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transcript sequence >TCONS_00001567 ID=TCONS_00001567|Name=TCONS_00001567|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2311bp ttttctttcaataaaaaaaaagataattgttataaatttacaatttaatt ATCCTTAAAAAAGTAGCTATTAAATTATAGAAGTTGTATTTAGTTATTTT AgttaattttaagaaaaaagtatttttttgttgttttctttagTAATATA GTAATTATATAGTACTTTAATgtatttttcactaaaataatcttattaag ctcttttaaagaaaattttccagatttttttataagaaccactgaatttt tgctgaggcgaaaccatttctaatttttcgtGCTTCTCTGGCTGAAAATA AGCTCTTGCCTCCTTGCGTTTTGACATCTGAAGTCGAGATTGTCCTTAAA ATTTGTTCTCGGTTTTTACCGAAATTCAGCCTCTtttttctcataagaaa acgTGCAATATTCGATGGCCTTCTTAGATCAGGTTTTACTGAACATTCTA ACAAAAGTTACTGTATGGGTTCTTTTTTATAGTAATATGTATGTATCTAA GAGGtatttttatacaatttttcttttgtttactttgttattttgttata cTGTTATAAAGTTTATTGTCTTACGAATCAAATTTTCATGTTGCTTTTTT CATGGTTATACAacagtttcttttttctttaaattttttatttgcgaTTT TGTGTTTAtatgtattttttaaaaatcactttgttttatttatgatgtta aagtttttgtgtttttgtttgttATTCATAAGTTTAAGAAAATACTTAAA AgcaaatttttgataacgtTATACCCTCGCCCTTTGGGAGATATCCTTTT TTATACAATATACCGGATATCTCAGTCACTTTGAAATTTAGTCCTGGGTG TTGTTGTGGCTATTATTGGTCAGTGGGTGAGCGAAAAAGCTCCAAAAGTT TTATTGTGATACTTAATTTTAtgtgttttttataagtattCTTTTGGCAG AGTAGTTTTCACATGCTTTCGTCAAAtctttttgctttcaatttcaggag ttaaaaataaatttaatcgaaaaaaatataaaaattaaaacatctCAACC TTATGGTGCAAAAAATGGACCAAGTTTGTCTTCATGAAAGGGTGACGTAG GTTATGCTCGGCTTCATGACGAATACCAAACGTATTGCAATATCAACAGC TGATCCAATCGCCTGTTGCCATCCTACCACATCCTTAAAGACATACATCA AAACCACCCAATACCAATCACAAACAAAGAAAGCATACATGCAAATCATC TTGATAGACTTTGGTAAAATAACATTATTGTTGGTTTTTGGGAATAATTT TTGACGTAGTCCATCGAAATTGACGAAAGCTTGTAGAACACTTGCGATCA TTAACCAACCAGCAATCATATACGTTGAACAATGTGCAGCTCTAGAATAG AAAGTAGGAAAAGCCAAAGCTGCGGTCACCATTATGGGTGACGTCACGAT ACCACATTCCTCATCATCAGCATCCCTCATTGCAGAATCATCCGAATCAC TCCCTTCGTCTCCGCTTCGATGGCGATCCCTCTCAATCTCTGATAATCTT TTAATAGTACACTGGCTATCTACACGGTTTGAATTCTCAAAGATACGCAT ACTGCTGTCTAAGGAACGCAACTCGACTTGACTTGCGTTATTGATACTTA GAAGACTTCCCCACTTTTGGATTGCGACATCTTTGTATAAGACTGCTTCT TCGTTGCCATCGAAACAACAACACCAACAAAACCCTTTACGCCCACGTTT TTTGTTCAATTTACGGAGGCGCCAAAAAGCTTGAcataaattcaaaatgg tagctgctAAGGTTGACATTCcaacgaaaatgaaaacaaaacatgaaacC ATATAATAAGTGTTCTTTTGATTGTAAAATTTGACTTGTCGAGTTCCTAT AGTTAGAATGGTCAGCCACCAAAAATGGAAATGATCAATGAAAGATCCGT AATCTTGATTCATGGACGCTGTAGTAAAACTTGCTCCAACGATTACCGAA ACTAAGAGAACCACAGTGATaaagaaacatttaaaatgtaaaaatttgat GTATCGTTTATATTTTTTGGCTGTTTTCAATTCAATCAACACCACAAGTA ATTTGATAGTGTTTAATATGGTTGAACCGAAATTTGTGTAAGTGATTATG GTGAATGAAATACCGAAAGTGGAGTAAACAATGGATGCGATTTTACTTGG AGCATTGTCAAGAATGATACCAAAACCTATGAAAAAAGAGTATTTTTATT AGGTTATAACAGCACAAAGATGTGTTATACTcttcttaaaaaataattct ttagaTTAGAC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000011:48201..64644+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001567 ID=TCONS_00001567|Name=TCONS_00001567|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16444bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011:48201..64644+ (Clytia hemisphaerica) ttttctttcaataaaaaaaaagataattgttataaatttacaatttaatt
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00001567-exon-sc0000011-1491911889:48201..49305 | TCONS_00001567-exon-sc0000011-1491911889:48201..49305 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001567-exon-sc0000011-1510915933:48201..49305 | TCONS_00001567-exon-sc0000011-1510915933:48201..49305 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001567-exon-sc0000011-1575043694:48201..49305 | TCONS_00001567-exon-sc0000011-1575043694:48201..49305 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001567-exon-sc0000011-1491911889:49523..49830 | TCONS_00001567-exon-sc0000011-1491911889:49523..49830 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001567-exon-sc0000011-1510915933:49523..49830 | TCONS_00001567-exon-sc0000011-1510915933:49523..49830 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001567-exon-sc0000011-1575043694:49523..49830 | TCONS_00001567-exon-sc0000011-1575043694:49523..49830 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00001567-exon-sc0000011-1491911889:63747..64644 | TCONS_00001567-exon-sc0000011-1491911889:63747..64644 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000011 | supercontig | sc0000011:48201..64644 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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