XLOC_041309 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_041309
Unique NameXLOC_041309
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_448:88682..114515-

Legend: gene
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>XLOC_041309 ID=XLOC_041309|Name=XLOC_041309|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=25834bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_448:88682..114515- (Clytia hemisphaerica)
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CTGTGATGTGGAGCAAACCACATCTGGTCACATGGAGGACGTATCATCAG TCTATGATGTGGAAGAAACCAAATCTGCCCACATGGAGGACGTAGCATCA GTCTGTGATGTGGAGGAAACCAAATCTGCCCACATGGAGGACGTAGCACC AGTCTGTGATGTGGAGCAAACCCAATCTGCCCACATGGAGCACGTAGCAT CAATTAGTGATATCGAAAAGACACAACCTGACCATTTGAGTGACTCTCCC TCTAATGACCATAACGCCGAGTCTGGGTCATCATCATCCAACAAAGATAC GGTCGAATCTGCACGGCAAAATCAGAAACCACGTCGTACCATGTGGTATA CATTATTGAATGACTTTTTTGAAAGATTCTACTAAAATCAAAGTTTTCAA AAGCAATTGTATCGAAATGTGAAGAAAGGAACGAAAAAAATTTTGTTTCT ATATTCTATTCTCTCTGAAGATCATAAATTAAGTAAAAGAAACTAGCAGG GAAACAGAACTATTCATGTCCTTTGGACCTTATGCTTATATTATTGATCG ACTAATTAAATATGCCATCAGCCAAAGGTGGAAAGGACTTTTGAAACTAA CAGCATCTTATCCGCCCAAAAAACTCAAAAGTTTTGGCCACCTTGCTGTT GTATATTTAAGTAACCTACAATATTAAGAGCATTAGCTTTAAAGTGTATG AATATTANCGTAGCACCAGTTGGTGATGTGGAGCAAACCAAATCTGCCCA CATGGAGGACGTATCATCAATCTGTGATGTGGAGCAAACCAAATCTGCCC ACATGGAGGACGTAGCACCAGTTGGTGATGTGGAGCAAACCAAATCTGCC CACATGGAGCACGTAGCACCAGTCTGTGATGTGGAGCAAACCAAATCTGC CCACATGGAGGACGTAGCACCAGTCTGTGATGTGGAGCAAACCCAATCTG CCCACATGGAGCACGTAGCATCAATTAGTGATATCGAAAAGACACAACCT GACCATTTGAGTGACTCTCCCTCTAATGACCATAACGCCGAGTCTGGGTC ATCATCATCCAACAAAGATACGGTCGAATCTGCACGGCAAAATCAGAAAC CACGTCGTACCATGTGGTATACATTATTGAATGACTTTTTTGAAAGATTC TACTAAAATCAAAGTTTTCAAAAGCAATTGTATCGAAATGTGAAGAAAGG AACGAAAAAAATTTTGTTTCTATATTCTATTCTCTCTGAAGATCATCAAT TAAGTAAAAGAAACTAGCAGGGAAACAGAACTATTCATGTCCTTTGGACC TTATGCTTATATTATTGATCGACTAATTAAATATGCCATCAGCCAAAGGT GGAAAGGACTTTTGAAACTAACAGCATCTTATCCGCCCAAAAAACTCAAA AGTTTTGGCCACCTTGCTGTTGTATATTTAAGTAGCCTCCAATATTAAGA GCATGAGCTTCAAATTGTATGAATATTGCCTGATCCCTGCTAGTGGCTTT GTCTTTTGATGGTACCTCAGTGAGTTTAGAATGTCAAAACAAAGTTTCTT TGTTTGTTTCTTTGCATATTGATACGATTGCTTTATATATTGTATATTAT TTTTCTTGTCATATCACTCACTATTATTATTTTCTTTGAATAAATTTATA AAAATCTAAAATCATTCTCAATAAACTTATTTTTCTAACCTATTTTCGGT TTCTCTTCGTATTTTAAGGGGTAATTAGTCCAGCACCGATCTAATTTATC GTTTTAACGCTTGTTCTTGAAGACCAATGAACAATCTGCTAGCCTGTACT AATCATGTGAGTTGTCGACGACCAACGAAACATGGATCTACTGCTAGCCT GTACCAAATCATATGATGAAGGTGGATTAGGTTCTAGTCAANATACATTA TTGAATGACTTTTTTGAAAGATTCTACTAAAATCAAAGTTTTCAAAAGCA ATTGTATCGAAATGTGAAGAAAGGAACGAAAAAAATTTTGTTTCTATATT CTATTCTCTCTGAAGATCATAAATTAAGTAAAAGAAACTAGCAGGGAAAC AGAACTATTCATGTCCTTTGGACCTTATGCTTATATTATTGATCGACTAA TTAAATATGCCATCAGCCAAAGGTGGAAAGGACTTTTGAAACTAACAGCA TCTTATCCGCCCAAAAAACTCAAAAGTTTTGGCCACCTTGCTGTTGTATA TTTAAGTAGCCTCCAATATTAAGAGCATGAGCTTCAAATTGTATGAATAT TGCCTGATCCCTGCTAGTGGCTTTGTCTTTTGATGGTACCTCAGTGAGTT TAGAATGTCAAAACAAAGTTTCTTTGTTTGTTTCTTTGCATATTGATACG ATTGCTTTATATATTGTATATTATTTTTCTTGTCATATCACTCACTATTA TTATTTTCTTTGAATAAATTTATAAAAATCTAAAATCATTCTCAATAAAC TTGTTTTTCCAACCTATTTTCGGTTTCTCTTCGTATTTTTAGGGGTAATT AGTCCAGCACCGATCTATTCTATCGTTTTAACGCTTGTTCCTGAAGACCA ATGAACAATCTGCTAGCCTGTACTAATCATGTGAGTTCTCGACGACCAAC GAAACATGGATCTACTGCTAGCCTGTACCAATTCATATGATGAAGGGGGA TTAGGTTCTAGTCACATAAGTTCAGCTGTGTGAGGCCATTGAATTGACAC ACACAGATTAGTGATATTTCAACATCATTTGACCATAGATTTATAAAGCC CCAAGGGCTAGATGTCGTGCTTAAGCTCTTCTAAGCAAAAAAGTAAATAT CGCAAAAATTATTGCTGCTTTTGTTTTCGAAAACCCACGAANAATTAAGT AAAAGAAACTAGCAGGGAAACAGAACTATTCATGTCCTTTGGACCTTATG CTTATATTATTGATCGACTAATTAAATATGCCATCAGCCAAAGGTGGAAA GGACTTTTGAAACTAACAGCATCTTATCCGCCCAAAAAACTCAAAAGTTT TGGCCACCTTGCTGTTGTATATTTAAGTAGCCTCCAATATTAAGAGCATG AGCTTCAAATTGTATGAATATTGCCTGATCCCTGCTAGTGGCTTTGTCTT TTGATGGTACCTCAGTGAGTTTAGAATGTCAAAACAAAGTTTCTTTGTTT GTTTCTTTGCATATTGATACGATTGCTTTATATATTGTATATTATTTTTC TTGTCATATCACTCACTATTATTATTTTCTTTGAATAAATTTATAAAAAT CTAAAATCATTCTCAATAAACTTGTTTTTCCAACCTATTTTCGGTTTCTC TTCGTATTTTTAGGGGTAATTAGTCCAGCACCGATCTATTCTATCGTTTT AACGCTTGTTCCTGAAGACCAATGAACAATCTGCTAGCCTGTACTAATCA TGTGAGTTCTCGACGACCAACGAAACATGGATCTACTGCTAGCCTGTACC AATTCATATGATGAAGGGGGATTAGGTTCTAGTCACATAAGTTCAGCTGT GTGAGGCCATTGAATTGACACACACAGATTAGTGATATTTCAACATCATT TGACCATAGATTTATAAAGCCCCAAGGGCTAGATGTCGTGCTTAAGCTCT TCTAAGCAAAAAAAGTAAATATCGCAAAAATTATTGCTGCTATTGTTTTC GAAAACCCACGAAGGTTCTGATTGGTCAAGCGCTGAAATTATATCGTAAT GTCACGTGACTTAGGTAGGATTTCCCACCTAATCTCGGCACACTTTTCAG CAAAAGCACGATATCTAGTCCTTTCGGCTTTATAAATCTATGCATTTGAT CAGTGATAAATTTGAACCCGATTGCAGTAACCAAAAAAAGTTTTTGACTA AAATTGCCATTGTCTAAAATCCTTTTACACCAACTTTATATACTTTAATC TACCCCTTAAAACGGGCAAAAAGACAAAGCAGAGAAACAATTTTAATCCG TCCGTCATCGTTTTTGATCTAAGAATTTCAAAAAGGAAGAATTAATACAA AAGACAGTGAAAAGGTAAACGGAGGTGAAAAGATATAGTACTTACTTTTT GTCAGCCAAAAGAACAGAAAACACATCTTCCATTTTTGATTCGATCGATC TATGTATGGCCGTTCTACAAAAGATAAGACCGAGTTTATGTATATGTGTT TTTCTGCAACGGACACGGTAAGGTTCTAATTGACTAGATTCTGACCAACT GAGGACGACGGTAAATTAGCACTTTTACCGTTCTCGGTTTTGCGTCTCAG AACTGCAGGTAATTCCAAATCGCTTCAGTTAATCTACCGTCCTCAATTAA CTGCAAATACATGAAATCGCTGAGTATAGTATACAAGCGCGGTAGTAAGT TAGTAGTGATTTCACTGGCGATTATGGACATGGATCAAATGTTTTGCAGA GTTGACTGAGAAGGGAAAGTTTGACATACAAAGTGAAGTGTTTAGCTTCA CTTTACCAATGAAATTTATCCCAGCCTTTGTAAATGAGGCTATTAAGTAA AGCTATTAAAAGACATTTCGCCTAACGCCACAAATTCAAACGCAAAAAAA ACTGACCAGTAAATCGTCCTGGGGCGTCATACATATTGCCGAAATAATAT TGCTCATTTTGTTGCTTTTTGAAAAAGAGATAAAACAGTTCCAGTGGAGC ATGATATAGTTTCTGTTGTAAATAAAAGCACACTTACTTTCCACTGACAT CCACGCTGTTGATATTGACACCGTAATCAAGTAACAATCGACAAACGCCA GCCATATCTTCTCTACTGGCTATTTTGCCTGAACCTGCACGCACTGAAAT TGGTCTGGGGATAAAATAAAAAAAATCATTAAGATTCATGGTCCATAAGA TTACATTATAAGTAGTAAGTCTGCTCCTCTTTCGATAGCTATCTACCCGA AGGTAGGGGAGGGCGCCACTCTTTCTCCCTGGATCTCTCCACTTACCCTT GATCCTTCTCTTAATTACTGAGCATCAAGCAGAGGGGCGTCAAGTACCAA TTTGAGAATCTTTGGTATGACCCTGCTGGGGGTTGAACCCACAACCTTGC GAACCGTAGCCGGATGCTCTACCACTGTACTACGGTCGCTTAACACTCCC TTTTAAAACCCTTCTCCTTCCTTCTTTGCTAACATATCCCTTTTTTTAAG GTATGTATTTGTTCTTTCCTAGGCTCTACGCCTCACTTTAGAAAAGGAAT AGGTAATACTAATAACCCCTGTCTCAATAAGCCAGTGAAGTCTTAAAATC CACCGGGTGTAAAATTTCCTCAGGTTTGATTTGAGATCTCAAAAAGTGGG TGTACTTATGAAGGACTGATACAGGGGTGTACTAATGAAGAGTGGTGGTT ACACAATACAAAAAGCGATCCCTAACTAAGGATAAGCAGGTTGAGTGTAT ATTAGGTAATAGGTTACCTATCCCAATTTCCCTTTTCTAAGTGGTAATAC AGACAGACAGACAGACAGATGCCTTCCCATGCAAGGGGATAGAANTGGGG CGTCATACATATTGCCGAAATAATATTGCTCATTTTGTTGCTTTTTGAAA AAGAGATAAAACAGTTCCAGTGGAGCATGATATAGTTTCTGTTGTAAATA AAAGCACACTTACTTTCCACTGACATCCACGCTGTTGATATTGACACCGT AATCAAGTAACAATCGACAAACGCCAGCCATATCTTCTCTACTGGCTATT TTGCCTGAACCTGCACGCACTGAAATTGGTCTGGGGATAAAATAAAAAAA ATCATTAAGATTCATGGTCCATAAGATTACATTANAAAGTTAGTAAATTT GCTACCGCAGTTTAGGGCGACCCTTTTCTTAAGGCTGTAAATTTTTGGTT TAAACCTTAGCCGACTCATACTGAAGATTGACAAATACTGTAAAAACATC ATCATTATGATCAACTTGGAAGCATTGTTTATTATCTTCATTACGAGGCT TTGTTATGTCCTTAGGGAAATTTGTATGTGATAAAAACGGTATTTTGGAA ATAGGAAACTATGATTTATGAAGCTCTATGATTAAGCGTTTTGATATGGA TTTATGATAGAAAGAGATTTTTTGAGCCGAAGGCTTTTTCAGTGTCAATT CACTTAAGATCCTTTTACAAATAACTTTTTACCACCTTACCTCTCTGTTC AGCAAACAAAGAGAAGTATAAGGGAAATAAATAGAGGTGTTCAGCAGTAG CGTGTTGGGTCGAAAAAAAGTCGGGCAAACTGGGGAGGCAATTTCCGAAA GAAAATTTTTCCGAAAGAAAATTTCTTAAGAAAATGGTACAAAAGTATTA ATTTTAAAGAAAATTTTAGTCTTAAAACTCAATAAGTAAAGAATAAATTA AACTTCAAATATTTTAGACGGTCTTGTAAAAAAAAACATAATTACATTTT GTTTGTATCTTAGGAATTACTTTATAATAACCACACCCACATCAATGGCA CCAAAATTACCAAATTAGGATTCGAATATACAAAACCAGAACTGAAGGTC GACGAACTAAGAGCGGTAAGTTGTATAGAGTTTTTTCTAAGTTAATCCAT TATGGAAGCAAATCTGTGAAGGCGATTCCTTAAGTAGCGAGCACTTCACT AAAAACCGGGATTTTTCATCTCGTTTCTTAGTGAGTTCCACTAGTTTGAA TGAAATCAGGTCTAGCATGCCGTACGACTAATTTAGACACAGTATGGAGA ATAAGCTAGAATTAACGGAATGGGCAAATCGTAGTCAATACAAACAGAAA TTATCCCATAACAACTATCGTATTATCATATCACACCCTATTTTACCTAT TTTTACCGGATCTTATGTTGGCCTTTTTAAACTCCGGTTAAGGAGTTTCT TAAAATCAGTGTTTTTCATTTGTAATTGTGCGTAAATCCCATTAATCGCA ATAGTCGGGTTCGATTTCCCGATCTTTCCGGTTTGATTTCCCTATCTTTC CGGTTTGATTTCTCGATTTGGTTTACGCTTTTAAATTCTATGTTAGATAT ATTAAGAAAGGCTGACCACGATAAAGAGGTTAACATAATGGTTCGCTATT CAAAAATGACAATTACCGCAGTTTGCAGCCGTCATTACGGCTGTTTTATT TTAATTCAATCAAATCTTGTTTTCTTTCAGGTGGTTGCCGATTATGTCAA GCTAGGCNTCGCTATTCAAAAATGACAATTACCGGAGTTTGCAGCCATCA TTACGGCTGTTTTATTTTAATTCAATCAAATCTTGTTTTCTTTCAGGTGG TTGCCGATTATGTCAAGTTAGGTGTCTTCCCAAAAACGTTGATGAGCTGA GGTCCATTCATAATACAGTAATTAGGTGTAATTAATTATGGGTTTCTTTG GTATGATATTCTTGATAATTTTCTATATCTGGATTTAACTTATGTATTTT GTGATAGTATATTTTGTACTTCTTGCTTTGTATTTTATAGCCTGGATATC CAAGCTTTAATTTATCTCCCTTATTTTGATGTTTTTCCTTACAGTTTGGT CTACCTAGATTCTTGTAAACCCAGGGTTGGAAAATTTTTAGCTGCGCGCG ATAATTGATTTGACAAAATATCCTTGGCACGTGCTGCCTATTAATGTTGG AATGCAAATTAGAATTAGAAAGACCAGGCTGTAAACCAGAAACATCATAA ATAAAAAAGTCTGGACATCCCGGCTATGTATTTTAATGTCGCGCATTCAT ACATTTTTTCGTCATATTTTTTGGTAATATTTAGTTCATACTGCTGATAA TTGTCTAGGTACTCTCGGGTACCTAATAGCCGGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065938TCONS_00065938Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065937TCONS_00065937Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065936TCONS_00065936Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065935TCONS_00065935Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065938-proteinTCONS_00065938-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_448supercontigscaffold_448:88682..114515 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
115.35 113.71 126.54 125.26 81.39 65.22 153.25 160.91 147.72 167.85 62.38 68.94 22.15 19.7 47.48 42.44 32.45 26 17.04 21.13 11.96 13.38 36.06 33.44 19.27 21.97 26.92 17.2 29.26 30.66