TCONS_00001235 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00001235
Unique Name	TCONS_00001235
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2502

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000007:1136849..1147793-

transcript sequence

>TCONS_00001235 ID=TCONS_00001235|Name=TCONS_00001235|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2502bp
gcaaaaaaagtttttgcagCCGACCGggtgtttatttttttcgtccagaa
acaaaaatattttaagggtCAGCCTAAAAGAGAGAAGTGATGTTCCCATA
CATTCTGATTATACTAAATTTACTAATTGTATCACGCTGTCCAAGCAGCT
GATTCTTTTAtcatttgtatttattttatttagacataaaaaataaaaaa
caatatgCAGCTTAAACACTTAAAAACTACACTGGCTCCCCAGGATGGAG
CTGCTAAGATCACAGCAATGGCATGGGCTCCTAACAATACCAAAATGGCA
ATAGTATCAACTGATCGtgtagttgttctttttgatgAACATGGAGAAAA
AAGGGACAAATTTGGAACAAAACCTGGTGATGCTAAAACTGGGAAGAAAG
GTTACCAAGTGAAAGGACTAGCATTTTCTCCTGATTCCACCAAGATAGCT
GTTGGACAAACAGATAACATTGTTTTTGTATACAAGATTGGTGACGAATG
gGGCGAAAGAAAAGTTATATGCAACAAGTTTCTCCAACAGAGTGCTGTTA
CATGTTTGGTTTGGCCCCCAGAAAATCAATATATTATTTTTGGTCTTGCT
GATGGAAAGgTCAGGATGGCAAGTctaaaaaccaacaaatcacaAACTGT
CTATGGAACTGGTATCCATTGTATATCTTTGTGTGTCAGTCCTGATGGGA
AAGGTGTTTTGTCAGGGCATGCAGATGGAGCCATTGTCAGATATATGTTT
GAAGATACTGGGACAGGTTTGACCCAGGGGCAAGTTGTGAAACATGGCTG
TCCACCGTATGCCTTGTGTTGGGGCTCATCAATCATTGCAGCAGGATGTG
ATAAAAGAATTGTTGCATATGGAAAAGAAGGGCGGGTATTACAAAACTTC
GACTATTCAAAAGATGATGAGGAAAAAGAGTTCACAGTTGCAATAGCAAG
TCCAAGTGGTCAGTCAGTGGTGGTTGGAAGTTATGATAGATTACGTGTTT
TCAATTGGAGTCCCCGAAGAGGAGCCTGGGAAGAATCTAAACCAAAAGAG
ATCAATAATTTATACACCATCAGCTCACTTTCTTGGAAAAGAGATGGTTC
AAGGCTTTGTGCTGGCACACTCTGTGGTGGAGTTGAACTGTTTGATTGCT
GTTTGAGAAGATCTATTTTCAAGAATAAATTTGAAATGACTTATGTTGGG
TTGAGCCAGGTTATTGTCAAAAATTTGGCATCAGGAGCCAGAGTTGTTTT
AAAATCACATTATGGATACGAGATTGATGAAGTGAAAATAATGGGGAAGG
ACAGATTTCTTGTTGGACACACTTCAGAAACATTGCTTGTGGGAGATCTA
AACGAAAACAAGCTTAGTGAGCTTCCATGGCATAATTCAGGTGGAAATGA
GAAGttcttctttgaaaatgaaacaGTTTGTATGGTATTCAATGCAGGAG
AATTATCTTTGATCGAGTATGGTCAAAATGAAGTGTTAGCTACAGTCAGA
ACAGAATTCATGAACCCTCATCTTATAAGCGTACGTTTGAATGAAAGAAA
GCTGAAAGATCAAGAAGACAATAAAAAATTGGGTTATTTGATTGACCTGA
AAACTATATGTGTCAtgGACTTGATGTCAGGGATGGTTGTAGCCAATATT
TCACATGATgtcaaaattgactggttagaGATGAATGAGACTGGAAAGAA
GCTCTTATTCCGAGACAAAAAACTGAGGTTATTATTGGCAGATATTCAAA
GTGAAACAAAAACCACTATTTCTACATATTGCTCTTATGTGCAATGGGTG
CCTTTGAGTGATGTTGTGGTAGCTCAAAGCAGAAGCGATCTTTGTGTTTG
GTACAATATTGAATCACCTGAACGAGTGACTATCGTTCCCATCAAAGGTG
ACATCACAGACCTTGAGAAGATCGAGGGTAAAACAAACGTGATCGTACAA
GAAGGTGTACAATCGATCAATTACACATTAGACGAAGGGCTAATCGAGTT
TGGAACTGCTATGGAAGATGGTGATTATGCTAGGGCTGTTTCGTTTCTGG
AAGGATTGGAGATGTCACCTGAAACAGAAGCTATGTGGAAGACTCTCAGC
AAGGTTGCCATGGAGAATAAAGAGCTTTTCATCGCCGAAAGGTGTTTTGC
TGCACTAGGAGATGTTTCTAAAGCTCGCTATTTACGTGGAATCAACGACT
TGATCGATGAACTGAACCCAAGTTATGGAGATCCTATGTATCATCCGACT
ATTCGCGCCAAACTGGCCATTTTTGAGAAACAATTCAAACTTGCAGAAAG
TATTTACTTGGAACAAGGACAAGTTGATGAAGCGATGGAGATGTACCAAG
AAGTTCACAAGTGGGATGAATCTTTGGCCATCGCCGAAGCCAAAAGACAT
CCAGAACTAGAGAACCTTAGAAGCTATTACTTGCAATATTTGATGAAGTC
AGGCCAAGAAGAAAAAGCTGGAGAGGTTAAAACCTTGAATTTAGTTAACA
GA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000007:1136849..1147793-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00001235 ID=TCONS_00001235|Name=TCONS_00001235|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10945bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007:1136849..1147793- (Clytia hemisphaerica)
GCAAAAAAAGTTTTTGCAGCCGACCGGGTGTTTATTTTTTTCGTCCAGAA
ACAAAAATATTTTAAGGGTCAGCCTAAAAGAGAGAAGTGATGTTCCCATA
CATTCTGATTATACTAAATTTACTAATTGTATCACGCTGTCCAAGCAGCT
GATTCTTTTATCATTTGTATTTATTTTATTTAGACATAAAAAATAAAAAA
CAATATGCAGCTTAAACACTTAAAAACTACACTGGCTCCCCAGGTATGAA
AACTTTCTTTTTTACAGTGTTGTAACTTTTCTCTTCATATAAAAAACTAT
TTAGGAATGAAATATTAAAGAACTCAAAATATAACCATTGCTGAACTTTA
TCTTTTTCATTTCACCCAGAGGCAAGACTGTTTAATCCTTTCTAGTATGA
TTTATTGTTATACCTTTAAATTGTAATTTTTATGAAGGATGGAGCTGCTA
AGATCACAGCAATGGCATGGGCTCCTAACAATACCAAAATGGCAATAGTA
TCAACTGATCGTGTAGTTGTTCTTTTTGATGAACATGGAGAAAAAAGGGA
CAAATTTGGAACAAAACCTGGTGATGCTAAAGTAAGCTCTATCTAAGTCA
AAAAATCCCTTTGTGATAGAACAAATAAAAGTTATCACATGATATCGATT
ACAATATGGGATGTATTATATTAAGTTAAACTTTTTCCTCATATTTTTGA
GCCCGTATGCCAGGAAACTATCAAAAACTTTGAACAAGAAAAATATATCC
AATATTGTGCGAGTAAGTTTGATAATTGGTTTAGCATTAACTTGAAAAAT
ACGACCAAACTTTTCTCTCTCCATTTGTGTCTTTTTCTATGTTTTTTTTT
CTCTTCATGCATTTTGTTCTTCCTCTATTTTGATGAAATTAACACCAAAA
CATTTATAAAAAATCCAAAGGTCATTAAAATGTTAAAAACATTCTTTTGT
ATAACTCTTCGGATGATTTGCTGCTCTATCAGCCAATCAGATTGCTCATA
TTTTTCATGTTGATGAAAAGATTAAATTATTTTAGTAGTCACATAAGCAT
AAGCCTTGGATGAAATAATGAATCTTCTTCATTTATTGATTTCAAATCTT
TCTTACTATCCACACCAAAGTTACCTTTCTAAATGATTGTTCTTTTAGAC
TGGGAAGAAAGGTTACCAAGTGAAAGGACTAGCATTTTCTCCTGATTCCA
CCAAGATAGCTGTTGGACAAACAGATAACATTGTTTTTGTATACAAGATT
GGTGACGAATGGTAAGACTAAGAACATTGATCTTTCTAAAAACTGAAACA
TCTACAGTCAGATATTATTTACTTATATTTGAAGATCGAACATAATATGA
AAATGTTATTTATATATATTAATTAATTTTTGATTTTATTTTAGGGGCGA
AAGAAAAGTTATATGCAACAAGTTTCTCCAACAGGTAAAGTATCTTTTTA
AATTGATTATTATTTCATCACAAGAGAAATTTTTTTAACATTTGATACCA
TAGTATTGTATTATCCTATACTGTGTTAAATGAATGATTTTACTTTACAC
ATCTGCTATAATAATATAATTTAATGAGGATCAATTTTTACATTAGAGTG
CTGTTACATGTTTGGTTTGGCCCCCAGAAAATCAATATATTATTTTTGGT
CTTGCTGATGGAAAGGTTTGTGACTTTTGACATTTTGACTTTTATGATGG
ATGATATCTCTTTTGGGATTCAAATTTTATAAATTGATAAAGTAAAATAG
TTGTCTGTTTGACCATACCTCCTAAATCTATAGGGCTGACAAAATGAATG
GCAAAAAAAGTGTTTTTAAAACCAGCCTAATGTCACCCCATAAGTGACCA
TTTCTTAGCTGAACAGTTAATTTATTTTTTTGAAAACAAATAATTAATTT
TACTATACTCATGAATTTTAAAAATCAAAAGGTGATCCTAAAAGTCTCAG
CTTTCAAAGATGGTTACATTTAAGAGATGGTATTGGTAGGAAAGGGAGAT
CTACTTTTTAACCTGGAAATATATATTGACGATATAAAGCATACAAACAC
CTAAAATTTTAGATCACACTTCAAATGATTGAGTTTGAGAATGATTATTT
TCTTCATCTTTCTGTAATGTTTTAAAATTTCCATTTTTTTTTAGGTCAGG
ATGGCAAGTCTAAAAACCAACAAATCACAAACTGTCTATGGAACTGGTAT
CCATTGTATATCTTTGTGTGTCAGGTTGGCATTCTGTTTTAATTACATAA
ATGATTTTCAAACTATAAAATGAAAGCAATATTACTATTATGTTAAGTCT
TTGAAGCTTGTAAATGAAGACATAATTGAGTACAGCTTTCAAGAAACTAC
TTTAACAATTCATATTTAAGCATTTTCACAACAGATAATAAACTAAAAAT
TTTTTTGAAAAAGTTTCATTTAATATAAACATTTTCTTGACTGGACAAAT
CCAATAACTGTTTCAGGTTAAATTATCTTTGCCATCTGTTCTCTTTTTAG
TCCTGATGGGAAAGGTGTTTTGTCAGGGCATGCAGATGGAGCCATTGTCA
GATATATGTTTGAAGATACTGGGACAGGTTTGACCCAGGTATTTTACATA
TTAAATGTTAAAACATTTAAAGTAGACAAACTAAACTAATATTAGGTATA
TTTCTTTTTGAGAAGTCCGACTGTTACTAGAAGAGTCAATTGCACTTCAG
ACAAACAATCATTCCAAAGAATAATTTGCAAATTTCTTTTTTTTTGAAGT
GCATTACACAAAGAATAATACAAAGAATTATATGCTATCCTAATATTCAA
ATCTCAAGATTGGTTCGATTTTTTCCATAGGGGCAAGTTGTGAAACATGG
CTGTCCACCGTATGCCTTGTGTTGGGGCNTACAAGAGAAAATTTTTTAAC
ATTTGATACCACAGTATTGTATTATCCTATACTGTGTTAAATGAATGATT
TTACTTTACACATCTGCTATAATAATATAATTTAATGAGAATCAATTTTT
ACATTAGAGTGCTGTTACATGTTTGGTTTGGCCCCCAGAAAATCAATATA
TTATTTTTGGTCTTGCTGATGGAAAGGTTTGTGACTTATGACATTTTGAC
TTTTATTATATCATGATATAATGATGGATGATATCTCTTTTAGGATTCAA
ATTTTATAAATTGATGAAGTAAAATAGTTGTCTGTTTGACCATACCTCCT
AAATCTATAGGGCTGACAAAATGAATTGCAAAAAAAGTGTTTTTAAAACC
AGCCTAATGTCACCCCATAAGTGGCCATTTCTTAGCTGAACAGTTAATTT
ATTTTTTTGAAAACATATAATTAATTTTACTATACTCGTGAATTTTAAAT
ATCAAAAGGTGGTCCTAAAAGTCTCAGCTTTCAAGATGGTTACATTTAAG
AGATGGTATTGTTAGGAAAGGGAGATCTACTTTTTAACCTGGAAATATAT
ATTGACGATATAAAGCATACAAACACCTAAAATTTTAGATCACACTTCAA
ATGATTGAGTTTGAGAATGATTATTTTCTTCATCTTTCTGTAATGTTTTA
AAATTTCCATTTTTTTTTAGGTCAGGATGGCAAGTCTAAAAACCAACAAA
TCACAAACTGTCTATGGAACTGGTATCCATTGTATATCTTTGTGTGTCAG
GTTGGCATTCTGTTTTAATTACATAAATGATTTTCAAACTATAAAATGAA
AGCAATATTACTATTATGTTAAGTCTTTGAAGCTTGTAAATGAAGACATA
ATTGAGTACAGCTTTCAAGAAACTACTTTAACAATTCATATTTAAGCATT
TTCACAACAGATAATAAACTAAAAATTTTTTTGAAAAAGTTTCATTTAAT
ATAAACATTTTCTTGACTGGACAAATCCAATAACTGTTTCAGGTTAAATT
ATCTTTGCCATCTGTTCTCTTTTTAGTCCTGATGGGAAAGGTGTTTTGTC
AGGGCATGCAGATGGAGCCATTGTCAGATATATGTTTGAAGATACTGGGA
CAGGTTTGACCCAGGTATTTTACATATTAAATGTTAAAACATTTAAAGTA
GACAAACTAAACTAATATTAGGTATATTTCTTTTTGAGAAGTCCGACTGT
TACTAGAAGAGTCAATTGCACTTCAGACAAACAATCATTCCAAAGAATAA
TTTGCAAATTTCTTTTTTTTTGAAGTGCATTACACAAAGAATAATACAAA
GAATTATATGCTATCCTAATATTCAAATCTCAAGATTGGTTCGATTTTTT
CCATAGGGGCAAGTTGTGAAACATGGCTGTCCACCGTATGCCTTGTGTTG
GGGCTCATCAATCATTGCAGCAGGATGTGATAAAAGAATTGTTGCATATG
GAAAAGAAGGTATTGTTTTTTGAGCTTATGTTTCACGAGAAAATCATTTT
TATTTAACAAATGATTAATCCTAATATTTCATTTCCCTAAACTCTCTTTA
GGGCGGGTATTACAAAACTTCGACTATTCAAAAGATGATGAGGAAAAAGA
GTTCACAGTTGCAATAGCAAGTCCAAGTGGTCAGTCAGTGGTGGTTGGAA
GTTATGATAGATTACGTGTTTTCAATTGGAGTCCCCGAAGAGGAGCCTGG
GAAGAATCTAAACCAAAAGAGATCAATAATTTATACACCATCAGCTCACT
TTCTTGGAAAAGAGATGGTTCAAGGCTTTGTGCTGTAAGTTAGATAATTC
CCTCTTATTTTTTGTCCTGCTGGAATATAGGTTTTAATACATAAAGACAG
TTTGACTTACATATGGATGAAAAGTTTCAATTAGTATTCTACATGCAAAT
ATAAAGAATTTTTTTAAATGGTATTTACAAATATATCATAATACAGTAGC
TAAATCTTACTGAATAATATTATTTCTGACTTCAGGGCACACTCTGTGGT
GGAGTTGAACTGTTTGATTGCTGTTTGAGAAGATCTATTTTCAAGAATAA
ATTTGAAATGACTTATGTTGGGTTGAGCCAGGTAAAATGAAGGATTTTTT
GTTATACTTTTGAAGATATTAACCCTTCAACCCTTTCAGACCCGGTACAC
ACGATTTAAATCTGCCAAAATACCAAGTCCTGACCACTTGATTTAAAAGG
GCATACACCGGATGCTGTTAGAAAGAGTACAAAAATATCTTTTCAATGGT
ACAAAAACCATTGCCTAAGTCTCAAGTTAAAACCTTTTATGCCAATTTGA
AAATTTGGAAAAAATGTTGCGCGCTGGAAAGGTTAAGAAAAAATTAAATA
AGAATCTGTATTTTGTAAAAAATATCTAAAAAATTGTCCAGAGGAAAACC
AATTTTCTCTGTCTGTGCGAGAGTGTGGAACATATAACATAGTTGAAAAT
AACACATCATCTTTCTTATGAAAATTTCTGCCAACTGGCCTTTTTCAACA
TAAAAATGAATTTAATGTTCTTCATTCGCCGCTGTGAGGAGACATTCTTA
ATGTTAGCAAAGGAAAGCTTACGTTCTGCTCTCTAAAGAGCAAATCATCT
CGTTTCGGTTCTCTAGCCTTCAGAATTTCTCGACTGACTAGTTGGTCACT
ATCCTTGTTTTTTTTTAGCCACAGTGCTAGCTGGTTGCAATTGAGGTCAA
AAAAAGAAATGTTCTGAACAGATGCGATTCAAGCGCAGGCCCTGGCCATA
AGGAATGGCCTTTTTTGAATGAAATGCACAATTATAAAAAAATATTTAGT
TATTTTCACTAACATTACAAATACAAAGAAACTTTGTTATTATTAATGCT
AACTGTTGATTTCTAGGTTATTGTCAAAAATTTGGCATCAGGAGCCAGAG
TTGTTTTAAAATCACATTATGGATACGAGGTTTGTATATAAATAATTTTT
ATAAGTAGAAAATCTATCATCAATATTTCTGCCTAATCAACTTTTTCTCA
AGAATCTGTAATATCATATTTTAAAGTTATATTTCTTGGCCCATTATTAT
CCCTTGCTGATGTTTTTAGATTGATGAAGTGAAAATAATGGGGAAGGACN
TTGTCCACCGTATGCCTTGTGTTGGGGCTCATCAATCATTGCAGCAGGAT
GTGATAAAAGAATTGTTGCATATGGAAAAGAAGGTTTTGTTTTTTGAGCT
TATGTTTCACGAGAAAATCATTTTTATTTAACAAATGATTAATCCTAATA
TTTCATTTCCCTAAACTCTCTTTAGGGCGGGTATTACAAAACTTCGACTA
TTCAAAAGATGATGAGGAAAAAGAGTTCACAGTTGCAATAGCAAGTCCAA
GTGGTCAGTCAGTGGTGGTTGGAAGTTATGATAGATTACGTGTTTTCAAT
TGGAGTCCCCGAAGAGGAGCCTGGGAAGAATCTAAACCAAAAGAGATCAA
TAATTTATACACCATCAGCTCACTTTCTTGGAAAAGAGATGGTTCAAGGC
TTTGTGCTGTAAGTTAGATAATTCCCTCTTATTTTTTGTCCTGCTGGAAT
ATAGGTTTTAATACATAAAGACAGTTTGACTTACATATGGATGAAAAGTT
TCAATTACTATTCTACATGCAAATATAAAGAATTTTTTTAAATGGTATTT
ACAAATATATCATAATACAGTAGCTACATCTTACTGAATAATATTATTTC
TGACTTCAGGGCACACTCTGTGGTGGAGTTGAACTGTTTGATTGCTGTTT
GAGAAGATCTATTTTCAAGAATAAATTTGAAATGACTTATGTTGGGTTGA
GCCAGGTAAAATGAAGGATTTTTTGTTATACTTTTGAAGATATTAACCCT
TCAACCCTTTCAGACCCGGTACACACGATTTAAATCTGCCAAAATACCAA
GTCCTGACCACTTGATTTAAAAGGGCATACACCGGATGCTGTTAGAAAGA
GTACAAAAATATCTTTTCAATGGTACAAAAACCATTGCCTAACTCTCAAG
TTAAAACCTTTTATGCCAATTTGAAAATTTGGAAAAAATGTTGCGCGCTG
GAAAGGTTAAGAAAAAATTAAATAAGAATCTGTATTTTGTAAAAAATATC
TAAAAAATTGTCCAGAGGAAAACCAATTTTCTCTGTCTGTGCGAGAGTGT
GGAACATATAACATAGTTGAAAATAACACATCATCTTTCTTATGAAAATT
TCTGCCAACTGGCCTTTTTCAACATAAAAATGAATTTAATGTTCTTCATT
CGCCGCTGTGAGGAGACATTCTTAATGTTAGCAAAGGAAAGCTTACGTTC
TGCTCTCTAAAGAGCAAATCATCTCGTTTCGGTTCTCTAGCCTTCAGAAT
TTCTCGACTGACTAGTTGGTCACTATCCTTGTTTTTTTTTAGCCACAGTG
CTAGCTGGTTGCAATTGAGGTCAAAAAAAGAAATGTTCTGAACAGATGCG
ATTCAAGCGCAGGCCCTGGCCATAAGGAATGGCCTTTTTTGAATGAAATG
CACAATTATAAAAAAATATTTAGTTATTTTCACTAACATTACAAATACAA
AGAAACTTTGTTATTATTAATGCTAACTGTTGATTTCTAGGTTATTGTCA
AAAATTTGGCATCAGGAGCCAGAGTTGTTTTAAAATCACATTATGGATAC
GAGGTTTGTATATAAATAATTTTTATAAGTAGAAAATCTATCATCAATAT
TTCTGCCTAATCAACTTTTTCTCAAGAATCTGTAATATCATATTTTAAAG
TTATATTTCTTGGCCCATTATTATCCCTTGCTGATGTTTTTAGATTGATG
AAGTGAAAATAATGGGGAAGGACAGATTTCTTGTTGGACACACTTCAGAA
ACATTGCTTGTGGGAGATCTAAACGAAAACAAGCTTAGTGAGGTAAGTTC
CTTCCTCAAGAACTATTTTTGAAATTAATATCATAAGATCTTTCAAGTGA
CATTATGGAACATAAAAAATAACAGAACTTGATTTTGATAATTATACTGT
TTTGTTTTTATGATTCAGCTTCCATGGCATAATTCAGGTGGAAATGAGAA
GTTCTTCTTTGAAAATGAAACAGTAAGTTTGTTTAAAATTCAATACATTT
TTCTTTTGGAAAAAGTAAAACAAAGAAAGTAGATTACTTCAAAACAATTT
TAAATCTTTCAAAGGTTCCTTAGCTTGCCACTGCTAAAATCATACCTTGT
TAGCATTACGAGTTTCAGGACTTCTATGTGTTACTTTGTTATTGTTTTAA
TCAATTAGGTTTGTATGGTATTCAATGCAGGAGAATTATCTTTGATCGAG
TATGGTCAAAATGAAGTGTTAGCTACAGTCAGAACAGAATTCATGAACCC
TCATCTTATAAGGTAATGATTTTTCAAATGCAGATATGAAACGATTGTGA
AATGTATTCTAGGGTTATGATATTTAGAATTTGATTTTTGAATAGTCTAT
TCCATTAAACAAATTTCTTTAGATATTTCAGAATAATTTACCCTGCTGCC
TCACATTCCTGCCTTGGTATTTTTACCGGAAAGAATTGAAACTCCATTCT
TTCTTACCAGCCATCCCTCTGTAAGAACTAGACTGGACGCTAGTCAGTAT
GATTCTCAATAGCAGTATTTCTTGACTTAACTTTTTCAGCGTACGTTTGA
ATGAAAGAAAGCTGAAAGATCAAGAAGACAATAAAAAATTGGGTTATTTG
ATTGACCTGAAAACTATATGTGTCAGTAAGTAAACGTTTTGTAAAAAATC
GACTATTTTGGCATTATTAGCAGCATTTCTCATTTCTATCGGGTGAATAC
AGATTTGAAATATTTGGGCTATTATGCTAAGCTCAGTTGTAAATTAGCCT
TAGGATTTTAGTTTTTTTTTACTTTAAATTTCTTTAATTTTCAGTGGACT
TGATGTCAGGGATGGTTGTAGCCAATATTTCACATGATGTCAAAATTGAC
TGGTTAGAGGTACTCCACTCTCATCTCTTATTGTCTCTAAGTTATGAATT
TCCAAGATAATATATTTATATTTAGATGCAAATCTCAAGAGTTTGAGTGG
TTGACAAATCTTGAATTTTCTCTGTTTATAGATGAATGAGACTGGAAAGA
AGCTCTTATTCCGAGACAAAAAACTGAGGGTAAGTAATTTAGATAATTTC
CGATACTCTTCCTCAAATTAGGACAGTTGTTTTAAAGTGTGAAGTGATTT
CTGGTTTCAACTTCTAATTATAGTACACTTACCTCTCAACTTTTAGTTAT
TATTGGCAGATATTCAAAGTGAAACAAAAACCACTATTTCTACATATTGC
TCTTATGTGCAATGGGTGCCTTTGAGTGATGTTGTGGTAGCTCAAAGCAG
AAGCGATCTTTGTGTTTGGTACAATATTGAATCACCTGAACGAGTGACTA
TCGTTCCCATCAAAGTAAGAGACCATTTTGTTCATTTCCTCTCAAAGGCT
TAACGGCGATCAAAAATAAACTATTTAAAAACTATTTTTTATGTCTTTTG
ATTCTTTCTAATGACTTGTAATAATGACTTGTAATTTGAGGGGTCGTTTG
TTAAATTTGGTCAACTAGGTAAAAAGCTATGGCCTAAATGCTAAAATATT
ACTTTTCAAAAAAGTAAAAAAAATGGCGAAAAATGAGGGTATTAAATCAT
CATAAAGATATCATAAAGAAATCTTTCTTTTATCAATTTATTAACGATCG
AAGTCTCTTCGTCCTCTTCGTGGCCAGTTTCCAAGAAAGGTGGTCAACAA
TCGAGGAGATGTTGAGTGACCCCTAAGTTCGCCTGAGCTTACAGTGTGTG
ATTTCTTTTTGTGGGGTTACACGAAACAAGAAATCTGGGAGCAACTCACA
AATTTGCAATTCCAGACCCTTGATCAATGAAAGCTTCAATCAAATATGAA
GACTTGGCAAATCGATTTTATATTATTTTCTCATGATAAAAAATTACATT
AATTGACTTTGTGACCCTTGTTTTACACGGTTTAGCCTACGATCGAGGCA
CCCTTATTCTGGATTTGTTATTCGAATTTCAAATCAAAGTTGAAAAGACA
CTGGTTTGGAATGTTAAGTTAAACTTTCCTTGCATGTTTAGGGTGACATC
ACAGACCTTGAGAAGATCGAGGGTAAAACAAACGTGATCGTACAAGAAGG
TGTACAATCGATCAATTACACATTAGACGAAGGGCTAATCGAGTTTGGAA
CTGCTATGGAAGATGGTGATTATGCTAGGTTTGTCTTATTGGTTATTTTA
ATTAGATTTTAAGACATTGATCTTCTAATGCTGCAGCAAATTTTTTAACA
TAAACAAACTTATTAAGATAAGGGTTATTTTTTATTGAGATTTTCTTCTC
AAAATGCTTCAACTGAGAGATTTTACCTGTCGTCTTTTCTTCGTTGTATT
ACTTTTTTTTGCTCAGAAATCTGATATAAAATTGTATTTTGTTCAGGGCT
GTTTCGTTTCTGGAAGGATTGGAGATGTCACCTGAAACAGAAGCTATGTG
GAAGACTCTCAGCAAGGTTGCCATGGAGAATAAAGAGCTTTTCATCGCCG
AAAGGTAAGACATAAATATGATCCAACAATCATGATTCAATGCATAGTCC
GAAACATTTTTTCTACAAAGGCTCTTTTAAGAGGATTCTGTAATGGGGTT
CTTAAACTTTTCAAAATATATTTTTGCTTTGTAGGTGTTTTGCTGCACTA
GGAGATGTTTCTAAAGCTCGCTATTTACGTGGAATCAACGACTTGATCGA
TGAACTGAACCCAAGTTATGGAGATCCTATGTATCATCCGACTATTCGCG
CCAAACTGGCCATTTTTGAGAAACAATTCAAACTTGCAGAAAGTATTTAC
TTGGAACAAGGACAAGTTGATGAAGCGATGGAGATGTACCAAGAAGTTCA
CAAGTGGGATGAATCTTTGGCCATCGCCGAAGCCAAAAGACATCCAGAAC
TAGAGAACCTTAGAAGCTATTACTTGCAATATTTGATGAAGTCAGGCCAA
GAAGAAAAAGCTGGAGAGGTTAAAACCTTGAATTTAGTTAACAGA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000661	XLOC_000661	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00001235 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: IF172 (Intraflagellar transport protein 172 homolog OS=Homo sapiens GN=IFT172 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 1090.1 bits (2818), Expect = 0.000e+0
Identity = 510/761 (67.02%), Postives = 636/761 (83.57%), Query Frame = 1

Query:  205 MQLKHLKTTLAPQDGAAKITAMAWAPNNTKMAIVSTDRVVVLFDEHGEKRDKFGTKPGDAKTGKKGYQVKGLAFSPDSTKIAVGQTDNIVFVYKIGDEWGERKVICNKFLQQSAVTCLVWPPENQYIIFGLADGKVRMASLKTNKSQTVYGTGIHCISLCVSPDGKGVLSGHADGAIVRYMFEDTGTGLTQGQVVKHGCPPYALCWGS-SIIAAGCDKRIVAYGKEGRVLQNFDYSKDDEEKEFTVAIASPSGQSVVVGSYDRLRVFNWSPRRGAWEESKPKEINNLYTISSLSWKRDGSRLCAGTLCGGVELFDCCLRRSIFKNKFEMTYVGLSQVIVKNLASGARVVLKSHYGYEIDEVKIMGKDRFLVGHTSETLLVGDLNENKLSELPWHNSGGNEKFFFENETVCMVFNAGELSLIEYGQNEVLATVRTEFMNPHLISVRLNERKLKDQEDNKKLGYLIDLKTICVMDLMSGMVVANISHDVKIDWLEMNETGXXXXXXXXXXXXXXADIQSETKTTISTYCSYVQWVPLSDVVVAQSRSDLCVWYNIESPERVTIVPIKGDITDLEKIEGKTNVIVQEGVQSINYTLDEGLIEFGTAMEDGDYARAVSFLEGLEMSPETEAMWKTLSKVAMENKELFIAERCFAALGDVSKARYLRGINDLIDELNPSY-GDPMYHPTIRAKLAIFEKQFKLAESIYLEQGQVDEAMEMYQEVHKWDESLAIAEAKRHPELENLRSYYLQYLMKSGQEEKAGEVK 2481
            M LKHL+T L+PQDGAAK+T MAW+ NN K A+ + DRVV+L+DEHGE+RDKF TKP D K G+K Y VKG+AFSPDSTKIA+GQTDNI++VYKIG++WG++KVICNKF+Q SAVTCL WP E   I+FGLA+GKVR+A+ KTNKS T+YGT  + +SL  +  GKG+LSGHADG IVRY F+D G+G +QG++V H CPPYAL W + SI+AAGCD++IVAYGKEG +LQ FDYS+D +E+EFT A++SP GQSVV+GSYDRLRVFNW PRR  WEE+KPKEI NLYTI++L+WKRDGSRLC GTLCGGVE FDCCLRRSI+KNKFE+TYVG SQVIVKNL+SG RVVLKSHYGYE++EVKI+GK+R+LV HTSETLL+GDLN N+LSE+ W  SGGNEK+FFENE VCM+FNAGEL+L+EYG N+ L +VRTEFMNPHLISVR+NER  +  EDNKKL YLID+KTI ++DL+ G  +  +SH+ ++DWLE+NETG KLLFRD+KLRL L DI+S +KT I  +CSY+QWVP SDV+VAQ+R+ LCVWYNIE+PERVT+  I+GD+  LE+  GKT V+V EGV ++ YTLDEGLIEFGTA++DG+Y RA +FLE LEM+PETEAMWKTLSK+A+E ++L IAERCF+ALG V+KAR+L   N++ D+++  Y G+      +RA+LA+ EK +KLAE I+LEQ  V+EAM MYQE+H+WDE +A+AEAK HP LE LR  Y Q+LM + QEE+AGE++
Sbjct:    1 MHLKHLRTLLSPQDGAAKVTCMAWSQNNAKFAVCTVDRVVLLYDEHGERRDKFSTKPADMKYGRKSYMVKGMAFSPDSTKIAIGQTDNIIYVYKIGEDWGDKKVICNKFIQTSAVTCLQWPAE-YIIVFGLAEGKVRLANTKTNKSSTIYGTESYVVSLTTNCSGKGILSGHADGTIVRYFFDDEGSGESQGKLVNHPCPPYALAWATNSIVAAGCDRKIVAYGKEGHMLQTFDYSRDPQEREFTTAVSSPGGQSVVLGSYDRLRVFNWIPRRSIWEEAKPKEITNLYTITALAWKRDGSRLCVGTLCGGVEQFDCCLRRSIYKNKFELTYVGPSQVIVKNLSSGTRVVLKSHYGYEVEEVKILGKERYLVAHTSETLLLGDLNTNRLSEIAWQGSGGNEKYFFENENVCMIFNAGELTLVEYGNNDTLGSVRTEFMNPHLISVRINERCQRGTEDNKKLAYLIDIKTIAIVDLIGGYNIGTVSHESRVDWLELNETGHKLLFRDRKLRLHLYDIESCSKTMILNFCSYMQWVPGSDVLVAQNRNSLCVWYNIEAPERVTMFTIRGDVIGLERGGGKTEVMVMEGVTTVAYTLDEGLIEFGTAIDDGNYIRATAFLETLEMTPETEAMWKTLSKLALEARQLHIAERCFSALGQVAKARFLHETNEIADQVSREYGGEGTDFYQVRARLAMLEKNYKLAEMIFLEQNAVEEAMGMYQELHRWDECIAVAEAKGHPALEKLRRSYYQWLMDTQQEERAGELQ 760

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00001235 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00001235 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
IF172	0.000e+0	67.02	Intraflagellar transport protein 172 homolog OS=Ho...	[more]

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TCONS_00001235 (transcript) - C. hemisphaerica