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transcript sequence >TCONS_00015196 ID=TCONS_00015196|Name=TCONS_00015196|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2151bp AGCGAAACTTGAAACAGaagtaaaagaaaaacagaacttatttccagaaa aaagaaaTGGAATGGTTAGTCCCTCATATAGCACGTATAGATAATTTCTG CAACAAACTTGAAACCGGGCAGAAAACATATCTCAACATTTCCCGTGACC GCGCCACATACTACGAACAACGAGCTCAATTATCACGTGATTATTTACAT CGCTTAAGAGAATCTTCCGATACCGACGAGAATAACAACATGAGAGAAAT CGAAGAAGTCGATGTTTTGAAAACATCTGATGATGGCGGTTCCGCATTCG AAATGAGTCCCTCCCAGGAAAATAGTTTTGGGTCGTCACATTCTGGTAGA ACGTCACCCGAGATTGATCTTCAAGGTCAAATAAAGAGATATAATGAAAT AATGCAAGCTAAAGCAAAGACATTACCTGTTTCTGTCATTGTTTCCGATC ACACGTTCACCAGCTCTGCACCCTCACCTACGTCCAGTATCACAGGAAGT GAAAGTTCACGCCTTGAGGGCGATATGAATAATATCGGACGCCCCAAATC ATACAATTACAAACCCGCCCCAATGGTACGGAAATCGGAACGTCGTTTTA TAAATGCGGAACAGAAGGATCAAAGTTATTGGGAAAGGCGTAAACGTAAT AACGCGGCGGCCAAAAAATCCCGCGAGTCACGCCGCGAGAAAGAAATCGA GGTTAGCCGACGTTGTGACGCTTTAGTCAAAGAAAACGAAGGTATGAAAT TTACTATCATGAACCTACAAGAACGTAATACACAAATGGAAAATACCATG AAAATCTACAAAGACATTTtagtcaaaaataatttgatttgatttgattt ttttcaaatttgttggTCTCATTTATACAACCCATTTCAATGTATGAGAA CTTGTATAATATGACATGAATGATCGAGGCAAGAGGAGGTGATGACATTT AATCGAGACAAAATACTTTGTGAATTTTGACCAATACCACAAACATTGAG AAGTATATGTCATAAATTACCGTGTCCCAACTGTTTATCAGACTTTGAGG GCGGGGAATCGCCATTCTTCAACAACGCCCGTATGAACAGGATCATGGAG GCCGCCCCCTGATAAACAACACTATTTCATGTCACACAAATATCGCTATC AATCCCCGGGGctaatatcaaaatatcatcGACGTTTTCTTTTGGATGTT ATAAATATTTAGACAATCAAACACAAAGACAATGGATAAAGCCAAGGGAC GAGGTTGAGCAAATAAATGATATTTGTTAGTTTGTGCAGAAAAGGAAGTa accaaaacatttaaaactgACAGCGCATTCTCAGCCGCAAGACAAAAAAA ACCCTgattggaaaagaaaaataaatatttgggCCCTGTAAATATTATAT CCAAATTTTTATTAGTATTGACGATAATTTTCTTAGTGTTTTACTTTACT TTATAGGACTGGTTCATCTATTAGATGAGAAGTAATATTTCCATTCAAGG GGAAAAATCTACGAGATCTGCCAGTCTCCTTTAACCTTTTTCTGTTACAA ACCCTGAAAAAAAtcttaaacacccctgtgtcacttCCACCGAAAGATTT GACAAATATTATTTTCGTCCCCGATGGGGAAATTTCTATCCCTattggga ttttgatagaaatctTTATACCTCAGCCAGAtctatgagacaggggtgtt ccaCCAGGtttatgagacaggggtgttccaCCAGAtctatgagacagggg tgttccaccagggctatgagacaggggtgttccaCCAGGgttatgagaca ggggtgttccaCCAGGtgtatgagacaggggtgctcCACCAGGTTTATGA GGCAGGGGTGTTCCACCAGGtttatgagacaggggtgttccaccagggct atgagacaggggtgttcttcACTTCACTGTTGtttcttttttcgaaatta TCTTTTGTTGAtattgtaaattattttgaacatTATATCAGTATTTTAAA GGTATTATTTTAAGTGCTATTTGCTCACGAAAGTCTTTAATAAGAATAAA acagaaattcttttaaataattgaagaaaaaaaaaccgtaAATCTTTTTA AGGTTCTGGACCTCCTTGAATTAAGGCTGAATTCTCATTTGGTATTATCG A Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000205:266623..282817+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015196 ID=TCONS_00015196|Name=TCONS_00015196|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16195bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000205:266623..282817+ (Clytia hemisphaerica) AGCGAAACTTGAAACAGaagtaaaagaaaaacagaacttatttccagaaa
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TGGACCTCCTTGAATTAAGGCTGAATTCTCATTTGGTATTATCGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:266623..266676 | TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:266623..266676 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015196-exon-sc0000205-1510915933:266623..266676 | TCONS_00015196-exon-sc0000205-1510915933:266623..266676 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015196-exon-sc0000205-1575043694:266623..266676 | TCONS_00015196-exon-sc0000205-1575043694:266623..266676 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:280640..282427 | TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:280640..282427 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:282509..282817 | TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:282509..282817 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015196-exon-sc0000205-1510915933:282509..282817 | TCONS_00015196-exon-sc0000205-1510915933:282509..282817 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00015196-exon-sc0000205-1575043694:282509..282817 | TCONS_00015196-exon-sc0000205-1575043694:282509..282817 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000205 | supercontig | sc0000205:266623..282817 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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