TCONS_00015196 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00015196
Unique NameTCONS_00015196
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2151

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00015196 ID=TCONS_00015196|Name=TCONS_00015196|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2151bp
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A
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000205:266623..282817+

Legend: exon
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>TCONS_00015196 ID=TCONS_00015196|Name=TCONS_00015196|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16195bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000205:266623..282817+ (Clytia hemisphaerica)
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_008506XLOC_008506Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:266623..266676TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:266623..266676Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015196-exon-sc0000205-1510915933:266623..266676TCONS_00015196-exon-sc0000205-1510915933:266623..266676Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:282509..282817TCONS_00015196-exon-sc0000205-1491911889:282509..282817Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000205supercontigsc0000205:266623..282817 +
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0 0.724471 3.42144 3.04075 0.777466 1.43439 1.16091 1.67326 8.20699 7.31823 0.531858 0.697804 1.31781 0.655046 0.333409 0.9442 0.603181 0.932459 0.157805 0 16.727 18.8704 0.264367 0.279244 0 2.50415e-10
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00015196 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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