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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000134_pilon:573237..579513- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_014301 ID=XLOC_014301|Name=XLOC_014301|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6277bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134_pilon:573237..579513- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTCTAAGCCTGTTGTTAATTGGCTTGTTGGGTTGTAATGCCCTCACCTC
ATCATTGACCTACAAAGATCAGCAAAAGCTTGGTCGCAAATTAAGTCAAC
CACCAACAGATCTTGAAAGTGCTTTCTATTCGGTATCTGGATTGACTGCG
CTTAAAAAAGAAGTTCTTGGCAAAGATGCTGTTTGTGAAATTGCGGGCAA
AAATCTGGACACTAAGAACGCAAAAGCTCTATATCAATTCTCTGAAGTAA
CCAAAGTTTGTGACTGCAAGGTGAGAATTTAAAGAACTTTACAATAAGTA
ATATTATTGATCAATGGCTCTTAATGTTTCAGAAGGGTCATTTAAAGTTT
CAGTTACATTTATATGGTCAATTTTGTTTCAGAATGTTCCAGCTATCAGT
AATATTGCTGAAGTTATTTCTGATTCATCATCTGCCATTGAATTCTCTTA
CCTTGTCGCTGCCCTACGCAATTTTGGCAAAGATATTGATGCTGAAACTC
TTAAGAAATTTGTCAACCTTCTCAAAGAAAATGACAACCCTGCCAGGTAA
AATTGATTTTTTTATTAGAAATGGCAATGATGAAAAGTCTGTTTTGATTT
GATGATAACATCAACAGTCCCACTGAGCCATTACTTTTGTTAACACAAGA
TTCCTCTTTCAAGTAGAGGACAACTTTTTTTTCTGTCTCCAAAAGATATA
CCTAGCTGTGGACTAAGTTCAGACTCTTTCAAGAAAATTTCAAGTTATCC
TTGACCATGTTGACAATTTTGTTCTCAATTGAAGAAATGAAATGCTAAAC
TTTAGCTTCTTGTGACATACGTTTTCCTTTTCATACAGTGCTTCTGTCGC
ATTCTACACTGCAAGTTTATTCCCAAAATCAGATGTTTTCAAACCAGTTA
TCTCTATGGTTGAGGTAGGATTTTCTTTTGCCAGCCCTTGGGCAGGTGAT
GATTTTGTTACACACATTGAAAGTAAATGTTTTCATTTGCTTGCAGAAAA
AAACAGTTTAACTGATGCCATATAATTTCAACATACACATACACCTAAAA
AAAACTTTTGTAGAGGTTGCCTTGCACTGATGATGTTTAAGCTCAGGCAA
CAAAGAGCAACCTCTTCAAAAATGGCATGATCATTCACATCGATACATCT
AATACATCTAATACATGACATTACATTTATTACGCAAAAATAAATAGACA
TATAGTTAACACAAATTAACACAAGTAATTTTGAGTTTAATAATTAGAAC
CAGCTGTGTGTTCTTGAAAAAAAATTTTGCACATGTTACTTTCATGGCCG
CCACTAAAGTGTCTACTTATTTTTGTGTAATAAGAAATTGTTACAACATT
GTAAGATTTGATAAACAGTTTTATATTTGATATAGGAGAATTTTCGAGTG
CTGGAGCAAAACTTTTCCCTTCAATTGAAATGATGTGTAATTTTTCTTGC
TATTTAACACGTTTTGGCAATTTTATTTGATATGCTGAATTATCAAAAGA
AGAACAGATATAAAGTTTCAAGCATTGTCTTGATTTAGGACATTGTTGCA
CAAGCTGATGAAGTCGGAGGAAACATTTTGCAATTTGAAGGAGGACTTGG
TGTCACTGCAGGTGTTGTTGATGGCATCATGCGCTTGTCTGATCAACAAG
GGACAAAACTCGTCAAGGATGTGAGTTTGTCTTTCTTTCGGTTTTATATT
TTCTCTTGATGCTTTTGATGATCAGTTATCCTTGCCCTGATGTTGTATTT
GACATTCATCTGATGCCAAAATATTGCAAAAATCATTCTGAAGCTAAAAA
TGTCCTAGGTTTGTTTACTGTATTTGAATGGTTGCTTTCTTCAACAAATT
TATTTCCTTTTTTTAGGATCAAGTTATGAAATTTACAGAATATTTCTTGA
GCAGAAAATTTGTTTTCACTCTTAAAGACATCTACTACCTTACCAAAGCA
CTTGCTGCTCTCTCAAATAACAAGGTATACCTTTATGTGTTGTGTTTGTG
TCTTTCCCAAGCATACGATGATGATAAATTCTCAGCTCACTTTGAGTTCT
TATGAAAATAACATACGAACATGCTGAGTATGCTTAACATAACTTTCAAC
TATTTCTTAAATATTTGTTCTTTTTAAAGTTTGATTATGATGATAAAACT
CAGCTCACTTTGAAATGAACTGAAAATCACTTTTTTTCTGAATCAAACTG
CTTATTCTTTTGTCTCGGCAAATTTTTCAAATGGTTACTCAACTTGTTTC
AAGGCTAGAGATAAGTTGTCTTCTGTTACATTTAGTAGGGGGGGATTTGT
AAAAGTCACTTGATTGTTTTGGTCAAAGCACTTGTTATACAGTTTTGAAA
AGTTAAGGGGTAGGGGAATCAAAACAACGTAGGTGCCAATTTTTTTGGAT
ACTTTGGTGTGCTTTGTGGACAAATATGACAGTCTCAGGCAAAAATCATA
GGGTCGAAAATTTCCCAAAATATACACCATGTCTCTCTTTTCTCAAGCTG
AAATTTTCATTAAATTTTGACCCTATGAATTTTGCATGAGACCGTCATAT
TTGTCCGAAAACACAGCAAAGTGTCTAAAAGATTGGCACCCTTGTTATTT
TGATTCCCCTACCCCTTAGCTTTCCAAAAATGTCAAACAAGTGCTTTGAC
TAAAAAGTTAAAGAACCTCAAAAAATCAAACAAATTTCCCTTACTAATTT
ACTTAAAGCTGTTCAGTAATTTCAATTGCATTATTTATTTAGAATCAAGT
ACCAATCGTCGTGTCTGTCTTCAAATCTAACTTTATCACTAAAGACAATC
CAGCATTGAAAATTCGTGTCACAAACCTTTTAGATAGATCTTTGTCGGAC
ATCAAATCTGTCACAGCCAAATCCTTCACAACTGCAGATGATACTGTCAC
CCTCTTTGACAACAAACCCTTCACCAAATCAAACAATAAGGATGACATGA
TTGTGTTGGATAATGAAGTTGCCAGAGGTTACATAGAAGCTCATGCTTTT
GATCTTAATGTAATGGCTGCCAACCCAAAGCGTGGAATGTTCATGTGCAA
TGTTGGAATACAAATGAAAGAAGCTAAGCAATATATCAAGAAATCCACAT
ATGGAATTGGATTGAAAGTTCTTGCCCGTGTAATGGTTGAAGATGTTGCT
GTTTTTGTTGCTGAAAAAGATCAAGCTTCAGGAAATGTGATCAAAATGAC
CTACCCTAAACAATTTCCAAATTCCCTTGAAGCTGACAGCCACCAAAAGA
TTGTTATGGACTTCAATTTGAAAGATCTCAATAGTGGTGAAACTGTGACA
GCCCATCAAACTTTTATCAGATTGACCAACGTAGAAACACAACAAGAAAT
CTTCTTTGTAGCTGAACCAAATGGTGATGATCATTACACTTTCACTTTGG
TAAGAATTTATCTGTTGTGTTAGATGTTAAAATTGGTTCTATATTTATTT
TGTTCCTTTTACACATAAGTAACTTACTTCATTACTTGATCCTTTTCCTT
TTTGAGCAATTTAAATTTTCTTTGTTTATGAAAATAACTGCCCAACAATT
TTTAATAAACATTAATTTTTCAACCCAGATTCTTGTCTTATTCTAGGATG
TCAGTGCCACTGCAAAGGACTCGTTCAATCACCAATCTGGAAAATACAAA
ATGGTAAGTTTATAAGATCTACCCTTAAAGGGAACTTATTTTTGCAGTGC
AAAGGTACTTAATATAATTGGTGTATTTTGCAGAACGAATTTTTGACAGT
TCTTTGATGTGCGAAGGGGTTTTTGGGGATTTTCAGTAAAAATTGCATTC
CCTGGAATTAATTTTTGCGGTAGACACCCAGAAAGTTTCACTTTTCACAT
TCCTAATGATGAACTATGTTTGTCTGTGTATTGATTTGAAAAGTTTTCAT
TGGTGTAACTTATTTCTCTATTGATGATTTGGTCATTTTCCTTACATGAA
AGTATTAAAAACTTGATGATTACAATAACAAGATTGAAGTAGTTTTCATA
TAGCCTCATTTTTCAATGGTTCTGAAGGAAAAATAGGATTTCATCTCTCT
TGGATGCATCCGTTGTTGCAATATGGTTTTGGTTTTCAAATATGATATTG
TGGCAGCATTCTGAGAGAAAAATAAATCCAAGTTAATCTCAATCTTCATT
TTCCAATATGAATGGTTGCTTCATGCCTTGGACACAACGTCTATTTCACC
TTAGATTATATACCGGGTGACCCACGAAAAAGTTCAGACGTTTCTCGACG
TCTTGAGGCCGAAAAAATGTCCCAAGGTGCTTGGAGTTTTGATATTTAGA
AAGTAGATATCCTAACTTAAAATTTGAGCTATCACTTTTTAAATTTGACC
GACTTGTTCTCTACTTATGAGCTTTTAAAGTCAAAATTCACTTTTCGGAA
AGTGTAAAAAACACGTAAAAAAGAGGTATTAAATTTATGCAATCAATTAG
AAAATCACTTACAAATTGACTTATTTAACGAGTTTTATGACATTAATAAT
TAATAAAAACACCTTTAAAAGTAATTTTTGCTTGAAACAAGACTATTTTT
TTTAAAAATTGGCGCTTTTGTAGATTTTTCAGATTTTTTTCAAAAATTGT
ATATCAAAAGCGTCTAAAAATACCAAATTTGATACCCCTTTATTACGTGT
TTTTTACACTTTCCGAAAAGTGAATTTTGACTTTAAAAGCTCATAAGTAG
AGAACAAGTCGGTCAAATTTAAAAAGTGATAGCTCAAATTTTAAGTTAGG
ATATCTACTTTCTAAATATCAAAACTCCAAGCACCTTGGGACATTTTTTC
GGCCTCAAGATGTCAGGAAACGTCTGAACTTTTTCGTGGGTCACCCGGTA
TTTTGAATAGTATTCGCTGTTGCACAACAGGTTCAACTGCTCCTCTTCCT
AGGTTTAATTTATTGATTCCTCTCCCTGGCCCCATTCGAAGCTGGTATAG
CCTTCTTGGTTGCTTTACCAGTCAACTTGGTGGCAATATAAACTTCCATT
TAAAAGGTCACTTCTTTTCTATCTCTTCATGAAAATGAGGTATCACCCAA
AATGTAAACAACAATTCCAGAGTTAAAATAATTTAAGCTCGCATGAAACT
CTCTTGTTGCAAGCAAATAGGGATAAGTTTTCTAACTTTGATTTTTCTTT
TCAGGCTCTCGTTGTTGGTGATGCAACTATGCAAGTTCCAATTAGTTGGA
ATATGGTAAGACACATTTATTTTGCATTACCCTCTTCCCCAAATTTCCTA
TCTCAGCAGATCATCCATTGTGTGCAAACCATGCCTAAGGTGTCATCTTC
AGCCTGTCATCTGCGGAATATGAGAATCTACTTGGCATCATGTTCTGTTT
CCACTTGAAAAATACTGATTGTTAGTGTAGCCGTGGATTGTAATGAGGGC
TTTCAAAACTTCACTAGTTTGAACTGCAGTGAAAGTTGCAAATTAATGAT
TTTGATTGCCATTTCTCTTCAGGGTGAGGTGAAATTGAAATTCTCTGGCA
AGCCAGCCACGAACAAACGACAAGAAAGATTGACTGAACCACAACCTATC
ATCGAGGTAAAAATCTTGTCTCTCTTCCCTGAGTCAATCTCTCCTGATGA
TTATAAATTCTGTGTCAGATGTCACAAGTGGATGATACTCTAGGACGGAA
TGAAGGAGAAATTACTTACCAATTTTGTATTGTTTTTCGGAAGACATCGT
TATGAATTGAGCTCTTCCAGAAAATATCCGTACATGGAGGGGTGGATGAT
ATATTGTCTGGGGTAGCAAAAAATAATCAAACTTTAGATTGTTTTGGGGA
AGACAACGTTATGAATTGAGCTCTTCCAGAAAATATCCTTACATGGGGGA
GTAGCAAAAAATCATCAAGTTTTGCATTGTTCGGGGTAAATTTGCTCTGT
CCAGGGGTAATTTAACTTATATTTTTCATTACATAGATAAAATGATTATT
TTCTTTTTCTAGCATTTGTTCCGTGTCCCAGAGAAACGTCCATCAAAGAT
TGTCTCCACTGTCTTCACTTTCTTATGTCTTTCACCTTTACTCATCATGA
TCGTATTATGGGCACAACTCGGTGCAAACCTTTCAAATTTCTCCTTCTCG
ATTTCAACCATCGTCTTTCACATTGGATTGGGAGCCATCTTCGCATTGTA
TTACATGTTTTGGGTGCAACTGGATATGTTCCAAACGTTGAAGTTGCTGG
CCATTATAGGAGGTGTAACATTCTTAGGAGGAAACAAAATGCTTGCTGAT
ATGGCGGCTGCTAAGTACAAGTCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000134_pilon:573237..579513- >XLOC_014301 ID=XLOC_014301|Name=XLOC_014301|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3828bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134_pilon:573237..579513- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTCTAAGCCTGTTGTTAATTGGCTTGTTGGGTTGTAATGCCCTCACCTC
ATCATTGACCTACAAAGATCAGCAAAAGCTTGGTCGCAAATTAAGTCAAC
CACCAACAGATCTTGAAAGTGCTTTCTATTCGGTATCTGGATTGACTGCG
CTTAAAAAAGAAGTTCTTGGCAAAGATGCTGTTTGTGAAATTGCGGGCAA
AAATCTGGACACTAAGAACGCAAAAGCTCTATATCAATTCTCTGAAGTAA
CCAAAGTTTGTGACTGCAAGGTTCTAAGCCTGTTGTTAATTGGCTTGTTG
GGTTGTAATGCCCTCACCTCATCATTGACCTACAAAGATCAGCAAAAGCT
TGGTCGCAAATTAAGTCAACCACCAACAGATCTTGAAAGTGCTTTCTATT
CGGTATCTGGATTGACTGCGCTTAAAAAAGAAGTTCTTGGCAAAGATGCT
GTTTGTGAAATTGCGGGCAAAAATCTGGACACTAAGAACGCAAAAGCTCT
ATATCAATTCTCTGAAGTAACCAAAGTTTGTGACTGCAAGAATGTTCCAG
CTATCAGTAATATTGCTGAAGTTATTTCTGATTCATCATCTGCCATTGAA
TTCTCTTACCTTGTCGCTGCCCTACGCAATTTTGGCAAAGATATTGATGC
TGAAACTCTTAAGAAATTTGTCAACCTTCTCAAAGAAAATGACAACCCTG
CCAGAATGTTCCAGCTATCAGTAATATTGCTGAAGTTATTTCTGATTCAT
CATCTGCCATTGAATTCTCTTACCTTGTCGCTGCCCTACGCAATTTTGGC
AAAGATATTGATGCTGAAACTCTTAAGAAATTTGTCAACCTTCTCAAAGA
AAATGACAACCCTGCCAGTGCTTCTGTCGCATTCTACACTGCAAGTTTAT
TCCCAAAATCAGATGTTTTCAAACCAGTTATCTCTATGGTTGAGTGCTTC
TGTCGCATTCTACACTGCAAGTTTATTCCCAAAATCAGATGTTTTCAAAC
CAGTTATCTCTATGGTTGAGGACATTGTTGCACAAGCTGATGAAGTCGGA
GGAAACATTTTGCAATTTGAAGGAGGACTTGGTGTCACTGCAGGTGTTGT
TGATGGCATCATGCGCTTGTCTGATCAACAAGGGACAAAACTCGTCAAGG
ATGACATTGTTGCACAAGCTGATGAAGTCGGAGGAAACATTTTGCAATTT
GAAGGAGGACTTGGTGTCACTGCAGGTGTTGTTGATGGCATCATGCGCTT
GTCTGATCAACAAGGGACAAAACTCGTCAAGGATGATCAAGTTATGAAAT
TTACAGAATATTTCTTGAGCAGAAAATTTGTTTTCACTCTTAAAGACATC
TACTACCTTACCAAAGCACTTGCTGCTCTCTCAAATAACAAGGATCAAGT
TATGAAATTTACAGAATATTTCTTGAGCAGAAAATTTGTTTTCACTCTTA
AAGACATCTACTACCTTACCAAAGCACTTGCTGCTCTCTCAAATAACAAG
AATCAAGTACCAATCGTCGTGTCTGTCTTCAAATCTAACTTTATCACTAA
AGACAATCCAGCATTGAAAATTCGTGTCACAAACCTTTTAGATAGATCTT
TGTCGGACATCAAATCTGTCACAGCCAAATCCTTCACAACTGCAGATGAT
ACTGTCACCCTCTTTGACAACAAACCCTTCACCAAATCAAACAATAAGGA
TGACATGATTGTGTTGGATAATGAAGTTGCCAGAGGTTACATAGAAGCTC
ATGCTTTTGATCTTAATGTAATGGCTGCCAACCCAAAGCGTGGAATGTTC
ATGTGCAATGTTGGAATACAAATGAAAGAAGCTAAGCAATATATCAAGAA
ATCCACATATGGAATTGGATTGAAAGTTCTTGCCCGTGTAATGGTTGAAG
ATGTTGCTGTTTTTGTTGCTGAAAAAGATCAAGCTTCAGGAAATGTGATC
AAAATGACCTACCCTAAACAATTTCCAAATTCCCTTGAAGCTGACAGCCA
CCAAAAGATTGTTATGGACTTCAATTTGAAAGATCTCAATAGTGGTGAAA
CTGTGACAGCCCATCAAACTTTTATCAGATTGACCAACGTAGAAACACAA
CAAGAAATCTTCTTTGTAGCTGAACCAAATGGTGATGATCATTACACTTT
CACTTTGAATCAAGTACCAATCGTCGTGTCTGTCTTCAAATCTAACTTTA
TCACTAAAGACAATCCAGCATTGAAAATTCGTGTCACAAACCTTTTAGAT
AGATCTTTGTCGGACATCAAATCTGTCACAGCCAAATCCTTCACAACTGC
AGATGATACTGTCACCCTCTTTGACAACAAACCCTTCACCAAATCAAACA
ATAAGGATGACATGATTGTGTTGGATAATGAAGTTGCCAGAGGTTACATA
GAAGCTCATGCTTTTGATCTTAATGTAATGGCTGCCAACCCAAAGCGTGG
AATGTTCATGTGCAATGTTGGAATACAAATGAAAGAAGCTAAGCAATATA
TCAAGAAATCCACATATGGAATTGGATTGAAAGTTCTTGCCCGTGTAATG
GTTGAAGATGTTGCTGTTTTTGTTGCTGAAAAAGATCAAGCTTCAGGAAA
TGTGATCAAAATGACCTACCCTAAACAATTTCCAAATTCCCTTGAAGCTG
ACAGCCACCAAAAGATTGTTATGGACTTCAATTTGAAAGATCTCAATAGT
GGTGAAACTGTGACAGCCCATCAAACTTTTATCAGATTGACCAACGTAGA
AACACAACAAGAAATCTTCTTTGTAGCTGAACCAAATGGTGATGATCATT
ACACTTTCACTTTGGATGTCAGTGCCACTGCAAAGGACTCGTTCAATCAC
CAATCTGGAAAATACAAAATGGATGTCAGTGCCACTGCAAAGGACTCGTT
CAATCACCAATCTGGAAAATACAAAATGGCTCTCGTTGTTGGTGATGCAA
CTATGCAAGTTCCAATTAGTTGGAATATGGCTCTCGTTGTTGGTGATGCA
ACTATGCAAGTTCCAATTAGTTGGAATATGGGTGAGGTGAAATTGAAATT
CTCTGGCAAGCCAGCCACGAACAAACGACAAGAAAGATTGACTGAACCAC
AACCTATCATCGAGGGTGAGGTGAAATTGAAATTCTCTGGCAAGCCAGCC
ACGAACAAACGACAAGAAAGATTGACTGAACCACAACCTATCATCGAGCA
TTTGTTCCGTGTCCCAGAGAAACGTCCATCAAAGATTGTCTCCACTGTCT
TCACTTTCTTATGTCTTTCACCTTTACTCATCATGATCGTATTATGGGCA
CAACTCGGTGCAAACCTTTCAAATTTCTCCTTCTCGATTTCAACCATCGT
CTTTCACATTGGATTGGGAGCCATCTTCGCATTGTATTACATGTTTTGGG
TGCAACTGGATATGTTCCAAACGTTGAAGTTGCTGGCCATTATAGGAGGT
GTAACATTCTTAGGAGGAAACAAAATGCTTGCTGATATGGCGGCTGCTAA
GTACAAGTCTTGACATTTGTTCCGTGTCCCAGAGAAACGTCCATCAAAGA
TTGTCTCCACTGTCTTCACTTTCTTATGTCTTTCACCTTTACTCATCATG
ATCGTATTATGGGCACAACTCGGTGCAAACCTTTCAAATTTCTCCTTCTC
GATTTCAACCATCGTCTTTCACATTGGATTGGGAGCCATCTTCGCATTGT
ATTACATGTTTTGGGTGCAACTGGATATGTTCCAAACGTTGAAGTTGCTG
GCCATTATAGGAGGTGTAACATTCTTAGGAGGAAACAAAATGCTTGCTGA
TATGGCGGCTGCTAAGTACAAGTCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000134_pilon | genome | sc0000134_pilon:573237..579513 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1612-1926:316 |
| Aaloc | 1528-1611:806 |
| Aaloc | 1477-1527:1124 |
| Aaloc | 1420-1476:2682 |
| Aaloc | 763-1419:3536 |
| Aaloc | 655-762:4412 |
| Aaloc | 523-654:4740 |
| Aaloc | 448-522:5439 |
| Aaloc | 283-444:5896 |
| Aaloc | 13-282:6278 |
|
