XLOC_043838 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043838
Unique NameXLOC_043838
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_55:17025..76969-

Legend: gene
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>XLOC_043838 ID=XLOC_043838|Name=XLOC_043838|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=59945bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_55:17025..76969- (Clytia hemisphaerica)
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TATTTGCCACTGTATGGTGGTAGTTATTACTGAGTTTATGTATGTGTGTT TTTCTGCGACGGAGACGGTAAGGTTCTGATTTGTCTAAATCCTGACTGAC TGAGGACAAAGGTAAGNGCGACGGAAACGGTAAGGTTCTGATTTGTCTAA ATCCTGACTGACTGAGGACGACGGTAAATCAGCACTGCGGGCTATTCCAA ATCTGTCACTTTACCGTCCTCAAAAGTGCAAATTCATAAACTCGCTATTT TGAAAGTGGTACCCGCAAAGAAGCCGATGCAGTGTCAAAAACTAACGTCA AACGAGACTACATCAACACAGTATTCAGGGAGGAGTAGATCTAGCGCTGT CGATGCATTTAAACTGGTATTGAGTAGTGCTACATTAGGGTACCGCTTTC AAAAAACTCCGATCAAAGGTTTATCTTGGCCTTGATTGAGAAACAAGGTA TATATAAAGGACTCGACAGCTGTTTGGTTGTAAGTGACATAAAATCAGTC AATACGTCACTTGCAACCAAATAGACGTCAAAATTCGCTGTCTTTAAGAA TGTTAATGCGACGACTTCAAACATTTTGACGTCATTTTTTCCTTAAACTC GAACCCAGTCTCCTCACGTAATGATACCAAGTTTATTTATGTGTGTTTTT CAGCGACGGAGACGGTAACGTTCTAATTTGACTAGATCATGACCAGCTGA GGACGACGGTAAATCAGCACTTTTCCCGTCCTCGATTTTGCGGGGCAGAA TTTACCGTCCTCAAAAGCGCAAATATATAAACTCGCTGATATGTGTACTA GTATTGAAAACAACCGCTTGATTTCAAAAGAGGAACTTGACTTTTAGTAA TATTTTTCCCTTGTAAATTTCCTTTTAAAGAATGTGGCTCCGATTTATTA GTCATTTGAAAAGCACTGGGAAGTGAAACTATACAAACAAACAAACGCCT CTGCAGTAAAGAAAGGTGTTAAAACATTATCCAAACAGCACTCTCAAAAG TCTAACTCCTCCACATATCTTTCAACTTTCCCATATATCATCATTTACCT AATTTGGATAGATAATAAATATTTTTCTACATTATGACATTTTTCTACTG AAATTCTTTGAATTGCTTCCGCCAGTAGCATATCATAAAAAATCATAAAA GTCTTACCTGGCGTGATCACCCCACCAAAAACACCATCTATGGGTTCGTT TAAAGCCTATCTCTACTATCTTAAAGGCTAGGAGTGTTCAGTTTACTGGT CATGGCATTCGTGTGTCCACAGAAGTCATCTCCTCTCTCTTACTCTGGAA GCCCAAGCAACTTGTTCAAAGATCGAGAAAGTTAACTTTCACTGACGCAG TCGGCTTAATTATAGTGGCCTGGAGACTGCCATGTGCGACAGCGATTCTT GGCGCCAGAGGGTGGAACCCATCATCTCGACCGCGGTCAAAAGATGATGA CGACGAGCATATCAAAGTCGAATAAATAAGTTTTAAATAAGACTTCACCT TTCTAGAATTTGATGAGATTTGAAAACCTCCTTTTAAATTTGTTCTCAGT TTCTTGGATATTCTTCTAAGATTAAGACTGCTACTTAATATTTCTATTAT GTCAGGAGAATCTTATCTCCGTCACAGGGGGTTTTTGATTTTTTTGTCGA TAACTGAATAGCGGCTCCTTTCCCTGGATTTCTTCACCTACCATTGATCC GTATCTTTTGTGTCTAAGCATCTAGCAGACTAGAGACACCAAGTACCATT TTGGGGATCTTCGGTATAACTAGGCTGTTGTTTGATGTGTTTGAATTCAC AACCCAGCGCATCGTAGCCGGATACTCCACCTTTGTGCTATGGTCGCAAT GAAATTCTAGAAAGAGTAGGTATTTAATCCAAGGTGGTCTGTGAAACACA 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GATATTTCTTTCAGCAAAACACTAAACTGTGAAGGTGGTTAAATCGTCAA TGAATCACTCCGCTAATTTTCTTCGCATTCAGTCAAGCTTATAAAACAAT GTACATAATTTTACCGAACCGCCAGAGGACCTCAACATTCTCTATCAAAA TTGTTTACTCTTTATTCGCTAATTTTTCAAAAATAGAAAAAATTGACGCA GATATTTGATTTGGCCCAAAAATGAGCTTTAAACAGCCAAAACTAATTAT TTAGATTTTCAGGTATGGGGTCTTTTGAAACAATATTTTCATTTTAAGAT TGCTTAGATTGTTTTTGGCAATGGTTTATTTCAATGAGGACCTTCGATAG ATTCTGTTTGATTTTTGAAATGTCAGTTTGATTTACGACTGAAAAATGTT TCATTCATACGAGTGCTCAAAACATTGTTTTGCTATTTAACAAATCCATA AATTAGAGGTAGGGCGTACGGCTAAGAGATGTCATTTGTTCAATCCCTGT CCAGATTCCTCTGTCTCTCTACCAGGCCCGGTAGAACAACCATAAAAGTG GGGAGGCTGAAGTCTCCCCAGTCTCCCTGCTTCCGCCAGGCCTGTCTACC TAGGTCATAATAGGTAAATTAAGAATTTGGCAGGTAATGCCCCCTTACTT CTTTGCCTAGATAACTCTAGAAGAAGGACAGCCTTTAGTACTCGCCCGGG TAAAATCGCTGTTGTATAGCGCTAAAGTTATCGTATAGTTATTCTAATGA CGAATTGGTGGATGCCAATCTAAAAGCATAAAAGTAGCGAATTAATTTCC CATCTGAGAGGAATGATAGTCAGCCTTAGATGTACCGCCTCTTCAGACGC GCTCGACTGCCATTGTAGTCCAAAACCTTCTAGATGTTTGAAAATATCAA GATCTTCAGAGCTTTAGCGTCTTTGAAGAAAAAATCAACATCTATTAGCA GAAAAGTGATATACAGTTGACGCTCTCTAATTCGATCTTCAAGGGGAATT GGATTTTCATCGAATAAGGGAGCTTATCGAATAAGGGAGCGTCGTTTATG AGAGTTTCTTGTTGACGGGGAGTCTAAATTTCATCGAATAAGGGATAATG AATAGTAGAACGTCGAATTAGAGAGCGTCGACTGTTGTATCACAGGGCCA AAGGTTCATATGTGAAAGTAAAGGGAGCGAATCATTACTGATCCAAATTA GATTCAAAAAAGATGAAAACCTTCAAAAGTAAAAAAAACACCTGCTTCTT GTACCATTTTGATTGTCTAGTTTTGATTGTCGAAAAAATTAATTACTCTC ATCCTGCAGACATGGTAAAAAAATAATGCCGACCTAAAGCACCTTATTAT CTTTTGAAAGGCATAAAAATAAGATTAATTATTTCCTCTGTACATGCCTT GTTTTGGCTTTGTTTGTTATATTTTTCAAAATAATTGGAAAAAATCACAG ACGAAAAAATAGGGTTCATTAGCAAGTCATTATAAAAAAAGCCTCTAACT ATGTGTTAATTGAAGTTCTAATTAAATTTTGACCACTAAGTACCCCTGAA ATGCTGAGATTACCTTGTATTGTGTTTTTTTGTTTTGCCGTAGACACGTT TGCTGTTTTTGTCTCGTTTTAGATACTTGCTTGTGTGAAAATTTAAGTAA ATATGGGATACTGCGGTCAAATATCATTTTTCCTTTTTACCTTCCTACAG TCACGCCTTTTAAATGGATGGTGATTGAAAAGTAGTGGTAAACAGATTTA TTTTAACCTTTGAGCTGTTCGAAGAAAAAGGCCGGGCAAGTTGGAAATTC TTTCAGGAGCTCTTCTGCCACAATACATCTTTCCCGTGATTCAAACTTTT CAGAAATTGTCCGAAAAAATGTGCGCTCTACACCGTTGTGTATAAAATTG TTTGGGAGGTAAACGAACGCGTTTTTGCCTGCGAGGGGTTAGGCTTCTAA TTTTTTATAGTGATCTATATTTTGGCAAAAAAAATTTTAGGGGGTATAAT TTCATGAATAGAAAGAGCATACTAAAATTGAAGGGATATTGATTGACAGA ACTCAAGAAAAGCTCCAAAACTAACTTTTCCTAAGGAAACACGGATAAAA ATGGGTTTGTTTACCTTCAGAGACCAAACGGAGGAGAGCATCAAAATAAA GCGCACGCATCTGTTTTGTGAATAACGGTAAATGTATTTAATTTTCATAA CGCCAGACTGTTTTTTACGTTTTATGCGAACCAAAAGATTACCCCCACAA ACGTTGGTATCCTGTGTTTTTGCTGAAAAGCACGTGGTTTCAACCTATAA CCAGTTGATTGAAGAACAAAGGGGGTGGGAATGAGTTTGAAAACACTTTC AAAAGCCCTTCCGCCCCTTGATAATATAAAGTAACCATAGCAGGCAAATC TTGATCATCTTTAATAAATTTTCATTTTAGATTTAAAGATTGTTTCTGGA GCATTTTACGAAAAAATTTTGACCGCTAATTTCAAATTTGCGTTTCAAAT TGTCACAAACAAAGTGCTTAAACGATGCCCTCAAATATGTAATCAATACA ATACCATTAGATTTTTTAAACAATTTTCTTTATTTTTAAACAAATCGCAA ATTAATTGGGGGTATGAATGAAAACAAGCGACGTTATGTTCAAAAAACAT CAATTCAATGTCATTTTCGGGACGTATTTTTTGTTCATTGGCGTCATTTT ACTTGAAGTTTTTTAGGTTAAATCTGTCTCCCATGGATAAGAAATCAATA TAAATTGCGGAAAATTATTCTTTTTATAGCAAAGATATACGTAAAAGAAG CCATTTATCCTGTGTCTTCCTGTCAAATTTTGACCAATTGATTTTTTTAA GATGAATGACCCCCAACAAAAAATATCGTTCATGAAACTTCACAATGCTC GACTCTTTCTAAACAATCAACTCCTGCCCCGATCTAAACAATGCCCCAGT ATTCGCGACTAGTGCGATTCACACCCAAGTTAATCTCAAATTTTGCGGCT CTTATTCTATCCCATCTAAAATCTCAATACTAGGGTTTAGAAACAGGAGT GTAAGAATTGCACAGGCACCACAGACGCGGTGGGACTTCCTACCTCCTGA AAAGAAGGGCAATGATTAAATCCCTTAAATATTGTCTTATTTAAAATGCA AATAGAGACAGACAGATAGACAGACAGAAATTTTTTAATTAGAATTTCGG GCCATATTCGCAAAAATCAGTTCCCTTAAGGTAAGCTTTCCAGTCAGCCA CCGTATTTGGAAAAGTTTGTTATTTATGGGTTTCGACTACGATTATATGA TACGGCCTCAATATAGCTGTTTTAGCCGACAGAAACTACACTAACAAGAA GAGTTCGGGCTAGTTCTATATTTATTATATCAACTTGTAACTATAGCGCC AAAGCTTCTTCCAAAGGTTCCCGTATGACACTCCACTATAGCCTTCTTTT TTCAAAGTAATGGTCAGACAAGGCGGTTCAGCTTAAGTAATTGGGCTTCA TGGTTACATCAATGCCTGAGGTTAATAAATCAAAGAATTTTTGTGATGCG AAACTACTGTAAAAACTTATTAAAAAACCTTAATCAAGGGCTTGTTTAAA AGAATGCTTTAGGCTTTCAGACAATTTGACAGTAATGGTACTTGTTTTGT TTGTCTTTAATCAACAATCCACTCCAAAGTATCAAAAATACCTTATCTTC TGCTATTTTAGTCGTGAGCATCGGAAATATTTGTTAACCAATGTGGTTTT TTGATGATGGAAGTTGTAAATCCATGATGAAATCAACACATTTTTAATTC CTTTCGTACGTTTTTTTTTCAATTTGGTTACTTCAGATTTATAGCGTAGG AGTTGTAACAAAGGTTTATAGTTTTGAAGGCAAATAAATATCACCCTTGC AAACCAGGGCCGCTAAACGATTCTGCGACGTAAAGAGGTCAGTGCCGTAA AATTGGAGGAATCGTTTACATCCCCCGTCAACGCGTCCATCAGAATTATC AATAGCATAAGGTCCAGGTAAGGCCTGGAGTCAAGGGTGAATAAATATTT AAAAAATAACCAAAATATATCCTCTAGAGTTAGCTCGTAGGATTAGCTCA CTGAGGTCCTTTTTATAGACCTTTTTATTGGCCTATCTAATTTTCCCAGT AACTATCCGACTCAAAAAAAAAATTAAGCATATGTATATGTATATCTACA TTCATTAGGAAACAGGGACAGGCTCGATCAGCGGCACTTTCAGTCACAAA TGCCGGCATTCCTGTTCATTGAATCAAGAAAATAAACGGTTTTTATAAAA ATAAACTATATAAAAACACATGGCTTCAATGGCCAAAAAAGAAATACTCA CAAAATGGTGAAATGAAAAATATTTTAATAACATTCTTAGGCTTCAAACT GAAAATGTTAAGAACATCCAAAGGTTTTCAAAATTTTGGATGATATTTAA AAAAAAACGTGTATCGGCTTAAAAGAGAAAATCTTCATTCCTGTTTTAGC GGCGGAATTTCAAATAACGGCATACACGCAACGTTGTTTCAACGTTCTTC TAATATTATATGGACGTCGTGAACGTTAGATAAACGTTAAAAGAACGTTA TATGCCAGCTGGGAAAAAACGGCAGACAACCAGACACCCACCTGGCAGAT GCTTCTGATCACCGACGCCTGTAATAGAAGTGAAATTGATTCCTTTGTTT CATATGCGAATTCCGATCTACCAATATATAATTTTAATTGGAATGCTATT TATAGTTCTTTGTTCTTCTTCATCTTCACCAATTATTTTCATTTGATTGA AGTTGTTGTCTTTTTAATTACTTCCAATGATTTTTTTCAGCAAGT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070387TCONS_00070387Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070386TCONS_00070386Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070385TCONS_00070385Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070384TCONS_00070384Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070383TCONS_00070383Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070382TCONS_00070382Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070385-proteinTCONS_00070385-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_55supercontigscaffold_55:17025..76969 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
NOL8PREDICTED: nucleolar protein 8 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
61.39 58.2 21.25 14.93 68.33 53.44 47.45 52.09 23.62 31.28 18.88 17.26 12.63 13.22 15.23 22.11 25.43 22.31 6.85 7.76 17.27 16.7 36.15 31.24 30.31 31.3 11.77 9.16 32.51 37.85