XLOC_033965 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033965
Unique NameXLOC_033965
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_234:62918..101927-

Legend: gene
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GAGCTTAAAGTTATGGTTAAAAAAAAAGACATCAGTTCGCAGGAAGTAGC TTTCACTATTTTTTGCTGAGTCAGAAGAAAGGAGAATGGGCGAGAAGGAA AAAGTAATAAAAAAGGTTAGTTTAATTTTTGTTGCAGTTTTATTCTAATT TTCGTTGTAGTTTGATTTTGACATTTTATGAAGACTAAATTTTTATTTAA GCTGAATAATTCTTTGAGCAGATGAACAATGAAACCTTTTTACTATTTAG GAAGACGCACCATTGGCCAATTTACCACTACTTGGTTACACTATAAGCCG CCCAACTGAGGTATGATATGTTAATTATGCTGATCCCATCTTTTGAGGAG TAATAGAGTATCCATCACTGATTTCAGACCTGTGCTCAAATTTTTCGTTT CTTTTTAAATAAAAACTTAAATCCCTCGACGTAGGGCTGAAACGGCTGAA AATGACCTAAAATGCGCTAAAATAGACCTACTTCACAGTGCTGCAACTTT TTATTTAAGAAAGATATGAAGAATTTGAATACAGGTTTGAAATCAATGAT ATTGGAATATTTGAGGTGTCAAAAAATCTAGGGTTCAGTTAAATGATGTG GGGAATCCAGGGGGGGGGTCAGTAAAACGATGTCGAAAATCATGGGTGGT CCAAAAAATGAGAAAAATAATCTAAGGGGTTCCTGAAAAATTGAAAAAAT AAGATCCGGGGGTCACCTTTCCTCCCAAAAAAGACCTCCTCAACATAGGG GGTATAAATTCTTTTTGGAATATCCCATCCTCTCAACTCGATTCTCGTTT AGGCTGAAACACACGAAGAATTCGCATTCAAATTACAATTCAAGACACAT CAATATTTATTCAAGACGGATAATGAATATACATACGAAAGGTACGTGAT TCTGCCCCACCCTAAATCTGCCCGCCCTAAATCTGCCTAACTCTGCTTCA GTTTTTCCTTGTTAATTTCTTATCTGCCAACGTAAGGTCTCCCAGTCTAT AAAAAACTGAAGTGTATATTTTAGTGGACCGACTGATTTGCCCGCATTTA GTTTGACCAATATTGAGATTAACTTGCATTTTCATCATGATAAGAAGAAA GCGTTTTTCGAGGCAAATTTCTTAAGAAAGAACATGCAATTCGTAAATGT TACATGCTTTTTTATAAGGAGCAGTAAATGTTAGCAGCTCTTTAGTTTTC AAAATTTCTAAGTCTCGAAATATTCATCCTGCAAGTGTTATAAAAAACAA GCTTGTCAGTCAAACTACCTAGAACCCAGTCCCTTAGTCCAATTTCCCAT GATTCAATAAGTACTCATCAAAGGGTTGTATCATGTCCCTCGCTGAAATC TCAAAGTGGCGCAAATAATTCTAGATTCCTTGATTGGAGTGTCTTTTTTT GTGTTGTTGTTTTTTGCAACTTCAAGTTCTTAAATAAAATTATCTTTCTC CTTTCATTACTTCATTAGATGGTATGAAGTTTTGAGTACCGCAACCAAAG CTTCGAACACGTTATCAAGTAGATCAAGACGTAAATTACCTTCCATCAGT TGATTTTATATGAACAGAATTTCAATAGAGAAAATTAAAAATGGTTGACT GGTCTCCACTCCCGTTGGTTGAGTGGAAATATGTAACAAAGACAATGGCC ATTTCTTGCTCCCAGCCGGCATATGAAATTGTTTCAACGCTCATTTAACG TTAGATGGACGTTACGAGTATTATATGGAAGCTGCGTGTATTATATGGAC GTTACGAGTATTAGATGGACGTTGCGAGTTATAGATAGACGTTACGAGAA TTTTTTGGACGTTACGAGTATCACATGGACGTTACGAGCATTATATGGAC GTTATGAGTATTATATGGACGTTTTGAGTATTATATTAGCGTTACGACCG TTATATGAACGTTACGGGTATTATATGTATGGAGGCTGATTTGACGTTAT ATGAAGTTGATACTGAAAAGATAATATGCAAGTTCAGTTTGCAGTATCCA AATAGTTTCAACGGACTAGCTGCTCGAGATCATTAGTGGATCAAGATGGT CAAAGAGTTTCTTCATAAATTGGGGGATAATTCTGTCCTGTTTCATGACC ACGTGAATTCATAGACATGTGATTTGTAGTGAAAATCTTTAGTCAAATAT TTTATACATATAAAAATTGGTATACATGAACATTGGGTTTAACTCAAGGT AATCAATTTTAAAGATTCTGCTCATAATAAAAAGTCGGTTTTTTTTGACG CAGCCGATCAATCAAAATGACCTTTCCTTTCTTTTCTTACGGTGCTAGTT AGAAAACTCCTATAAATTGAACAGATACTGTACATTTTAACAGTATCTTC GGGCGCCCCCTACAGGAGTTGAACAAAATCACTTGATCATCTAAACTAGC ATTCATTTGGTTTCAAAAATGTTTTCTCAATTGATGTCATTATTGACAAG CTTCAGAGACATTGATTATAGCCAAGTAGTTAAACATATTATGTAGTTAT TCCTTCTTATATTATTTTTATAATTTAAAATCTTTACGTACTGTATTTGT AATATACATTTACCCCTTTGAAGAAATTATTTTTATATATATTTGGTAGA GACACAATTTTTTGGTTTTTCATAAAATATTTTCTAATGATTTTACTATA TTATTCATCATCTTTTATACATAGTAGCACACCAAAATGATTTTTCAGCA CAATTTTTTTATAATGTTTTATAATTATTAAAAAATCAATTTTACAATTT TTCTGTTTCCATTTTTGTATGTACTTATAATATTATTATAACAAGTTTAT TTTTTGTAGTGCGTTTTTCAAACTAAAGTAAAATACTTTATATACTACCT TATAAATCAATCAATCAGCCTCAAAAACTTTTCCAGCGTTTATCCGAGCA GATTCTGCTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053828TCONS_00053828Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053827TCONS_00053827Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053826TCONS_00053826Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053825TCONS_00053825Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053826-proteinTCONS_00053826-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_234supercontigscaffold_234:62918..101927 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
FARP1PREDICTED: FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 isoform X1 Homo Sapiens
FARP2PREDICTED: FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.48 3.17 1.4 1.4 40.6 30.79 27.88 29.5 15.52 24.16 15.23 12.65 46.64 42.73 15.76 19.46 31.8 33.65 33.29 42.56 26.66 25.96 10.13 12.88 23.96 21.39 18.08 16.68 18.85 21.26