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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000022_pilon:1697737..1706315- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033549 ID=XLOC_033549|Name=XLOC_033549|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8579bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1697737..1706315- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTGGGTCCTTACACTGAAATTCATTTTGCTGTTGTTGGTGGAGTTCGG
ACATTCGTTTGACGGTAAGTTAACTACGTCATCGGCCCTTTTTACACCGG
CAACTTAACTACAATATCGGCCCTTTTTACACCGGCATTAATTGCGCTAA
AGGTCAAATTTTTCCATCCCGATCCCTTACGCCGTCCCATATTACGCCAG
CGACAAGAATTTAACGCCAACAAGGAGTAGTGTAAAAAGGGAAGATTAGG
TATTATTATTTTGTGGAATTTTGGAGGTATTTGATTTGATCGGATAATAT
TTTTTTGAAATTTTTGTTTTCTTCTAAAGGTAATCAAGGAACTTGGATGG
ACAAATTTTCTTCCAAATAATTGTTTACCTAGTCATTTGGCAAATGCAAG
ATTAGCAAAGAGATAACTTGTCATTTCTTTTTAAGAACAAAATATCTCTC
TGGGATTTAAAGATACAGATTTTCCTGGTACCATATGATAGCTAAACTTT
CCCATTCCCAGCCAAACATTCCTGGTGCATTTTAGCCTGGAGATCCATGC
TATGATTTCTTATTCTATATACTGATGGCGAAATATATAGCATGGTATGG
GCTGAGAGTTTGAATTTCCCAGATCCTAATAACAGTCGAAAACATAGAGA
ATCAAATTTTGTTGTTCTTTTACTGGTTACACTTTCTTAGAGAAAGCGCA
ACTTCCGAAATTTGTTTTTTATTTTAGTAAGTAAGGACAGCGCTAAATTC
GAATTTCCCACTGTAATTTTTTTGAGGCAAATCTGTGCCTCACAGGTCAT
ACCCGTCCTGTATACATCAGATTATAAAGATACAGGACGGGTCTCCTGTC
TAGGCTCATTTCGGCATCTTTCCGCTGTTTTTCTTCTGATTATAACGGCA
AAAAAACTTTTTTGACTATACGTGCAAATGTATGGACAACATGCAAAGGC
CTAAAGATAAAGCTACTTTTGTCGTTACATGTTAAAGTTGCAAAAGTAAA
GGAATGAGAAAGTTTACATCCTACGGTAGAGATAGTAATAAAATCTGTAT
CCTTTACACTTTAGGAAACGCCAATTATGAAGGCTGTTACATTGTGTACA
ATCAAGGTCGATTCAATGTCTCCTTTCAACTTCCAGCCAATGAAACAGTT
CAAAATGATAACCATACAAGCTTTCAAGAAGACTACAAAAACCTCTACGA
CATCCAACTGTTTTACTCAAACAACTCAAACAGATATGATTTCACGCCCG
GGCGTTTTTGTCAAGTTACATTCATAACGCCCCAAAACGGATCGGTTCAA
TGCCACTTGTTCCCATTGGAAGGGCGTGATATGTATCATATTAAATTGGT
TGTCCAACGGCTGAGTGATGGGAAGATATTGATTGATCAATATATAAAAT
CATATTTTAATACGTACCTAGACGGATTCAACTGTTCAATTGGTAAGTTT
ACACGTTTTGTTTTTATTAATATATGAACAAACGATGTAAAAACAAGTTA
AGAACATTTTGAGGCTTTGTAAAACACCCGATTTCTTAGAAAAGACAATT
AACAAAAATATTCACCAAATGGTGGCATAAGAACATGTTAAGGGAACATT
TTTAGACTTAAAACTCAAAAAGTTAACAATATCCATCCGAAGGCTTTAAA
AAATGTTCCTATAAAAACACGTGTATTCTTTAAAACACTTACCGACTGGC
ACAGTACGCCCAATCATTATTTGATATTCTGATGGCGGATTGGCGGCCGC
CTTCGTTGAAGATCTAGAGTGACGGGTCAATTTCTCATCGGTGAGAATTG
AATAATAGTCGGTCTTCGGTTTTCCGCATCCCCAGTCGGGTTCAACGGCC
CTTTGCGCGTTAACCTAAAAATATTTCAGTAATCCCAGAAAACAAAGGGT
TAGGTTCAGACCTCCCTTGGCAAATCCCTCGACGTGCTCTGGCGAAATTA
GGTAATCCAAACCCTCCAGCTGTTGAAAACCCTCCTTGATCTTTAGAACG
TTAGAGTGCACTGCATGGCTGGTGAGCGAATTTACTGCAAGTCTCTAGAA
AATTACTCTTCAGCCAATTGGAAATACTCTACAAGGACGCAACTAGTACA
CAATAGTAGGGGGAAATTTGTAAAATAGTGTGACTTTTTTAGTCAAAGCA
CTTGTTATACATTTTTTGGAAAGCTAAGGGGTAGGCAATCAAAATAACAT
GGGTGCCAATTTTTTTTCGGATACTTTGATGTGTTGTTCGGACAAATATG
ACGGTCTTAGGCAAAAATCATAGGGTCAAAATTTAATGAAAATTTTAGCT
TGAGAAAAGAGAGACCTGTTGTATATTTTTGGAAAGCTCTCAAAAAATTA
AGATTAGAGATATATTGCGAGTATTTGTGATTTCTGTACCTCATTCAAGA
TTCTGACCCTGAAAATAGTGTTTTCAGCCAGAAACAGCTGTTTTGTCAGG
GGGGGGGGGGGCACGCAGTTACTACAAGACAGTATGACACTTACTACCGT
GGTGGTACTGTATTCAGAAGTTATGAAAGCAGTTACTACATAGTGTAGTA
ACTGCTGTTTGGGGGTGGTGCCAAACACTAAAACTAGCACTTTTGGTGTA
GTAAGTGCTTATATTTCAATTCTTTTTAAAGAACTTTCAAAATTTTTACA
AAAAATGATTTTTTTTGTGAAAAAATTATTTGTTAAAAAAAATATTTTTG
TTATAAATGGACGAAAAAAAATCTGAAATTTTTCTCAGACCCAACTTTGA
AATTATGCTTTCCCTAATTTCATTAAAATGTTCTCAAAAGCTGTTAACCA
AGTAAATCAAAAGAAAATCTAGCACAAAAATGGCTTTAGGTTGAAAAATA
ATCGCAATTTAGGGTAATTTCGAGCATGTTTTTGATGATATCACTCAAAA
ACAGGGGTGGTACCTGGAAATCTTTTCTGAAAACAGTTACTACCAAGGTG
TAGTAACTGCAAAGGGTGGTGGTCCTGAAAAAAATTGTTGAAAAAGCACT
TACTACACATCATGTCTTGTAGTAACTGCGTGCCCCCCCCCTGGTTTTGT
CCACTTTTTGCACTCTTTGAAGCTCCCCTAACCCTTAACTTTCCAAAAAA
TGTATAACAAGTGCTTTGACTAAAAAAGTCACACAATTTTACAAATTTCC
CCCTACTATTGTGTACTAGTTGCGTCCTTGTAGAGTACTTCCAATTAGTT
GAAGAGTAATTTTCTAGAGACTTGTAGTAAATTCGCTCTTCATCCACGTA
GTGATTCAATCATTAGACCTGTAGAGGAAAGCGCGTGTCTTATCATCCTT
GAATCTATCTCTTAATTTTGACTGTTGATTACATAGCAGCGATAATCAGT
AAGATCGAAGCTTGACCAGCTTGGGATCAAACACTAAACGTTATCTAAAA
AGGCCTTTTTACACTGTGTCACTGTCGTTAGTTGAGATGCTTCTTGAATA
CACCTAAATTTTGAATAAAAGTTAACTCTCAATACCTTCCCATTAAACTT
CTTTGTAATACTTTGCAACTGAGCAGCAATGAAAAGAAAAGTATGAAAGA
CATTTTGAAACGCTATTTTCACTATTGGATTCTAAAGGATTCTTGTGTTT
TTCACTTTAGATCATGGGCCAACCTATGTTAAACTTTTGGAGACTTATGA
TAATTTGATCAAATTAGAATGGCAATATCCTTTGTACGAACTTCAGTACC
TTTCATCCACGCATAATGTCTCAATACGTGACAAACAAAATGTGACAGTT
TTGGAGGTAAGAGCCAATCCTACTCAGAGCTTTTTTATGAAAACTCTACA
ATTTGTATATACTCCAGAAAAAAAACCTTTGAAATGGTGGTCACAATATC
TTCTTCTATCTTAGCAAAGTCACCTTAAAATGTGTCCATCACCCCAACAA
GAAAGGTTTCCCGGGCTCTTCATTTTTTATAAGGCTGGATGTGACCACTT
CTCCCAAAACTCGCTGAAATTGATCATGATTATATCCTTGAATTTTTTTA
ATATTTAAGGTTTTATTTTTACATAAGTATTTCCGTTTCATATCAGACAC
ATATATCATATCAGGACAGTGTCTTGCTATTGTTATATTATGCTGATATA
AGCAAAAAAGTGTTTTCCTTTTCCTCTTTCTGACCAATCTTGCTCCACAT
CCGTGTCGATGCAATGTGAAAAAGCTAAAATTGATGAGTAAGCGAACGAT
ATAACTCTTAATTAAAAACAAAACCTTTAAGATATAGAAGGAAAGCGAAA
TCTTGGTTGTTCTTCTGGTTTGAAAAATCTCGTTAAACAAGTGAAACGTA
GATAATCTCTTATTTATAAAATATTTGAATAAAATCTCTCAAAAAAATGA
AAATGTTGAAAATATTTTGAAATTTATCATAGTTTTTACAAAAGATTTTA
ATAAATTTTGTCTATTGTCAAAGTTAATTTTTTTTTGTGAGGGCTTGTTG
TGAGCTACGTGATTTCGACTTCAAATTAATAAATTTTTCTTTTTCCTTTC
GAAATAATCAGACGACGTTTTAATGACTTTTAGCAACGTGCACTGCAGAT
GGATTTCTAGCTAAATAGGTCTAAAACTGAATTAAAGAAAAAAACCCCGA
CAGGGCAGTTTGAAATGAGACTTGAGTTGACTAACCTTTTCCTGACATCA
GTCAATCGAATAAGCGTAGCTAGGAGATTGTTATTGTGACAAATTATTTT
TGGATTTTTGATGAGGAGAAGTCACTAACACTAAGTTTTCCCTTGGGGGA
AATTTGTATTAGGTGGTTTTTAATATTCGAAGGATGTCTCTTGAGTTTCA
CGAGCTCCTTGCGTTTCTACCATCGAGTTTGAAAGTTCGAAGGGCTAGTG
GGAAATCTTAAACCTTTTTCATGCGAGAAAAAGTGAAGCCTTAAGATTTG
CACCGCTTTTGGAATGACTGATTGAACCGAGCGCTTTCTTTTATTTTCAC
ACGGCATATATTCTCCAAAAAAGTTATAAGTTTTATTTTCAATCTACCAT
TTGTGTGAAAACCACGTGTTTCAGATGGGAAATAAGCGGCTTCGTTTACC
ATTCAAGGGTTTCAACTGTAGCACCTTCGAGGCTTTAAACAATGGCCCCC
GTCACCGGGGGGGGGCCAGGGGGCCATGGCCCCCCCAATATTTTGCAAAG
TATTTTTTTTTTTACTTTGAAAAATATTATATATACCGTTTAGAGGGGTG
AAATAAGGGCAAAAAGTCGAAAATTTTCTTCGTCGCCCAACCATGGTGGG
CGACATATTTTTTCGGCCCCCTCAATTCGATGCGCACGCCGGGGGCCATG
TAAACTCCATGGATTCTACTATAATTACTCTAATCAGCAACCCGAATTTT
ATTTCTTCTGAATTTCAAATAAGATTAAAGGTTTTATTTTTACATAAGTG
TTCCCATCTCATATCAGACACATACTTCATATCAGGACAGTGTCTGTGTC
TACCTATTGTTATATTATGCTTATATAAGCAAAAAAAATGTTTTTCTTTT
CCTCTTTCTGACCAATCTTGCTCCATAGTCGTGTCAATCCAATGTGAAAA
AGCTTTAGTAAGTAAATGTTATCACTGTTATTTAAAAAAAACTTTTAAAT
TAGATTTAGTTTTGCATCTACTTTTCCAGAAACCATGTCGATGTAGAAGT
TTAGAATGTGAGTGTACCATATCTGGTGACAACTTGATCGAACCTTGTCA
AACATACACTTTATGTCTATCTACGGTGTACAAGTTTCATAAAGAGATGG
AAAATTGTCAACCTTTTTACGCTAATCACAACAAGGTGAGGTGTAATCTT
AAACTGTTCATAAAACAAAATGGGCTATTCCAGAAAAAATTGTACCCCTA
TGTTGAGGAGATTCTTTTATGAAAAGGATCCCCTGGATTTTTTTTTTAAT
TTTCAGGACCCCCTTGGATTTCTTTTCTCACTTTTCGAACCACCCTGGTT
TTTCAACCTCATTTACTGACCACCCTGGTTTTTCAACCTCATTTACTGAC
CACCCTGATCGTCACATCTCCTCAACATGGGAGGGGCCAACTATTTCTGG
AACAGCCCAATTTATGATCAAACCTGTGCGGGCAACACAAAAATCAGAAC
AAAAAGTAGCACTATTTTTTACCCATTTTTCTTCTTTTTTTCTTACCGAA
TAATAAACTTTAAAATCTTAAACAGGCCTTTAGGGATAACCACTTAGCTT
TGTGATAGAAATGCCCTTACTATAGCAATCTTACGCAACACAATCATTAA
CCTTCGACAACCACAACACTTAAGCATGGCCTAGGAAAAACCTATTGTAC
ACAGAAGTAAAGAAAAACGCATTGAAATAACTTAGAATACTGTCAAATGT
AGCATTAGTGTGCTACATACACTAAACACCTTATTTTGAGAATATAAATA
AAAGACGAATAACCTAAACCTAGTGTGTTTCTTGTATTGCAGGCGAAGAA
AATTGTCAACAAATTTCTCCAGAAGAAGGTGAACCCCTTTTCCCTGGTTT
TCTATAAAGTTTTTCAACGACATTCCCAATAAGTCACATTCCTTAGAAAA
TATTAAGAATCGAAAAAGGTCATTTAATTGTTATAGCTTGAGGTATTTAA
CGCTATTTGACCCTTTTAAACTCTAGTCTAAACATTCAAGAACTTCAGGT
CATGGCATCGTAGGGGATCTGGCCAGTTTTGGGGGACGCTTTGATGTTTT
TCATCCAAATTTCGGATAAACATTAACTTAAAACTTCTAAGCGTGGCGAT
CGGCTAAAGCAAAACAATCACGCAAATGTAACGCCAATTACAAACATAAA
CTATAGAACTCTTCGCTTTCACAGTTTGTTTTGAATGTTTTAGCTGAGCA
ACTAGACAAGATCATCACAGTTGCAACATCCCCTTTAGAGCAGGTTTTGA
CCAAAACTTAGTCTTTACCATTTTAGAATTTTTCTAATGAAACATTTATC
AACTTTCTTTAGACCAATGGAAGACACTGTCAATTGTTGGGATTGCCACA
CCCATTTCTGTTGCAATTGCTATTATTGTTTTTGTCAAAATCTATCTACG
GTAAGCTACCTGAACCTGATATGGCTAGAAATAAGGAATTTCGTGACCTT
TTAAGGCCTTTTTTAAGTTGTAAAGCTCTTTTTAATGTCAAAAATTCGTA
CGTGGTGTCCAAATTATTTTCGATATAGACTTTGAAGTTCTCTTCCGTTT
TTTGTGACCTCACTCTTCGGTATCTTTCACCTTTTAAACCTTTGTAAGCC
AAATTAATGAGAAATATGTAAATGATTTCTTTTAAATGACCATTTTTTGG
CATGGAAATTACCTATGCATGCGTCTATGCATGAATTATTTTGGCTACTA
TTTTTATATAACTGATTCCTATTCTTTTTGTTCTCTCGCCAGACGTTGCA
AGTCATCAAGTGTCGAAAGCGAGGACCCCGAGGTATTTATTTTTCTAAAT
CTATTCAAAGTCTTTCCTCAATCTCAAAGCAATGTTCTTTTGTTTTCATT
TTTCTGTTCCACCATAGCCGTACCTAGAATGATATGATAACATCTGAATT
TCTGGGCCCAGACTCAAAGATATCTAAAGGGCTACTTAGACTACACAATA
TATTGACGAGCAATATTTGACAATATCGTTTTCGGACCGTAACGAAGTAA
ATAACAAGTGCTCTATTATAAAAAGCAAGCAATATATCATCAATATTGTG
TAGTGTTGTAACCCTTAACATCAAAACTTTGTTGTGAAGGAAAATATGAG
AGAAATTCCAAAAACTACTATCTACCAAGAATAAACTGGCATAATTGTCG
TTCTTATAGAGTCAACTAACTGAAAATACAATGCGGTGAACATTCCAGCC
ACGGCTTTCTTACGCTATGGTTCCACTCCAAATCTACCGTTTCCATTTGT
TGATGATAAGTTGTTAAAAAAGGAATAGGAATCTTATCTTTAGGAACTTC
AGTGAAGGGATTTTTTTCAGATATTCAGCCCCTTCACAATCATTTCTCTT
AGAAACAGTACTTTTTACACTTTAACTAATCAAGCATTTGACCGGGGAAA
ATGAATGCGATAATTCATTCACGTGAAAGTCAGGGTATTCGAAAATCAGC
TCGGCTCAAATTCTGTTTTACGTTAACGGCTGTAATTTGCGTTAATAGCT
TAAGCAGTTATATAAGTGTCACAAGGTGATTATTCTCCTCATTTAAGAGC
CATGTCTAAAAGTCATTTTGTATTCTTTTGTTTTGAAAATCCGAACCTTA
AGCCGTTTTTTATTTGCTCTAAACAAAATTGAGCCTAGCTATCTAAGATT
AAAATAAGCCTTTTTCATACAGTCTTACCGTGCAATAAACCATTTCAGAA
ATTTAAAATTGTGAGTCTTTTGTACTTTTGTGTTATTGAGAGTCGACAGT
TTTTAAGAAATCTAAAATGTTTTTCGATATCCCTTTCTTTTTTGCAGATT
TTCCCAGTGGTGCAAGAAGGGGAAGAAAGCACCTTACGTCCAAGAAATCC
GGAAGGTTTAGAACCGATCTATGAAACTATACCGGACATAAGTGTCCGAA
ACTACGATACTTTAAATGGTATGACGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000022_pilon:1697737..1706315- >XLOC_033549 ID=XLOC_033549|Name=XLOC_033549|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2082bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1697737..1706315- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTGGGTCCTTACACTGAAATTCATTTTGCTGTTGTTGGTGGAGTTCGG ACATTCGTTTGACGATGTGGGTCCTTACACTGAAATTCATTTTGCTGTTG TTGGTGGAGTTCGGACATTCGTTTGACGGAAACGCCAATTATGAAGGCTG TTACATTGTGTACAATCAAGGTCGATTCAATGTCTCCTTTCAACTTCCAG CCAATGAAACAGTTCAAAATGATAACCATACAAGCTTTCAAGAAGACTAC AAAAACCTCTACGACATCCAACTGTTTTACTCAAACAACTCAAACAGATA TGATTTCACGCCCGGGCGTTTTTGTCAAGTTACATTCATAACGCCCCAAA ACGGATCGGTTCAATGCCACTTGTTCCCATTGGAAGGGCGTGATATGTAT CATATTAAATTGGTTGTCCAACGGCTGAGTGATGGGAAGATATTGATTGA TCAATATATAAAATCATATTTTAATACGTACCTAGACGGATTCAACTGTT CAATTGGAAACGCCAATTATGAAGGCTGTTACATTGTGTACAATCAAGGT CGATTCAATGTCTCCTTTCAACTTCCAGCCAATGAAACAGTTCAAAATGA TAACCATACAAGCTTTCAAGAAGACTACAAAAACCTCTACGACATCCAAC TGTTTTACTCAAACAACTCAAACAGATATGATTTCACGCCCGGGCGTTTT TGTCAAGTTACATTCATAACGCCCCAAAACGGATCGGTTCAATGCCACTT GTTCCCATTGGAAGGGCGTGATATGTATCATATTAAATTGGTTGTCCAAC GGCTGAGTGATGGGAAGATATTGATTGATCAATATATAAAATCATATTTT AATACGTACCTAGACGGATTCAACTGTTCAATTGATCATGGGCCAACCTA TGTTAAACTTTTGGAGACTTATGATAATTTGATCAAATTAGAATGGCAAT ATCCTTTGTACGAACTTCAGTACCTTTCATCCACGCATAATGTCTCAATA CGTGACAAACAAAATGTGACAGTTTTGGAGATCATGGGCCAACCTATGTT AAACTTTTGGAGACTTATGATAATTTGATCAAATTAGAATGGCAATATCC TTTGTACGAACTTCAGTACCTTTCATCCACGCATAATGTCTCAATACGTG ACAAACAAAATGTGACAGTTTTGGAGAAACCATGTCGATGTAGAAGTTTA GAATGTGAGTGTACCATATCTGGTGACAACTTGATCGAACCTTGTCAAAC ATACACTTTATGTCTATCTACGGTGTACAAGTTTCATAAAGAGATGGAAA ATTGTCAACCTTTTTACGCTAATCACAACAAGGAAACCATGTCGATGTAG AAGTTTAGAATGTGAGTGTACCATATCTGGTGACAACTTGATCGAACCTT GTCAAACATACACTTTATGTCTATCTACGGTGTACAAGTTTCATAAAGAG ATGGAAAATTGTCAACCTTTTTACGCTAATCACAACAAGGGCGAAGAAAA TTGTCAACAAATTTCTCCAGAAGAAGGCGAAGAAAATTGTCAACAAATTT CTCCAGAAGAAGACCAATGGAAGACACTGTCAATTGTTGGGATTGCCACA CCCATTTCTGTTGCAATTGCTATTATTGTTTTTGTCAAAATCTATCTACG ACCAATGGAAGACACTGTCAATTGTTGGGATTGCCACACCCATTTCTGTT GCAATTGCTATTATTGTTTTTGTCAAAATCTATCTACGACGTTGCAAGTC ATCAAGTGTCGAAAGCGAGGACCCCGAGACGTTGCAAGTCATCAAGTGTC GAAAGCGAGGACCCCGAGATTTTCCCAGTGGTGCAAGAAGGGGAAGAAAG CACCTTACGTCCAAGAAATCCGGAAGGTTTAGAACCGATCTATGAAACTA TACCGGACATAAGTGTCCGAAACTACGATACTTTAAATGGTATGACGTGA ATTTTCCCAGTGGTGCAAGAAGGGGAAGAAAGCACCTTACGTCCAAGAAA TCCGGAAGGTTTAGAACCGATCTATGAAACTATACCGGACATAAGTGTCC GAAACTACGATACTTTAAATGGTATGACGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000022_pilon | genome | sc0000022_pilon:1697737..1706315 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 910-1041:133 |
| Aaloc | 871-909:1187 |
| Aaloc | 784-867:1616 |
| Aaloc | 748-780:2136 |
| Aaloc | 589-744:2951 |
| Aaloc | 445-588:4968 |
| Aaloc | 67-441:7514 |
| Aaloc | 1-63:8580 |
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