAGGTGGAATGATCTCGGTGAGAGGTGGATCGCCATCAGTTGG
AACTGGTAGGTCACCTTCAAATAGGGGCGGATCCGACATTGATGGAAGTG
AATCTGTTGATTGAGGTGGAAGTAATTCCTTGGGTTGATTTGAAGTTGCT
TGAAGTGGAGGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNaccaaaaatttataatttaattatg
caaaaataaagcaaagttgactaaataaatattgatttgatgaataaatt
aacataaattaacataaaaatggccaaaaggcACAAAAACTCCAAATGCA
AAAAACAAGACAAAACACAGACCAGACtgaaaaaaaatgccaaaaggCAG
GAAACTGAAAAGACCAAAAGAACATGaaactgaaaacaaacaaaactgcA
GCTGATGCTGTAACACAATTGCTTTTGTAATTGATAATATCCAGGCTGAA
TTATATTGTATTATTTATTCGTCCTAAGTAAGTTCATAACGTAGCAACAA
TGGCATTCTAAAATTTAAACAACCTAAAAAATTGACGTAAAACACTCATT
TTAAacaaaactgacgtcaaatagaAATTATCTTGactatttcattaaat
tttatttttgtaggtTGGTTAATTGGTTGTTCGAATTGCGGTggtatatt
tctatgtttttgattGGTCCAATTTAAAACCTTTGTCTGCAAAACAGAGA
TTTACGGAGCAGGTTTGTCTGTTTTTATATATTATTCTCTCTAATTATTT
GATCGTTCATTCTATATATCGGTAAGGGAGGTTTCAGAAGGGGGATACTT
AACAAGGcttgttcaatatttttggtcagctcccagctggcacacaaaaT
TGGTTCAACGTTCttctaacgttatttggacgttgtgaacattagattaa
cgttgaaacaacgttgtgtgccagctgggttgtgTATTATTTGATTATTC
ATTCGTCTTTCGTTTTTCATTCGGGAGATTACGAGAGGGAGAGTTTACAC
TTTATGAATTTTAGAGTTagataaaatattataaatgtGGTAAGTTAATT
AATGAGAATGATGGACTCAACAGAGAGGTATTCAACTtatttttcaatgt
ttc
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_012134XLOC_012134Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00021641-exon-sc0000391-1491911889:195294..195363TCONS_00021641-exon-sc0000391-1491911889:195294..195363Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021641-exon-sc0000391-1510915933:195294..195363TCONS_00021641-exon-sc0000391-1510915933:195294..195363Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021641-exon-sc0000391-1575043694:195294..195363TCONS_00021641-exon-sc0000391-1575043694:195294..195363Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021641-exon-sc0000391-1491911889:205607..206096TCONS_00021641-exon-sc0000391-1491911889:205607..206096Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021641-exon-sc0000391-1510915933:205607..206096TCONS_00021641-exon-sc0000391-1510915933:205607..206096Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00021641-exon-sc0000391-1575043694:205607..206096TCONS_00021641-exon-sc0000391-1575043694:205607..206096Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000391supercontigsc0000391:195294..206096 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.101076	0	0.11457	0.122893	0	0.107712	0.129998	0	0.257695	0.105902	0	0.134749	0.0675537	0.703465	0.23179	0.185587	0.0758775	0.07789	0.537231	0.449739	0.0977656	0.143209	0	0.105363	0.110847	0.290557	0.139164	0.889731	0.226251	0.228601
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00021641 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top