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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00008763 ID=TCONS_00008763|Name=TCONS_00008763|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2137bp tttttactttttataactTTTCACATCACCGCATTGTGGGTTACATTTGC TGGTGAATTTATGTAtgtttttgcacttttgaggacgtcAGAGTGACTGG AGTGGTTTGGAATagcccgcagttttgacccgcaaaatcaaggacggtaa aagtgctgatttaccgctGTCCTCAGTTAGTCAAGATATAGACAGGCTTC CCAAAGTGCCATAATCTGCTCAAATTCGCATCAAGACGAACTTGTCCGAC ACCTCGACAATCTTTATACACCATACCCAACCTACCTCCTGGCACAACAT CCACTTTCTTGAGCACTAGAGAATCTCTTGATGCCATTGGTAGCATATTG GTCAGATCGTGTGCTGAATGTCATTATCAAATCAATTTACCTGATGGTTA TTACCCACGTGAGCACCGTCACGTGATTTGTCCGCCAGCTAAAGTCAATT GTTTTGCCGGTATCGGAAAGTGCGCTAAGAATGAAGTACTGATGACAATT TTCAAAGATACGGATAACGATTCAACAAGATTCGATTGGGACAGTAAAGT GAATATCATTTTCAACAAAGGATGTGGATGTCAAATGCTGGCTGATTACT CATTTATTGGAGATGGGAATTAATTGATATCGCCATTTTCAAAGACAAAT TTATGGGTTTACgaacatagatttataaagcccaatGTCTGGATGGCTAG ATGNTCGCCATTTTCAAAGACAAATTTATGGGTTTACgaacatagattta taaagcccaatGTTGATGACTAGATATCGTGAATATCGGAAAACATGTTG TTGCACtagcttttgattggtcaagcgctgaaattctattgtaatgtcac gtgacttaggtaggatttcctacctagccACAGCACACTTTTCAGAAAAA GTACGcaatctagctcttcgggctttataaatctatgtttACGAAGGCAG TTATGAGTAAGGTTTTTAGCCTATCCTCTGCAAATTTCTGTTGTTTTAGA ATTTTATGTTTACACttcaaaaaatactttaatcCTGAATCCAGAAACCC CTTGTAAAAAAGGGTGATTACAGTTTTAGTAGGGGGATTAAAAATCGTTT TGctcttatattttttgtttgttaacaTACACTANGGGGATTAAAATCAT TTTGCTCTTATATTTTCTGTTTGTTAACATACactatttttcaatttaat tttccaAATCACTAGATTTTTAAAACGATATAGCTACAAGACAAATacta aagtttttattttttctacgaaaattgatttataacatttaaaaataaac caaaattacaaaatttcatcACAATTTACAATGATTGTTGACAATATCTA CTCTGTTACAAAAATTTGTATGCCCCAGCGTGCCGTCTGAAGTGAGGGAC CGAAATTTGCAGGGGAAAATTGTTGTCGGCgacagagaaaattttgacta tttGCACCTTCTAAACATCACAAATAGCCATTGAATTGGGTAAAAAACAG GATTATGATGTCTGTTAACAGGATTTTTATCCTGCAAAAAAAAGGGTCAT GTACCCTCCCCTCACGTCAATCTTTAGAGTATTGCTTAAAAACCTAAACT TTGTTTTTGTAATGAGTACAGTACTGCTTTTTAAAAGGACCCCATTCTTT GATTcaataatttataaattttggGAATGTTTCATCTTATAGATATCATC ATTCATCTTAAGTCCCATCCACATGCCTCAAAATCGGAATCAAAATAGTG ACCGATTGGGAAAGACTAGagttctgaaattttcactggATATTTGTTTA AATGTTCTCCGTTCTccatcagaaaaaaaaaattcctgtcTTTAAACATC ATCAATTTTTCTTTGCAACTTAATAAGATAAGCATTTTTAATCCGATAAA TCCGATAAATCCGATAAAAGATCACCGCCCTTTGCCCCTCCCCGCACGGG GTTCATTGTATGGTAGTATTATTTGCCGTTGTCGAGTATGTCAGACGTCA GACAATGCGTACAAGTTTTTAAACTCCTGAAAACGTTCATGTTTGTAAAG TAATTTAAAACGTTTGACCATTTTGGATTTATCCCATCTTAATGAAGCGT agtaaaaagcaatttttgaaaTCCTAGAGTGGAAGTa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000087:156558..165630- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00008763 ID=TCONS_00008763|Name=TCONS_00008763|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9073bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000087:156558..165630- (Clytia hemisphaerica) TTTTTACTTTTTATAACTTTTCACATCACCGCATTGTGGGTTACATTTGC
TGGTGAATTTATGTATGTTTTTGCACTTTTGAGGACGTCAGAGTGACTGG
AGTGGTTTGGAATAGCCCGCAGTTTTGACCCGCAAAATCAAGGACGGTAA
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ACAGGGGTACCTGACCACATGTTTGCTTGCCCAGAACAATTTGGATGTGA
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TGGCAAACCTTGACTTAGCCCCTGTTGATTACCTCTCTGCTGAGAACAGG
GAACTTTTCACCACCATAATTTCTAATCCTGGTGATATTCAATGCAAAGA
TCTAGCTGACAAATACTTGTATTTAAAAACTCAACTAAGCCATAGTGCTT
AAGTCATTTGCAAAGTTGTCTTGGCTGCCTAATGTTGATAAATTTCTTAC
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TTCTTATCTTTATAAACTATACAAAACTGTGTGAGATTACAAAAATTTAT
ACAAGCATTTTTAAAAATAATGACCTCATTGGTCACTATAAATTGGAGGT
GATGATACCTGACATTGATGAAATTTACCCTCTTACACAGTATGCTGTAT
GAAATTTTTATTTTTTGTCAAACAAGGCATTCCAGGGTATTTTAGAGTCT
TAACCCCCACCTTCTTGGGCCACCCCTCCTAAATTCTGAAAAATCTTCAA
CCCCTACCTGTTTCAACAATTTTGAAGGTAAGGATTTCTCTTTATGTCAT
GATATAATAATAAGGGGATTGAGGGGGTTCACATTATGTATTATAATTTG
CTTTTTGGTTCCGCATTTTTTGGGCTAACTCTACCTTATGTGCGTGGATT
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ATGCCTGTAGCCTGTTTCTTTCTCTTAAAACGTAAATCTGACTTTGCCCT
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TGGATGTTAAGATTAAGTTCAATGTTAAAAAAAAGTAGTATAACCTTCAC
TAATCCTCATTGGCATCTTGAAGTCTGAGTTTTAGAAAAGGACCAAAATC
TTCTTACTACTTTGCGTACCATATAAATTCCTAGAATTATTAATCAATTT
TCTTATATTTTAGTGTAAAAATCAGATAAGAAAAATGAATAATGAAGAAA
AGTGGAAAGGCTATCGCAGACATATTTCTAACAAGCGCACCGGAGGAGGA
GACAACAAAAATGTCAAGAAAGTGTCCACGCTAATGGTTCAAAAAATGAA
CCCGGTTCCTGTTGGAAAATTGAAGAAGTATGAACCTGAGAGACCTAGAG
ATTTCATCGATTTTTCTGCATTTTCAAAATTAACTTTAAAGAACGTAAAA
GATGCATGTGAAAAATTTTATAATGAACTGCCAGGCTCTTGTGACGTTTT
GTATGATATTACAGGACCTTCATGCACTAATGATGAGCAAGTTTCTGGAA
TGAAAGTATTCCGTGTGCGTTTTGTGAATCCTACCAATAATGACCATTTG
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AGAGGAAAAGGGTTTCATCGATTCTGCTCCCAAAGAAACCACATTTGCAA
GAAGATATGCCAGTATCAATTTCTATTGGAGGCATTTTACAAGCAGGAAA
ATTAGTTACTCCAACATTGGATAATGAGGTAACTTTGACACTAGAGTCAT
TCAACATCAAACATAAAATTTGGCTAAAAGGTGAAACTAGCAAATTTCAC
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ATACACAACTGAAAATGGAACCACAAAAATTTGGGTCATAAAAAAGTTCA
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GAACACACAAGAAAGCAGGTACAAATGCACACTGCAGCAAAAGCAATAAC
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CAAGGAAGTGGTTATAATCTATACGATCCGGAGATCGCCACATCAGCCGA
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TTCAAAGTTGTAAGAAAACATGCTCGCCTTTGACGAGTACTGGATCGTCA
GATAAAAACCTAACGTGTATTCAAGTTTATTTTTGTTACTTTTTTATTTT
CTTTTAAAAAAGAAATTTTTAGTTGTTACACGCTTTTTTTATAAGAATTG
GCTGAGGGTCAAGTATTCTTAAAAAAAATGGCCGAAATTGAGGGTGAAAT
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TCTTTCTTGTTTCTTTCTATTTAGCCAGATTTAGCGCACATTTGAAGCTA
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CCATTCATTTTTGTCAACAAATAGAAAATGACTATATTATTATCAAAATC
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TGTGTGTTTTTAGCTTGTATATAGATGTACCTTTCTGTGTGATAAAAGAG
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ATAGCTTGTTTTCAAATTCAGCTTATGGCTGTATGTGCATTTTTCAATGC
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GTAGTAATTTTAGTATTTTTCGGATACTCTTCTGTGCTTAATTGTAGGGG
GCGTGGAATAAGCAGGGGGTGGGTACCCCGGAAGAAAAATCATAAAATGG
GGGTGGGTTCATTATTAAGTGATTTTGGAGTGATTTTCCCAAAAAAAACC
CTAGGGAAATGAAGGTTTTGGCACTTTTTTCAGGAAAACTTCATACAATG
GGGGACATTATAAAATGCTATGGGGTGATTTTCCAAAAATTGCAAAGTGA
NTCAGGAAAATTTCATAAAATGGGGGACATTATAAAATGCTATGGGGGTG
ATTTTCCAAAAATTGCAAAGTGACCCCCCCTACGATTAAGCACATATGAG
TACGATTTTTTGTTTTTATTGGTTTGAACCTGCTTGCATTTGAATATTTT
TGATTCAACAGAATATATATATCATATTTGCAGAGAAAGTTTTGTCTTTT
TTATTAATATACCTAATGAGTAAATGAACTGAGTCGTCGTAATAAATTAC
CGAGATTGTCCTAATTAACAAGTGCACGAAGTACAGTCGAGGCTCTCTAA
TTAGACGTTCCATTATTCGAAAAGTTACCGTATTCGATGAAAATCTCACT
CCCTGGGAATCGAATTATAAAAACTAAATTGAAAACAAAAATACTGTGAT
CAGTTGTCATAAATTGTTCCCGACATGCGAAAGCCGATATCACTCTCAGG
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CAATCTCCTTTAAAGTCTCAAGAGAGGGGAATCTTGTTCTTGCAGTTGAC
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ACACGTCCGGATGAGTTTCCTAGTTTTGTTGGCACATTAAAGTCCACTGC
TACTACCTCATTTGAGCCGTCAGTCGATTCCGACTACTGCGTAATCTTCC
TATTTTTAAACACCTTTGATGGGATGCTGGCCCCCATTATTGCTTTAACG
TGGGTGGCCTCCGCCAAATACGCCACGGATTAAGGTTGCAGCGCAGTGCC
CGTAAGTTAAGCGGAATAAGTAAATGATGATCTGTGACTCTAGAATACAC
TCGTTCTTCATTCTCCACTTTGTAATTTTTCTTGAACGTATTCCCAAACT
CCAAATACTAGGGAGATAAAAATGACAATGACAACGCTGGGCTACGTGAT
TTTTTTACGTTTTTTAAATTTTTTAAATTTTAAATTTTTTCTTTTTTAAT
TAAATTTTTTTTATTGTCTCTTTTTTTAACTATTTTTTATTTTTTTATTA
TTTTTTTTATTTTTAAAATGATTTTTAAAATTTTTATTCAGAAATAAAAA
AATGTTTTTCTTTTTTTAATTACTTTTCGTACTACTTTCTATTTGAAGAA
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AGTACAGTACTGCTTTTTAAAAGGACCCCATTCTTTGATTCAATAATTTA
TAAATTTTGGGAATGTTTCATCTTATAGATATCATCATTCATCTTAAGTC
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GCAACTTAATAAGATAAGCATTTTTAATCCGATAAATCCGATAAATCCGA
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TGACCATTTTGGATTTATCCCATCTTAATGAAGCGTAGTAAAAAGCAATT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00008763-exon-sc0000087-1575043694:165403..165630 | TCONS_00008763-exon-sc0000087-1575043694:165403..165630 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00008763-exon-sc0000087-1510915933:165403..165630 | TCONS_00008763-exon-sc0000087-1510915933:165403..165630 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008763-exon-sc0000087-1510915933:165077..165245 | TCONS_00008763-exon-sc0000087-1510915933:165077..165245 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00008763-exon-sc0000087-1510915933:163274..164422 | TCONS_00008763-exon-sc0000087-1510915933:163274..164422 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000087 | supercontig | sc0000087:156558..165630 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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